摘要:從玉米自交系9801基因組DNA中克隆了玉米19 kD醇溶蛋白基因(ze19)啟動子,將其連接到pMD18-T載體上。測序結果表明該序列與已報道序列同源性為94%,包含TATAbox、CAATbox啟動子基本元件以及GCN4、skn-1、prolamin box、-300 element等參與調節玉米醇溶蛋白表達及活性的順式元件。將克隆的ze19啟動子取代質粒pBI121中的35 S啟動子,成功構建了由ze19啟動子驅動gus報告基因的植物表達載體pBIze19。利用土壤桿菌介導法將構建好的重組質粒pBIze19轉入煙草中,為進一步研究該啟動子組織特異性表達奠定了基礎。
關鍵詞:ze19啟動子;土壤桿菌介導法;植物表達載體
中圖分類號:Q785文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2011)13-2775-05
Cloning of 19 kD Zein Promoter from Maize and Construction of Plant
Expression Vector
LI Hui-lun1,2,WEI Yan-li2,LI Hong-mei2,HU Jin-dong2,LI Ji-shun2,YANG He-tong2
(1.School of Life Science, Shandong University of Technology, Zibo 255049, Shandong, China;
2. Biology Institute of Shandong Academy of Sciences/Key Laboratory for Applied Microbiology of Shandong Province, Jinan 250014, China)
Abstract: The 19 kD zein(ze19)promoter was amplified from the genomic DNA of maize inbred line 9801, and the sequence was linked to vector pMD18-T. Sequence analysis indicated that the cloned sequence shared 94% homology with the published sequence. The cloned promoter contains the two basic promoter element, TATA box and CAAT box, and several cis-regulatory elements, such as GCN4 motif, skn-1 motif, prolamin box,-300 element, which were necessity for mediating endosperm expression of maize zein. By replacing the 35 S promoter, ze19 promoter was inserted upstream of the β-glucuronidase (gus) reporter gene in plasmid pBI121; and the plant expression vector pBIze19 was constructed.Then tobacco were transformed via Agrobacterium tumefacients mediated procedure, thus a foundation for further research about tissue-specific expression of ze19 promoter was laid.
Key words: ze19 promoter; Agrobaterium tumefacients mediated procedure; plant expression vector
隨著植物基因工程的不斷完善,人們需要目的基因準確高效地在受體植物特定部位表達,但組成型啟動子使基因表達分散而造成目標部位表達量不足,難以滿足要求,因此克隆專一的組織特異性啟動子成為目前植物基因工程研究的重點[1]。玉米醇溶蛋白是玉米種子貯藏蛋白的主要成分,占總蛋白的50%~60%。根據醇溶蛋白一級結構的相似性可分為α、β、γ、δ 4種,其中α-醇溶蛋白由25~50個基因組成的基因家族編碼,包括19 kD和22 kD的醇溶蛋白。由于玉米醇溶蛋白基因的表達具有嚴格的時空特異性,在種子發育過程中,其表達嚴格限定在胚乳組織中,一般授粉后10~12 d開始表達[2],因此本實驗從玉米基因組中克隆了19 kD醇溶蛋白基因(ze19)的啟動子序列,對其結構和功能進行分析,以期構建種子特異性啟動子,為玉米種子生物反應器的研究奠定基礎。
1材料與方法
1.1材料和試劑
玉米自交系9801、煙草(Nicotiana tabacum,WT)均來自山東省農業科學院高新技術中心。大腸桿菌TOP10、土壤桿菌LBA440、植物表達載體pBI121均由山東省科學院中日友好生物技術研究中心保存,克隆載體pMD18-T、各種限制性內切酶和T4 DNA連接酶購自Takara公司,其他化學試劑為國產分析純,PCR引物由上海生工生物工程技術服務有限公司合成。
1.2啟動子的PCR擴增與克隆
以玉米自交系品種9801幼苗為材料,利用CTAB法[3]提取玉米基因組DNA。根據Giovinazzo等[4]發表的ze19啟動子序列(GenBank登錄號為x63667),設計一對特異引物P1:5′ACGAAGCTTAA
CAGACCCGCCTCA3′(劃線部分為引入的Hin d Ⅲ酶切位點);P2:5′ACGGGATCCATTGTTGGTACACT
A 3′(劃線部分為引入的Bam HⅠ酶切位點)。以9801玉米基因組DNA為模板,擴增該基因起始密碼子上游約1 400 bp的調控序列。PCR體系為50 μL,包括10×Buffer 5 μL,10 μmol/L P1 2 μL,10 μmol/L P2 2 μL,10 mmol/L dNTPs 1.2 μL,基因組DNA模板 1 μL,Taq酶 0.5 μL,ddH2O 38.3 μL。PCR反應程序為:94 ℃預變性,5 min;94 ℃變性1 min,50 ℃退火50 s,72 ℃延伸90 s,30個循環;72 ℃延伸10 min。
擴增產物經瓊脂糖凝膠電泳分離純化后,與克隆載體pMD18-T在T4 DNA 連接酶作用下16 ℃保溫過夜,構建重組質粒pMD18-ze19。將連接反應產物轉化大腸桿菌TOP10感受態細胞,提取質粒,經PCR、酶切鑒定后,將陽性轉化子送上海生工生物工程技術服務有限公司測序,并保存菌種。
1.3ze19-gus融合表達載體的構建
將重組質粒pMD18-ze19和pBI121-gus分別用Hin dⅢ和Bam HⅠ進行雙酶切,在T4 DNA連接酶作用下,16 ℃連接反應過夜,連接反應產物轉化大腸桿菌TOP10感受態細胞,利用PCR及酶切方法篩選陽性轉化子,并進行測序鑒定,得到植物表達載體pBI ze19-gus,表達載體構建過程如圖1所示。
1.4土壤桿菌介導的煙草轉化
采用液氮凍融法將重組植物表達載體pBI ze19-gus轉入土壤桿菌LBA4404中,采用堿裂解法[5]提取重組土壤桿菌的質粒,PCR鑒定轉化子。表達載體pBI 121-gus中gus基因上游含有35 S啟動子,因此將其轉入土壤桿菌,作為分析ze19啟動子活性時的陽性對照,設計gus部分基因(約500 bp)的引物(P1:5′GGGATCCATCGCAGCGTAATG3′;P2:5′GCCGACAGCAGCAGTTTCATC3′)對其進行PCR鑒定。
挑取土壤桿菌陽性重組子于含抗生素(50 mg/L Kan,50 mg/L Str)的2 mL YEB液體培養基中,28 ℃過夜培養,轉接到20 mL YEB培養基中,28 ℃繼續培養至OD600為0.6左右,用刀片將煙草無菌苗葉片邊緣部分切去并棄中脈,切成約1 cm2大小作為土壤桿菌侵染外植體,在土壤桿菌菌液中侵染5~10 min,其間不斷搖動,侵染后的外植體用無菌濾紙吸干菌液置于MS分化培養基上(2.0 mg/L 6-BA+0.1 mg/L NAA),28 ℃暗培養2 d,轉入MS篩選分化培養基(50 mg/L Kan,200 mg/L Carb,2.0 mg/L 6-BA+0.1 mg/L NAA)中。25 ℃光照培養約2周后,將煙草愈傷組織及部分抗性芽轉入新鮮培養基中繼代培養,待抗性芽長至2 cm左右切下轉入MS生根培養基(50 mg/L Kan,200 mg/L Carb,0.5 mg/L IAA)中。待根系發育良好進行室內移栽,隨機選取12株長勢良好的植株提取其葉片總DNA,PCR和瓊脂糖凝膠電泳檢測其是否含有ze19啟動子,并設立陰性對照(野生型煙草基因組DNA)、陽性對照(構建的重組質粒pBIze19)。
2結果與分析
2.1ze19啟動子的擴增、克隆和序列分析
以玉米自交系9801基因組DNA為模板,根據所設計的引物進行PCR擴增,可特異地擴增到約
1 400 bp的條帶(圖2),與目的片段大小一致。將ze19啟動子PCR純化產物連接到pMD18-T上得到重組質粒pMD18-ze19,進行Hin dⅢ和Bam HⅠ雙酶切鑒定,可切出大小約1 400 bp的條帶(圖3),與ze19啟動子片段大小一致,證明ze19 PCR產物已連接到pMD18-T,將重組質粒送往上海生工生物工程技術服務有限公司測序。
測序結果表明得到的啟動子長度為1 425 bp,與報道序列同源性為94%,其3′末端緊鄰該基因起始密碼子AUG,與報道序列相比缺失了20 bp,缺失序列位于啟動子的可變區,不屬于保守序列,不同玉米品系之間均有差異[4];另外整個序列有22個堿基發生了改變,包括12個堿基的突變和10個堿基的插入或缺失。采用Neural Network Promoter Prediction啟動子數據庫進行功能預測,結果表明該序列存在2處核心啟動子區域(表1),并且得分較高(總分為1分),初步判斷此克隆序列具有啟動子結構。
為了分析序列差異是否發生在啟動子功能元件和重要調控區域,通過PLACE和PLANTCARE數據庫對啟動子進行順式調控元件分析。發現該序列含有TATA box和CAAT box啟動子核心元件,屬于典型啟動子。該啟動子序列中還具有胚乳表達特異性元件,如GCN4、skn-1、prolamin box、-300 element等參與調節玉米醇溶蛋白表達及活性的順式元件(表2)。序列分析結果表明,在TATA box和CAAT box以及ze19啟動子調節基因特異表達的調控區域沒有發生堿基的變化。此外,該序列中還發現了調節植物生長發育的一些應激元件,例如光反應元件I-box、CATT-motif、GT1-motif、Sp1、GA-motif、G-box、GATA-motif、GAG-motif;抗氧化元件ARE;抗逆反應順式作用元件MBS、LTR;代謝調控元件O2-site等順式元件,這些元件可能在植物的生長發育和器官發育中起重要作用。
2.2含ze19啟動子的植物表達載體
構建的植物表達載體pBIze19-gus經PCR擴增得到片段大小約為1 400 bp的產物(圖4),通過
Hin dⅢ與Bam HⅠ雙酶切后瓊脂糖凝膠電泳檢測,也得到大小約為1 400 bp的啟動子片段(圖5),與預期結果相符。表明ze19啟動子已插入到表達載體pBI121中,測序結果也顯示重組表達載體pBIze19-gus已構建成功。
將重組載體pBIze19-gus與陽性對照質粒pBI121-gus通過凍融法轉化土壤桿菌,PCR鑒定轉化子。結果表明,在轉pBIze19重組質粒的土壤桿菌中擴增到了約1 400 bp的片段(圖6),說明pBIze19-gus已經成功轉化土壤桿菌;而在轉pBI121-gus質粒的土壤桿菌中擴增到了約500 bp的gus片段(圖7),表明pBI121也已經成功轉化土壤桿菌。
2.3轉基因煙草的獲得
煙草葉盤經土壤桿菌侵染1周后,外殖體迅速生長,周圍已經開始形成愈傷組織;而沒有經土壤桿菌侵染的陰性對照,在含相同濃度卡那霉素的篩選培養基上葉盤沒有長大,葉盤周圍也沒有愈傷組織形成(圖8)。
連續繼代培養4~5周以后,外殖體分化出大量的愈傷組織及抗性芽(圖9),結果表明,篩選分化培養基中抗生素和生長素的濃度及其配比可以滿足煙草葉盤選擇分化的需要。將抗性芽轉入生根培養基中,一個月后根系發達(圖10),可以進行室內移栽。
隨機選取12株生長良好的植株提取其葉片總DNA,以基因組為模板利用ze19啟動子的特異引物進行PCR擴增,經檢測12株轉pBIze19-gus的煙草抗性苗有10株是陽性植株,轉化率達到83%,而陰性對照沒有擴增到條帶(圖11)。
3討論
玉米醇溶蛋白的表達具有嚴格的組織特異性,被嚴格限定在種子胚乳中,是研究組織特異性啟動子的良好材料。根據19 kD玉米醇溶蛋白啟動子保守序列,設計特異引物從玉米9801自交系中擴增啟動子片段,擴增到長約1 400 bp的片段。將該片段連接克隆載體并測序后,該序列與報道序列同源性為94%。通過生物信息學方法對該序列進行序列分析和功能預測,該序列具有兩處核心啟動子區域,一個位于轉錄起始位點上游-49 bp位置,另一個位于-1 189 bp位置,區域得分分別為0.92、0.93,這與Giovinazzo等[4]的報道一致。在序列結構上,克隆序列含有GCN4、Skn-1、Prolamin box、-300 element等多個種子或胚乳表達特異性調控元件。因此,在理論上,所克隆啟動子序列具有種子特異性啟動子的潛在功能。
實驗選用pBI121質粒作為基本載體,用ze19置換表達載體pBI121中的35 S啟動子,構建植物表達載體pBIze19,因為質粒pBI121的35 S啟動子下游連接報告基因gus,gus基因在很多植物中沒有內源活性,并且其檢測方法靈敏、快速、穩定、線性好,方便下一步對啟動子表達情況的研究。構建好的表達載體pBIze19可以用于下一步植物轉化和再生,研究啟動子活性,也可以用于其他轉基因植物研究。
玉米醇溶蛋白基因啟動子在外源植物中的表達調控是個很復雜的問題,還需要利用克隆的玉米19 kD醇溶蛋白基因啟動子對其表達部位、表達周期以及表達強度進行研究。相對于組成型啟動子而言,種子貯藏蛋白基因啟動子具有很強的組織和發育特異性[11],可避免外源基因在轉基因宿主植株中非特異表達所造成的能量負荷和物質浪費[12]。因此,利用種子特異性的啟動子來啟動外源基因以保證外源基因的高效表達,可用于改良農作物品種和性狀以提高產品質量,目前人們已經開始利用轉基因植物作為新型的生物反應器(Bioreator)來生產有意義的次生代謝物、蛋白質、糖類和脂類等[13]。
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