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異亮氨酰-tRNA 合成酶基因變異的研究進展

2024-01-26 14:10:45蔣勁嵩高景波曹桂芝趙晨玥張莉雪薛慧琴
中國醫(yī)藥導(dǎo)報 2023年33期
關(guān)鍵詞:基因突變

蔣勁嵩 高景波 郭 榮 曹桂芝 郭 敏 趙晨玥 張莉雪 薛慧琴

1.山西醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院兒科醫(yī)學(xué)院,山西太原 030001;2.山西省兒童醫(yī)院(山西省婦幼保健院)細(xì)胞遺傳室,山西太原 030013

在生物體內(nèi),蛋白質(zhì)的合成過程依賴于氨酰tRNA合成酶群(aminoacyl-tRNA synthetases,ARSs)的催化活性,不同的ARSs 可以通過氨?;饔么呋煌陌被岷团c之相應(yīng)的tRNA 結(jié)合以確保遺傳信息的正確傳遞[1-2]。氨酰化和編輯是ARSs 典型功能,調(diào)控轉(zhuǎn)錄和翻譯是ARSs 非典型功能。越來越多的研究表明,不管是ARSs 的典型功能還是非典型功能發(fā)生缺陷都會導(dǎo)致人類疾病[3]。目前已報道的ARSs 有24種,依據(jù)其同源保守序列及CCD 折疊方式可分為兩類:Ⅰ類多以單體形式存在,Ⅱ類多以二聚體或多聚體形式存在[4]。異亮氨酰-tRNA 合成酶(recobinant isoleucyltRNA synthetase,IARS)由IARS 基因編碼,是ARSs 家族成員之一,催化異亮氨酸和特異tRNA 結(jié)合[5]。此外,IARS 是人細(xì)胞中氨酰-tRNA 合成酶復(fù)合物(multisynthetase complex,MSC)的一部分,該大分子多酶復(fù)合物由9 種細(xì)胞質(zhì)氨酰-tRNA 合成酶和3 種輔因子(AIMP1、AIMP2、AIMP3)組成[6]。IARS 基因突變導(dǎo)致的疾病是一種少見的常染色體隱性遺傳病,有關(guān)IARS 基因突變的致病機制研究報道較少,其發(fā)病機制尚不明確。

1 動物中的IARS 基因變異

動物中IARS 基因純合錯義突變會導(dǎo)致一系列表型出現(xiàn),而雜合攜帶者擁有維持正常生活的IARS 活性。IARS 基因中的純合錯義突變c.235G>C(p.Val79 Leu)是日本黑牛弱犢綜合征的原因,導(dǎo)致IARS 蛋白的氨?;钚越档?8%,進而損害蛋白質(zhì)合成[7]。受影響的小牛表現(xiàn)出宮內(nèi)生長遲緩、新生牛虛弱、嚴(yán)重肌無力伴失語和肝細(xì)胞脂肪變性,比未受影響的胎牛更可能在產(chǎn)前死亡[8]。IARS 基因變異雜合攜帶者和野生型奶牛的代謝譜試驗(metabolic profile test,MPT)結(jié)果和生殖性能數(shù)據(jù)進行比較分析,發(fā)現(xiàn)攜帶者和野生型奶牛之間在MPT 結(jié)果或生殖性能方面比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),提示攜帶者奶牛具有維持最低健康和生殖潛力所必需的IARS 活性[9]。IARS 基因變異小牛在肌肉、肝臟和成纖維細(xì)胞中的氧化磷酸化活性正常,鋅水平也未受到影響,因此鋅水平降低和氧化磷酸化活性受損可能與IARS 基因突變不直接相關(guān)[10-11]。

IARS 基因在斑馬魚中是保守的,與人類蛋白質(zhì)具有74%的同源性,且在斑馬魚早期胚胎發(fā)育中普遍表達(dá)。對斑馬魚的IARS 基因進行了原位雜交和嗎啡啉敲除,實驗證明IARS 基因下調(diào)導(dǎo)致高致死率,存活的胚胎表現(xiàn)出嚴(yán)重的腦表型和體軸縮短,提示IARS基因在胚胎發(fā)生中的重要作用[10,12]。斑馬魚中出現(xiàn)的腦表型和體軸縮短與人類IARS 基因變異出現(xiàn)的智力低下和發(fā)育遲緩相對應(yīng)。

2 人類中的IARS 基因變異

IARS 基因突變患者具有表型異質(zhì)性和多樣性的特點,從輕度的臨床表現(xiàn)到快速進展的多器官受累,且表型在同一家系不同成員間和不同家系間都有可能存在較大差異。IARS 基因在Clinvar、HGMD、PubMed、中國知網(wǎng)等國內(nèi)外數(shù)據(jù)庫中雖有P/LP 變異15 個,但僅有8 例先證者被詳細(xì)報道。Kopajtich 等[10]發(fā)現(xiàn)IARS 基因突變患者3 例,分別為c.1252C>T 合并c.3521T>A 復(fù)合雜合變異、c.760C>T 合并c.1310C>T 復(fù)合雜合變異和c.1109T>G 合并c.2974A>G 復(fù)合雜合變異。Orenstein 等[10]發(fā)現(xiàn)IARS 基因c.2215C>T 合并c.1667T>C 變異1 例。Smigiel 等[14]發(fā)現(xiàn)IARS基因c.2011delC 合并c.206C>T 變異1 例。Fuchs 等[5]發(fā)現(xiàn)IARS 基因c.1305G>C 合并c.3377dup 變異2例。王國杰等[15]發(fā)現(xiàn)IARS 基因c.1604A>G 變異1 例。

既往報道的8 例IARS 基因突變患者表型比較結(jié)果:宮內(nèi)發(fā)育遲緩(7/8)、生后發(fā)育遲緩(8/8)、語言延遲(5/8)、智力低下(7/8)、肝脂肪變性(4/8)、肝纖維化(4/8)、肝功能異常(6/8)、肝脾腫大(3/8)、肌張力低下(6/8)、特殊面容(5/8)、小頭畸形(2/8)、缺鋅(5/8),個別患者還有頭顱MRI 異常、癲癇發(fā)作、孤獨癥、膽汁淤積、感音神經(jīng)性聽力損失、腎積水、呼吸系統(tǒng)疾病、喂養(yǎng)不良等癥狀。所有報告的IARS 基因突變患者幾乎均有發(fā)育遲緩和智力低下特征表型,所以IARS基因變異會導(dǎo)致嚴(yán)重的生長發(fā)育問題。

3 IARS 基因突變引發(fā)疾病的機制

ARSs 基因變異可能引起其典型或非典型功能障礙,從而導(dǎo)致疾病的發(fā)生。ARSs 的典型功能是將氨基酸與相應(yīng)的tRNA 結(jié)合,生成活化的氨基酰-AMP,然后將活化的氨基酰-AMP 轉(zhuǎn)移到相應(yīng)的tRNA 3’端上,使活化的氨基酰tRNA 更容易與mRNA 上的密碼子結(jié)合,確保蛋白質(zhì)的氨基酸序列與mRNA 上的密碼子序列一致,這對于蛋白質(zhì)的正確折疊和功能至關(guān)重要。ARSs 的非典型功能包括作為分子伴侶,協(xié)助其他蛋白質(zhì)折疊成正確的三維結(jié)構(gòu);參與細(xì)胞內(nèi)信號傳導(dǎo)通路,調(diào)控蛋白質(zhì)合成的過程;參與tRNA 的選擇和識別,為翻譯起始做好準(zhǔn)備[3]。需要注意的是,雖然ARSs 具有上述非典型功能,但其主要功能仍然是催化氨基酸與tRNA 的結(jié)合,并合成肽鏈。

IARS 基因突變引發(fā)疾病的機制可能因突變的類型和位置而異,引起隱性IARS 缺陷的致病性變異通常位于IARS 基因的催化或反密碼子結(jié)合域。有研究認(rèn)為隱性IARS 缺乏癥的常見臨床表型是由于氨基?;钚圆蛔阋詽M足特定器官或生命周期的翻譯需求所致[16]。子宮內(nèi)生長受限和發(fā)育不全可能與氨酰化活性降低、翻譯減慢或效率低下相關(guān)。在隱性IARS缺陷中受影響最明顯的是高氨基酸滲入率的器官:肝臟(2.4%/h)、肺(1.0%/h)、腦(0.6%/h)和肌肉(0.4%/h~0.7%/h)及高增殖率器官——腸道[17-18]。圍生期和感染期都是高轉(zhuǎn)化需求的時期,所以IARS 基因變異會導(dǎo)致高氨基酸滲入率及高增殖率器官出現(xiàn)相應(yīng)癥狀。

4 ARS 其他基因變異

常染色體隱性ARS 缺陷代表了一組快速增長的嚴(yán)重遺傳性疾病,涉及多個器官。所有ARS 缺陷都與中樞神經(jīng)系統(tǒng)癥狀相關(guān),包括聽力和視力缺陷,大多數(shù)與發(fā)育不良、喂養(yǎng)和胃腸道問題有關(guān)。線粒體功能障礙和面部畸形的體征很常見,還有各種內(nèi)分泌異常。肝臟和神經(jīng)系統(tǒng)癥狀在生后1 年內(nèi)和感染期最嚴(yán)重,如急性肝衰竭、癲癇持續(xù)狀態(tài)和腦病[5]。還有些特定的臨床特征:絲氨酰-tRNA 合成酶基因變異會導(dǎo)致智力殘疾[19];天冬氨酰-tRNA 合成酶基因變異會出現(xiàn)白質(zhì)腦病和腿部痙攣[20];精氨酰-tRNA 合成酶基因變異出現(xiàn)髓鞘形成不足[21];纈氨酰-tRNA 合成酶基因變異導(dǎo)致神經(jīng)遺傳性疾病[22];賴氨酰-tRNA 合成酶基因變異出現(xiàn)非綜合征性聽力損傷[23]??梢愿鶕?jù)特定的臨床特征對ARS 缺陷的種類進行初步判斷,為疾病的診治提供參考。

5 IARS 基因變異的特定氨基酸治療

氨基酸治療ARS 缺陷目前是一個研究熱點,動物模型發(fā)現(xiàn)氨基酸治療可以改善癥狀,初步研究結(jié)果令人鼓舞。如氨?;钚越档蛯?dǎo)致隱性IARS 缺陷的患者可能通過補充相應(yīng)的異亮氨酸或高蛋白質(zhì)攝入改善癥狀[5,24]。之前報道的ARS 缺陷患者:丙氨酰-tRNA 合成酶[25];甲硫氨酰-tRNA 合成酶[26];異亮氨酰-tRNA 合成酶[10];組氨酰-tRNA 合成酶[27];絲氨酰-tRNA 合成酶[19];谷氨酰胺酰-tRNA 合成酶[28]和賴氨酰-tRNA 合成酶[29]缺陷,均表現(xiàn)為氨基?;钚越档?,但從未降低至酶活性正常值以下,推測ARS 活性過低會對胎兒產(chǎn)生不利影響,導(dǎo)致胎兒無法順利產(chǎn)出,從而未被報道。因此,蛋白質(zhì)/氨基酸的充足供應(yīng)至關(guān)重要,特別是在翻譯需求增加的時期,如生命早期和感染期[30]。患者的雜合子父母不受影響的事實表明,IARS 活性存在一些過剩的能力,而且IARS 基因變異導(dǎo)致的疾病與缺鋅有關(guān),還可以通過補充鋅來緩解癥狀[10]。氨基酸治療ARS 缺陷的方法仍處于早期階段,需要更多深入的研究評估其有效性和安全性,將來有望成為治療的新靶點。

IARS 基因變異會導(dǎo)致多系統(tǒng)病變,其表型復(fù)雜多樣,表型譜仍需不斷拓展總結(jié)。目前IARS 基因新發(fā)復(fù)合雜合變異導(dǎo)致發(fā)育遲緩的功能實驗尚鮮見報道,所以開展IARS 基因新發(fā)剪接位點變異及錯義突變的功能試驗來進一步驗證該復(fù)合雜合變異的致病性是具有創(chuàng)新性的。此外,雖然有研究發(fā)現(xiàn)可以用整體的轉(zhuǎn)錄翻譯解釋發(fā)育遲緩的表型,但器官特異性體征的病理機制可能更加復(fù)雜,所以關(guān)于IARS 基因型與表型相關(guān)性的機制還有待進一步研究。

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