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核磁共振圖像重構(gòu)的即插即用算法

2022-11-20 13:59:32李金城謝朝陽李金蘭
計算機工程與應(yīng)用 2022年22期
關(guān)鍵詞:實驗

李金城,謝朝陽,李金蘭,張 濤,鄒 健

長江大學(xué) 信息與數(shù)學(xué)學(xué)院,湖北 荊州 434023

自20世紀(jì)70年代早期開始,核磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)因其無創(chuàng)性且能有效地描述軟組織病變等優(yōu)點,徹底改變了放射學(xué)和醫(yī)學(xué),成為廣泛應(yīng)用于臨床診斷的方法。限制MRI應(yīng)用的主要因素是其數(shù)據(jù)采集過程比其他技術(shù)慢。在不降低重構(gòu)質(zhì)量的前提下,減少數(shù)據(jù)采集量一直是MRI成像研究的重點[1-3]。在過去的幾十年里,基于稀疏先驗的壓縮感知(compressed sensing,CS)利用圖像在某些變換域(如傅里葉變換、小波變換、梯度變換)中的稀疏性,精確地從少量隨機測量數(shù)據(jù)中重構(gòu)稀疏信號。壓縮感知核磁共振成像(CS-MRI)使得從高度欠采樣的K空間數(shù)據(jù)重構(gòu)核磁共振圖像成為可能,并成為多種重構(gòu)方法的基礎(chǔ)[4-5]。在MRI模型中,獲取的K空間數(shù)據(jù)y∈Rm通常被表示為:

其中,x∈Rn為待重構(gòu)圖像;ηe∈Rm為測量噪聲或干擾;A∈Rm×n(m<n)是壓縮感知采樣矩陣。通常A=P×F,P∈Rm×n為欠采樣模板,如隨機采樣模板、徑向采樣模板、笛卡爾采樣模板等;F∈Rn×n為稀疏變換算子,如小波變換、傅里葉變換等。此時獲取的K空間數(shù)據(jù)y要比觀測核磁共振圖像x的規(guī)模小得多。從低維y中重構(gòu)唯一的高維圖像x可以通過求解如下優(yōu)化問題得到:

MRI中最常用的正則函數(shù)是L1正則,即φ(x)=L1范數(shù)的凸性可以保證問題(2)得到高效的求解。但是L1正則得到的解是真實信號的一個有偏估計,往往會低估x的高振幅分量[6]。非凸正則通常比L1正則更能有效地促進(jìn)稀疏和更準(zhǔn)確地估計x的高振幅分量。常用的非凸正則包括:光滑剪切絕對偏差(smoothly clipped absolute deviation,SCAD)正則,Lq范數(shù)φ(x)=‖x ‖q(0<q<1)等[7]。然而這些非凸正則,會使得問題(2)的目標(biāo)函數(shù)是非凸的,使其陷入次優(yōu)的局部最小值,增加了求解難度。Selesnick等人通過引入L1范數(shù)的Moreau包絡(luò)和最小最大凹罰函數(shù),構(gòu)造了凸-非凸(convex-nonconvex,CNC)稀疏正則[6,8-9],其表達(dá)式如下:

MRI重構(gòu)的另一個重要問題是重構(gòu)算法。近似點梯度下降(proximal gradient descent,PGD)是一種高效的求解非光滑問題(2)的一階算法,其基本原理是利用不同策略來處理目標(biāo)函數(shù)的光滑和非光滑部分,對光滑部分使用梯度迭代,對非光滑部分利用近似點算子求解[11-12]。近年來,隨著深度學(xué)習(xí)的興起,將傳統(tǒng)優(yōu)化算法與深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)合的數(shù)據(jù)驅(qū)動算法得到快速發(fā)展。即插即用(plug-and-play,PnP)算法將用合適的去噪器來替代傳統(tǒng)稀疏優(yōu)化算法中的近似點算子[13-14],其優(yōu)點是當(dāng)沒有足夠的數(shù)據(jù)進(jìn)行端到端訓(xùn)練時,傳統(tǒng)或者預(yù)先訓(xùn)練好的去噪器可以作為即插即用框架下的模塊化部件靈活插入使用。常用的去噪器包括傳統(tǒng)的手工設(shè)計去噪器,如全變差(total variation,TV)、三維塊匹配協(xié)同濾波(block-matching 3D,BM3D)[15]等。近年來,深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)去噪器可以從大量自然圖像中學(xué)習(xí)到更為豐富的圖像先驗,顯示了優(yōu)異的去噪性能[13,16]?;谏疃葘W(xué)習(xí)的即插即用算法在圖像重構(gòu)、圖像去噪、語音去噪和運動設(shè)備等方向得到了廣泛的應(yīng)用[17-19]。

本文利用即插即用近似點梯度下降算法來求解帶凸-非凸正則的核磁共振重構(gòu)模型,其主要貢獻(xiàn)如下:

(1)給出了凸-非凸正則的近似點算子的迭代解形式,解決了采用凸-非凸正則的優(yōu)化問題求解過程中較為困難的部分,從而提高計算效率。

(2)提出求解基于凸-非凸正則的核磁共振重構(gòu)模型的近似點梯度下降算法,進(jìn)而利用去噪器替換近似點算子,得到求解基于凸-非凸正則的核磁共振重構(gòu)模型的即插即用的近似點梯度下降算法。其中即插即用算法可以靈活地引入更多先進(jìn)的去噪器,可以有效提升去噪效果。另外在MRI重構(gòu)中,采用凸-非凸正則能夠更精確地重構(gòu)圖像在頻域中的高頻分量,進(jìn)而能減少重構(gòu)圖像邊緣輪廓和細(xì)小紋理等細(xì)節(jié)信息的丟失。

1 相關(guān)工作

定義1對于任意的α>0,對于給定的適當(dāng)、閉、凸函數(shù)g(x),其近似點算子定義為:

其中,xi為x的第i個元素。從軟閾值的定義可以看出,當(dāng)xi的絕對值小于某一閾值α?xí)r,軟閾值函數(shù)會將xi的值變?yōu)?,因此軟閾值函數(shù)可理解為一個去噪器,參數(shù)α控制其去噪強度。

由近似點算子的定義,可得到近似點梯度下降算法的一般形式??紤]復(fù)合優(yōu)化問題:

其中,f(x)凸且可微的,g(x)凸但不可微,且g(x)的近似點算子容易求得。

近似點梯度下降算法的基本迭代形式如下:

其中,?f(x)是f(x)的梯度函數(shù),α是步長,g的近似點算子proxαg如式(4)所定義。

2 凸-非凸稀疏正則的近似點算子

凸-非凸稀疏正則φb(x)的近似點算子定義如下:

由于φb(x)形式較為復(fù)雜,此時proxλφb(y)不再具有封閉解,本文將給出其迭代解。

證明 由近似點算子的定義可得Sb(x)的最優(yōu)值點為:

代入Sb(x)中,則有:

容易求得Sb(x)的梯度如下:

命題1得證。

命題2 φb(x)的近似點算子為:

證明 將式(8)中的目標(biāo)函數(shù)記為:

由近似點梯度下降算法,可得:

取步長μ=1,命題2得證。

3 即插即用近似點梯度下降算法

3.1 近似點梯度下降算法

本節(jié)將考慮運用近似點梯度下降算法求解基于凸-非凸稀疏正則的核磁共振圖像重構(gòu)模型(2)。令式(2)中,結(jié)合命題2,求解基于凸-非凸稀疏正則的近似點梯度下降(proximal gradient descent algorithm for convex-nonconvex sparse regularization,PGD-CNC)算法的主要步驟如下:

步驟1

步驟2

3.2 即插即用近似點梯度下降算法

此時若選擇兩個適當(dāng)?shù)娜ピ肫鱄σ1、Hσ2分別替換近似點算子、proxαλ‖·‖1,其中σ1、σ2為去噪?yún)?shù),值越大去噪強度越大,則式(19)可改寫為:

綜合式(18)、(20),可得到求解基于凸-非凸稀疏正則的即插即用近似點梯度下降(plug-and-play proximal gradient descent algorithm for convex-nonconvex sparse regularization,PnP-PGD-CNC)算法如算法1所示。

算法1 MRI圖像重構(gòu)的PnP-PGD-CNC算法

即插即用的近似點梯度下降算法與近似點梯度下降算法的區(qū)別:前者可將預(yù)先訓(xùn)練好的去噪器直接插入到傳統(tǒng)近似點梯度下降算法中的一個迭代步中。當(dāng)去噪器滿足一些簡單條件,如非擴(kuò)張、收縮時,可以保證算法的收斂性[17,19]。

算法1中計算復(fù)雜度較高的是z(k+1)的迭代,涉及到多個矩陣相乘,但在實際實驗中都可以進(jìn)行快速計算。由于P是欠采樣矩陣,則PTP為矩陣元素間的乘積。若F為傅里葉變換,則有FT=F-1,F和FT在實驗中可通過快速傅里葉變換(fast Fourier transform,F(xiàn)FT)和逆快速傅里葉變換(inverse fast Fourier transform,IFFT)實現(xiàn)。

4 數(shù)值實驗與結(jié)果分析

4.1 實驗設(shè)置

壓縮感知核磁共振成像通過下采樣獲取更少的數(shù)據(jù)來加速核磁共振成像。本實驗選取了三種不同的核磁共振圖像:大腦、腦部血管和上半身。所有圖像灰度值取值范圍為0~1,尺寸設(shè)置為256×256像素;ηe為測量噪聲且滿足ηe~N(0,σeIk),噪聲級別為σe=15/255;P是欠采樣模板,本實驗應(yīng)用了采樣率均為30%的欠采樣隨機采樣模板、徑向采樣模板和笛卡爾采樣模板;F為傅里葉算子。待重構(gòu)圖像和采樣模板如圖1所示。

為了驗證PnP-PGD-CNC算法的有效性,實驗將ADMM-Net[20]、BM3D-MRI[21]、基于L1正則的近似點梯度下降算法(PGD-L1)[17]、基于L1正則的即插即用近似點梯度下降算法(PnP-PGD-L1)[17]以及本文提出的基于凸-非凸稀疏正則的近似點梯度下降算法(PGD-CNC)、基于凸-非凸稀疏正則的即插即用的近似點梯度下降算法(PnP-PGD-CNC)的核磁共振重構(gòu)圖像進(jìn)行對比。其中ADMM-Net[20]是將傳統(tǒng)的交替方向乘子法(alternating direction method of multipliers,ADMM)展開到深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中;BM3D-MRI[21]是使用非局部的BM3D圖像模型進(jìn)行MRI重構(gòu);其他四種算法的主要迭代步驟如表1所示。

表1中PGD-L1算法為正則項φ(x)=‖x‖1時,使用PGD算法得出的迭代解,其解由軟閾值函數(shù)給出[17];PnP-PGD-L1算法為文獻(xiàn)[17]中提到的,由上述PGD算法與PnP算法相結(jié)合得出的迭代解;PGD-CNC算法即由式(18)、(19)給出;PnP-PGD-CNC算法即本文所提出的算法(算法1)。

表1 算法的迭代式Table 1 Iterative formula of algorithms

在PnP-PGD-L1和PnP-PGD-CNC算法中選取BM3D[15]和五種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)去噪器作為PnP框架下不同的去噪器。表2簡要羅列了各種去噪器的特點。

表2 PnP框架下的去噪器Table 2 Denoiser under PnP framework

特別地,文獻(xiàn)[25]中提到DnCNN需要為每個噪聲水平分別學(xué)習(xí)一個模型,其他的去噪器通過單個模型可以處理各個噪聲水平的噪聲圖片。因此,在PnP-PGDCNC算法中選用DnCNN去噪器時,去噪?yún)?shù)σ1=5σe/3=25/255,σ2=σe/3=5/255,在其余算法中σ1=σ2=σe=15/255。本實驗中,參數(shù)設(shè)置均是在大量的實驗下選擇圖像恢復(fù)效果較好時的參數(shù),迭代次數(shù)均設(shè)置為各算法在50次內(nèi)效果最好時的迭代次數(shù)。五種神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)去噪器由多種不同的自然數(shù)據(jù)集訓(xùn)練得到[22-25]。實驗操作都是在Intel?CoreTMi7-8750HM、2.20 GHz CPU、16 GB內(nèi)存,NVIDIA GeForce GTX 1060 6 GB顯卡的PC上進(jìn)行,編程環(huán)境使用Python3.8,深度學(xué)習(xí)框架使用Pytorch。本文的主要實驗代碼、參數(shù)設(shè)置和結(jié)果可以從網(wǎng)站鏈接https://github.com/zj15001/PNP-PGD-CNC下載。

本文實驗結(jié)果由兩方面進(jìn)行呈現(xiàn),第一方面是視覺效果圖像對比,第二方面是數(shù)值結(jié)果比較。

為了從視覺效果上直觀的評價重構(gòu)效果,本文分別給出了表1中不同算法的重構(gòu)效果圖,以及重構(gòu)后效果圖與待重構(gòu)核磁共振圖像的差值圖像。為方便更好地顯示差異,選取圖像的兩個局部細(xì)節(jié)進(jìn)行放大顯示,并將差值圖像的灰度值取值范圍設(shè)置為0~0.2。

數(shù)值結(jié)果比較采用峰值信噪比(PSNR)的數(shù)值大小來作為評價核磁共振圖像重構(gòu)效果的重要指標(biāo),其定義如下:

4.2 實驗結(jié)果分析

首先,采用隨機采樣模板對大腦圖像進(jìn)行采樣后加噪聲,再運用表1中的四種算法進(jìn)行圖像重構(gòu),具體重構(gòu)圖像和差值圖像如圖2所示。其中,每張子圖的第一排為重構(gòu)圖像,第二排為重構(gòu)圖像與待重構(gòu)圖像的差值圖像,每排下方的兩個小圖則是將兩個局部細(xì)節(jié)進(jìn)行放大顯示;PnP-PGD-L1和PnP-PGD-CNC算法的重構(gòu)結(jié)果中顯示了部分去噪器(BM3D、FFDNet、IRCNN、DRUNet)的重構(gòu)圖像和差值圖像。

由圖2中各算法的重構(gòu)圖像及其差值圖像的對比可以看出,PGD-L1算法的重構(gòu)效果最差,圖像分辨率較低,保留了較少的邊緣和細(xì)節(jié)信息。PnP-PGD-L1和PGD-CNC算法相較PGD-L1算法都有不同程度的性能提升。本文提出的PnP-PGD-CNC算法整體要比其他算法的重構(gòu)效果更好,其中效果最好的是采用了DRUNet去噪器的圖2(j)。其左上角方框中的邊緣線條和紋路更加清晰,右下角方框中的棱角部分更加分明,保留了更好的邊緣輪廓信息,且差值圖的顏色明顯變深,表明了重構(gòu)圖像與原始圖像的一致性較高。從數(shù)值結(jié)果來看,PGD-L1算法的重構(gòu)圖像(圖2(a))峰值信噪比為23.78 dB,而在PnP-PGD-CNC框架下使用DRUNet去噪器的重構(gòu)圖像(圖2(j))峰值信噪比為31.60 dB,顯然PnP-PGD-CNC的視覺效果和數(shù)值結(jié)果更好。

最后,表3給出對于不同圖像使用不同算法進(jìn)行圖像重構(gòu)的數(shù)值比較結(jié)果。實驗數(shù)據(jù)表明,對于本文給出的三種不同采樣模板,PnP-PGD-L1算法和PGD-CNC算法的重構(gòu)效果都要明顯高于PGD-L1算法,分別突出了即插即用算法和凸-非凸稀疏正則的有效性。同時對比PnP-PGD-L1算法和PnP-PGD-CNC算法中使用不同去噪器時,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)去噪器的重構(gòu)效果要優(yōu)于其他去噪器,能夠得到更高的峰值信噪比值,其中峰值信噪比值最高的是選用DRUNet去噪器。當(dāng)PnP-PGD-CNC算法選用DRUNet去噪器時,較PGD-L1算法峰值信噪比值平均提升了6.26 dB。同時從PSNR值的大小也可以看出PnP-PGD-CNC算法的重構(gòu)效果明顯優(yōu)于ADMMNet和BM3D-MRI算法。

表3 圖像重構(gòu)的峰值信噪比值Table 3 Peak signal-to-noise ratio of image reconstruction 單位:dB

5 結(jié)束語

本文提出了一種基于凸-非凸稀疏正則和即插即用近似點梯度下降的核磁共振圖像重構(gòu)算法,主要有以下特點:

(1)該算法是基于凸-非凸稀疏正則的,可以保證目標(biāo)函數(shù)的整體凸性,并且能夠準(zhǔn)確地估計高振幅分量。本文給出了該正則項的近似點算子的迭代解形式,這為之后基于凸-非凸稀疏正則的優(yōu)化問題的計算提供了便利。

(2)該算法中融入的即插即用算法,是將傳統(tǒng)優(yōu)化算法與深度學(xué)習(xí)相結(jié)合,與傳統(tǒng)圖像重構(gòu)方法不同,它可以通過去噪器隱式定義即插即用先驗。該框架具有足夠的靈活性,可以與各種最先進(jìn)的去噪器兼容。同時可以從理論上保證算法的收斂性,體現(xiàn)出其便捷、高效等優(yōu)點。

為驗證本文所提算法的有效性,與另外幾種算法的重構(gòu)結(jié)果進(jìn)行比較。從視覺效果圖像和數(shù)值(PSNR)結(jié)果比較都可以得出:本文所提算法對邊緣輪廓和細(xì)小紋理的處理具有較為顯著的性能提升,并且可以得到更高的峰值信噪比。

進(jìn)一步的工作研究主要分為三方面:一是將繼續(xù)探究本文所提出算法的收斂性理論證明;二是考慮設(shè)計更為高效的基于深度學(xué)習(xí)的去噪器,以達(dá)到更好的去噪效果;三是將凸-非凸稀疏正則和即插即用算法融入到其他的凸優(yōu)化算法進(jìn)行圖像重構(gòu)的研究。

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