研究揭示小白菜維生素C等營養物質的代謝機制

2020年12月28日，南京農業大學園藝學院教授侯喜林團隊在《Horticulture Research》上在線發表研究論文，以不結球白菜“蘇州青”為材料，利用最新的測序手段，獲得了396.83 Mb近完整的高質量染色體級基因組，并對其功能進行注釋。此基因組質量高于現有其他白菜基因組。根據這一新基因組，研究發現重復序列占全基因組的比例約為53%，并且注釋得到了48 158個蛋白質編碼基因。比較基因組分析證實，不結球白菜經歷了一個與其他十字花科物種共享的全基因組三倍化（WGT）事件，這發生在與擬南芥共享的WGD事件之后，為研究蕓薹屬蕓薹種亞種之間分化提供了重要的依據。對維生素C和硫代葡萄糖苷（GSLs）合成和代謝途徑相關基因進行鑒定和比較分析，得到了串聯復制導致的基因拷貝數變異，并且GSL基因在白菜基因組中發生了高度擴張。聯合轉錄組分析，對相關基因的表達進行了探究，揭示了不結球白菜維生素C和硫代葡葡糖苷營養物質的代謝調控機制。該研究為優良性狀分子設計育種奠定了堅實基礎。