劉曉暉 何 勇 符奉川 鐘小薇
1.海口市第三人民醫院外科 (海南 海口, 571100) 2.海口市第三人民醫院檢驗科
肝癌是常見的惡性腫瘤,其發病率呈增長趨勢[1]。紫杉醇是目前較為常用的抗肝癌藥物,但長期使用易引起肝癌耐藥性,改善肝癌紫杉醇耐藥性是當前研究的重要課題。環狀RNA(circRNA)和微小RNA(miRNA)是兩類非編碼RNA,參與調控腫瘤細胞惡性行為及耐藥性[2,3]。circNOLC1是近年來新發現的一種circRNA,調控多種腫瘤的發展進程。研究顯示,circNOLC1在前列腺癌組織和細胞中過表達,其可通過靶向結合miR-647上調 PAQR4表達促進前列腺癌細胞增殖和遷移,circNOLC1可能是前列腺癌治療的潛在靶點[4]。circNOLC1在上皮性卵巢癌(EOC)組織中的表達高于正常組織,且其高表達與FIGO分期和腫瘤分化程度密切相關,circNOLC1可能通過結合ESRP1并調節CDK1和RhoA表達來促進EOC的發生和發展[5]。Starbase靶基因在線軟件預測顯示,circNOLC1可能靶向結合miR-485-5p。研究顯示,miR-485-5p在肝癌中表達下調,上調miR-485-5p可削弱肝癌細胞的增殖、侵襲和遷移能力,miR-485-5p可能為肝癌的治療提供了新靶點[6]。本研究主要觀察了circNOLC1和miR-485-5p對紫杉醇耐藥肝癌細胞增殖、遷移和侵襲的影響及circNOLC1能否靶向miR-485-5p發揮作用,以期為改善肝癌紫杉醇耐藥性提供分子靶點。
1.1 細胞和試劑 HCCLM3細胞系購自中國科學院上海細胞庫;RNA抽提試劑盒、逆轉錄試劑盒和PCR試劑盒購自大連寶生物;RPMI 1640培養基、LipofectamineTM 2000試劑盒、Annexin V-FITC/PI試劑盒、BCA蛋白檢測試劑盒和雙熒光素酶活性檢測試劑盒購自北京索萊寶;胎牛血清(FBS)購自杭州四季青;PCR引物、si-circNOLC1、si-NC、miR-485-5p mimics、miR-NC、anti-miR-485-5p、anti-miR-NC及circNOLC1野生型和突變型熒光素酶載體(WT-circNOLC1、MUT-circNOLC1)購自上海生工;蛋白質印跡實驗所需抗體購自中國Abcam公司。
1.2 方法
1.2.1 紫杉醇耐藥肝癌細胞的建立 用含10% FBS的RPMI 1640培養液培養HCCLM3細胞。參照文獻[7]采用濃度梯度間歇刺激法誘導HCCLM3細胞,獲得紫杉醇耐藥的細胞HCCLM3/Tax。具體方法如下:取對數期HCCLM3細胞,加含0.05 μmol/L紫杉醇和10% FBS的RPMI 1640培養液培養24 h。棄培養液,用磷酸鹽緩沖液(PBS)清洗細胞,重新加含10% FBS的RPMI 1640培養液培養24 h,待細胞生長密度至90%時,傳代培養。再次用含0.05 μmol/L紫杉醇和10% FBS的RPMI 1640培養液培養24 h,如此反復換液、傳代。然后依次用含0.1 、0.15、0.20 μmol/L紫杉醇的培養液干預,每個濃度重復3次,最后獲得紫杉醇耐藥的人肝癌細胞HCCLM3/Tax。HCCLM3/Tax細胞一直用含低濃度(0.02 μmol/L)紫杉醇的培養液中培養。
1.2.2 紫杉醇對HCCLM3、HCCLM3/Tax的半數抑制濃度 將HCCLM3、HCCLM3/Tax均接種至96孔板中(2.5×104個/孔),分別用含0、0.08、0.16、0.32、0.64、1.28、2.56 μmol/L[7]紫杉醇的培養液培養24 h,加10 μl CCK-8。孵育2 h,酶標儀測光密度(OD)值。細胞增殖抑制率(%)=(OD對照組-OD實驗組)/OD對照組×100%。采用GraphPad Prism 7軟件計算紫杉醇對HCCLM3、HCCLM3/Tax的半數抑制濃度(IC50值)。
1.2.3 RT-qPCR檢測circNOLC1和miR-485-5p表達 將HCCLM3、HCCLM3/Tax均接種至6孔板中(1.0×105個/孔),常規培養液培養24 h后,用RNA抽提試劑盒提取細胞中總RNA,逆轉錄為cDNA后,行PCR擴增。引物序列:circNOLC1:上游5'-GTACGATAGGCTCGATCGTAC-3',下游5'-CGTCTCTGAGGCTAGCC-3';GAPDH:上游5'-AGAGGCAGGGATGATGTTCTG-3',下游5'-GACTCATGACCACAGTCCAT GC-3′;miR-485-5p:上游5'-CCAAGCTTCACCCATTCCTAACAGGAC-3',下游5'-CGGGATCC GTAGGTCAGTTACATGCATC-3';U6:上游5'-TGCGGGTGCTCGCTTCGGCAGC-3',下游5'-CCAGTGCAGGGTCCGAGGT-3'。2-△△Ct法計算circNOLC1相對GAPDH、miR-485-5p相對U6的表達量。
1.2.4 細胞轉染 將HCCLM3/Tax細胞接種至6孔板中(1.0×105個/孔),用含10% FBS的RPMI 1640培養液培養24 h后,棄培養液,換為不含FBS的RPMI 1640培養液。用LipofectamineTM 2000脂質體法,分別轉染si-NC、si-circNOLC1、miR-NC、miR-485-5p mimics、共轉染si-circNOLC1與anti-miR-NC、si-circNOLC1與anti-miR-485-5p。轉染12 h后,棄培養液,重新加含10% FBS的RPMI 1640培養液。培養24 h后,RT-qPCR法檢測細胞中circNOLC1或miR-485-5p表達驗證轉染效果,方法同1.2.3,并收集細胞用于后續實驗。
1.2.5 CCK-8法檢測細胞增殖抑制率 取96孔板,接種轉染si-NC、si-circNOLC1、miR-NC、miR-485-5p mimics、共轉染si-circNOLC1與anti-miR-NC、si-circNOLC1與anti-miR-485-5p后的HCCLM3/Tax細胞(2.5×104個/孔),用含0.16 μmol/L紫杉醇的培養液培養24 h,依次標記為Tax+si-NC組、Tax+si-circNOLC1組、Tax+miR-NC組、Tax+miR-485-5p 組、Tax+si-circNOLC1+anti-miR-NC組、Tax+si-circNOLC1+anti-miR-485-5p組。加10 μl CCK-8,孵育2 h,酶標儀測光密度(OD)值。細胞增殖抑制率(%)=(OD對照組-OD實驗組)/OD對照組×100%。
1.2.6 克隆形成實驗檢測細胞克隆形成能力 取6孔板,接種轉染后的HCCLM3/Tax細胞(1.0×105個/孔),用含0.16 μmol/L紫杉醇的培養液培養,并按照上述1.2.5標記分組。每2天更換一次培養液,培養10~14 d后,棄培養液。用4%多聚甲醛固定30 min,0.4%結晶紫染色15 min,顯微鏡觀察并統計細胞克隆數。
1.2.7 劃痕實驗檢測細胞遷移 取6孔板,接種轉染后的HCCLM3/Tax細胞(1.0×105個/孔),用常規培養液培養12 h后,棄培養液。用200 μl移液器槍頭在培養板底部劃兩條平行線,并PBS除去劃痕間細胞,測量劃痕間距(d),記為d0 h。然后用含0.16 μmol/L紫杉醇的培養液培養24 h,并按照上述1.2.5標記分組。棄培養液,再次測量細胞間間距,記為d24 h。劃痕愈合率(%)=(d0 h-d24 h)/d0 h×100%。
1.2.8 Transwell實驗檢測細胞侵襲 取6孔板,接種轉染后的HCCLM3/Tax細胞(1.0×105個/孔),用含0.16 μmol/L紫杉醇的培養液培養24 h,并按照上述1.2.5標記分組。培養后,收集各組細胞,并調整密度為1.0×105個/ml。將Transwell小室上室鋪Matrigel基質膠,自然晾干后,加100 μl各組細胞懸液,另取500 μl培養液加至Transwell下室。培養24 h后,棄培養液,用多聚甲醛固定,結晶紫染色,顯微鏡觀察,隨機取5個視野,記數。
1.2.9 蛋白質印跡法檢測MMP-2和MMP-9蛋白表達 取6孔板,接種轉染后的HCCLM3/Tax細胞(1.0×105個/孔),用含0.16 μmol/L紫杉醇的培養液培養24 h,并按照上述1.2.5標記分組。培養后,用RIPA試劑提取細胞中總蛋白。經BCA法測蛋白濃度、SDS-PAGE電泳、轉膜和封閉后,于4℃冰箱中分別用MMP-2(1∶500)、MMP-9(1∶500)和GAPDH(1∶1 000)一抗孵育過夜。洗膜后,再于37℃搖床中用山羊抗兔二抗(1∶2 000)孵育2 h。最后加顯影液,避光顯影,曝光拍照,Image J軟件分析MMP-2、MMP-9相對GAPDH的表達量。
1.2.10 雙熒光素酶報告基因實驗 取6孔板,接種HCCLM3/Tax細胞(1.0×105個/孔),用含10 % FBS的RPMI 1640培養液培養24 h后,棄培養液,換為不含FBS的RPMI 1640培養液。用LipofectamineTM 2000脂質體法,分別共轉染WT-circNOLC1與miR-485-5p mimics或miR-NC、MUT-circNOLC1與miR-485-5p mimic或miR-NC。轉染12 h后,更換為含10% FBS的RPMI 1640培養液。再培養24 h,棄培養液。加細胞裂解液,充分裂解后,離心(3 500 r/min、5 min)。取上清液,檢測熒光素酶活性,結果以螢火蟲與海腎的熒光強度比值表示。

2.1 紫杉醇對HCCLM3細胞和HCCLM3/Tax細胞抑制率的影響 紫杉醇對HCCLM3、HCCLM3/Tax細胞的抑制率隨著其濃度的增加逐漸升高。與HCCLM3細胞比較,相同濃度的紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞的抑制率降低(P<0.05)。紫杉醇對HCCLM3、HCCLM3/Tax細胞的IC50值分別為(0.40±0.06)μmol/L、(2.71±0.37)μmol/L。見表1。

表1 紫杉醇對HCCLM3細胞和HCCLM3/Tax細胞抑制率的影響
2.2 circNOLC1和miR-485-5p在HCCLM3和HCCLM3/Tax細胞中的表達 與HCCLM3細胞比較,HCCLM3/Tax細胞中circNOLC1的表達升高(P<0.05),而miR-485-5p的表達降低(P<0.05)。見表2。

表2 circNOLC1和miR-485-5p在HCCLM3細胞和HCCLM3/Tax細胞中的表達
2.3 敲減circNOLC1聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞增殖、遷移和侵襲的影響 與轉染si-NC的HCCLM3/Tax細胞比較,轉染si-circNOLC1的HCCLM3/Tax細胞中circNOLC1的表達量顯著降低(0.18±0.03比1.00±0.00,t=82.000,P<0.05)。與Tax+si-NC組比較,Tax+si-circNOLC1組HCCLM3/Tax細胞抑制率升高(P<0.05),克隆形成數、劃痕愈合率和侵襲數均降低(P<0.05),遷移和侵襲相關蛋白MMP-2和MMP-9表達降低(P<0.05)。見圖1、表3。

表3 敲減circNOLC1聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞增殖、遷移和侵襲的影響

圖1 敲減circNOLC1聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞中MMP-2和MMP-9蛋白表達的影響
2.4 過表達miR-485-5p聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞增殖、遷移和侵襲的影響 與轉染miR-NC的HCCLM3/Tax細胞比較,轉染miR-485-5p mimics的HCCLM3/Tax細胞中miR-485-5p的表達量顯著升高(2.99±0.23比1.00±0.00,t=25.957,P<0.05)。與Tax+miR-NC組比較,Tax+miR-485-5p組HCCLM3/Tax細胞抑制率升高(P<0.05),克隆形成數、劃痕愈合率和侵襲數均降低(P<0.05),遷移和侵襲相關蛋白MMP-2和MMP-9表達降低(P<0.05)。見圖2,表4。

表4 過表達miR-485-5p聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞增殖、遷移和侵襲的影響

圖2 過表達miR-485-5p聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞中MMP-2和MMP-9蛋白表達的影響
2.5 circNOLC1靶向調控miR-485-5p的表達 StarBase靶基因在線軟件預測顯示的circNOLC1與miR-485-5p的結合位點見圖3。共轉染WT-circNOLC1與miR-485-5p mimics的HCCLM3/Tax細胞熒光素酶活性顯著低于共轉染WT-circNOLC1與miR-NC的細胞(P<0.05),而共轉染MUT-circNOLC1與miR-485-5p mimics的HCCLM3/Tax細胞熒光素酶活性與共轉染MUT-circNOLC1與miR-NC的細胞比較差異無統計學意義(P>0.05),見表5。與轉染si-NC的HCCLM3/Tax細胞比較,轉染si-circNOLC1的HCCLM3/Tax細胞中miR-485-5p的表達量顯著升高(3.11±0.26比1.00±0.00,t=24.346,P<0.05)。

圖3 circNOLC1的序列中含有與miR-485-5p互補的核苷酸序列

表5 雙熒光素酶報告實驗
2.6 干擾miR-485-5p逆轉敲減circNOLC1聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞增殖、遷移和侵襲的作用 與共轉染si-circNOLC1與anti-miR-NC的HCCLM3/Tax細胞比較,共轉染si-circNOLC1與anti-miR-485-5p的HCCLM3/Tax細胞中miR-485-5p的表達量顯著降低(0.35±0.04比1.00±0.00,t=48.750,P<0.05)。與Tax+si-circNOLC1+anti-miR-NC組比較,Tax+si-circNOLC1+anti-miR-485-5p組HCCLM3/Tax細胞抑制率降低(P<0.05),克隆形成數、劃痕愈合率和侵襲數均升高(P<0.05),MMP-2和MMP-9蛋白表達升高(P<0.05)。見圖4,表6。

表6 干擾miR-485-5p逆轉敲減circNOLC1聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞增殖、遷移和侵襲的作用

圖4 干擾miR-485-5p逆轉敲減circNOLC1聯合紫杉醇對HCCLM3/Tax細胞中MMP-2和MMP-9蛋白表達的作用
circRNA是一種呈閉合環狀的非編碼RNA,其可發揮miRNA分子海綿作用影響miRNA靶基因的表達,進而發揮生物學調控作用。近年來研究表明,circRNA參與調控腫瘤細胞對化療藥物紫杉醇的敏感性。circRNF111在紫杉醇抗性的乳腺癌組織和細胞中表達增加,敲低circRNF111可在體外抑制紫杉醇抗性的乳腺癌細胞生長、侵襲和糖酵解,其作用機制與靶向調控miR-140-5p/E2F3軸有關[8];circ_0002874的下調可通過調節miR1273f/MDM2/P53信號通路逆轉肺癌細胞對紫杉醇的耐藥性[9];circ_CELSR1在紫杉醇耐藥的卵巢癌組織和細胞中表達上調,其通過調節miR-149-5p/SIK2軸增強卵巢癌細胞對紫杉醇的耐藥性[10];circBIRC6在肝癌組織中表達上調,敲減circBIRC6可通過靶向上調miR-877-5p降低肝癌細胞對紫杉醇抗性軸[11]。這些參與調控腫瘤細胞對紫杉醇耐藥性的circRNA為改善腫瘤對紫杉醇的耐藥性提供了潛在分子靶點。
作為一種circRNA,目前對circNOLC1影響腫瘤發展的研究還很少見。本研究顯示,circNOLC1在紫杉醇耐藥肝癌細胞中呈高表達,敲減circNOLC1可阻礙紫杉醇處理的紫杉醇耐藥肝癌細胞增殖、遷移和侵襲,提示circNOLC1可作為逆轉紫杉醇耐藥肝癌細胞對紫杉醇耐藥性的分子靶點。細胞遷移和侵襲受多種基因分子和信號通路的調控,其中MMP-2和MMP-9屬于基質金屬蛋白酶家族成員,表達增加使促進細胞外基質的降解,進而促進細胞遷移和侵襲[12]。本研究顯示,敲減circNOLC1可降低紫杉醇處理的紫杉醇耐藥肝癌細胞中MMP-2和MMP-9的蛋白表達,提示敲減circNOLC1可能通過調控MMP-2和MMP-9表達來抑制紫杉醇處理的紫杉醇耐藥肝癌細胞遷移和侵襲。
為了進一步探究敲減circNOLC1降低紫杉醇耐藥肝癌細胞對紫杉醇的耐藥性的分子機制,本研究證實了circNOLC1可靶向結合miR-485-5p,且敲減circNOLC1能夠促進紫杉醇耐藥肝癌細胞中miR-485-5p的表達,說明circNOLC1靶向結合并負調控miR-485-5p。miR-485-5p參與調控多種腫瘤的惡性表型,與腫瘤發展密切相關。研究顯示,miR-485-5p在神經膠質瘤、肺腺癌、腎細胞癌、肝癌和乳腺癌等腫瘤中表達降低,上調其表達可抑制腫瘤細胞的惡性行為,進而阻礙腫瘤發展進程[13-17]。此外,miR-485-5p還影響腫瘤的放化療療效。研究顯示,miR-485-5p在順鉑耐藥的皮膚鱗狀細胞癌中表達下調,上調其表達可通過靶向抑制REV3L阻礙順鉑耐藥的皮膚鱗狀細胞癌增殖、遷移和侵襲,并降低細胞對順鉑的耐藥性[18];miR-485-5p表達的上調可通過靶向抑制FERMT1增強食管癌細胞的放射敏感性,miR-485-5p可作為改善食管癌放射抵抗的分子靶點[19]。本研究結果顯示,miR-485-5p在紫杉醇耐藥的肝癌細胞中表達降低,過表達miR-485-5p可降低紫杉醇處理的紫杉醇耐藥肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力,這說明過表達miR-485-5p增強了紫杉醇耐藥肝癌細胞對紫杉醇的敏感性,提示miR-485-5p可作為改善肝癌細胞紫杉醇耐藥性的分子靶點。同時,本研究還顯示,干擾miR-485-5p降低了敲減circNOLC1對紫杉醇處理的紫杉醇耐藥肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力的抑制作用,進一步提示敲減circNOLC1通過靶向上調miR-485-5p來降低紫杉醇耐藥肝癌細胞對紫杉醇的耐藥性。
綜上所述,circNOLC1在紫杉醇耐藥肝癌細胞中表達上調,而miR-485-5p表達下調;敲減circNOLC1可削弱紫杉醇處理的紫杉醇耐藥肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力,其作用機制可能與靶向上調細胞中miR-485-5p的表達有關,circNOLC1/miR-485-5p軸可能為改善肝癌紫杉醇耐藥性提供了分子靶點,但尚需在體內進行驗證。