王宏宇,田志飄,劉紅線,鄭亮,3,于雯,吳志軍,Matthew Kay,高振秋,曹宏偉,耿榮慶,張華,,3,4
(1.黑龍江八一農墾大學生命科學技術學院,大慶 163319;2.鹽城師范學院藥學院;3.黑龍江八一農墾大學動物科技學院;4.鹽城師范學院江蘇省腫瘤靶向納米診療材料工程研究中心)
2019 年暴發了由嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染引起的新型冠狀病毒肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19),于2020 年流行至全球,給多個國家和地區人民的生命財產安全帶來巨大威脅[1-2]。截至2022 年9 月,全球報告的COVID-19病例數超過6 億,死亡人數超過650 萬,但疫苗接種率只有68%。而且SARS-CoV-2 基因組仍在不斷地變異,形成多種傳播力強的變異株,對研究高效的疫苗造成了嚴重的困難[3]。
SARS-CoV-2 屬于β 冠狀病毒,是一種有包膜的單股正鏈RNA 病毒[4]。SARS-CoV-2 基因組大約30 kb,包含一個5′-非翻譯區(5′-UTR)、3′-非翻譯區(3′-UTR)和十個單獨的蛋白質編碼開放閱讀框(ORF)。病毒基因組可翻譯出非結構蛋白(Nonstructural protein)、結構蛋白(Structural protein)和輔助蛋白(Accessory protein)3 大類[5-6]。其中,非結構蛋白的ORF 序列位于基因組上游,形成兩個開放閱讀框(ORF1a 和ORF1b),并在蛋白酶作用下水解形成16 個非結構蛋白(Nsp1-Nsp16)[7-8];結構蛋白由核衣殼(N)蛋白、膜(M)蛋白、包膜(E)蛋白和刺突(S)蛋白組成,結構蛋白和輔助蛋白的ORF 位于基因組下游[9-10]。SARS-CoV-2 的基因組比對其他β 冠狀病毒基因組發現,與SARS-CoV 具有79.5%的序列同一性,但顯然SARS-CoV-2 與SARS-CoV 是不同的,它被認為是一種感染人類的新型β 冠狀病毒[11-12]。
Nsp1 是冠狀病毒編碼的第一個病毒蛋白,基因位于ORF1a 的5′端[13]。Nsp1 基因組長540 bp,蛋白由180 個氨基酸組成,大小為19.78 kDa,等電點5.36[14]。Nsp1 是冠狀病毒的毒力決定因子,是病毒用來確保自身在宿主中復制和傳播的核心武器之一;……