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環介導等溫擴增技術檢測鼠疫感染動物敏感性的應用性研究※

2021-12-29 12:59:16祁芝珍楊曉艷趙海紅劉中凱
中國高原醫學與生物學雜志 2021年3期
關鍵詞:檢測

謝 輝,祁芝珍,楊曉艷,趙海紅,劉中凱,李 勝,張 琪

(青海省地方病預防控制所,青海 西寧 811602)

環介導等溫擴增技術(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一種新型恒溫核酸擴增技術,能否應用于鼠疫現場觀點不一,本研究擬考察環介導等溫擴增技術(LAMP)檢測鼠疫實驗感染動物的敏感性及檢測時間,探討在鼠疫流行現場應用LAMP技術的可行性。現將有關研究情況報告如下。

1.材料與方法

1.1 材料

試劑及儀器:LAMP引物由北京擎科生物有限公司合成,Loopamp?朗報?DNA擴增試劑盒(批號98004)、Loopamp熒光目視檢測試劑盒(批號98002)由北京成志科為生物科技有限公司提供;鼠疫膠體金免疫層析試紙(批號202001)由中國人民解放軍軍事醫學科學院微生物流行病研究所提供;中國細菌濁度標準吧管(批號2018-1)由中國藥品生物制品檢定所提供;恒溫水浴箱ZC-22Q由杭州卓馳儀器有限公司提供。

實驗動物:小白鼠、 豚鼠、大耳白兔由重慶鵬鑫生物科技有限公司西安分公司提供。

培養基:赫氏培養基由青海省地方病預防控制所培養基室提供。

1.2 方法

1.2.1 動物感染

1.2.2 鼠疫耶爾森菌反向血凝試驗(RIHA):

分別取制備的臟器懸液,按照鼠疫診斷標準(WS279-2008)[1]方法進行反向血凝試驗。

1.2.3 細菌檢測

按照鼠疫診斷標準(WS279-2008)方法進行細菌學檢測。

1.2.4 鼠疫膠體金免疫層析法(RGICA)試驗

按1.2.1方法制備臟器懸液取上清液200 μL加入膠體金免疫層析試紙條檢測孔內,15 min后觀察結果:見兩條顯色帶視為陽性結果,僅見一條顯色帶視為陰性結果。同時做空白對照。

1.2.5 模板制備

采用煮沸法,取動物臟器懸液于100 ℃水浴加熱10 min,離心(12000r/min)取上清液作為DNA模板。將模板置-20 ℃冰箱保存。

1.2.6 鼠疫耶爾森菌環介導等溫擴增技術(LAMP)試驗

引物合成根據NCBI數據庫(GenBank登錄號AF350075)公布的鼠疫耶爾森菌3a基因序列,用Priner Explorer version 4在線軟件設計LAMP引物,包括外引物F3、B3和內引物FIP、BIP以及相應的環引物(表1)。模板制備方法同1.2.5所示方法。

表1 引物序列

LAMP反應體系及反應條件:反應體系(25μL)包括:2×Reaction Mix.(12.5μL)、混合引物(1μL。引物濃度:F3、B3為5pmol/μL,BIP、FIP為40pmol/μL)、Bst DNA聚合酶(1μL)、DNA模板(2μL)、熒光染料(1μL)、滅菌純水(補至25μL);使用恒溫水浴加熱(65℃)1 h。

2.結果

2.1 檢測結果

LAMP檢出率為100%,檢測時間為1 h,細菌學培養檢出率為100%,檢測時間最短需24 h,RIHA檢出率低于細菌學檢驗,檢測時間為2 h,RGICA檢出率最低,檢測時間為15 min(表2)。

表2 各類動物材料檢測結果

2.2 敏感性結果

表3 LAMP與RIHA法檢測動物材料的敏感性試驗結果

1~12是不同稀釋度(40~81920)的LAMP可視化結果;13是陽性對照結果;14~15是陰性對照結果

3.討論

為考察LAMP檢測鼠疫實驗感染動物的敏感性及檢測時間,探討在鼠疫流行現場應用LAMP技術的可行性,我們在研究鼠疫菌的敏感性和特異性基礎上[2-3],對本研究目的進行了一系列的實驗探索。RIHA試驗是目前應用廣泛的鼠疫診斷方法之一,資料表明該方法最低檢菌量是2.5~5萬個菌/mL[4],RGICA 是6萬個菌/mL[5],當菌量低于2.5萬個菌/mL時RIHA、RGICA檢不出陽性結果,LAMP的最低檢菌量是20個菌/mL[2],實驗結果顯示,LAMP法檢測各種動物臟器的陽性符合率為100%,LAMP 檢出率優于RIHA、RGICA。本試驗陽性結果呈綠色,陰性對照結果為桔紅色,肉眼觀察結果清晰,易判斷。

從檢測時間來看,細菌學培養在材料新鮮情況下可做檢測且檢測時間最短(24h),而腐敗材料或患者用過抗生素,則不能對突發的鼠疫疫情做出快速判定;RIHA試驗受反應溫度等條件制約,結果判定依賴檢驗人員專業層次及累積經驗因素的限制,最快的結果需2 h;RGICA檢測時間最短(15min),其方法是采用鼠疫單克隆抗體作為探針,捕捉特異性的FI抗原[6],具有較強的特異性,但敏感性不高,易漏診[7];LAMP法的特點在于不需要特殊儀器設備,在1 h內即可觀察結果,結果直觀可靠,適合在野外疫區快速診斷。

本研究結果顯示,LAMP技術具有高度敏感性,1 h內肉眼可判讀結果,在鼠疫流行現場應用LAMP技術具有可行性。

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