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牦牛GHR 基因exon 10 SNP對乳成分影響的研究

2021-09-15 07:23:12金鑫燕
青海畜牧獸醫雜志 2021年4期

金鑫燕

(青海大學畜牧獸醫科學院,西寧 810016)

生長激素受體(growth hormone receptor,GHR)基因位于牛20號染色體,由10個外顯子和9個內含子組成,其堿基序列的突變可能導致其結構及功能的改變,進而影響到信號轉導及生長激素作用的生理效應,最終影響產奶、產肉等經濟性狀。因此,將牛GHR基因作為候選基因,研究其與生產性能的關系,對牛的育種有很大實踐意義[1,2]。在基因組DNA中,任何堿基均有可能發生變異,因此SNP既有可能在基因序列內,也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來說,位于編碼區內的SNP(coding SNP,cSNP)比較少,因為在外顯子內,其變異率僅及周圍序列的1/5。cSNP又可分為兩種:一種是同義cSNP,即SNP所致的編碼序列的改變并不影響其所翻譯的蛋白質的氨基酸序列,突變堿基與未突變堿基的含義相同;另一種是非同義cSNP,即堿基序列的改變可使以其為藍本翻譯的蛋白質序列發生改變,從而影響了蛋白質的功能。這種改變常是導致生物性狀改變的直接原因。本試驗對牦牛GHR基因exon 10片段進行了SNP檢測,旨在結合各乳成分數據研究該序列各SNP是同義突變還是非同義突變,是否影響各乳成分,為下一步將該遺傳標記應用于牦牛泌乳性狀的標記輔助選擇(MAS)育種奠定一定的基礎。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

試驗動物來自青海省澤庫縣有機牧場,采集20頭(胎次為2~3胎,年齡為6~7歲,產犢時間為當年4月底到5月初)泌乳牦母牛頸靜脈血樣5mL,干冰保存運往實驗室,-20℃冷凍保存。

1.2 基因組DNA提取

基因組DNA提取采用柱式血液基因組DNA抽提試劑盒。……

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