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河南不同產區烤煙代謝物區域特征分析

2023-12-20 13:50:08周漢紅孫書斌羅先學肖金勝方武軍
湖北畜牧獸醫 2023年11期
關鍵詞:差異分析

周漢紅,孫書斌,羅先學,肖金勝,甘 韜,方武軍

(1.湖北中煙工業有限責任公司,武漢 430040;2.湖南省煙草專賣局張家界市公司,湖南 張家界 427000)

河南產區烤煙年生產量在10 萬t 以上,是全國重要的濃香型卷煙優質產區,在卷煙品牌中發揮重要的配方作用,但河南各產區空間跨度大,土壤和氣候條件也存在較大區別,導致煙葉風格在產區間存在一定的差異。學者對河南煙葉進行了大量研究,但主要集中在施肥、烘烤等煙葉生產方面[1-5]以及物理特性、化學成分等質量方面[6-13],對各產區煙葉代謝物質方面的研究比較少。

煙葉在成熟和烘烤過程中存在一系列復雜的生化反應,其中代謝物的種類和含量對烤煙的感官質量有重要的影響[14]。非靶向代謝組學旨在通過考慮數據集中存在的所有信息,在生物系統中收集盡可能多的代謝物的信息,廣泛應用于植物代謝組學分析。其主要技術有液相色譜-質譜聯用(LC-MS)、氣相色譜-質譜聯用(GC-MS)和毛細管電泳-質譜聯用(CE-MS)等[15-17],其中液相色譜-質譜聯用(LC-MS)具有可靠的靈敏度、較高的精度和分析方法的魯棒性,是靈敏度和選擇性的最佳組合,因此在大多數代謝組學方法中必不可少。本研究運用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)方法對河南省駐馬店市泌陽縣、南陽市社旗縣、信陽市羅山縣、洛陽市宜陽縣和三門峽市盧氏縣5 個產區的C3F 進行非靶向代謝組學分析,探索不同產區煙葉的關鍵差異代謝產物差異,旨在更好地指導煙葉生產和工業調撥。

1 材料與方法

1.1 試驗樣品

試驗對象為河南省駐馬店市泌陽縣、南陽市社旗縣、信陽市羅山縣、洛陽市宜陽縣、三門峽市盧氏縣5 個產區2021 年的C3F 樣品(表1),把剛調制完下炕的煙葉樣品立即放入液氮中冷凍,樣品郵寄到北京諾禾致源科技股份有限公司實驗室,-80 ℃冰箱中儲存備用。

表1 樣本詳情

1.2 試驗儀器

本試驗委托北京諾禾致源科技股份有限公司檢測。Q Exactive?HF-X 質譜儀、Vanquish UHPLC 色譜儀,德國賽默飛世爾科技公司;Hypesil GOLD Column 色譜柱(100 mm×2.1 mm,1.9 μm),美國賽默飛世爾科技公司;D3024R 型低溫離心機,美國Scilogex品牌。甲醇、甲酸、醋酸銨均購于美國賽默飛世爾科技公司,超純水購于德國Merck 公司,以上試劑純度均為色譜級。

1.3 試驗設計

本項目基于液質聯用(LC-MS)技術進行非靶向代謝組學研究,試驗設計主要包括樣本的代謝物提取、LC-MS/MS 檢測以及數據分析等。由于同一種代謝物可能帶正電荷或者負電荷,所以分別對帶正電荷和負電荷的代謝物進行檢測和分析。

1.4 數據處理與分析

首先將質譜檢測得到的原始文件(.raw)導入Compound Discoverer 3.1(CD)軟件進行譜圖處理及數據庫搜庫,得到代謝物的定性定量結果,然后對數據進行質控,保證數據結果的準確度、可靠性。再對代謝物進行多元統計分析,包括主成分分析(PCA)、偏最小二乘法判別分析(PLS-DA)等,揭示不同組別代謝物的差異。利用層次聚類(HCA)和代謝物相關性分析,揭示樣本之間及代謝物之間的關系。最后,通過代謝通路等功能分析解釋代謝物相關的生物學意義。

2 結果與分析

2.1 各區域C3F 等級煙葉代謝組的多元統計分析

為了探究C3F 代謝物在泌陽縣、社旗縣、羅山縣、宜陽縣和盧氏縣的區域特征,對烘烤后的煙葉進行代謝組測序和分析。正離子代謝物和負離子代謝物的主成分分析結果如圖1 所示。由圖1 可知,5 個地區間的煙葉代謝物特征差異明顯,但各地區內部樣本差異較小,且分離趨勢均處在95%置信區間內。比較5 個地區發現,泌陽縣和社旗縣的煙葉代謝物主成分比較相近,宜陽縣和盧氏縣的煙葉代謝物主成分比較相近,而羅山縣與其他地區的煙葉代謝物主成分相對差異較大。

圖1 帶正電荷代謝物(a)與帶負電荷代謝物(b)主成分分析結果

2.2 主要代謝物及各區域特異代謝物表達分析

基于所有代謝物的表達豐度數據,利用單因素方差分析對樣本組間進行差異比較,按照標準差(s)進行排序,以P<0.05 為閾值,對代謝物進行差異表達的篩選,得到各區域差異表達代謝物數量(表2),泌陽縣、社旗縣、羅山縣、宜陽縣和盧氏縣的差異代謝物分別為477、411、319、186 和227 種,其中差異代謝物為正離子代謝物和負離子代謝物總和。圖2 為差異表達代謝物可視化熱圖,由圖2 可以看出,泌陽縣和社旗縣的差異代謝物的豐度比較相似,宜陽縣和盧氏縣代謝物比較相似(黑框標識)。基于差異代謝物豐度,通過皮爾森相關性分析(表3)發現,泌陽縣和社旗縣、宜陽縣和盧氏縣煙葉代謝物相關性較高(P<0.05)。

圖2 差異表達代謝物豐度可視化結果

表2 各區域差異表達代謝物數量(單位:種)

表3 各區域煙葉代謝物皮爾森相關性分析

基于以上差異分析的結果,得到前20 種差異表達正離子代謝物(表4)和前20 種差異表達負離子代謝物(表5)。其中前20 種差異表達正離子代謝物包括14 種酸,分別為DL-色氨酸、葡萄糖酸、檸檬酸、L-蘇糖酸、琥珀酸、水楊酸、富馬酸、D-α-羥基戊二酸、2R-2,3-二羥基丙酸、DL-4-羥基苯乳酸、檸康酸、2-羥基己酸、N-乙酰基-D-別異亮氨酸和N-乙酰-DL-丙氨酸;1 種亞胺;1 種酚;1 種醇;1 種酰胺和2 種內酯。前20 種差異表達負離子代謝物包括7 種酸類,3 種堿,2 種酮等物質。

表4 前20 種差異表達正離子代謝物

表5 前20 種差異表達負離子代謝物

圖3 為葡萄糖酸、L-蘇糖酸、富馬酸、D-甘露醇、D-谷氨酰胺、N-乙酰基-D-別異亮氨酸的豐度柱狀圖。通過L-蘇糖酸和富馬酸的豐度圖可以看出,其在泌陽縣和社旗縣的豐度比較相近。結果支持本文前述猜想。

圖3 6 種差異代謝物豐度

2.3 基于KEGG 數據庫的代謝通路分析

為確定5 個區域C3F 等級煙葉差異代謝物的主要生物學功能,對這些差異代謝物進行了KEGG 通路富集分析(以P≤0.05 為閾值),如圖4 所示。結果表明,差異代謝物主要富集在氨基酸代謝相關通路中。圖5 以三門峽市盧氏縣C3F 等級煙葉為例,色胺酸代謝通路表達差異最顯著,該條代謝通路富集到的差異代謝物為吲哚和吲哚酚,主要集中在吲哚和吲哚酚生物合成上(圖6)。

圖4 KEGG 通路富集分析

圖5 三門峽市盧氏縣C3F 等級煙葉KEGG 富集氣泡

圖6 富集差異代謝物代謝路徑

3 結論

1)泌陽縣和社旗縣煙葉代謝物相關性比較高,宜陽縣和盧氏縣相關性比較高,羅山縣與其他區域代謝物均相差較大。可見地理位置相近,氣候相近,代謝物相關性高;地理位置遠,氣候相差較大,代謝物相關性低。

2)KEGG 富集結果顯示,差異代謝物主要富集在氨基酸代謝相關通路中。以三門峽市盧氏縣C3F等級煙葉為例,以色氨酸為底物合成吲哚和吲哚酚生物合成途徑是三門峽市盧氏縣C3F 等級煙葉差異最顯著的代謝途徑。

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