全國(guó)種豬遺傳評(píng)估中心2011年第二次遺傳評(píng)估報(bào)告

為了更好地貫徹落實(shí) 《全國(guó)生豬遺傳改良計(jì)劃 （2009-2020年）》，按照農(nóng)業(yè)部辦公廳印發(fā)的 《全國(guó)生豬遺傳改良計(jì)劃 （2009-2020年）實(shí)施方案》的要求，推進(jìn)全國(guó)種豬性能測(cè)定和遺傳評(píng)估，加快遺傳改良的進(jìn)展，提高我國(guó)種豬的整體質(zhì)量，全國(guó)種豬遺傳評(píng)估中心根據(jù)24家國(guó)家生豬核心育種場(chǎng)上報(bào)到“全國(guó)種豬遺傳評(píng)估信息網(wǎng)”的性能測(cè)定數(shù)據(jù)，進(jìn)行了遺傳評(píng)估。現(xiàn)對(duì)數(shù)據(jù)情況、評(píng)估結(jié)果予以公布和說(shuō)明。

一、數(shù)據(jù)來(lái)源

本次分析數(shù)據(jù)來(lái)自24家國(guó)家生豬核心育種場(chǎng)于2011年8月12日前 （含8月12日）上報(bào)至 “全國(guó)種豬遺傳評(píng)估信息網(wǎng)”的性能測(cè)定數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)范圍2006-2011年，涉及杜洛克、大白和長(zhǎng)白3個(gè)品種。

二、遺傳評(píng)估模型

1.育種值估計(jì)

根據(jù) 《全國(guó)種豬遺傳評(píng)估方案 （牧站 （種） [2000]60號(hào)）》， 采用多性狀動(dòng)物模型最佳線性無(wú)偏預(yù)測(cè) （MTBLUP）方法估計(jì)達(dá)100kg體重日齡、背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)3個(gè)性狀的育種值。具體如下：

（1）達(dá)100kg體重日齡和背膘厚

達(dá)100kg體重日齡或背膘厚觀察值=總平均數(shù)+場(chǎng)年季性別固定效應(yīng)+窩隨機(jī)效應(yīng)+個(gè)體隨機(jī)遺傳效應(yīng) +隨機(jī)剩余效應(yīng)

（2）總產(chǎn)仔數(shù)

總產(chǎn)仔數(shù)觀察值 =總平均數(shù)+場(chǎng)年季固定效應(yīng)+母豬出生的窩效應(yīng)+個(gè)體隨機(jī)遺傳效應(yīng)+母豬永久環(huán)境效應(yīng)+隨機(jī)剩余效應(yīng)

2.父系指數(shù)和母系指數(shù)

?

根據(jù)達(dá)100kg體重日齡、背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)三個(gè)性狀的估計(jì)育種值，分別計(jì)算杜洛克、長(zhǎng)白和大白三個(gè)品種的父系指數(shù)和母系指數(shù)，其中父系指數(shù)包括達(dá)100kg日齡和背膘厚2個(gè)性狀，母系指數(shù)包括達(dá)100kg日齡、背膘厚和總產(chǎn)仔數(shù)3個(gè)性狀。

(1）杜洛克

父系指數(shù)=100-4.21AGE-17.1BF，母系指數(shù)=100-3.16AGE-12.85BF+43.4NB

(2)長(zhǎng)白

父系指數(shù)=100-3.62AGE-14.7BF，母系指數(shù)=100-2.5AGE-10.17BF+34.33NB

(3)大白

父系指數(shù)=100-3.79AGE-15.4BF，母系指數(shù)=100-2.54AGE-10.33BF+34.88NB

其中，AGE：達(dá) 100kg體重日齡的育種值，BF：背膘厚的育種值，NB：總產(chǎn)仔數(shù)的育種值。

3.分場(chǎng)計(jì)算育種值和選擇指數(shù)

由于各豬場(chǎng)之間的場(chǎng)間遺傳關(guān)聯(lián)不大，不適合進(jìn)行聯(lián)合遺傳評(píng)估，因此本次遺傳評(píng)估分開(kāi)計(jì)算各豬場(chǎng)的育種值和選擇指數(shù)，各豬場(chǎng)之間的結(jié)果和排名沒(méi)有可比性。

三、性能測(cè)定數(shù)據(jù)總體情況

根據(jù)2011年8月12日前各核心場(chǎng)上傳至 “全國(guó)種豬遺傳評(píng)估信息網(wǎng)”的數(shù)據(jù)，統(tǒng)計(jì)了24家國(guó)家生豬核心育種場(chǎng)從2006-2011年的測(cè)定數(shù)據(jù)總體情況（如表1所示），各核心場(chǎng)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)見(jiàn)附錄。

四、育種值結(jié)果

根據(jù)父系指數(shù)或母系指數(shù)分別列出各豬場(chǎng)公豬前25名和母豬前50名的個(gè)體，其中杜洛克根據(jù)父系指數(shù)排序，大白和長(zhǎng)白，根據(jù)母系指數(shù)排序。具體結(jié)果詳見(jiàn)附表7。

五、場(chǎng)間關(guān)聯(lián)率

用2006年到2011年8月，24家國(guó)家生豬核心育種場(chǎng)，杜洛克、長(zhǎng)白和大白豬達(dá)100kg體重日齡的測(cè)定記錄，根據(jù)場(chǎng)效應(yīng)的相關(guān)系數(shù)來(lái)度量場(chǎng)間關(guān)聯(lián)程度，即關(guān)聯(lián)率 （connectednessrating，CR）的方法，進(jìn)行長(zhǎng)白豬和大白豬場(chǎng)間關(guān)聯(lián)度的計(jì)算，評(píng)價(jià)種豬場(chǎng)間的遺傳聯(lián)系程度。三個(gè)品種各豬場(chǎng)間的關(guān)聯(lián)率及各場(chǎng)的平均關(guān)聯(lián)率見(jiàn)附表1到附表6。

總體而言，相互有關(guān)聯(lián)的場(chǎng)比較少，有關(guān)聯(lián)的場(chǎng)之間的關(guān)聯(lián)率還比較低。