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耐亞胺培南銅綠假單胞菌的臨床分離及耐藥機(jī)制分析

2011-07-27 13:24:42麥麗文余治健鄧啟文
關(guān)鍵詞:耐藥

廉 婕 ,麥麗文 ,余治健 ,鄧啟文 *

1.廣東醫(yī)學(xué)院附屬南山醫(yī)院中心實(shí)驗(yàn)室,廣東深圳 518052;2.廣東醫(yī)學(xué)院附屬南山醫(yī)院感染科,廣東深圳 518052

銅綠假單胞菌(pseudomonas aeruginosa,PAE)是引起醫(yī)院感染的最常見(jiàn)條件致病菌之一,對(duì)多種抗生素天然或獲得性耐藥,一直是臨床關(guān)注的焦點(diǎn)。亞胺培南等碳青霉烯類抗生素由于抗菌譜廣、抗菌活性強(qiáng),已成為目前治療多重耐藥銅綠假單胞菌最有效的抗生素。但隨著該類抗生素臨床應(yīng)用的逐漸增多,出現(xiàn)了大量的耐亞胺培南菌株(imipenem-resistant pseudomonas aeruginosa,IRPA),給臨床治療帶來(lái)了極大困難。因此,加強(qiáng)對(duì)IRPA的研究,為臨床有效控制其感染提供科學(xué)依據(jù)顯得尤為重要。為了解深圳地區(qū)IRPA的耐藥情況和耐藥機(jī)制,作者收集了廣東醫(yī)學(xué)院附屬南山醫(yī)院2009年1月~2010年12月住院患者臨床標(biāo)本中分離的IRPA進(jìn)行分析,現(xiàn)報(bào)道如下:

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 菌株來(lái)源與質(zhì)控菌株 404株銅綠假單胞菌分離于我院2009年1月~2010年12月住院部各科患者的各類臨床標(biāo)本(包括痰液、尿液、傷口分泌物、膿液、血液等),同一患者的同一部位連續(xù)分離的多株銅綠假單胞菌以1株計(jì)算。金屬酶IMP基因陽(yáng)性菌株P(guān)A987由廣州醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院卓超教授提供。質(zhì)控菌株為銅綠假單胞菌ATCC 27853,大腸埃希菌ATCC 25922,購(gòu)自衛(wèi)生部臨床檢驗(yàn)中心。

1.1.2 PCR引物設(shè)計(jì) 參考文獻(xiàn)[1]設(shè)計(jì)MBL基因型IMP、VIM、GIM、SPM以及通道蛋白基因oprD2的擴(kuò)增引物,由上海生物工程有限公司合成,引物序列和目的產(chǎn)物長(zhǎng)度詳見(jiàn)表1。

表1 耐藥基因PCR引物序列

1.2 方法

1.2.1 細(xì)菌培養(yǎng)及分離 臨床送檢的各類標(biāo)本嚴(yán)格按照《全國(guó)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》進(jìn)行細(xì)菌的分離培養(yǎng)。分純后的銅綠假單胞菌用小牛血清保存至-80℃冰箱待用。

1.2.2 菌株鑒定及藥敏試驗(yàn)方法 所有菌株均以BD Phoenix100全自動(dòng)微生物分析儀鑒定到種,必要時(shí)采用梅里埃ATBExpression半自動(dòng)細(xì)菌分析儀補(bǔ)充鑒定。藥敏試驗(yàn)采用BD Phoenix 100革蘭陰性細(xì)菌配套藥敏試驗(yàn)復(fù)合板,包括阿米卡星、阿莫西林/克拉維斯、氨芐西林、氨芐西林/舒巴坦、氨曲南、頭孢唑啉、頭孢吡肟、頭孢噻肟、頭孢他啶、氯霉素、環(huán)丙沙星、慶大霉素、亞胺培南、美洛培南、左氧氟沙星、哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、四環(huán)素、復(fù)方磺胺、多粘菌素E,共20種抗菌藥物。

1.2.3 基因擴(kuò)增 采用煮沸法提取模板DNA,oprD2基因擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性 3 min,然后 95℃ 30 s→55℃ 30 s→72℃60 s,循環(huán)35個(gè)周期,最后72℃延長(zhǎng)5 min;其余基因擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性 3 min, 然后 95℃ 60 s→55℃ 60 s→72℃60 s,循環(huán)35個(gè)周期,最后 72℃延長(zhǎng)5 min。取PCR產(chǎn)物4 μg經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,EB染色后在凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。

1.2.4 PCR產(chǎn)物測(cè)序 使用DNA凝膠回收純化試劑盒(購(gòu)自TaKaRa)將PCR產(chǎn)物割膠純化,送至深圳華大基因測(cè)序,序列登錄GenBank進(jìn)行比對(duì)分析。

2 結(jié)果

2.1 IRPA的分離率

從404株銅綠假單胞菌中檢出IRPA 100株,分離率為24.75%。其中大多數(shù)分離自痰液標(biāo)本90株,占90.0%,其次為血液和膿液標(biāo)本,均為3株,各占3.0%,分離自傷口分泌物和膽汁標(biāo)本均為2株,各占2.0%。

2.2 IRPA感染者科室分布

IRPA感染者主要來(lái)自重癥醫(yī)學(xué)科,占31.0%,其次為呼吸內(nèi)科和神經(jīng)內(nèi)科,分別為20.0%和16.0%,具體科室分布情況見(jiàn)表2。

2.3 IRPA對(duì)抗菌藥物的耐藥性

100株亞胺培南耐藥的銅綠假單胞菌,對(duì)阿米卡星的耐藥率最低,為27.0%,耐藥率在30.0%~50.0%的有4種抗菌藥物:頭孢他啶、慶大霉素、哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦;耐藥率在50.0%~70.0%的有4種抗菌藥物:氨曲南、環(huán)丙沙星、左氧氟沙星、頭孢吡肟;對(duì)其余10種抗菌藥物的耐藥率均>70.0%,其中,氨芐西林、氨芐西林/舒巴坦、頭孢唑啉和氯霉素的耐藥率為100%。具體耐藥情況見(jiàn)表3。

表2 耐亞胺培南銅綠假單胞菌的科室分布情況

表3 耐亞胺培南銅綠假單胞菌的耐藥情況

2.4 MBL基因及oprD2基因檢測(cè)結(jié)果

100株IRPA中,檢測(cè)到IMP基因陽(yáng)性1株(PA47),陽(yáng)性率為1.0%,oprD2基因缺失65株(PA47為擴(kuò)增陽(yáng)性菌株),陽(yáng)性率為65.0%,其余耐藥基因(VIM、GIM、SPM)均未檢出。

2.5 IMP基因測(cè)序結(jié)果

通過(guò)對(duì)PA47菌株的IMP基因PCR產(chǎn)物進(jìn)行正向測(cè)序,經(jīng)Clustal W程序分析,其核酸序列與GenBank已登陸的blaIMP-9序列(登錄號(hào):AY033653)的同源性為100%,可判定為IMP-9型基因。PA47_blaIMP在GenBank的登錄號(hào)為JN107561。

3 討論

近年來(lái),由于化療、放療、免疫抑制劑及各類侵入性診療項(xiàng)目在臨床的廣泛開(kāi)展,非發(fā)酵類病原菌引起的醫(yī)院感染逐漸增多,其中銅綠假單胞菌分離量占首位(45.4%)[2]。碳青霉烯類抗生素(亞胺培南、美羅培南等)具有抗菌譜廣、抗菌活性強(qiáng)、對(duì)β-內(nèi)酰胺酶穩(wěn)定性高等優(yōu)點(diǎn),已成為治療IRPA感染最有效的抗生素[3]。然而,隨著該類抗生素在臨床治療中的廣泛應(yīng)用,銅綠假單胞菌對(duì)它的耐藥率也呈不斷上升的趨勢(shì),中國(guó)CHINET細(xì)菌耐藥性監(jiān)測(cè)報(bào)道,1994~2001年中,銅綠假單胞菌對(duì)亞胺培南的耐藥率由1994年的8.5%上升到2009 年的 30.5%[4-5]。

我院分離的銅綠假單胞菌對(duì)亞胺培南耐藥率為24.75%(100/404),90.0%的菌株從痰液中分離得到,表明耐亞胺培南的銅綠假單胞菌多引起呼吸道感染,是醫(yī)院獲得性肺炎的首位病因,這和國(guó)內(nèi)外諸多相關(guān)報(bào)道一致[6-8]。

在科室分布方面,我院耐亞胺培南銅綠假單胞菌多來(lái)自ICU(31.0%),這可能與患者多為急重癥或昏迷階段,免疫力低、病程和住院時(shí)間長(zhǎng)、有手術(shù)史以及較頻繁地大量使用廣譜抗菌藥物,造成菌群失調(diào),易繼發(fā)感染銅綠假單胞菌,且長(zhǎng)時(shí)間在藥物選擇性壓力下,耐藥性菌株成為優(yōu)勢(shì)菌群,因此,這些科室分離的耐亞胺培南銅綠假單胞菌亦多為多重耐藥菌株。

藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示(表3),100株IRPA中,對(duì)阿米卡星的敏感性最好(73.0%),其次是哌拉西林/他唑巴坦(63.0%)、哌拉西林(59.0%)、慶大霉素(58.0%)、頭孢他啶(57.0%),其余藥物的敏感率均<50.0%。100株IRPA對(duì)氨芐西林、氨芐西林/舒巴坦、頭孢唑啉、氯霉素全部耐藥。同處廣東地區(qū),我院IRPA對(duì)氨基糖苷類和喹諾酮類抗生素的耐藥率均<53.0%,而姚芬等[7]報(bào)道的耐藥率達(dá)到95%以上,這可能跟不同醫(yī)院臨床用藥習(xí)慣不同有關(guān)。由此可見(jiàn),重視和加強(qiáng)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè),優(yōu)先選用低耐藥可能性的抗生素,合理應(yīng)用廣譜抗生素,將有助于避免IRPA引起醫(yī)院感染流行。

銅綠假單胞菌對(duì)碳青霉烯類抗生素的耐藥機(jī)制包括β-內(nèi)酰胺酶的產(chǎn)生、外膜通透性的降低和主動(dòng)外排系統(tǒng)的表達(dá)。金屬酶(metallo-β-lactamases,MBL)是一類能夠水解包括碳青酶烯類在內(nèi)的所有β-內(nèi)酰胺類藥物的β-內(nèi)酰胺酶,主要通過(guò)基因盒,整合子和轉(zhuǎn)座子的形式傳播。MBL包括四種類型:IMP型金屬酶,已報(bào)道的超過(guò)19種;VIM型金屬酶,已超過(guò)11種;SPM-1型金屬酶和GIM-1型金屬酶。MBL編碼基因多位于整合子上,其中以IMP型和VIM型 最為常見(jiàn)[1]。從實(shí)驗(yàn)結(jié)果看,2009年1月~2010年12月收集的耐亞胺培南的銅綠假單胞菌中僅發(fā)現(xiàn)1株產(chǎn)IMP型金屬酶菌株,提示產(chǎn)IMP型金屬酶是抗菌后效應(yīng)(PAE)對(duì)IMP耐藥的機(jī)制之一。另外,我院檢出的IMP型金屬酶經(jīng)分析為IMP-9型,具有該類型金屬酶的銅綠假單胞菌曾在2000年于廣州地區(qū)三家醫(yī)院爆發(fā)流行[9],需引起我院醫(yī)院感染管理科的高度重視。

在β-內(nèi)酰胺類抗生素抑菌過(guò)程中,首先必須穿透銅綠假單胞菌的外膜進(jìn)入周漿間隙才能起作用,oprD2蛋白是目前所知的PAE外膜中唯一有助于抗生素通過(guò)的孔道蛋白,具有配體特異性,能形成亞胺培南的特異結(jié)合位點(diǎn)。一旦oprD2蛋白缺失,PAE對(duì)亞胺培南的MIC由1~2 mg/L上升至8~32 mg/L,而對(duì)其他β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物影響并不大,所以碳青酶烯類抗菌藥物與其他β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物無(wú)交叉耐藥性。一般認(rèn)為,oprD2孔道蛋白的缺失是PAE對(duì)亞胺培南耐藥的主要機(jī)制[10],本實(shí)驗(yàn)中65%的IRPA未擴(kuò)增出oprD2基因,表明大多數(shù)菌株存在oprD2基因突變,導(dǎo)致oprD2表達(dá)減少或不表達(dá),這可能是我院臨床分離銅綠假單胞菌對(duì)亞胺培南耐藥的主要機(jī)制。

總之,IRPA對(duì)臨床常用抗生素耐藥情況非常嚴(yán)峻,PAE對(duì)亞胺培南耐藥機(jī)制復(fù)雜,產(chǎn)酶、孔道蛋白o(hù)prD2基因缺失以及外排泵出機(jī)制三者可單獨(dú)或同時(shí)存在。應(yīng)加強(qiáng)臨床細(xì)菌耐藥性的發(fā)生和發(fā)展的監(jiān)控,盡量獲得細(xì)菌學(xué)證據(jù),并根據(jù)細(xì)菌的體外藥物敏感結(jié)果聯(lián)合選用抗生素。另外,未來(lái)這類產(chǎn)酶銅綠假單胞菌可能會(huì)引起醫(yī)院感染的暴發(fā)和流行,必須加強(qiáng)耐藥監(jiān)測(cè)。

[1]顏英俊,糜祖煌,劉華,等.耐亞胺培南銅綠假單胞菌耐藥特征及其耐藥機(jī)制的研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2007,17(6):627-630.

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[10]時(shí)東彥,魏宏蓮.5年間耐亞胺培南銅綠假單胞菌耐藥性監(jiān)測(cè)及耐藥機(jī)制探討[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2010,20(12):1654-1656.

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