TM4SF1與腦膠質瘤病理分級及預后的相關性

霍宏志 梁 金 柴爾青

膠質瘤是成人最常見、最具侵襲性的原發性顱 內腫瘤。目前，膠質瘤的治療方法包括手術、化療和放療，但是效果仍不理想，腦膠質瘤的治療仍然是一個嚴重的臨床和科學問題。研究發現，一些分子與腦膠質瘤的個體化預后密切相關。跨膜四蛋白超 家 族 成 員1（transmembrane 4 super family 1，TM4SF1）是一種四聯體跨膜結構域表面蛋白，屬于L6四聚糖超家族成員，由于含有4個跨膜結構域，可與多種蛋白（如整合素、受體酪氨酸激酶、免疫蛋白等）形成復合物，參與多種細胞生物學過程，如細胞的運動、粘附、增殖、遷移和侵襲。本文探討TM4SF1與腦膠質瘤病理分級及預后的關系。

1 資料與方法

1.1 生信分析 從公開的腫瘤基因組圖譜（The Can?cer Genome Atlas，TCGA）（https://cancergenome.nih.gov/）篩選腦膠質瘤病人數據集，包括基因表達譜和臨床信息，共獲得5 個正常腦組織、529 個低級別腦膠質瘤（low grade glioma，LGG）組織和169 個膠質母細胞瘤（glioblastoma multiforme，GBM）組織，后續處理排除年齡、總生存時間數據不足或缺失的病例。首先轉換RNA測序數據，將計數數據轉換為與微陣列結果更相似的值。為了研究TM4SF1 表達對預后的影響，根據TM4SF1的表達將腫瘤組織分為高表達和低表達兩組。利用基因表達譜交互分析（Gene Expression Profiling Interactive Analysis GEPIA）在線數據庫（http://gepia.cancer-pku.cn/index.html）確認TM4SF1 表達與臨床病理信息之間的相關性。從RNA測序表達數據中分析9 736個腫瘤組織樣本，并從GTEx 和TCGA 項目中分析8 587 個正常組織樣本。GEPIA分析TM4SF1差異表達的生存曲線，以發現該基因表達與病人預后的相關性。同時，以疾病狀態（腫瘤或正常）為變量繪制箱線圖，以計算TM4SF1基因的差異表達。

1.2 臨床病例分析