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艾里莫芬烷倍半萜抗白血病定量構(gòu)效關(guān)系的量子化學(xué)研究

2010-03-23 10:17:18徐文媛劉建群朱根華熊浩仲
華東交通大學(xué)學(xué)報 2010年5期
關(guān)鍵詞:生物

徐文媛,劉建群,張 銳,朱根華,熊浩仲

(1.華東交通大學(xué)基礎(chǔ)學(xué)院,江西南昌330013;2.江西中醫(yī)學(xué)院教育部重點實驗室,江西南昌330004)

艾里莫芬烷倍半萜是菊科千里光族植物中存在的一類特征性化學(xué)成分,如千里光族的橐吾屬和千里光屬植物中含有許多該類成分。據(jù)文獻(xiàn)[1-7]報道艾里莫芬烷倍半萜具有多種抗腫瘤作用,許多該類成分具有抑制人早幼粒白血病細(xì)胞(HL-60)生長活性。為了進(jìn)一步探討該類倍半萜結(jié)構(gòu)與抗白血病活性的關(guān)系,為該類倍半萜結(jié)構(gòu)改造和開發(fā)利用提供參考依據(jù),對本課題組分離并測定抗白血病生物活性的15種艾里莫芬烷倍半萜化合物[6-7]采用Gaussian03程序的密度泛函理論計算了這類化合物的量子化學(xué)參數(shù),研究了這類化合物抗白血病(HL60)生物活性與量子化學(xué)參數(shù)間的關(guān)系,確定了化合物的生物活性區(qū)域。

1 計算

1.1 化合物及其活性數(shù)據(jù)

15種艾里莫芬烷倍半萜及其抗白血病(HL60)生物活性(半數(shù)抑制濃度IC50值)由本課題組測定,參見文獻(xiàn)[6-7],化合物結(jié)構(gòu)見圖1。

圖1 艾里莫芬烷倍半萜分子結(jié)構(gòu)(1-6)

圖1 艾里莫芬烷倍半萜分子結(jié)構(gòu)(7-15)

1.2 量子化學(xué)參數(shù)的計算與回歸分析

采用Chemoffice2008軟件和Gaussian03的B3LYP/6-31G方法計算了艾里莫芬烷倍半萜的13種量子化學(xué)結(jié)構(gòu)參數(shù),并進(jìn)行了振動分析驗證,將量子化學(xué)結(jié)構(gòu)參數(shù)與抗白血病生物活性進(jìn)行了線性回歸分析。

2 結(jié)果與討論

2.1 分子軌道和偶極

表1列出了上述15種化合物的生物活性(IC50)、前線軌道(HOMO、LUMO)能級等量化參數(shù)。

表1 艾里莫芬烷倍半萜的量化參數(shù)及生物活性數(shù)據(jù)

圖2列出了這15種化合物的生物活性(IC50)與LUMO和LUMO+1軌道的能量以及偶極(Dipole/Dipole)相關(guān)圖。由圖2可以看出化合物的生物活性與其LUMO和LUMO+1軌道能級以及Dipole/Dipole有較好的線性關(guān)系(R>0.6),LUMO和LUMO+1軌道的能量越低,Dipole/Dipole越大,則生物活性越好。而與其它量子化學(xué)參數(shù)(Stretch;Bend;Stretch-Bend;Torsion;Non-1,4 VDW;1,4 VDW;Total;HOMO-1;HOMO)相關(guān)性較差(R<0.6)。利用表1中各化合物生物活性及LUMO和LUMO+1軌道的能量以及Dipole/Dipole做線性回歸分析,得到回歸方程如下:

圖2 抗白血病活性與軌道能級相關(guān)圖

根據(jù)前線分子軌道理論,HOMO及其附近的占據(jù)軌道因能量較高,易失去電子,以供電子為主,而LUMO及其附近空軌道能量較低,以接納電子為主。由于該類化合物的LUMO能級與抗白血病生物活性間存在線性關(guān)系,因此該類化合物在發(fā)揮生物活性時,以接納電子為主。為了形象、直觀地了解前線分子軌道的分布,繪制了這類化合物的LUMO軌道圖(見圖3、圖4,以活性較好的內(nèi)酯化合物5和活性較差的呋喃化合物14為代表),由圖3、圖4可見LUMO軌道體現(xiàn)了內(nèi)酯環(huán)的共軛π軌道的特征,而呋喃環(huán)基本未體現(xiàn)軌道的共軛特征,內(nèi)酯化合物活性較高,呋喃化合物活性最小,說明內(nèi)酯環(huán)是該類化合物生物活性區(qū)域,其主要原因為軌道的共軛性。

圖3 化合物5的LUMO軌道圖

圖4 化合物14的LUMO軌道圖

2.2 電荷分布

藥物分子與生物受體間的作用可能涉及到靜電作用,因此分子的電荷分布是影響藥物分子生物活性的一個重要因素。為了進(jìn)一步確定該類藥物的活性區(qū)域,計算了上述化合物骨架中各原子的電荷密度(見表2),化合物電荷密度分布圖見圖5、圖6(以內(nèi)酯化合物5和呋喃化合物14為代表)。由表2可見,C12原子是正電荷的最主要分布區(qū)域,是最主要的接受電子區(qū),C8,C10和C7也分布了相當(dāng)?shù)恼姾?,說明這些原子也具有接受電子的能力;C12,C10和C7正電荷密度越高,則化合物活性越強(qiáng),因此結(jié)構(gòu)修飾時可考慮提高C12,C10和C7的正電荷密度,特別是提高C12的正電荷密度。

圖5 化合物5的電荷密度分布圖

圖6 化合物14的電荷密度分布圖

表2 艾里莫芬烷倍半萜骨架各原子上的電荷密度分布

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