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廣藿香Trihelix家族基因PatGT-Ia的克隆、生物信息學(xué)及表達(dá)分析

2025-08-30 00:00:00李俊仁吳帶娣趙公政陳秀珍
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2025年12期

關(guān)鍵詞:廣藿香;Trihelix基因家族;GT-1;基因克?。槐磉_(dá)模式; PatGT-Ia 基因中圖分類號(hào): S567.23Σ+9.01 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1002-1302(2025)12-0033-08

轉(zhuǎn)錄因子可以通過(guò)直接結(jié)合基因啟動(dòng)子上的順式作用元件并促進(jìn)或抑制其轉(zhuǎn)錄活性,從而影響靶基因的表達(dá),控制各種生物過(guò)程[1]。目前,植物中已有超過(guò)60個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族被鑒定出,作為一類重要的調(diào)控因子,轉(zhuǎn)錄因子在植物的生長(zhǎng)發(fā)育、次生代謝及脅迫應(yīng)答等方面發(fā)揮著不可或缺的作用,如研究比較透徹的有MYB、WRKY、NAC及AP2/ERF等轉(zhuǎn)錄因子家族。與植物的其他轉(zhuǎn)錄因子家族相比,Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族是其中比較小且研究相對(duì)較少的一個(gè)家族,又被稱為GT家族,因?yàn)槠浼易宄蓡T可以特異性地與DNA序列上的GT元件結(jié)合[2]。Trihelix 家族成員最明顯的特征是在DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域含有3個(gè)串聯(lián)的螺旋結(jié)構(gòu)(螺旋-環(huán)-螺旋-環(huán)-螺旋),此結(jié)構(gòu)域在Trihelix家族的不同成員中高度保守并且含有較多的堿性和酸性氨基酸、脯氨酸和谷氨酰胺[3]。根據(jù)Trihelix保守結(jié)構(gòu)域的特征,又可將此家族劃分為5個(gè)亞家族,包括GT-1,GT-2,GTγ,SH4 和 SIP1[2] 。目前,Trihelix 家族越來(lái)越吸引研究者的興趣,不同植物的Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族特征也逐漸被報(bào)道,如水稻、藜麥、菠蘿、番茄、玉米、人參、石斛、甜瓜等[4-1]

廣藿香[Pogostemoncablin(Blanco)Benth.]為唇形科刺蕊草屬的多年生草本植物,其干燥地上部分為中藥廣藿香,為嶺南道地藥材,具有芳香化濁、開胃止嘔、發(fā)表解暑的功能,臨床應(yīng)用廣泛[12]。廣藿香醇是廣藿香主要的藥效活性成分,也是廣藿香油的主要組成部分,化學(xué)結(jié)構(gòu)上屬于倍半萜化合物。廣藿香醇的生物合成通路起源于植物細(xì)胞質(zhì)中的甲羥戊酸(MVA)途徑和質(zhì)體中的甲基赤蘚糖醇磷酸(MEP)途徑而合成所有萜類化合物的共同前體物質(zhì):異戊烯焦磷酸(IPP)和其同分異構(gòu)體二甲烯丙基焦磷酸(DMAPP);IPP和DMAPP在法尼基焦磷酸酶(FPS)的催化下生成倍半萜化合物的共同前體法尼基焦磷酸(FPP),F(xiàn)PP隨后在廣藿香醇合酶(PatPTS)的催化下生成廣藿香醇[13]。隨著廣藿香醇生物合成途徑的闡明,關(guān)于轉(zhuǎn)錄因子對(duì)途徑上酶基因的調(diào)控研究也日漸吸引研究者的興趣。目前,廣藿香轉(zhuǎn)錄因子PatSWC4、PatDREB、PcWRKY44及PcbZIP44已被證實(shí)可通過(guò)結(jié)合并調(diào)控廣藿香醇合成途徑基因的表達(dá)從而控制廣藿香醇的生物合成[14-17]。在前期研究中,表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析和酵母單雜交文庫(kù)篩選試驗(yàn)初步提示廣藿香Trihelix轉(zhuǎn)錄因子 PatGT-Ia 可能參與廣藿香醇的合成調(diào)控,因此,本研究擬對(duì) PatGT-Ia 基因進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析PatGT-Ia 在廣藿香的組織特異性表達(dá)水平及其在激素處理下的表達(dá)模式,分析 PatGT-Ia 的亞細(xì)胞定位和轉(zhuǎn)錄自激活活性;本研究一方面可豐富廣藿香Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族的研究,另一方面又可為后續(xù) PatGT-Ia 功能的研究奠定基礎(chǔ)。

1材料與方法

1.1 材料與試劑

廣藿香植物采自廣州中醫(yī)藥大學(xué)時(shí)珍山并經(jīng)廣州中醫(yī)藥大學(xué)詹若挺研究員鑒定為唇形科刺蕊草屬?gòu)V藿香,移栽并培育于仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院植物培養(yǎng)室。于2023年5月選取生長(zhǎng)態(tài)勢(shì)一致(具有3對(duì)真葉)的廣藿香苗進(jìn)行本試驗(yàn),試驗(yàn)地點(diǎn)主要在仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院。

OminiPlantRNAKit(DNaseI)試劑盒購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司;pLB零背景快速克隆試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司; 2×Taq Plus Master Mix II (Dye Plus)、Phanta Max Super -Fidelity DNA Polymerase、ClonExpress II One StepCloningKit、FastPure Gel DNA Extraction Mini Kit、HiScript RT SuperMix for qPCR( + gDNAwiper)、ChamQUniversalSYBRqPCRMasterMix、大腸桿菌 DH5α ,以上試劑盒及感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自南京諾唯贊生物科技股份有限公司。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1植物處理采用qRT-PCR測(cè)定PatGT-?Ia 基因的相對(duì)表達(dá)量,隨機(jī)選取生長(zhǎng)態(tài)勢(shì)一致(具有3對(duì)真葉)的廣藿香苗進(jìn)行如下處理。

1.2.2組織采集采集廣藿香的葉、莖、根,每個(gè)組織采集3個(gè)生物學(xué)重復(fù)樣品,液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80°C 保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.3MeJA處理配制 100μmol/L MeJA溶液并噴施于廣藿香葉片,在處理后的 0.4,8,12,24h 時(shí)分別采集第2對(duì)真葉,每個(gè)時(shí)間點(diǎn)采集3個(gè)生物學(xué)重復(fù)樣品,液氮速凍后轉(zhuǎn)移至 -80°C 保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.4廣藿香總RNA提取及cDNA合成按照試劑盒說(shuō)明書方法,利用OminiPlantRNAKit(DNaseI)試劑盒提取廣藿香總RNA。取定量的RNA,按照HiScript II Q RT SuperMix for qPCR (+gDNA wiper)試劑盒的方法進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成第1鏈cDNA,于 -20°C 保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.5 PatGT-Ia 基因克隆與測(cè)序從前期建立的廣藿香全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組中挖掘 PatGT-Ia 基因的ORF序列并設(shè)計(jì)特異性引物 PatGT-Ia-F/R( F:5 -ATGTACATGTCCGATAAACCCC -3 5 R:5 -TTTACAAGCACGATTCTCACCG -3 ),依據(jù)PhantaMaxSuper-FidelityDNAPolymerase說(shuō)明書方法以合成的cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。利用瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證PCR產(chǎn)物,將檢驗(yàn)合格的目標(biāo)條帶純化回收,隨后構(gòu)建到pLB載體并轉(zhuǎn)化至大腸桿菌 DH5α ,經(jīng)菌液PCR驗(yàn)證后送至公司測(cè)序。廣州天一輝遠(yuǎn)基因科技有限公司負(fù)責(zé)本研究的引物合成及常規(guī)測(cè)序。

1.2.6 PatGT-Ia 的生物信息學(xué)分析使用表1的在線軟件對(duì) PatGT-Ia 進(jìn)行相應(yīng)的生物信息學(xué)分析。系統(tǒng)進(jìn)化樹使用本地軟件MEGA-X構(gòu)建,建樹方法為鄰-接(neighbor-joining,簡(jiǎn)稱NJ)法,Bootstrap設(shè)置為1000,其余參數(shù)默認(rèn)。

1.2.7 PatGT-Ia 基因的qRT-PCR分析根據(jù)克隆的 PatGT-Ia 基因序列設(shè)計(jì)qRT-PCR引物q-PatGT-Ia-F/R(FS-AGTCACAATTCAGCTC ACCC-3 ;R:5'-TTTGCGGAGAAGGATGAGTG-3 ),以廣藿香cDNA為模板,依據(jù)ChamQUniversalSYBRqPCRMasterMix試劑盒說(shuō)明書步驟進(jìn)行qRT-PCR分析。內(nèi)參基因?yàn)閺V藿香Pat18S基因(引物 q-PatIamp;S-F/R,F(xiàn)ξ 5'-TCGCCGTTCGGACCAAATAA- -3 : R:5 -CGATGGTTCACVGGGATTCTGC-3) ,每組試驗(yàn)設(shè)置3個(gè)生物學(xué)重復(fù)和2個(gè)技術(shù)重復(fù),使用 法處理數(shù)據(jù)。

1.2.8PatGT-1a的亞細(xì)胞定位分析將PatGT-1a的ORF克隆至pAN580載體,構(gòu)建EGFP-PatGT-1a融合蛋白表達(dá)載體。以Yoo等報(bào)道的方法,將對(duì)照pAN580空載體和pAN580-EGFP-PatGT-1a質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化擬南芥原生質(zhì)體,使用激光共聚焦顯微鏡檢測(cè)對(duì)照pAN580、EGFP-PatGT-1a融合蛋白及葉綠體自發(fā)熒光的表達(dá)情況[18] 。

表1生物信息學(xué)分析軟件及用途

1.2.9 PatGT-Ia 的轉(zhuǎn)錄自激活活性分析構(gòu)建pGBKT7 -PatGT-Ia 質(zhì)粒,并將其和pGBKT7空載體質(zhì)粒依據(jù)說(shuō)明書方法轉(zhuǎn)化至酵母Y2HGold。將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物涂布在 SD/-Trp 固體培養(yǎng)基上,于 28°C 培養(yǎng)4d,挑取單菌落利用PCR驗(yàn)證陽(yáng)性單克隆。驗(yàn)證成功后,將陽(yáng)性克隆子置于 SD/-Trp 液體培養(yǎng)基中,在 28°C 搖菌培養(yǎng)后將酵母液稀釋10倍后分別在 SD/-Trp.SD/-Trp+50μg/mLX-∝-Gal. ABA固體培養(yǎng)基上進(jìn)行點(diǎn)斑驗(yàn)證,陽(yáng)性對(duì)照為pGBKT7-53/pGADT7-T 質(zhì)粒,陰性對(duì)照為pGBKT7空載體質(zhì)粒。

2 結(jié)果與分析

2.1廣藿香 PatGT-Ia 基因的克隆與序列分析

克隆得到ORF長(zhǎng)度為 1179bp 的基因片段(圖1),Swiss-Prot注釋結(jié)果顯示,基因序列與擬南芥Trihelix轉(zhuǎn)錄因子GT-1(AT1G13450.1)同源,故命名為 PatGT-Ia 。將 PatGT-1a 和擬南芥Trihelix家族的氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,可見 PatGT-Ia 與AT1G13450.1-3聚為一支,親緣性近;根據(jù)擬南芥Trihelix家族的亞家族分類, PatGT-Ia 可劃分至GT-1亞家族(圖2)。

PatGT-Ia 序列分析顯示其編碼392個(gè)氨基酸,終止密碼子為TGA。根據(jù)BLAST比對(duì)結(jié)果,從NCBI上下載擬南芥(Arabidopsisthaliana)、松蒿(Phtheirospermum japonicum)、一串紅(Salviasplendens)的同源蛋白進(jìn)行多序列比對(duì),結(jié)果表明,和其他植物的GT-1一樣, PatGT-Ia 也含有1個(gè)GT1保守結(jié)構(gòu)域(圖3)。

圖1廣藿香PatGT-1a基因的PCR擴(kuò)增電泳條帶

2.2 PatGT-1a蛋白的理化性質(zhì)分析

Expasy工具分析結(jié)果顯示, PatGT-Ia 共編碼392個(gè)氨基酸,分子式為 C1927H2991N557O622S13 ,原子總數(shù)為6110個(gè),分子質(zhì)量約為 44.33ku 。含帶正、負(fù)電荷的殘基數(shù)目分別為51、60個(gè),理論等電點(diǎn)和不穩(wěn)定指數(shù)分別為5.67、42.97;因不穩(wěn)定指數(shù)值 gt; 40,提示PatGT-1a為不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。親水性平均系數(shù)、脂溶指數(shù)分別為-0.896、59.74。ProtScale軟件預(yù)測(cè)PatGT-1a在一級(jí)氨基酸結(jié)構(gòu)上表現(xiàn)為親水性(圖4-A)。

2.3PatGT-1a蛋白的信號(hào)肽、蛋白結(jié)構(gòu)域及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

SignalP-4.1在線軟件預(yù)測(cè)結(jié)果如圖4-B所示,原始剪切位點(diǎn)分值、信號(hào)肽剪切位點(diǎn)分值及綜合剪切位點(diǎn)分值均小于閾值0.5,說(shuō)明PatGT-1a蛋白不存在切割位點(diǎn),不具有信號(hào)肽結(jié)構(gòu),為非分泌蛋白。保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,PatGT-1a含有1個(gè)GT1保守結(jié)構(gòu)域,屬于GT1超家族(圖4-C)??缒そY(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)結(jié)果表明,PatGT-1a肽鏈不存在跨膜結(jié)構(gòu)域,提示PatGT-1a蛋白為非跨膜蛋白(圖4-D)。

圖2廣藿香PatGT-1a和擬南芥Trihelix家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹

2.4PatGT-1a蛋白的磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

NetPhos-3.1在線軟件預(yù)測(cè)提示,PatGT-1a蛋白可能的磷酸化位點(diǎn)有43個(gè),其中絲氨酸位點(diǎn)數(shù)量最多(20個(gè)),其次為蘇氨酸位點(diǎn)(17個(gè))和酪氨酸位點(diǎn)(6個(gè))(圖4-E)。

2.5PatGT-1a蛋白的二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

SOPMA軟件的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果表明,PatGT-1a蛋白由 ∝ -螺旋、β-轉(zhuǎn)角、延伸鏈及無(wú)規(guī)則卷曲4種二級(jí)結(jié)構(gòu)組成,占比分別為 29.59% !4.85% , .14.03% 及 51.53% (圖5-A)。SWISS-MODEL在線軟件的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)也顯示,PatGT-1a蛋白的結(jié)構(gòu)主要是無(wú)規(guī)則卷曲和 ∝ -螺旋,與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相符(圖5-B)。

圖4PatGT-1a的蛋白親水性/疏水性(A)、蛋白信號(hào)肽(B)、蛋白保守結(jié)構(gòu)域(C)、蛋白跨膜結(jié)構(gòu)域(D)、蛋白磷酸化位點(diǎn)(E)預(yù)測(cè)

圖5PatGT-1a蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)(A)和三級(jí)結(jié)構(gòu)(B)預(yù)測(cè)

2.6 PatGT-1a蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析

從NCBI下載其他植物物種的GT-1氨基酸序列,并通過(guò)MEGA-X軟件的鄰-接法構(gòu)建與PatGT-Ia 的系統(tǒng)進(jìn)化樹,可見 PatGT-Ia 氨基酸序列與同為唇形科一串紅SsGT-1的同源性最高,兩者聚為一個(gè)類群,具有較近的親緣關(guān)系(圖6)。

2.7 PatGT-Ia 基因的表達(dá)分析

利用qRT-PCR測(cè)定 PatGT-Ia 基因在廣藿香不同組織及MeJA處理后的相對(duì)表達(dá)量。由圖7-A可知, PatGT-Ia 在廣藿香的根、莖及葉中均有表達(dá),以在根中的表達(dá)量最高,其次為莖、葉。經(jīng)過(guò)外源MeJA噴施處理后, PatGT-Ia 基因的表達(dá)量與對(duì)照組 (0h) 比較顯著提高,在處理時(shí)間 4~24h 內(nèi)PatGT-Ia 基因表達(dá)量呈上升趨勢(shì);其中 24h 時(shí)的表達(dá)量最高,是 0h 的1.99倍(圖7-B)。

2.8 PatGT-1a的亞細(xì)胞定位分析

將構(gòu)建成功的 pAN580-EGFP-PatGT-Ia 表達(dá) 載體和空載體pAN580-EGFR分別轉(zhuǎn)化擬南芥原生質(zhì) 體,激光共聚焦顯微鏡檢測(cè)結(jié)果顯示,EGFR對(duì)照在葉

綠體和細(xì)胞核中均有綠色熒光,而EGFP-PatGT-1a僅在細(xì)胞核中有綠色熒光,表明PatGT-1a定位到細(xì)胞核,與WoLFPSORT在線預(yù)測(cè)結(jié)果一致(圖8)。

圖8PatGT-1a的亞細(xì)胞定位

2.9 PatGT-Ia 的轉(zhuǎn)錄自激活活性分析

轉(zhuǎn)錄自激活活性試驗(yàn)結(jié)果表明,轉(zhuǎn)陽(yáng)性對(duì)照 pGBKT7-53/pGADT7-T、pGBKT7空載體質(zhì)粒、pGBKT7/PatGT-1a的酵母都可以在SD-Trp和SD-Trp+50μg/mLX-α-Gal 固體培養(yǎng)基上正常生長(zhǎng);轉(zhuǎn)陽(yáng)性對(duì)照pGBKT7-53/pGADT7-T和pGBKT7/PatGT-Ia 的酵母在 SD-Trp+50μg/mL ABA固體培養(yǎng)基上均可正常生長(zhǎng)且顯藍(lán)斑,而轉(zhuǎn)陰性對(duì)照pGBKT7空載體的不能生長(zhǎng),表明 PatGT-Ia 有轉(zhuǎn)錄自激活活性(圖9)。

圖9PatGT-1a的轉(zhuǎn)錄自激活活性分析

3討論與結(jié)論

有研究表明,Trihelix家族成員參與了植物的次生代謝調(diào)控,如在擬南芥中,AtGT-3b可分別結(jié)合并調(diào)控膽堿單加氧酶(CMO)基因和甜菜堿醛脫氫酶(BADH)基因的表達(dá),從而促進(jìn)甜菜堿的合成,提高擬南芥的耐鹽脅迫能力[19]。長(zhǎng)春花的GT-1轉(zhuǎn)錄因子可與CPR基因的啟動(dòng)子結(jié)合并調(diào)控基因的表達(dá),最終調(diào)節(jié)萜類吲哚堿的生物合成[20]。在二穗短柄草中,BdCSLF6和BdXTH8基因的表達(dá)受到Trihelix轉(zhuǎn)錄因子BdTHX1的調(diào)控,從而調(diào)控混聯(lián)葡聚糖的合成[21]。GTL1可結(jié)合水楊酸代謝途徑上基因的啟動(dòng)子并調(diào)控基因表達(dá),最終促進(jìn)水楊酸的代謝[22]。Liu 等研究發(fā)現(xiàn),蘋果Trihelix 轉(zhuǎn)錄因子MdSIP1-2可通過(guò)與MdNIR1基因的啟動(dòng)子結(jié)合,抑制其轉(zhuǎn)錄表達(dá),從而調(diào)控硝酸鹽的合成及代謝[23]。Zhu 等利用RNAi技術(shù)沉默人參 04后發(fā)現(xiàn)單體皂苷Rg1、Rd、PPT和PPD的含量均提高,表明Trihelix轉(zhuǎn)錄因子 PgGT25-04 是人參皂苷生物合成的負(fù)調(diào)控子[24]

目前,關(guān)于廣藿香Trihelix轉(zhuǎn)錄因子的研究鮮有報(bào)道。本研究成功克隆了1個(gè)廣藿香Trihelix家族基因 PatGT-Ia ,該基因編碼392個(gè)氨基酸;分析發(fā)現(xiàn)PatGT-1a蛋白為不穩(wěn)定的親水性蛋白,無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽,并含有20個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn);保守結(jié)構(gòu)域分析發(fā)現(xiàn)其含有1個(gè)GT1結(jié)構(gòu)域。Trihelix家族根據(jù)保守結(jié)構(gòu)域的氨基酸和DNA結(jié)合域的數(shù)量,可細(xì)分為5個(gè)亞家族GT-1、GT-2、GTγ,SH4 和 SIP1[2] 。在本研究中,根據(jù)擬南芥Trihelix家族的分類, PatGT-Ia 可歸類到Trihelix家族的GT-1亞家族。GT-1轉(zhuǎn)錄因子是首個(gè)在豌豆中被發(fā)現(xiàn)的Trihelix家族成員,其可以特異性結(jié)合rbcS-3A基因啟動(dòng)子上的光響應(yīng)GT元件Box II/GT1box(5-GTGTGGTTAATATG-3) ,GT-1亞家族也因其而得名[25]。同時(shí),PatGT-1a與其他物種GT-1蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,PatGT-1a氨基酸序列與同為唇形科的一串紅SsGT-1的同源性最高,具有較近的親緣關(guān)系。亞細(xì)胞定位試驗(yàn)顯示,PatGT-1a為細(xì)胞核定位蛋白,與擬南芥AtGT-1的結(jié)果[26]一致。轉(zhuǎn)錄自激活活性試驗(yàn)亦顯示, PatGT-Ia 具有轉(zhuǎn)錄自激活活性。

前人研究發(fā)現(xiàn),GT-1在植物不同的組織器官和不同生長(zhǎng)時(shí)期中均有轉(zhuǎn)錄表達(dá)[26-27]。同樣的,本研究結(jié)果亦顯示, PatGT-Ia 在廣藿香的根、莖及葉中均有表達(dá),這與煙草 GT-Ia 基因和番茄 GT-I 基因的表達(dá)情況相似;不同的是 PatGT-Ia 在根中的表達(dá)量最高,煙草 GT-Ia 主要在莖中表達(dá),番茄GT-1 則在根、莖、葉中的表達(dá)無(wú)明顯差異[27-28] 。崔保祿等克隆了番GT-1亞家族的3個(gè) GT-I 基因,噴施外源茉莉酸甲酯后發(fā)現(xiàn)它們的表達(dá)均被抑制[28];而在本研究中,在MeJA處理下, onumberPatGT- Ia 的表達(dá)量顯著升高,提示 PatGT-Ia 為茉莉素響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子,可能參與茉莉素信號(hào)通路轉(zhuǎn)導(dǎo)。Green等研究證明,GT-1可以激活 rbcS-3A 基因的轉(zhuǎn)錄活性,擬南芥 AtGT-I 也被證明可通過(guò)與TFIIA-TBP-TATA復(fù)合體互作從而激活基因的轉(zhuǎn)錄;然而Le等則發(fā)現(xiàn), AtGT-I 通過(guò)結(jié)合光調(diào)控基因RBCS- 和RPL21的啟動(dòng)子并抑制它們的轉(zhuǎn)錄活性[29-31]。至于 PatGT-Ia 是否影響廣藿香醇合成通路上基因的轉(zhuǎn)錄活性,是否影響廣藿香醇的生物合成,后續(xù)還需要進(jìn)一步的試驗(yàn)驗(yàn)證。

綜上所述,本研究克隆得到1個(gè)廣藿香Trihelix轉(zhuǎn)錄因子家族基因 PatGT-Ia ,對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析并考察了基因表達(dá)模式、亞細(xì)胞定位及轉(zhuǎn)錄自激活活性,研究結(jié)果有助于加深對(duì)廣藿香Trihelix家族的認(rèn)識(shí),并為后續(xù)深人探討 PatGT-Ia 的功能提供參考。

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