AI助力“撈出”腸道菌群中耐藥菌“殺手”

在人體的“宇宙”中，居住著數(shù)百萬(wàn)種微生物。它們相生相克、相互制衡，維持著人體健康的微生態(tài)平衡。

很多常見(jiàn)耐藥菌，如金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、大腸桿菌等都是人體共生的“原住民”。而人體中同樣存在著克制它們的微生物及其代謝產(chǎn)物。找到這些耐藥菌的“克星”作為藥物是當(dāng)前生命科學(xué)領(lǐng)域的前沿問(wèn)題。

如何在數(shù)以千萬(wàn)億計(jì)的人體微生物“居民”中“撈出”這些耐藥菌的天然“殺手”呢？面對(duì)這一難題，中國(guó)科學(xué)院微生物研究所研究員陳義華和王軍團(tuán)隊(duì)合作，利用機(jī)器學(xué)習(xí)的方法，從一萬(wàn)多個(gè)腸道微生物中“海淘”出3個(gè)具有顯著活性和安全性的抗菌肽“潛力股”。相關(guān)研究3月4日發(fā)表于《自然—生物技術(shù)》。

“整個(gè)研究令人振奮！從人體腸道微生物組挖掘抗菌肽的方法十分新穎。”該刊一位審稿人評(píng)論說(shuō)。

科學(xué)家認(rèn)為，人體腸道中龐大的微生物“居民”中也蘊(yùn)含著與耐藥病原菌共生的克星，它們的代謝產(chǎn)物能夠抑制耐藥菌的活性。

抗菌肽（AMPs）就是這樣一類具有抗微生物活性的小肽（序列在幾個(gè)到幾十個(gè)氨基酸殘基之間）。以往研究發(fā)現(xiàn)，它們經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)單的后修飾或不經(jīng)任何修飾就能直接發(fā)揮作用，達(dá)到抑制病原微生物的效果。它們能抵御多重耐藥菌，同時(shí)不易產(chǎn)生耐藥性的抗菌肽，被認(rèn)為是可能替代傳統(tǒng)抗生素的下一代抗菌劑。

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