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煙草甲氣味受體基因的鑒定和組織表達(dá)譜

2022-12-20 05:58:16王桂瑤楊萌萌常延斌苗晨琳趙國(guó)慶李玉娥宋紀(jì)真
煙草科技 2022年11期
關(guān)鍵詞:煙草

王桂瑤,楊萌萌,常延斌,許 強(qiáng),苗晨琳,趙國(guó)慶,李玉娥,宋紀(jì)真*

1. 中國(guó)煙草總公司鄭州煙草研究院,鄭州高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開發(fā)區(qū)楓楊街2 號(hào) 450001

2. 江蘇中煙工業(yè)有限責(zé)任公司,南京市建鄴區(qū)興隆大街29 號(hào) 210000

3. 吉林煙草工業(yè)有限責(zé)任公司,長(zhǎng)春市經(jīng)開區(qū)世紀(jì)大街99 號(hào) 130022

煙草甲Lasioderma serricorne(Fabricius)屬鞘翅目(Coleoptera)竊蠹科(Anobiidae),是世界性倉(cāng)儲(chǔ)害蟲,具有食性雜、繁殖力強(qiáng)和分布范圍廣的特點(diǎn),主要為害貯藏的煙葉及煙草制品、糧食和中草藥等[1-2]。已有調(diào)查表明煙草甲為害給卷煙企業(yè)造成的直接損失率約為0.215%[3],每年給國(guó)家?guī)砭薮蟮慕?jīng)濟(jì)損失。目前,磷化鋁熏蒸是防治煙草甲的主要手段,但長(zhǎng)期應(yīng)用化學(xué)防治已引起害蟲抗藥性和環(huán)境污染等問題[2,4-5]。嗅覺對(duì)昆蟲搜尋食物、尋找配偶和產(chǎn)卵等至關(guān)重要[6]。隨著分子生物學(xué)和基因組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,可利用昆蟲嗅覺基因高通量篩選對(duì)昆蟲嗅覺行為具有調(diào)節(jié)作用的小分子化合物來開發(fā)昆蟲行為調(diào)節(jié)劑,此方法相比使用昆蟲嗅覺儀篩選昆蟲行為調(diào)控劑的傳統(tǒng)方法[7-10]效率更高,對(duì)于煙草甲的綠色防控具有重要意義。

昆蟲氣味受體是具有反向拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(N 端位于細(xì)胞內(nèi),C 端位于細(xì)胞外)的G 蛋白偶聯(lián)受體[11],能夠特異性地識(shí)別氣味分子,是昆蟲嗅覺感受中最關(guān)鍵的嗅覺蛋白[11-13]。通過鑒定昆蟲氣味受體基因,進(jìn)而研究氣味受體基因功能,可以解釋昆蟲行為產(chǎn)生的分子基礎(chǔ),有助于昆蟲行為調(diào)控劑的開發(fā)[13-14]。已有研究表明,昆蟲氣味受體主要分為兩種:一種是傳統(tǒng)氣味受體(ORx),它們?cè)诓煌ハx間同源性較低且數(shù)量各異[15];另一種是氣味受體輔助受體Orco(Odorant receptor co-receptor),每種昆蟲只有1個(gè),在不同昆蟲間保守,能夠與ORx 形成配體門控性離子通道(異源二聚體)[12]。例如,利用星天牛(Anoplophora chinensis)觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),Wang 等[16]鑒定出43 個(gè)ORs基因和1 個(gè)Orco基因。Cheng 等[17]從黃野螟(Heortia vitessoides)觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中鑒定出27 個(gè)ORs基因和1 個(gè)Orco基因。在煙草甲中,Wang 等[18]對(duì)煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測(cè)序分析,鑒定出14 個(gè)氣味結(jié)合蛋白、5 個(gè)化學(xué)感受蛋白和2 個(gè)Niemann-Pick C2 蛋白。然而,目前有關(guān)煙草甲氣味受體基因的鑒定研究還鮮見報(bào)道。因此,基于煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)手段挖掘鑒定氣味受體基因,并分析煙草甲氣味受體與其他鞘翅目昆蟲氣味受體之間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系,進(jìn)而通過熒光定量PCR 分析氣味受體基因在煙草甲雌蟲和雄蟲觸角中的相對(duì)表達(dá)量,旨在增加對(duì)煙草甲嗅覺感受系統(tǒng)的認(rèn)識(shí),一方面為煙草甲氣味受體的功能研究奠定基礎(chǔ),另一方面為煙草甲行為調(diào)控劑的開發(fā)提供理論依據(jù),從而加快引誘劑和趨避劑等行為調(diào)控劑在煙草甲綠色防控中的應(yīng)用步伐。

1 材料與方法

1.1 供試蟲源和組織解剖

煙草甲從中國(guó)煙草總公司鄭州煙草研究院貯存的原煙上采集并在培養(yǎng)箱內(nèi)用人工飼料(全麥粉和燕麥粉的質(zhì)量比為7∶3)飼養(yǎng)多代。培養(yǎng)箱的溫度為29 ℃±1 ℃,相對(duì)濕度為75%±5%,光照條件為全暗。剛羽化的煙草甲被分成雌蟲和雄蟲,收集大約500 對(duì)羽化2 d 的煙草甲成蟲用來解剖其觸角、腹部和足[19-20]。解剖的組織樣品液氮冷凍后保存在-80 ℃冰箱中備用。

1.2 煙草甲ORs基因的挖掘

實(shí)驗(yàn)室前期通過高通量測(cè)序構(gòu)建了煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,利用關(guān)鍵詞odorant receptor 對(duì)轉(zhuǎn)錄組注釋結(jié)果進(jìn)行搜索。基因的開放閱讀框通過網(wǎng) 站https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/進(jìn) 行 預(yù)測(cè)。搜索到的序列在NCBI(National Center for Biotechnology Information)的Nr 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLASTX 分析,從而確認(rèn)序列注釋的正確性。

1.3 煙草甲ORs基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析

選擇煙草甲的9 個(gè)氣味受體的氨基酸序列,與下載自NCBI 數(shù)據(jù)庫的暗黑鰓金龜(Holotrichia parallela)、綠豆象(Callosobruchus chinensis)、光肩星天 牛(Anoplophora glabripennis)和 赤 擬 谷 盜(Tribolium castaneum)等鞘翅目昆蟲氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。利用Clustal Omega(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/)對(duì)這些嗅覺基因進(jìn)行多序列聯(lián)配。使用最大似然法,在MEGA 7(JTT model,1 000 bootstrap)中 構(gòu) 建 系 統(tǒng) 進(jìn) 化樹。使用Figtree 1.4.0 軟件對(duì)進(jìn)化樹進(jìn)行可視化編輯。

1.4 煙草甲ORs基因的組織表達(dá)譜分析

利用Trizol 試劑(南京諾唯贊生物科技股份有限公司)提取煙草甲雌雄蟲觸角、腹部和足的總RNA。利用Nanodrop 微量核酸蛋白檢測(cè)儀(美國(guó)賽默飛公司)測(cè)定RNA 濃度。利用熒光定量PCR反轉(zhuǎn)錄試劑盒(南京諾唯贊生物科技股份有限公司)反轉(zhuǎn)錄1 μg RNA 為cDNA。以煙草甲的18SrRNA 和RPS15基因?yàn)閮?nèi)參基因,在線設(shè)計(jì)(http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0yi/)所有基因的引物,引物序列見表1。用Light Cycler 480 II 熒光定量PCR 儀(瑞士羅氏公司)進(jìn)行擴(kuò)增,使用SYBR 熒光定量專用染料(南京諾唯贊生物科技股份有限公司),PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性30 s;95 ℃變性5 s,60 ℃退火和延伸共30 s,40 個(gè)循環(huán);95 ℃15 s,60 ℃60 s,95 ℃15 s 形成融解曲線,通過融解曲線判斷引物的特異性。利用2-ΔΔCt方法計(jì)算ORs基因在煙草甲雌蟲和雄蟲觸角、腹部和足中的相對(duì)表達(dá)量,以足為對(duì)照,RPS15基因?yàn)閮?nèi)參基因,進(jìn)行3 次生物學(xué)重復(fù)。用DPS 19.05 軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行ANOVA(One-way Analysis of Variance)方差分析,利用LSD(Least Significant Difference)法對(duì)差異顯著性(P<0.05)進(jìn)行檢驗(yàn)。

表1 熒光定量PCR 使用的引物Tab.1 Primers for qRT-PCR

2 結(jié)果與分析

2.1 煙草甲ORs基因的挖掘

基于煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),共鑒定出9 個(gè)ORs基因(LserOR1 ~LserOR8,LserOrco)(表2)。這些ORs基因序列具有完整的開放閱讀框,氨基酸長(zhǎng)度范圍為132 ~479 個(gè)氨基酸。煙草甲ORs基因在NCBI 進(jìn)行BLASTX 比對(duì)的結(jié)果顯示,煙草甲的Orco 序列與光肩星天牛的Orco 序列相似度最高(78.29%),而煙草甲其他的ORs 序列與其他昆蟲ORs 的匹配度為24.06% ~55.36%。

表2 煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中鑒定的氣味受體基因Tab.2 OR genes identified in antennal transcriptome data of L. serricorne

2.2 煙草甲ORs基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析

系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果(圖1)表明,煙草甲的LserOR6 與光肩星天牛AglaOR22 聚在同一個(gè)分支,表明它們之間進(jìn)化關(guān)系更接近。另外,煙草甲的LserOrco 與綠豆象等其他鞘翅目昆蟲的Orco 也聚在同一個(gè)分支。

圖1 不同鞘翅目昆蟲氣味受體蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.1 Phylogenetic analysis of ORs from various coleopteran insects

2.3 煙草甲ORs基因的組織表達(dá)譜分析

實(shí)時(shí)熒光定量PCR 結(jié)果顯示,兩個(gè)LserORs基因(LserOR5和LserOrco)在煙草甲雌蟲和雄蟲觸角中表達(dá)量相對(duì)較高,是對(duì)照轉(zhuǎn)錄本量的3~5 倍(圖2)。其中,LserOR5在雄蟲觸角中的表達(dá)量顯著高于雌蟲,而LserOrco在雌蟲和雄蟲觸角中的表達(dá)量無顯著差異。另外,LserOR1和LserOR4在雄蟲觸角中表達(dá)量是對(duì)照的1.7 倍,而其他氣味受體基因(LserOR2~LserOR3,LserOR6~LserOR8)在觸角和腹部低表達(dá)。

圖2 煙草甲氣味受體基因在雌雄蟲的組織表達(dá)譜Fig.2 Tissue expression profiles of L. serricorne OR genes

3 討論

目前,研究人員已經(jīng)在多種鞘翅目昆蟲中發(fā)現(xiàn)了ORs基因[21]。本研究中從煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組中共鑒定出9 個(gè)ORs基因,相比星天牛(44 個(gè)ORs)[16]和甘薯小象鼻蟲(Cylas formicarius)(54 個(gè)ORs)[22]較少。在不同昆蟲中鑒定出的ORs基因數(shù)目各異,一方面可能是由于昆蟲本身的生理學(xué)差異[23],另一方面可能是昆蟲在特定條件下表達(dá)的基因數(shù)目有限,因?yàn)檗D(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)呈現(xiàn)的只是特定時(shí)間細(xì)胞中表達(dá)的嗅覺基因,而缺少一些低豐度或不表達(dá)的氣味受體基因[24]。下一步可通過煙草甲全基因組測(cè)序,更全面地揭示煙草甲氣味受體基因信息[25]。

本研究中,煙草甲的ORs 與其他昆蟲的ORs 相似度為24% ~55%,這與黑肩綠盲蝽(Cyrtorhinus lividipennis)(28% ~77%)[26]等其他昆蟲的研究結(jié)果具有一致性,表明ORs在不同昆蟲間同源性較低,可能與不同昆蟲具有不同的氣味偏好有關(guān)[12-13]。氣味受體蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,煙草甲與其他鞘翅目昆蟲的Orco 聚在一起,這與甘薯小象鼻蟲Orco 蛋白聚類分析結(jié)果一致[22],進(jìn)一步說明Orco序列在不同昆蟲間的保守性。另外,煙草甲的LserOR6 與光肩星天牛AglaOR22 聚在同一個(gè)分支,說明它們?cè)谶M(jìn)化上具有相似性[26-27]。

煙草甲LserOR5和LserOrco基因在觸角中表達(dá)量相對(duì)較高,已有研究表明昆蟲觸角中一些高表達(dá)的ORs和Orco基因與感受植物揮發(fā)物和昆蟲性信息素密切相關(guān)[28-29]。例如,暗黑鰓金龜觸角中特異性表達(dá)的氣味受體HparOR27 能夠感受3 種植物揮發(fā)物[29]。利用RNAi 技術(shù)降低Orco基因在黑肩綠盲蝽[26]和紅棕象甲(Rhynchophorus ferrugineus)[30]觸角中的表達(dá)量,可以使這些昆蟲對(duì)植物揮發(fā)物等多種氣味的敏感性下降。在煙草甲中,LserOR5和LserOrco識(shí)別氣味分子的功能有待通過蛋白體外表達(dá)和RNAi等技術(shù)進(jìn)一步研究。另外,本研究中發(fā)現(xiàn)一些氣味受體基因(LserOR2~LserOR3,LserOR6~LserOR8)在煙草甲成蟲觸角和腹部低表達(dá),這可能是由于這些基因在煙草甲其他生長(zhǎng)發(fā)育階段高表達(dá)或具有其他生理功能[13,21],仍需進(jìn)一步研究。

4 結(jié)論

基于煙草甲觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),共鑒定出9 個(gè)ORs基因(LerOR1~LerOR8,LserOrco)。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,煙草甲的LserOR6 與光肩星天牛AglaOR22 聚在同一個(gè)分支,它們的進(jìn)化關(guān)系更接近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR 結(jié)果顯示,煙草甲的兩個(gè)氣味受體基因(LserOR5和LserOrco)在觸角中表達(dá)量相對(duì)較高。上述結(jié)果可為煙草甲氣味受體基因的功能研究奠定基礎(chǔ),從而促進(jìn)其引誘劑和趨避劑等行為調(diào)控劑的開發(fā)。

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