李思雨 賴恭梯 賀麗媛 許 恒 林俊璇 郭奧琳 陳桂信 賴呈純,
(1福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院,福建 福州 350002;2福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品加工研究所/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部亞熱帶特色果蔬菌加工重點(diǎn)實(shí)驗室,福建 福州 350003)
果膠是一類復(fù)雜的細(xì)胞壁多糖,在植物生長發(fā)育的諸多方面具有重要功能[1]。果膠生物合成和修飾酶的不同組合,在不同細(xì)胞類型和不同環(huán)境條件下細(xì)胞壁重塑的可塑性和特異性等方面起著關(guān)鍵作用[2],可調(diào)節(jié)細(xì)胞生長[3],從而影響組織器官生長發(fā)育。有研究表明,果膠含量和形態(tài)能影響芍藥莖的直立或彎曲[4],亞麻莖干果膠含量降低時纖維強(qiáng)度增加[5],果膠含量豐富的植物葉片吸收水分速度較快[6],在植物的幼嫩葉片中果膠含量明顯高于衰老葉片[7],這表明果膠在植物莖、葉生長過程中有重要的調(diào)控作用。半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移酶(galacturonosyltransferase,GAUT)是果膠生物合成的關(guān)鍵酶,將半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移到果膠多糖上,合成聚半乳糖醛酸(homogalacturonan)。聚半乳糖醛酸屬于糖基轉(zhuǎn)移酶家族8(glycosyltransferases 8,GT8),是一種α-1,4-半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移酶(α-1,4-galacturonosyltransferase,GalAT),GAUT表達(dá)變化能夠影響植物果膠積累,從而調(diào)節(jié)植株生長發(fā)育[8]。在擬南芥中過表達(dá)GhGATL2、GhGATL9、GhGATL12和GhGATL15,發(fā)現(xiàn)其果膠含量增加;而在棉花中沉默GhGATL15發(fā)現(xiàn)果膠含量減少,并引起表型差異[9]。Fan 等[10]發(fā)現(xiàn)GAUTs可能影響棉纖維的伸長和增厚,Orfila 等[11]發(fā)現(xiàn)擬南芥qua1-1突變體花序莖中半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移酶的活性下降。由此可見,GAUTs影響果膠生物合成,在植物莖和葉等組織器官生長發(fā)育中起著重要作用。
葡萄(Vitisvinifera)屬于木質(zhì)藤本果樹,是我國五大水果之一,在我國廣泛栽培。葡萄莖和葉片對植株生長和物質(zhì)運(yùn)輸有重要作用,在自然狀態(tài)下,葡萄主梢和副梢無差別生長,會導(dǎo)致營養(yǎng)生長與生殖生長不平衡。摘心處理是葡萄控產(chǎn)提質(zhì)的重要栽培措施,可控制葡萄新梢徒長及促進(jìn)分枝形成,并改變營養(yǎng)運(yùn)輸方向,使葡萄樹體的營養(yǎng)更多地由頂端運(yùn)輸?shù)狡渌L點(diǎn)器官[12]。福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品加工研究所營養(yǎng)科學(xué)與工程研究室前期發(fā)現(xiàn),摘心處理能抑制莖增粗和葉片生長[12],結(jié)合前人研究發(fā)現(xiàn)果膠作為細(xì)胞壁的重要結(jié)構(gòu)組分,參與植物組織和器官生長發(fā)育,推測摘心可能通過調(diào)控果膠合成相關(guān)基因表達(dá),改變果膠生物合成從而影響莖和葉片的生長。為探究摘心處理下莖和葉片中果膠生物合成的分子機(jī)制,本試驗以巨峰葡萄為材料,進(jìn)行半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移酶GAUTs基因的克隆,對基因序列特征及功能進(jìn)行預(yù)測分析,并分析摘心處理下巨峰葡萄莖和葉片中VvGAUTs基因的表達(dá)量變化,以期為深入探究摘心抑制莖增粗與葉片生長的分子機(jī)制提供理論依據(jù)。
以種植于福建省福安市溪柄鎮(zhèn)葡萄示范基地的10 年生巨峰葡萄為試驗材料,樹形為自然傘形,株行距1.5 m×2.6 m,每公頃種植約2 550 株。分別進(jìn)行花序上留2 葉摘心和留6 葉摘心的處理,以不摘心為對照,選取摘心處理后的0、10、20、60 和120 d 的莖和葉片儲存于干冰保溫盒,轉(zhuǎn)運(yùn)至實(shí)驗室立即浸沒于液氮中速凍后于-80 ℃冰箱中保存?zhèn)溆?。葉片及莖段的選取參照文獻(xiàn)[12],葉片取基部向上第3 葉的葉片,莖段取基部向上第2 至第3 葉節(jié)間莖段,每次隨機(jī)取10 個葉片和10條莖段,設(shè)3次重復(fù)。
1.2.1 總RNA的提取與cDNA的合成 按照RNAprep Pure 多糖多酚植物總RNA 提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)的操作步驟對巨峰葡萄新芽進(jìn)行總RNA提取?;蚩寺〉腸DNA模板制備采用EasyScript?One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMixs試劑盒(北京全式金生物技術(shù)股份有限公司)。實(shí)時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)的cDNA 模板制備采用Prime ScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time)試劑盒(大連寶生物工程有限公司)。
1.2.2VvGAUTs基因克隆與序列分析 在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)數(shù)據(jù)庫中檢索獲得1個釀酒葡萄GAUT基因和3 個河岸葡萄GAUT基因,其登錄號分別為XM_002269146.3、XM_034818285.1、XM_002281622.4 和XM_002271260.3,以上述4 個GAUT基因序列為模板設(shè)計克隆引物,引物信息見表1。以巨峰葡萄的cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。PCR 反應(yīng)體系共50 μL:HS 2× Master Mix 25 μL,上下游引物各1 μL,cDNA 1 μL,ddH2O 補(bǔ)充至50 μL。PCR 擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃變性30 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共35 個循環(huán);72 ℃終延伸5 min,4 ℃保存。PCR 產(chǎn)物經(jīng)過1%瓊脂糖凝膠電泳得到目的條帶,回收目的條帶,連接pLB Vector 載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)胞。經(jīng)抗性篩選、PCR 鑒定得到陽性克隆菌液,送至北京擎科生物科技股份有限公司測序,獲得目的條帶序列。利用DNAMAN 6.0軟件對基因序列進(jìn)行分析,使用Ensembl網(wǎng)站(http://plants.ensembl.org/index.html)下載VvGAUTs基因注釋文件,用TBtools v1.116軟件進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)繪制。

表1 引物信息Table 1 Primer information
1.2.3 VvGAUTs 蛋白理化特性分析 使用Expasy(http://web.expasy.org/)預(yù)測蛋白序列的分子質(zhì)量、親疏水性和等電點(diǎn)等理化性質(zhì)。利用Plant-mPLoc 網(wǎng)站(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/plant-multi/)進(jìn)行蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測。利用HMMER 網(wǎng)站(https://plants.ensembl.org/hmmer/index.html)進(jìn)行蛋白序列的信號肽預(yù)測。使用MEME 在線軟件(http://memesuite.org/tools/meme)分析基因編碼蛋白的保守基序。
1.2.4 啟動子順式作用元件預(yù)測 通過NCBI在線網(wǎng)址提取VvGAUTs基因的啟動子區(qū)域序列,利用PlanCARE在線網(wǎng)址(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)檢索VvGAUTs基因的順式作用元件,并對其進(jìn)行比較分析。
1.2.5 染色體定位和多物種共線性分析 從Ensembl網(wǎng)站下載葡萄(Vitisvinifera)、擬南芥(Arabidopsis thaliana)、毛果楊(Populustrichocarpa)和水稻(Oryza sativa)的相關(guān)基因組數(shù)據(jù)文件,通過TBtools v1.116 軟件繪制VvGAUTs基因的染色體定位圖以及構(gòu)建其與多物種間的共線性關(guān)系圖譜。
1.2.6 物種間系統(tǒng)發(fā)育分析 用巨峰葡萄VvGAUTs蛋白序列于NCBI在線網(wǎng)站上進(jìn)行比對,獲得VvGAUTs與其他物種同源性大于70%的蛋白序列,使用MEGA 11.0軟件鄰接法(Neighbor-Joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,bootstrap值設(shè)為1 000,其他參數(shù)為默認(rèn)值。
1.2.7 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)預(yù)測 利用String 在線軟件(https://cn.string-db.org/)構(gòu)建VvGAUTs 的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)模型,設(shè)置置信度為0.4,預(yù)測蛋白個數(shù)少于10個,探究VvGAUTs 與植物細(xì)胞中其他基因的編碼蛋白的互作關(guān)系。
1.2.8 qRT-PCR 分析 以經(jīng)過篩選優(yōu)化的clathrinadaptor complex subunit mu(AP-2)作為巨峰葡萄莖的內(nèi)參基因,SAND family protein(SAND)作為巨峰葡萄葉片的內(nèi)參基因,PCR 擴(kuò)增采用前期研究優(yōu)化后的運(yùn)行參數(shù)[13],在LightCycler?480Ⅱ 實(shí)時熒光定量PCR 儀(Roche,瑞士)上進(jìn)行,設(shè)3 次重復(fù)試驗。擴(kuò)增結(jié)束后,利用LightCycler?480 Software Version 1.5 進(jìn)行Cp 值(crossing point)和熔解曲線分析,采用2-ΔΔCt法進(jìn)行目的基因表達(dá)水平的計算。測定相關(guān)基因在不同摘心處理下巨峰葡萄莖和葉片中的相對表達(dá)量,目的基因和內(nèi)參基因引物信息見表1。
使用Microsoft?Excel 2019 和SPSS 26.0 軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析,用GraphPad Prism 9軟件作圖。
以巨峰葡萄cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,克隆得到4 條VvGAUTs基因序列,與預(yù)估目的片段長度一致(圖1-A),測序結(jié)果與NCBI葡萄基因組數(shù)據(jù)庫相應(yīng)基因片段相似性均達(dá)到98%以上,分別命名為VvGAUT1a(登錄號OQ718918.1)、VvGAUT1b(登錄號OQ718919.1)、VvGAUT3(登錄號OQ718920.1)、VvGAUT4a(登錄號OQ718921.1),開放閱讀框(open reading frame,ORF)序列長度分別為1 056、1 167、1 038 和1 071 bp,分別編碼351、388、345 和356 個氨基酸。與葡萄基因組數(shù)據(jù)庫中相應(yīng)基因的DNA序列對比發(fā)現(xiàn),VvGAUT1a包含5 個外顯子和4 個內(nèi)含子,VvGAUT1b只有2 個外顯子和1 個內(nèi)含子,VvGAUT3和VvGAUT4a均有3 個外顯子和2個內(nèi)含子(圖1-B)。

圖1 VvGAUTs的PCR擴(kuò)增電泳圖(A)和基因結(jié)構(gòu)(B)Fig.1 PCR amplification electrophoretic diagram(A) and gene structure(B) of VvGAUTs
蛋白質(zhì)理化特性預(yù)測信息見表2,VvGAUT1a、VvGAUT1b、VvGAUT3 和VvGAUT4a 的分子量分別為39.281 9、43.272 3、39.252 3 和40.427 4 kDa,等電點(diǎn)分別為6.16、5.39、9.10和9.05。蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性預(yù)測顯示,VvGAUT1a為穩(wěn)定蛋白,VvGAUT1b、VvGAUT3和VvGAUT4a 屬于不穩(wěn)定蛋白。信號肽預(yù)測結(jié)果顯示,VvGAUT1b 無明顯信號肽,而VvGAUT1a、VvGAUT3 和VvGAUT4a 均含信號肽。從亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果得知,VvGAUT1a 定位在葉綠體上,VvGAUT1b 定位于細(xì)胞膜、線粒體和細(xì)胞核,VvGAUT3 和VvGAUT4a 均定位于葉綠體與細(xì)胞核。保守基序預(yù)測顯示,VvGAUTs包含相同數(shù)量和類型的Motifs,4 個VvGAUTs 都有8 個保守基序(圖2)。

圖2 VvGAUTs蛋白的基序(A)和基序序列(B)Fig.2 The protein motifs(A) and motif sequences(B) of VvGAUTs

表2 VvGAUTs的蛋白質(zhì)理化特性Table 2 Protein physicochemical properties of VvGAUTs
為了探究VvGAUTs 與其他蛋白在植物體中的聯(lián)合作用機(jī)制,對克隆到的4 個VvGAUTs的編碼蛋白的互作蛋白進(jìn)行了預(yù)測(圖3)。結(jié)果顯示,VvGAUT1a與纖維素合成酶、漆酶和糖基轉(zhuǎn)移酶等蛋白存在相互作用關(guān)系,這些互作蛋白主要參與細(xì)胞壁中纖維素合成、木質(zhì)素降解以及調(diào)節(jié)代謝的速率、方向等生命活動。與VvGAUT1b 存在相互作用的蛋白主要為β-葡萄糖苷酶、UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶、組蛋白賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶、組氨酸激酶和果膠酯酶等蛋白,這些蛋白主要參與糖代謝、植物細(xì)胞分化、葉片衰老調(diào)控和果膠代謝。VvGAUT3、VvGAUT4a 的互作蛋白大多與細(xì)胞信號傳導(dǎo)、細(xì)胞分裂和染色質(zhì)修飾等生物過程有關(guān)。

圖3 VvGAUTs的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)Fig.3 Protein-protein interaction network of VvGAUTs
為探究VvGAUTs與其他物種間的親緣關(guān)系,以4個巨峰葡萄VvGAUTs 為查詢序列,利用NCBI 數(shù)據(jù)庫的Blast 工具進(jìn)行比對分析并下載同源性高于70%的其他物種GAUT 蛋白序列。使用MEGA 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖4)。結(jié)果顯示,GAUT1蛋白聚為一大類,而GAUT3和GAUT4聚為另一大類,并且GAUT3和GAUT4又分別聚成2個亞類,表明GAUT3和GAUT4蛋白有較近的進(jìn)化關(guān)系。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),巨峰葡萄VvGAUT1a、VvGAUT1b 均與河岸葡萄(Vitisriparia)的GAUT1 親緣關(guān)系最近。VvGAUT3 也與河岸葡萄VrGAUT3 最先聚類合并,表明兩者間親緣關(guān)系最近,其次是與大麻(Cannabissativa)的GAUT3屬于同一分支,親緣關(guān)系較近。VvGAUT4a 與河岸葡萄VrGAUT4 的親緣關(guān)系最近,其次是與罌粟(Papaversomniferum)的GAUT4 表現(xiàn)出較近的親緣關(guān)系。

圖4 VvGUATs和其他物種GUATs系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.4 Phylogenetic tree for VvGUATs and GUATs from some other plant species
從Ensembl 在線軟件得到葡萄基因組序列及染色體位置信息,克隆得到的VvGAUTs基因序列均被定位到不同染色體上,分別為染色體4號、18號、1號和7 號(圖5-A)。以葡萄、水稻、擬南芥和毛果楊的基因組數(shù)據(jù)為參考,4個VvGAUTs基因與不同物種的共線分析發(fā)現(xiàn),VvGAUT1a、VvGAUT1b和VvGAUT4a與其他物種的共線基因為13個,但VvGAUT4a顯示與水稻、擬南芥和毛果楊無共線基因,說明該基因具有物種特異性(圖5-B)。VvGAUT1a和毛果楊有4個共線基因,和擬南芥有1個共線基因。VvGAUT1b與毛果楊有4 個共線基因,與擬南芥有2 個共線基因。VvGAUT3在毛果楊染色體8 號和10號上各有1個共線基因。因此,巨峰葡萄GAUT基因與木本毛果楊的共線性高于草本的水稻和擬南芥。

圖5 VvGAUTs染色體定位(A)和多物種共線性(B)Fig.5 Chromosome localization(A) and multispecies collinearity analysis(B) of VvGAUTs
順式作用元件分析結(jié)果表明,VvGAUTs具有光響應(yīng)、厭氧感應(yīng)、赤霉素響應(yīng)、脫落酸響應(yīng)和茉莉酸甲酯響應(yīng)等多種與植物生長發(fā)育相關(guān)的順式作用元件(圖6)。4個VvGAUTs基因均含有光響應(yīng)的順式作用元件,其中VvGAUT3的光響應(yīng)作用元件個數(shù)最多,而VvGAUT1a和VvGAUT4a的數(shù)量基本相等。VvGAUT1a除了響應(yīng)光的順式作用元件外,還含有較多的激素響應(yīng)、防御和脅迫響應(yīng)與分生組織表達(dá)等作用元件;VvGAUT1b響應(yīng)的順式作用元件類型與VvGAUT1a相似,但VvGAUT1b還含有種子特異性調(diào)節(jié)的順式作用元件;VvGAUT3只響應(yīng)了光、厭氧、赤霉素和脫落酸的順式作用元件;VvGAUT4a響應(yīng)光、干旱、赤霉素、防御和脅迫、分生組織表達(dá)、水楊酸和厭氧感應(yīng)的順式作用元件。

圖6 VvGAUTs的啟動子順式作用元件Fig.6 Identified cis-acting elements in promoters of VvGAUTs
2.7.1VvGAUTs基因在巨峰葡萄莖中的表達(dá)模式分析 分析VvGAUTs在巨峰葡萄不同摘心處理下莖中的表達(dá)模式,不同生長發(fā)育階段下4 個VvGAUTs基因成員的表達(dá)模式見圖7,2 葉摘心處理下,VvGAUTs基因在莖中的相對表達(dá)量總體低于其他兩種摘心處理。VvGAUT1a在不同處理下的表達(dá)量均呈先升后降的模式,在10 d時均達(dá)到表達(dá)高峰,并且在生長后期處于較低水平,其中摘心處理的表達(dá)模式總體低于不摘心處理。VvGAUT1b和VvGAUT3在不摘心和6 葉摘心下呈先升后降的表達(dá)模式,并在生長后期處于低表達(dá)水平,2 個基因的表達(dá)水平分別于10 和20 d 達(dá)到表達(dá)峰值;而2 葉摘心處理下,VvGAUT1b和VvGAUT3均處于低表達(dá)水平,且低于不摘心和6 葉摘心。VvGAUT4a在2 葉摘心處理和不摘心處理下的表達(dá)模式基本一致,均呈現(xiàn)較低的水平;而在6 葉摘心處理下,其表達(dá)模式在生長前期呈“降-升-降”的趨勢,而在60 d 后呈現(xiàn)出急劇上升的狀態(tài)。總體上,與對照相比,2 葉摘心處理抑制了VvGAUTs基因在莖中的表達(dá)。此外,從葉片生長過程看,VvGAUT1a、VvGAUT1b和VvGAUT3在葉片生長前期表達(dá)水平較高,后期表達(dá)水平較低,而VvGAUT4a呈現(xiàn)相反的趨勢。

圖7 VvGAUTs基因在不同發(fā)育階段時不同摘心處理下莖中的表達(dá)量Fig.7 The expression of VvGAUTs in stems at different developmental stages after pinching
2.7.2VvGAUTs基因在巨峰葡萄葉片中的表達(dá)模式分析 對不同摘心處理后巨峰葡萄葉片中VvGAUTs的表達(dá)量進(jìn)行分析,不同生長發(fā)育階段下4個VvGAUTs基因在葉片中的表達(dá)量差異見圖8。VvGAUT1a在2 葉摘心處理下的表達(dá)呈現(xiàn)下降趨勢,6葉摘心處理和不摘心處理下生長前期的表達(dá)呈現(xiàn)相反的趨勢,6葉摘心處理下10 d時具有表達(dá)高峰,而不摘心處理下10 d時的表達(dá)量最低。VvGAUT1b在2葉摘心處理下的表達(dá)總體高于其他兩種處理,6葉摘心處理和不摘心處理下的表達(dá)均為先升后降的模式,其后趨于平緩。VvGAUT3在不摘心處理和6葉摘心處理下的表達(dá)均呈現(xiàn)下降的趨勢,而2葉摘心處理下呈現(xiàn)“降-升-降”的表達(dá)模式,且比其他兩種處理具有更高的表達(dá)水平。VvGAUT4a在2葉摘心處理下的表達(dá)量總體高于其他兩種處理,不摘心處理和6葉摘心處理下的表達(dá)總體表現(xiàn)出相似的模式,但不摘心處理下葉片生長時期為20 d時表達(dá)量最高,而此時6葉摘心處理下葉片中該基因的表達(dá)量最低,2葉摘心處理下的表達(dá)呈現(xiàn)“升-降-升”的趨勢,且表達(dá)量高于其他兩種處理??傮w上,在巨峰葡萄葉片生長前期,2葉摘心處理促進(jìn)4個VvGAUTs基因表達(dá),而在葉片生長后期抑制其表達(dá),雖然不同基因間存在時間上的差異,但整體趨勢相同。此外,從葉片生長過程看,VvGAUT1a、VvGAUT1b和VvGAUT3在葉片生長前期表達(dá)水平較高,后期表達(dá)水平較低,而VvGAUT4a表達(dá)水平變化較平緩。

圖8 VvGAUTs基因在不同發(fā)育階段時不同摘心處理下葉片中的表達(dá)量Fig.8 The expression of VvGAUTs in leaves at different developmental stages after pinching
基因結(jié)構(gòu)的多樣性是深入了解研究物種的進(jìn)化過程的重要途徑,對了解植物物種之間多樣化的結(jié)構(gòu)或功能關(guān)系具有重要意義[14-15]。通過對克隆到的4 個VvGAUTs進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),VvGAUT1a基因有5個外顯子,VvGAUT1b基因的外顯子有2 個,而VvGAUT3和VvGAUT4a基因均有3 個外顯子。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn),VvGAUTs和VrGAUTs的親緣關(guān)系最近,其中VvGAUT1a和VvGAUT1b也具有較近的親緣關(guān)系。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育保守假說,親緣關(guān)系越近的物種在進(jìn)化史上的分歧時間越短[16-17],因此推測同一組群的VvGAUTs基因具有相同或者相似的生物學(xué)特性,其對植物的生長發(fā)育調(diào)節(jié)可能具有相同或相似的作用特征。摘心處理不僅會改變葡萄植株體內(nèi)激素水平,也會形成機(jī)械損傷脅迫,4 個VvGAUTs啟動子順式作用元件分析發(fā)現(xiàn)VvGAUT1a、VvGAUT4a具有防御與脅迫響應(yīng)元件,VvGAUT1a、VvGAUT1b和VvGAUT3具有脫落酸響應(yīng)元件,4 個基因更是都含有赤霉素響應(yīng)元件,推測摘心處理通過這些響應(yīng)元件調(diào)控VvGAUTs基因的表達(dá)。
蛋白質(zhì)在動植物的營養(yǎng)運(yùn)輸和生殖生長等生命活動中具有重要的調(diào)節(jié)作用,對細(xì)胞的形態(tài)發(fā)生和功能至關(guān)重要[18-19]。植物在進(jìn)行各類生命活動時往往需要多種蛋白質(zhì)聯(lián)合進(jìn)行功能的行使及應(yīng)用。從蛋白互作預(yù)測結(jié)果可以發(fā)現(xiàn),VvGAUTs基因的編碼蛋白和纖維素、木質(zhì)素和糖代謝等蛋白互作,這與前人研究結(jié)論相似,果膠能與其他細(xì)胞壁組成成分聯(lián)合以保證細(xì)胞壁的伸縮靈活性,從而維持植株的正常生命活動[20-22]。前人研究發(fā)現(xiàn),楸樹中GAUTs基因和纖維素合成通路上的植物多肽信號基因(CLAVATA3/Embryo surrounding region-related,CLE)、葡糖苷酶基因(β-glucosidase,BGLU)共同調(diào)節(jié)樹木的拉伸應(yīng)力[23];果膠合成關(guān)鍵基因的缺失會導(dǎo)致纖維素合成酶基因(cellulose synthase,CesA)的表達(dá)受到抑制[24];半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移酶基因通過調(diào)節(jié)細(xì)胞壁重塑,從而調(diào)控葉片的大?。?5]。因此,推測VvGAUTs基因通過對葡萄莖和葉片細(xì)胞壁的調(diào)控,進(jìn)而影響莖和葉片的生長發(fā)育。
果膠是維持植物細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)和功能完整的不可缺少的一類聚合物,存在于細(xì)胞壁中的果膠在保護(hù)細(xì)胞對膨脹壓力的反應(yīng)中起著至關(guān)重要的作用,從而影響著植物的形態(tài)與功能[26]。摘心處理對果樹和農(nóng)作物均具有積極的作用,平衡營養(yǎng)生長與生殖生長,促進(jìn)營養(yǎng)物質(zhì)向花果等營養(yǎng)器官輸送[27-28]。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn),2 葉摘心處理顯著提高單果質(zhì)量、果穗質(zhì)量和株產(chǎn)量,顯著提高果實(shí)產(chǎn)量;進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)摘心處理下的巨峰葡萄莖的粗度比不摘心莖的粗度小,且摘心處理下葡萄莖的木質(zhì)化程度更深,摘心處理下的巨峰葡萄葉片比不摘心處理的葉片更?。?2]。2葉摘心處理下巨峰葡萄的莖木質(zhì)化,可能與VvGAUTs基因的相對表達(dá)量低,果膠合成受到一定抑制有關(guān),這與Westermark等[29]通過測定云杉木質(zhì)化樣品中果膠組成成分半乳糖醛酸和鼠李糖含量,發(fā)現(xiàn)其復(fù)合胞間層中果膠殘留較少的結(jié)論相似。2 葉摘心處理下巨峰葡萄葉片相對較小,4 個VvGAUTs基因在葉片生長前期的相對表達(dá)量明顯增強(qiáng),這與Biswal等[30]在楊樹中發(fā)現(xiàn),GAUT12.1基因的表達(dá)水平與株系葉面積呈負(fù)相關(guān)的結(jié)果相近。以上均證明了葡萄摘心處理可以通過調(diào)控VvGAUTs的表達(dá)影響果膠合成,但不同的VvGAUT基因在巨峰葡萄生長的不同時期,表達(dá)量變化存在明顯的差異,其對巨峰葡萄果膠生物合成和含量的影響程度,還有待進(jìn)一步的深入研究。
本研究成功從巨峰葡萄中克隆出4 個半乳糖醛酸轉(zhuǎn)移酶基因,分別為VvGAUT1a、VvGAUT1b、VvGAUT3、VvGAUT4a,編碼351、388、345和356個氨基酸。VvGAUTs與河岸葡萄VrGAUTs 的親緣關(guān)系最近。VvGAUTs 與纖維素、木質(zhì)素和糖代謝等基因的編碼蛋白密切互作??傮w上,在巨峰葡萄2 葉摘心處理下的莖中VvGAUTs基因表達(dá)受到抑制,而VvGAUTs基因在葉片中的表達(dá)呈現(xiàn)生長前期表達(dá)量增強(qiáng),在生長后期表達(dá)量受到抑制的趨勢,表明VvGAUTs基因可以響應(yīng)葡萄摘心處理。