倪兆林,左順武,劉紅雁,艾志瓊,農(nóng)璐銘,趙秋芳,吳 強(qiáng)*
(1.玉溪市疾病預(yù)防控制中心,云南玉溪 653100;2.大理大學(xué),云南大理 671000)
流感是由流感病毒引起的常見(jiàn)急性呼吸系統(tǒng)傳染病,其病毒抗原易發(fā)生轉(zhuǎn)化或漂移,而且受人群免疫水平以及環(huán)境與社會(huì)等因素影響,每年流感季節(jié)類型或優(yōu)勢(shì)毒株類型不同〔1〕,有研究報(bào)道大約60%的流感樣病例是由非流感病毒引起〔2〕,所以通過(guò)及時(shí)準(zhǔn)確的監(jiān)測(cè)能及早發(fā)現(xiàn)疫情,及時(shí)做出反應(yīng),避免可能的流行或大流行,降低流行的強(qiáng)度〔3〕。目前利用數(shù)學(xué)模型預(yù)測(cè)流感短期流行趨勢(shì)的報(bào)道很多,但預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)僅依賴于傳統(tǒng)的哨點(diǎn)醫(yī)院監(jiān)測(cè)來(lái)源以及社交網(wǎng)絡(luò)活動(dòng)和搜索查詢等數(shù)字監(jiān)測(cè)〔4〕,而這些資料由于本身受各種因素影響,用于預(yù)測(cè)流行趨勢(shì)難以做出準(zhǔn)確科學(xué)的評(píng)估?;诖?,本文通過(guò)分析玉溪市2010—2019 年流感核酸陽(yáng)性病例的流行特征及活動(dòng)規(guī)律,建立并使用自回歸綜合移動(dòng)平均模型(autoregressive integrated moving average model,ARIMA 模型)來(lái)估計(jì)流感未來(lái)活動(dòng)趨勢(shì),為公共衛(wèi)生專業(yè)人員加強(qiáng)防控措施提供參考。
1.1 資料來(lái)源選取2010 年1 月—2019 年12 月“中國(guó)疾病預(yù)防控制信息系統(tǒng)”中的子系統(tǒng)“中國(guó)流感監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)”玉溪市網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行研究。
1.2 病例定義采用《全國(guó)流感監(jiān)測(cè)方案(2017 年版)》流感樣病例定義標(biāo)準(zhǔn):發(fā)熱(腋下體溫≥38 ℃),伴咽痛或咳嗽癥狀之一。
1.3 樣本采集及實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)流感樣本采集由受過(guò)專業(yè)培訓(xùn)的哨點(diǎn)醫(yī)院護(hù)士全年采集符合流感樣病例定義且發(fā)病3 d 內(nèi)的標(biāo)本,監(jiān)測(cè)診室涵蓋兒科、內(nèi)科門(mén)、急診和發(fā)熱門(mén)診,于4 ℃條件下,48 h 內(nèi)送至玉溪市流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室,實(shí)驗(yàn)室收到標(biāo)本后立即開(kāi)展檢測(cè),如不能及時(shí)檢測(cè)則將標(biāo)本保存于-70 ℃冰箱。具體檢測(cè)流程為:從標(biāo)本提取核酸,用熒光RT-PCR 檢測(cè)流感病毒及相關(guān)亞型,完成檢測(cè)后,實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)結(jié)果于48 h 內(nèi)錄入“中國(guó)流感監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)”。
1.4 研究方法
1.4.1 描述性研究 采用描述流行病學(xué)方法對(duì)玉溪市2010—2019 年流感核酸陽(yáng)性病例流行現(xiàn)狀及變化趨勢(shì)進(jìn)行描述。
1.4.2 平均增長(zhǎng)速度(average increment speed,AIS)式中:xi為平均發(fā)展速度;an表示第n 年報(bào)告指標(biāo);a0表示基期指標(biāo);i 表示第1,2,3…n 年。
1.4.3 集中度值 集中度〔6〕是指月發(fā)病數(shù)與全年發(fā)病總數(shù)之比,是表示發(fā)病季節(jié)性強(qiáng)弱的指標(biāo)。
式中:r 表示某月流感發(fā)病數(shù)與全年發(fā)病數(shù)之比;R 表示離散程度;M 表示集中度:M=1.0,表示季節(jié)性極強(qiáng);0.9<M<1.0,表示有嚴(yán)格的季節(jié)性;0.7<M≤0.9,表示有很強(qiáng)的季節(jié)性;0.5<M≤0.7,表示有較強(qiáng)的季節(jié)性;0.3<M≤0.5,表示有一定的季節(jié)性;0.0<M≤0.3,表示季節(jié)性較差;M=0.0,表示無(wú)季節(jié)性,疾病在1 年內(nèi)均勻分布。
1.4.4 ARIMA 模型 采用SPSS 25.0 軟件中ARIMA 建模器對(duì)2010 年1 月—2019 年12 月收集的流感監(jiān)測(cè)資料建立模型并分析〔7〕。通過(guò)流感發(fā)病時(shí)間流行曲線和各參數(shù)反復(fù)驗(yàn)證,最終采用乘積季節(jié)模型,即ARIMA(p,d,q)×(P,D,Q)s。式中:p、q為自回歸和移動(dòng)平均階數(shù);P、Q 為季節(jié)性自回歸和移動(dòng)平均階數(shù);d 為平穩(wěn)化過(guò)程中差分的階數(shù);D 為季節(jié)差分階數(shù);S 為季節(jié)周期。通過(guò)數(shù)據(jù)平穩(wěn)化處理、模型識(shí)別、參數(shù)估計(jì)與檢驗(yàn)等步驟,探索建立模型。為驗(yàn)證該模型的預(yù)測(cè)能力,使用2010—2019 年的實(shí)際觀測(cè)數(shù)據(jù)和預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行模型擬合,評(píng)價(jià)模型預(yù)測(cè)效果。最后利用最優(yōu)模型預(yù)測(cè)2020 年1—6月流感發(fā)病趨勢(shì)。
1.5 統(tǒng)計(jì)分析通過(guò)Excel 2016 收集整理數(shù)據(jù),運(yùn)用SPSS 25.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析并建立ARIMA 模型,對(duì)各種率之間比較采用χ2檢驗(yàn),統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。
2.1 流感流行病學(xué)特征2010 年1 月—2019 年12 月,玉溪市流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室共檢測(cè)流感樣病例咽拭子標(biāo)本9 925 份,經(jīng)熒光RT-PCR 核酸檢測(cè)出2 849 份陽(yáng)性標(biāo)本,陽(yáng)性率28.71%,AIS 為2.01%,不同年度間流感陽(yáng)性率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=374.44,P<0.05)。在2 849 例流感陽(yáng)性病例中,A 型流感1 489 例(占52.26%),B 型流感1 360 例(占47.74%)。對(duì)A 型和B 型流感病毒進(jìn)行亞型分析后發(fā)現(xiàn),A/H1N1 pdm 占27.62%(787/2 849),A/H3N2 占24.64%(702/2 849),B/Yamagata 占18.22%(519/2 849),B/Victoria 占29.52%(841/2 849)。各年度優(yōu)勢(shì)流感病毒株逐年變化,2010 年和2018 年以A/H1N1 pdm 為主,分別占50.55%和62.87%;2011年和2012 年以B/Victoria 為主,分別占74.48%和60.00%;2013 年和2016 年以B/Yamagata 為主,分別占63.74%和47.55%;2015 年和2017 年以A/H3N2 為主,分別占45.14%和52.76%;2014 年以B/Yamagata 和A/H1N1 pdm 為主,分別占41.35%和37.50%;2019 年以B/Victoria 和A/H3N2 為主,分別占45.76%和33.95%。見(jiàn)表1。
在流感陽(yáng)性病例中,男性占55.46%(1 580/2 849),女性占44.54%(1 269/2 849),男女比為1.25∶1;5~14 歲兒童占比最高,占40.86%(1 164/2 849),占比最低為≥65 歲老年人,占5.37%(153/2 849)。流感陽(yáng)性病例集中度為0.60,各年度集中度范圍在0.52~0.76,說(shuō)明玉溪市流感陽(yáng)性病例分布有較強(qiáng)的季節(jié)性。見(jiàn)表1。

表1 玉溪市2010—2019 年流感病例人口學(xué)及病原學(xué)特征
2.2 ARIMA 模型
2.2.1 繪制序列圖及平穩(wěn)性分析 繪制2010 年1月—2019 年12 月玉溪市流感時(shí)間序列圖,見(jiàn)圖1。由圖1 可見(jiàn)玉溪市流感病例有明顯的季節(jié)性,以12個(gè)月為流行周期,集中度值法也證實(shí),該序列具有季節(jié)性波動(dòng)特點(diǎn),所以對(duì)原序列進(jìn)行一階季節(jié)差分,差分后的序列自相關(guān)函數(shù)(ACF)和偏自相關(guān)函數(shù)(PACF)無(wú)明顯截尾和拖尾現(xiàn)象,也不呈線性衰減趨勢(shì),差分后的時(shí)間序列圖接近平穩(wěn),對(duì)序列進(jìn)行白噪聲檢驗(yàn),P<0.001,說(shuō)明序列為非隨機(jī)性序列,可以對(duì)平穩(wěn)序列進(jìn)行建模且差分后序列適合時(shí)間序列模型。

圖1 玉溪市流感病例差分前后時(shí)序圖

圖2 ACF 和PACF 一階季節(jié)差分后的時(shí)間滯后圖
2.2.2 模型的參數(shù)估計(jì)和診斷 確定模型類型后,需要對(duì)各模型參數(shù)值進(jìn)行定階。根據(jù)序列季節(jié)性特征和平穩(wěn)化處理過(guò)程可以推導(dǎo)出d=0,D=1;根據(jù)ACF 和PACF 圖推導(dǎo)出p=1,q=0。季節(jié)模型P、Q 值則需要不斷探索嘗試,一般很少超過(guò)二階〔8〕,最后比較各組合模型的擬合優(yōu)度、殘差以及系數(shù)間的相關(guān)性等進(jìn)行檢驗(yàn)確定。見(jiàn)表2。模型ARIMA(1,0,0)(0,1,1)12的標(biāo)準(zhǔn)化BIC 值最小,平穩(wěn)R2=0.501,殘差序列的ACF 及PACF 均在95%置信區(qū)間內(nèi),Ljung-Box Q=21.258,P=0.169,為最優(yōu)模型。見(jiàn)圖3。

表2 玉溪市流感ARIMA 模型驗(yàn)證

圖3 模型ARIMA(1,0,0)(0,1,1)12 殘差序列ACF、PACF 圖
2.2.3 模型驗(yàn)證及預(yù)測(cè) 通過(guò)最優(yōu)模型ARIMA(1,0,0)(0,1,1)12對(duì)2010—2019 年的流感預(yù)測(cè)陽(yáng)性數(shù)進(jìn)行回代擬合,結(jié)果顯示,模型很好地?cái)M合了季節(jié)性波動(dòng),擬合值和實(shí)際值基本吻合,所有預(yù)測(cè)值都在95%置信區(qū)間,實(shí)際值和預(yù)測(cè)值之間的平均相對(duì)誤差為10.14%。見(jiàn)圖4。同時(shí)利用該模型對(duì)2020 年流行趨勢(shì)進(jìn)行預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),玉溪市2020 年1—6 月流感呈下降趨勢(shì)。

圖4 模型ARIMA(1,0,0)(0,1,1)12 預(yù)測(cè)值與實(shí)際值擬合的時(shí)間序列圖
2010—2019 年玉溪市流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)流感陽(yáng)性率為28.71%,高于重慶地區(qū)〔9〕監(jiān)測(cè)結(jié)果,其流感陽(yáng)性病例數(shù)大體上呈逐年上升趨勢(shì),AIS為2.01%,防控形勢(shì)十分嚴(yán)峻。流感陽(yáng)性病例的增多除部分反映流感活動(dòng)強(qiáng)度外,也與醫(yī)療機(jī)構(gòu)診斷、快檢和報(bào)告意識(shí)的提升有關(guān),而且2009 年甲型H1N1 流感大流行后玉溪市加強(qiáng)了對(duì)流感和不明原因肺炎報(bào)告的管理規(guī)范,每年2 次對(duì)轄區(qū)內(nèi)(市-縣-鄉(xiāng)-村)進(jìn)行流感等傳染病報(bào)告質(zhì)量抽查,各縣區(qū)每年4 次對(duì)轄區(qū)內(nèi)(縣-鄉(xiāng)-村)報(bào)告質(zhì)量進(jìn)行檢查,同時(shí)在2017 年后按照《全國(guó)流感監(jiān)測(cè)方案(2017 年版)》要求,各縣區(qū)增加了流感暴發(fā)疫情事件監(jiān)測(cè),要求各縣區(qū)按照突發(fā)公共衛(wèi)生事件處置流程上報(bào)流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)。玉溪市各年度流感陽(yáng)性病例集中度值在0.52~0.76 之間,說(shuō)明玉溪市流感陽(yáng)性病例具有較強(qiáng)的季節(jié)性,符合流感季節(jié)性特征〔10〕,而且陽(yáng)性病例主要集中在每年11 月至次年3 月,這與我國(guó)北方地區(qū)和云南省〔11〕流行特征一致,下一步將收集更多有關(guān)監(jiān)測(cè)信息綜合了解玉溪市的流感季節(jié)性特征、病原變異、耐藥性分析等。
玉溪市流感陽(yáng)性病例有明顯的年齡特征,研究結(jié)果顯示5~14 歲兒童占比最高(占40.86%),與Zhu 等〔12〕研究結(jié)果一致。為減少流感病毒引起的嚴(yán)重感染和并發(fā)癥風(fēng)險(xiǎn),一些地區(qū)采取老年人免費(fèi)接種流感疫苗政策,但是很少有地區(qū)對(duì)青少年采取相關(guān)政策,鑒于此類人群中流感發(fā)病率較高,應(yīng)該也優(yōu)先考慮接種流感疫苗,以預(yù)防和緩解流感可能的暴發(fā)流行。從病毒型別流行來(lái)看,在10 年的監(jiān)測(cè)中,A 型流感占52.26%,B 型流感占47.74%,A 型和B 型流感各有4 個(gè)年度為主要流行毒株,2 個(gè)年度為A 型和B 型混合流行,需要加強(qiáng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)力度,及時(shí)反饋結(jié)果,根據(jù)各年度流感流行毒株情況及時(shí)匹配相應(yīng)的流感疫苗并調(diào)整防控策略。
ARIMA 模型可以預(yù)測(cè)傳染病未來(lái)短期的發(fā)病情況,及早發(fā)現(xiàn)其發(fā)展趨勢(shì)〔7〕,所以建立玉溪市流感ARIMA(1,0,0)(0,1,1)12模型,該模型各參數(shù)最優(yōu),回代擬合效果較好,對(duì)2020 年流感發(fā)病趨勢(shì)進(jìn)行預(yù)測(cè)顯示呈“U”型趨勢(shì),但由于傳染病發(fā)病的復(fù)雜性和不可預(yù)知性〔13〕,比如2020 年在新型冠狀病毒肺炎疫情的影響下,各地實(shí)施了嚴(yán)格的防控措施,戴口罩、勤洗手、保持1 m 距離和居家隔離等措施,減少了人群的接觸機(jī)會(huì),實(shí)際觀測(cè)數(shù)據(jù)和預(yù)測(cè)值將受到一定影響,但根據(jù)預(yù)測(cè)值的動(dòng)態(tài)趨勢(shì)可以估計(jì)未來(lái)可能的流行趨勢(shì),同時(shí)結(jié)合實(shí)際情況采取更具針對(duì)性和主動(dòng)性的預(yù)警和防控措施。
由于本次研究對(duì)象為國(guó)家流感監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù),監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院少且主要集中在市區(qū),采樣水平、政策、重視程度、人員素質(zhì)和意識(shí)等社會(huì)因素及地區(qū)差異或者一些不確定因素的存在,結(jié)果可能有所偏差,未能準(zhǔn)確反映流感活動(dòng)水平。但是通過(guò)ARIMA 模型可以大概預(yù)測(cè)主要趨勢(shì),在新型冠狀病毒肺炎防控的同時(shí)也要加強(qiáng)流感疫情和病原型別的監(jiān)測(cè),加強(qiáng)流感疫苗的接種,對(duì)流感疫情及時(shí)研判和預(yù)警。