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聯用多步驟虛擬篩選方法發現具有新母核的GABAA受體正性變構調節劑

2024-07-02 00:00:00孔維愷忻廉靖靖彭超朱杰鄭鈺琳黃巍然張博段桂芳馬琳彭曉東馬維寧朱素杰黃卓
物理化學學報 2024年1期
關鍵詞:機器學習

摘要:GABAA受體主要介導哺乳動物中樞神經系統的抑制性信號傳遞,是鎮靜催眠藥的關鍵靶點。在尋找具有新母核的鎮靜催眠藥的過程中,計算機輔助藥物設計(CADD)方法顯示出巨大的優勢。在這項研究中,首先,我們通過機器學習模型、分子對接模型和分子力學廣義玻恩比表面積(MMGBSA)方法篩選了來自于商業數據庫中的41112種化合物。經過篩選,我們得到了16個化合物,然后我們通過全細胞膜片鉗電生理學實驗驗證了4個結構新穎的化合物確實為有效的GABAA受體正性變構調節劑。其中,化合物GPR120在細胞水平和動物水平都得到了實驗驗證。在重組表達α1β2γ2型受體的皮層神經元中,在10和50 μmol?L?1濃度下,GPR120可將GABA EC3-10電流分別增強71.5%和163.8%。通過全分解貢獻分析和點突變實驗,我們發現GPR120與GABAA受體結合的關鍵位點是H102,與陽性藥物地西泮相似。為了進一步驗證GPR120在動物水平上的功能,我們進行了運動活動測試和翻正反射消失(LORR)實驗。GPR120對小鼠的運動活動有抑制作用,6 h后可恢復,說明GPR120是一種中度鎮靜劑。在戊巴比妥鈉(PB)誘導的翻正反射消失實驗中,與生理鹽水組相比,GPR120 (20 mg?kg?1)可顯著縮短開始LORR的時間并延長LORR的持續時間。綜上所述,通過聯用多種虛擬篩選方法,我們發現了GPR120是一種具有新型母核的中度強度鎮靜劑。

關鍵詞:機器學習;離子通道;分子對接;虛擬篩選;GABAA受體

中圖分類號:O641

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