基于IRAP技術(shù)的磨盤柿變異單株鑒定

摘要：以已知親子關(guān)系的柿品種、柿近緣種和磨盤柿標準品種為對照，對采自北京市房山區(qū)磨盤柿產(chǎn)區(qū)的部分變異單株進行了IRAP分析。結(jié)果表明，19條逆轉(zhuǎn)座子引物中的4個(rtdk13-f5，redk16-r10，rtdk4-p3和rtdk2-p6)可將供試11份變異單株完全區(qū)分；供試變異單株間的相似系數(shù)在0.90-0.98(平均0.94)，與磨盤柿標準品種的相似系數(shù)為0.91，大于種間和品種間相似系數(shù)，與芽變類型及其母株間的相似系數(shù)接近；聚類分析結(jié)果表明，變異單株與磨盤柿標準品種緊密相聚，分支模式與種間及品種間明顯有別。因此，供試11份變異單株已發(fā)生部分遺傳物質(zhì)改變，且可能為磨盤柿芽變。IRAP可區(qū)分遺傳背景高度相似的種質(zhì)間的微小變異，可望在果樹芽變鑒定中應用。

關(guān)鍵詞：柿；品種鑒定；親緣關(guān)系；芽變；逆轉(zhuǎn)座子分子標記；UPGMA

中圖分類號：S665.2 文獻標識碼：A 文章編號：1009-9980(2011)02-257-06

植物基因組40％-60％為逆轉(zhuǎn)座子，其在縱向和橫向傳遞中能產(chǎn)生高度的異質(zhì)性和拷貝數(shù)，且易被生物和非生物因素差異激活，成為植物遺傳多樣性的重要來源。基于逆轉(zhuǎn)座子的分子標記是檢測基因組變異的手段之一，尤其是Kalendar等開發(fā)的逆轉(zhuǎn)座子間擴增多態(tài)性(inter-retrotransposon amplifiedpotymorphism，IRAP)技術(shù)，操作簡單、多態(tài)性豐富、檢測效率高，已在種質(zhì)鑒定、遺傳多樣性檢測和系統(tǒng)發(fā)育重建、基因作圖以及重要農(nóng)藝性狀基因的標記等方面得到成功應用。

芽變是多年生木本果樹新品種選育的重要變異來源，許多主栽柿品種來自芽變。磨盤柿原產(chǎn)我國，分布最廣、面積最大，長期的營養(yǎng)繁殖可能已經(jīng)積累許多變異類型，但早期采用的形態(tài)學鑒定由于環(huán)境條件和技術(shù)人員的主觀因素等原因往往影響鑒定結(jié)果的真實性。……