基于生物信息學方法分析GPCR116基因與肺腺癌的相關性及其作用機制▲

黃勛功 馮 旭 涂順珂

(廣西醫科大學第一附屬醫院心胸外科，廣西南寧市 530021)

肺癌是全球最常見的癌癥之一，早期診斷是肺癌治療過程中最關鍵的部分，但晚期患者占肺癌人群的比例依然很高，因此，對患者進行早期診斷及預后監測至關重要[1]。近年來，諸多研究發現多個基因與肺癌的發生、發展及預后相關，基因靶向治療可有效識別腫瘤細胞及正常細胞，在發揮抗腫瘤作用的同時減少對正常細胞的損傷，這使其成為研究的重點。目前，肺腺癌約占全部肺癌的45%，在女性和抽煙者中發病率較高，但其具體的分子機制尚未完全清楚，因此，揭示潛在關鍵基因對肺腺癌的防治和預后評估非常重要[2]。G蛋白偶聯受體116(G-protein coupled receptor 116, GPCR116)屬于G蛋白偶聯受體家族，該受體在維持肺表面活性物質穩態中起著關鍵作用，GPCR116丟失會引起肺氣腫樣病變[3]。有研究顯示，GPCR116具有調節血管內皮的功能，其功能的缺失會導致腦血管滲漏風險顯著增加[4]。此外，還有研究報道GPCR116可以預測胃癌和結直腸癌的不良預后[5-6]。然而，GPCR116基因在肺腺癌中的作用尚不清楚，本研究旨在探討GPCR116基因與肺腺癌發生、發展的相關性及其作用機制。現報告如下。

1 對象與方法

1.1 數據來源 從高通量功能基因組(Gene Expression Omnibus, GEO)數據庫(www.ncbi. nlm.nih. gov/geo)下載GSE68465數據集，該數據集包含442例肺腺癌組織樣本和20例正常組織樣本的mRNA數據和基本臨床資料(包括T分期、N分期、年齡、性別、吸煙史等)[7]。

1.2 數據分析 利用R語言對基因名進行注釋，用“limma”和“impute”工具包對其相應的基因表達量進行補缺矯正[8-9]。……