999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

川芎-赤芍治療下肢動脈硬化閉塞癥的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)機制

2023-03-22 09:39:00蔡金濤李華剛
中醫(yī)藥臨床雜志 2023年2期
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫分析

蔡金濤,李華剛

1 安徽中醫(yī)藥大學(xué) 安徽合肥 230038

2 安徽中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院 安徽合肥 230031

下肢動脈硬化閉塞癥(arteriosclerosis obliteran,ASO)以下肢涼、疼痛、麻木、間歇性跛行為臨床表現(xiàn)的疾病,病變部位多發(fā)生于大、中動脈,尤其為腹部主干血管以下的分叉起始端。其發(fā)病率與年齡成正相關(guān),70歲以上發(fā)病率在15%-20%,男性患者多于女性[1]。中醫(yī)將該病稱為“脈痹”、“脫疽”,本病病因多為寒邪侵襲、外傷、飲食不節(jié),病位在血脈,涉及肝、脾、腎,血脈瘀阻或氣血虧虛,導(dǎo)致下肢失養(yǎng)[2]。

我院國家級名老中醫(yī)周玉朱在臨床中運用自擬的“丹參化瘀湯”治療ASO,其對ASO的治療收到了較為滿意的效果。其方可活血化瘀,通絡(luò)止痛,但其具體機制尚不明確。

在丹參化瘀湯中,川芎辛溫香燥為血中氣藥,走而不守,能入血分,下行可達血海,適宜瘀血阻滯各種病癥。赤芍苦微寒,清熱涼血,活血祛瘀,二者相互配合而發(fā)揮重要作用。因此,本研究選取藥對川芎、赤芍,以網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析其治療下肢動脈硬化閉塞癥的作用機制,以期為丹參化瘀湯相關(guān)臨床應(yīng)用提供潛在機制。

方 法

1 川芎-赤芍藥對有效成分篩選

TCMSP 數(shù) 據(jù) 庫(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)挖掘,檢索標準設(shè)定為口服利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18,篩選川芎、赤芍的潛在有效成分,并檢索文獻補充。通過輸入2味中藥的名稱,篩選得到有效藥物成分所對應(yīng)的靶點。通過UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)進行靶點蛋白-人類基因名稱轉(zhuǎn)換,從而得到川芎、赤芍兩味中藥的作用靶點。

2 下肢動脈硬化閉塞癥相關(guān)靶點篩選

以“arterial occlusive”為關(guān)鍵詞,在 GeneCards數(shù)據(jù)庫、 OMIM 數(shù)據(jù)庫、TTD 數(shù)據(jù)庫、PharmGkb數(shù)據(jù)庫以及 DrugBank 數(shù)據(jù)庫中檢索,獲得疾病相關(guān)靶點。將各個數(shù)據(jù)庫所得到的的靶點信息導(dǎo)入Cytoscape3.8.0軟件,并用 R軟件(https://cran.r-project.org/mirrors.html)構(gòu)建疾病相關(guān)基因合并的venn圖。再將川芎、赤芍成分作用靶點和下肢動脈硬化閉塞癥相關(guān)的疾病靶點利用R軟件進行映射構(gòu)建venn圖,篩選出中藥-疾病的共同靶點。

3 化學(xué)成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

將藥物有效化學(xué)成分與疾病的共同靶點基因?qū)隒ytoscape3.8.0軟件,進行圖像可視化處理。

4 川芎-赤芍藥對治療下肢動脈硬化閉塞癥的核心靶點篩選

將藥物關(guān)鍵化學(xué)成分與疾病的共同靶點,運用STRING 數(shù)據(jù) 庫(https://string-db.org/),在“Multiple Proteins”中將篩選出的共同靶點輸入“l(fā)ist of names”,其中種類設(shè)為“Homo sapiens”,在設(shè)置中選擇“highest confidence(0.9)”。構(gòu)建 PPI網(wǎng)絡(luò)模型,導(dǎo)出 png圖片和tsv文件。將tsv文件導(dǎo)入Cytoscape軟件中,通過Network Analyse功能分析其網(wǎng)絡(luò),篩選節(jié)點度值(Degree)分布、接近中心性(Closeness centrality)、介數(shù)中心性(Betweenness centrality)均在中位數(shù)以上的作為“核心靶點”。通過篩選最后得到MAPK14、AKT14、RELA、TP5等共17個PPI網(wǎng)絡(luò)核心基因。

5 基因本體(GO)富集分析和京都基因與基因組百科全書(KEGG)富集分析

利用R軟件對上述得到的核心靶點進行entrezID的轉(zhuǎn)換,再將轉(zhuǎn)換的ID通過R軟件進行GO富集分析和KEGG富集分析,以此獲得川芎、赤芍治療下肢動脈硬化閉塞癥的GO富集分析及KEGG富集分析。將靶點基因、GO生物功能、KEGG信號通路導(dǎo)入Cytoscape3.8.0軟件,繪制核心靶點-信號通路-生物功能圖。

結(jié) 果

1 川芎-赤芍藥對有效成分及靶點的篩選

TCMSP平臺共收錄赤芍的主要化學(xué)成分為119個,川芎主要化學(xué)成分為189個,符合篩選條件的赤芍有效成分29個,川芎有效成分為7個,其中谷甾醇是兩者共有的成分,具體有效化合物的相關(guān)信息如表1所示。運用TCMSP中的Related Targets篩選到作用靶點赤芍682個、川芎1356個。篩選與有效成分相關(guān)的靶點并去除重復(fù)后共獲得靶點201個。

表1 川芎-赤芍化合物相關(guān)信息

2 下肢動脈硬化閉塞癥相關(guān)靶點的篩選

輸入“arterial occlusive”,得到不同數(shù)據(jù)庫的疾病靶點基因,刪除每個數(shù)據(jù)庫中及相互之間的重復(fù)基因,最終得到疾病基因,其中GeneCards 1916個,OMIM 1 個,PharmGkb 76 個,TTD 70 個,DrugBank 2個,并繪制venn圖。見圖1。將其與藥物靶點基因進行對應(yīng),得到藥物-疾病共同靶點基因共63個,并繪制venn圖。見圖2。五個數(shù)據(jù)庫共獲得靶點2065個,篩除重復(fù)靶點后最終獲得靶點數(shù)量1984個。

圖1 疾病靶點venn圖

圖2 川芎-赤芍治療ASO venn圖

3 川芎-赤芍藥對治療下肢動脈硬化閉塞癥的關(guān)鍵化學(xué)成分-靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

應(yīng)用Cytoscape 3.8.0軟件將藥物-關(guān)鍵化學(xué)成分-疾病-靶點基因網(wǎng)絡(luò)進行可視化處理。 圖中矩陣代表靶點,倒三角代表化合物,其中不同顏色代表化合物來源于不同的藥物。見圖3。

圖3 藥物-關(guān)鍵化學(xué)成分-靶點網(wǎng)絡(luò)

4 PPI分析及核心靶點篩選

將藥物靶點與疾病靶點取交集后獲得治療靶點數(shù)量為63個,通過STRING數(shù)據(jù)庫獲得靶蛋白相互作用信息,并導(dǎo)出tsv文件及png圖,如圖4所示。圖中共有節(jié)點46個,邊120條。將tsv文件導(dǎo)入Cytoscape中對網(wǎng)絡(luò)中所有節(jié)點的拓撲參數(shù)篩選節(jié)點度值(Degree)分布、接近中心性(Closeness centrality)、介數(shù)中心性(Betweenness centrality)進行分析篩選,共得到核心靶點17個,見表2。包括絲裂原激活蛋白激酶 14(MAPK14)、p53 基因(TP53)、絲氨酸 /蘇氨酸激酶1(AKT1)、過氧化物酶體增生激活受體γ(PPARG)等。

表2 核心靶點拓撲分析表

圖4 川芎-赤芍治療下肢動脈硬化閉塞癥PPI圖

5 GO 富集分析和 KEGG 通路富集分析

使用R軟件對核心靶點分別進行GO富集分析與KEGG通路富集分析。結(jié)果顯示,川芎、赤芍兩味中藥富集到的BP包括:活性氧代謝過程、活性氧代謝過程的調(diào)控、對類固醇激素的反應(yīng)等生物學(xué)過程,富集到的CC包括:RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)復(fù)合物、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)復(fù)合物等細胞成分,富集到的MF包括:脫氧核糖核酸-結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、核心啟動子序列-特異性DNA結(jié)合、脫氧核糖核酸-結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活活性等分子功能。與ASO相關(guān)的KEGG通路主要包括流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化、脂質(zhì)與動脈粥樣硬化、IL-17信號通路等信號通路發(fā)揮治療下肢動脈硬化閉塞癥的作用。見圖5和圖6。并通過Cytoscape軟件構(gòu)建成分-核心靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖。見圖7。

圖5 川芎-赤芍治療ASO的GO富集分析

圖6 川芎-赤芍治療ASO的KEGG富集分析

圖7 成分靶點通路網(wǎng)絡(luò)圖

討 論

下肢動脈硬化閉塞癥是由于下肢動脈粥樣硬化斑塊形成,引起下肢動脈狹窄、閉塞,進而導(dǎo)致肢體慢性缺血。其發(fā)病機制尚不明確,主要的包括損傷及平滑肌細胞增殖學(xué)說、脂質(zhì)浸潤學(xué)說、血流動力學(xué)學(xué)說、遺傳學(xué)說、炎癥反應(yīng)等有關(guān)。中醫(yī)認為血瘀為該病的主要矛盾[3],活血化瘀應(yīng)貫穿于整個治療過程之中,大部分醫(yī)家皆認可。

丹參化瘀湯是我院治療ASO的有效經(jīng)驗方劑[4],其中川芎、赤芍的配伍是此方必不可少的藥對之一,川芎活血行氣、祛風(fēng)止痛,為血中之氣藥。赤芍活血化瘀止痛,兩藥相配伍,既可活血化瘀,又可行氣止痛。本次研究即是通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對川芎-赤芍藥對治療ASO的作用機制進行分析。

川芎中的有效成分可有效拮抗血小板聚集,改善血液黏稠度,還能擴張血管,能夠有效增加下肢血流量、腦動脈流量[5]。赤芍的有效成分可抑制人類成纖維樣滑膜的增殖,從而抑制炎癥,以及保護神經(jīng)、抗腫瘤、抗氧化等作用[6]。

本次通過運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究方法,發(fā)現(xiàn)川芎赤芍藥對中的β谷甾醇、鞣花酸、(+)兒茶素、芍藥苷、黃芩素、楊梅酮等可能抗ASO的主要成分。

谷甾醇是川芎和赤芍的共有化合物,具有降脂、抗炎、清除自由基活性、參與免疫調(diào)節(jié)等。Yuan,Chuanxun[7]等研究發(fā)現(xiàn)提示β-谷甾醇和β-谷甾醇亞油酸酯(SELA)不同的載藥方式可以促進小鼠總脂質(zhì)和膽固醇的排泄。這可能是由于β-谷甾醇與膽固醇的分子結(jié)構(gòu)相似,在小腸腔內(nèi)取代了膽汁酸微膠束中的膽固醇,降低了膽固醇的吸收利用。Kasirzadeh[8]等觀察到用1mg/kg劑量的β-谷甾醇治療兩天導(dǎo)致CLP誘導(dǎo)的膿毒癥大鼠血清中的促炎細胞因子顯著減少。在用β-谷甾醇治療的大鼠中,TNF-α和NF-κBi的肝臟表達也降低了。β-谷甾醇靶向NF-κB作為細胞因子級聯(lián)的主要調(diào)節(jié)因子,并在很大程度上抑制炎癥反應(yīng)。Jiang,Yue-Hua[9]等研究發(fā)現(xiàn)β-谷甾醇表現(xiàn)出優(yōu)異的直接內(nèi)皮保護作用,可顯著抑制細胞凋亡,增加細胞遷移,改善HAECs的線粒體功能。此外,β-谷甾醇減輕了細胞骨架,降低了VE-鈣粘蛋白的密度并改善了細胞形態(tài)。鞣花酸通過抑制ROS生成和調(diào)節(jié)PI3K/Akt/eNOS 信號通路在oxLDL刺激的內(nèi)皮細胞中引起抗凋亡作用[10]。在葡聚糖-兒茶素處理的HMEC-1細胞中,ATOX-1水平顯著下調(diào)[11]。證明了葡聚糖-兒茶素的強效抗血管生成特性。由此可以推斷β-谷甾醇、鞣花酸、兒茶素可以通過抑制炎癥反應(yīng)、降低了膽固醇的吸收利用、抗凋亡作用、強效抗血管生成來治療ASO。

本研究提示藥物的有效成分主要作用于MAPK14、AKT1、PPARG、TNF、RELA、TP53等靶點,參與的通路主要包括流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化、TNF信號通路、MAPK信號通路、IL-17信號通路等。

流體剪切應(yīng)力表示血液流動在血管壁的內(nèi)皮表面施加的摩擦力。血管暴露于剪切應(yīng)力,尤其是內(nèi)皮細胞似乎是主要的傳感器,因為它們位于血液和血管壁之間的內(nèi)表面。此外內(nèi)皮細胞暴露于剪切應(yīng)力會刺激內(nèi)皮一氧化氮合酶(eNOS)產(chǎn)生一氧化氮(NO),能引起細胞內(nèi)鈣的急劇而短暫的升高,增強鈣調(diào)蛋白與eNOS的結(jié)合,從而增加eNOS活性[12]。腫瘤壞死因子信號通路是宿主防御的一個非常重要的組成部分,在各種類型的損傷和刺激后會迅速釋放。TNF-α在激活內(nèi)皮細胞和上調(diào)粘附分子中具有重要作用[13]。TNF-α參與對病變中不同細胞類型的多種作用,例如粘附分子表達和泡沫細胞形成。通過TNF結(jié)合蛋白阻斷TNF-α或通過IL-1受體拮抗劑阻斷IL-1可部分保護apoE敲除小鼠免受動脈粥樣硬化的影響。在MAPK信號通路中,miR-26a過表達能抑制p38MAPK的激活并下調(diào)VEGF表達,而miR-26a的沉默具有相反的效果[14]。VEGF是最有效的血管生成因子之一,它增加血管通透性和血管內(nèi)皮細胞存活,p38MAPK的激活在調(diào)節(jié)VEGF水平中發(fā)揮作用。IL-17通過增強VEGF的表達,促進腫瘤內(nèi)血管新生和炎癥的發(fā)生[15],從而參與調(diào)控血管新生的過程。

綜上,本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法對丹參化瘀湯湯中的“川芎-赤芍”藥對進行分析,發(fā)現(xiàn)抗炎是該藥對治療ASO的主要方式,此次研究佐證了前期對川芎-赤芍藥對治療 ASO的研究結(jié)論,通過篩選得到的靶點和相關(guān)信號通路為后續(xù)的研究提供了研究方向。因本研究缺少相關(guān)的實驗驗證,具有一定的局限性,是否與上述靶點和信號通路有關(guān),需要進一步驗證。

猜你喜歡
數(shù)據(jù)庫分析
隱蔽失效適航要求符合性驗證分析
電力系統(tǒng)不平衡分析
電子制作(2018年18期)2018-11-14 01:48:24
數(shù)據(jù)庫
財經(jīng)(2017年15期)2017-07-03 22:40:49
數(shù)據(jù)庫
財經(jīng)(2017年2期)2017-03-10 14:35:35
電力系統(tǒng)及其自動化發(fā)展趨勢分析
數(shù)據(jù)庫
財經(jīng)(2016年15期)2016-06-03 07:38:02
數(shù)據(jù)庫
財經(jīng)(2016年3期)2016-03-07 07:44:46
數(shù)據(jù)庫
財經(jīng)(2016年6期)2016-02-24 07:41:51
中西醫(yī)結(jié)合治療抑郁癥100例分析
在線教育與MOOC的比較分析
主站蜘蛛池模板: 多人乱p欧美在线观看| 亚洲精品午夜天堂网页| 青青青草国产| 久久无码免费束人妻| 精品久久久久久中文字幕女| 亚洲午夜福利在线| 国产sm重味一区二区三区| 伊人久久婷婷五月综合97色| 91精品啪在线观看国产91| 极品av一区二区| 人妻中文字幕无码久久一区| 国产区精品高清在线观看| 国产第一页免费浮力影院| 亚洲国产91人成在线| 国产亚洲欧美在线专区| 日本人妻丰满熟妇区| 精品91视频| 992tv国产人成在线观看| 岛国精品一区免费视频在线观看| 美女被操黄色视频网站| 中文字幕日韩久久综合影院| av在线手机播放| 亚洲精品国产自在现线最新| 成人精品在线观看| 五月婷婷亚洲综合| 国产综合精品日本亚洲777| 亚洲国产精品日韩欧美一区| 都市激情亚洲综合久久| 欧美午夜在线播放| 国产精品亚洲一区二区三区在线观看| 亚洲精品自在线拍| 手机成人午夜在线视频| www.91在线播放| 91精选国产大片| 国产婬乱a一级毛片多女| 老熟妇喷水一区二区三区| 国产小视频在线高清播放 | 国产三区二区| 国产日产欧美精品| 欧美区一区二区三| 爱色欧美亚洲综合图区| 国产a v无码专区亚洲av| 成色7777精品在线| julia中文字幕久久亚洲| 亚洲热线99精品视频| 亚洲男人的天堂久久香蕉| 免费Aⅴ片在线观看蜜芽Tⅴ | 中文无码日韩精品| 色老头综合网| 丰满人妻中出白浆| 55夜色66夜色国产精品视频| 国产精选小视频在线观看| 青青热久麻豆精品视频在线观看| 久久综合久久鬼| 美女扒开下面流白浆在线试听| 一本大道视频精品人妻| 色婷婷国产精品视频| 婷婷色在线视频| 精品人妻系列无码专区久久| 亚洲美女久久| 理论片一区| 久久99精品久久久久纯品| 国产精品亚洲五月天高清| 精品一區二區久久久久久久網站 | 精品无码一区二区三区电影| 国产高清在线观看| 亚洲无码高清免费视频亚洲| 久久成人免费| 国产精品一区在线观看你懂的| 日本黄色a视频| 1024国产在线| 日本在线欧美在线| 久久综合九色综合97婷婷| 夜精品a一区二区三区| 毛片免费观看视频| 69综合网| 亚洲欧美成人在线视频| 国产精品不卡片视频免费观看| 在线观看欧美精品二区| 欧美日韩在线国产| 精品国产aⅴ一区二区三区| 中文字幕久久波多野结衣 |