SSR標(biāo)記與扁穗牛鞭草農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析

摘要：利用ＳＳＲ引物對(duì)４４份外部形態(tài)差異較大的扁穗牛鞭草基因組進(jìn)行掃描，結(jié)合農(nóng)藝性狀，進(jìn)行性狀與標(biāo)記間的關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明，①扁穗牛鞭草群體的農(nóng)藝性狀存在較大變異，其中分蘗數(shù)變異最大，變異系數(shù)達(dá)３４．８％，其次是單株生物量、葉長(zhǎng)和莖葉比，變異系數(shù)也達(dá)２０％以上。②扁穗牛鞭草農(nóng)藝性狀間存在顯著的相關(guān)關(guān)系，單株生物量與葉寬、莖直徑、莖長(zhǎng)呈極顯著正相關(guān)，莖葉比與節(jié)間長(zhǎng)、莖長(zhǎng)呈極顯著正相關(guān)，與分蘗數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān)。③通過(guò)單向分組資料的方差分析，從１８２條多態(tài)性條帶中共檢測(cè)到與扁穗牛鞭草８?jìng)€(gè)農(nóng)藝性狀極顯著相關(guān)的ＳＳＲ標(biāo)記１８?jìng)€(gè)，其中，６個(gè)標(biāo)記分別與２個(gè)以上性狀關(guān)聯(lián)。標(biāo)記對(duì)性狀變異的貢獻(xiàn)率為１５．１％～３２．８％，ＳＧ５－１６０能解釋３２．８％節(jié)間長(zhǎng)表型變異，引物ＳＧ２５的４個(gè)標(biāo)記對(duì)莖直徑表型變異的總貢獻(xiàn)率達(dá)９１．６％。該研究結(jié)果對(duì)早期發(fā)現(xiàn)優(yōu)異種質(zhì)，縮小篩選范圍，降低篩選成本和工作量，加快扁穗牛鞭草育種進(jìn)程有重要意義。

關(guān)鍵詞：扁穗牛鞭草；ＳＳＲ標(biāo)記；農(nóng)藝性狀；關(guān)聯(lián)分析

中圖分類號(hào)：Ｓ５４；Ｑ７８文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：Ａ文章編號(hào)：0439－８114（２０11）07－1494-05

Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＳＳＲ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Markers ａｎｄ Ａｇｒｏｎｏｍｉｃ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ ｏｆ

Ｈｅｍａｒｔｈｒｉａ ｃｏｍｐｒｅｓｓａ

ＣＨＥＮ Ｙｏｎｇ－ｘｉａ１，２，ＺＨＡＮＧ Ｘｉｎ－ｑｕａｎ２，ＭＡ Ｘｉａｏ２，ＸＩＥ Ｗｅｎ－ｇａｎｇ２

（１． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｘｉｃｈａｎｇ Ｃｏｌｌｅｇｅ， Ｘｉｃｈａｎｇ ６１５０００，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ；

２． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｓｉｃｈｕａｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｙａ’ａｎ ６２５０００，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ）

Ａｂｓｔｒａｃｔ： ８ ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ ｏｆ ４４ Ｈｅｍａｒｔｈｒｉａ ｃｏｍｐｒｅｓｓａ ｍａｔｅｒｉａｌｓ ｗｅｒｅ ｍｅａｓｕｒｅｄ ａｎｄ １０ ｐａｉｒｓ ｏｆ ＳＳＲ ｐｒｅｍｉｅｒｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｍｐｌｉｆｙ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｍａｔｅｒｉａｌｓ． Ｓｉｎｇｌｅ ｆａｃｔｏｒ ｖａｒｉａｎｃｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｑｕａｎｔｉｔｉｖｅ ｔｒａｉｔｓ ａｎｄ ＳＳＲ ｍｏｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ： ① ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｖａｒｉｏｕｓ ｖａｒｉａｂｉｌｉｔｙ ａｍｏｎｇ Ｈ．ｃｏｍｐｒｅｓｓａ ｇｅｒｍｐｌａｓｍ． Ｔｈｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ｔｉｌｌｅｒｓ ｗａｓ ３４．８％． Ｔｈｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｂｉｏｍａｓｓ， ｌｅａｆ ｗｉｄｔｈ ａｎｄ ｓｔｅｍ－ｌｅａｆ ｒａｔｉｏ ｗａｓ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ ２０％． ②Ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｗａｓ ｆｏｕｎｄ ａｍｏｎｇ ｔｈｅｓｅ ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ． Ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｂｉｏｍａｓｓ ａｎｄ ｌｅａｆ ｗｉｄｔｈ， ｓｔｅｍ ｄｉａｍｅｔｅｒ， ｂｒａｎｃｈ ｌｅｎｇｔｈ， ａｎｄ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｓｔｅｍ－ｌｅａｆ ｒａｔｉｏ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｎｏｄｅ ｌｅｎｇｔｈ， ｂｒａｎｃｈ ｌｅｎｇｔｈ． Ｈｏｗｅｖｅｒ， ｔｈｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｓｔｅｍ－ｌｅａｆ ｒａｔｉｏ ａｎｄ ｔｉｌｌｅｒｓ ｗａｓ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｎｅｇａｔｉｖｅ． ③Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｏｆ ｏｎｅ－ｗａｙ ＡＮＯＶＡ ｒｅｖｅａｌｅｄ ｔｈａｔ １８ markers ｏｕｔ ｏｆ ｔｈｅ ｔｏｔａｌ １８２ ＰＣＲ ｐｒｏｄｕｃｅｄ ｂａｎｄｓ ｗｅｒｅ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ８ ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ， ａｍｏｎｇ ｗｈｉｃｈ ６ markers ｗｅｒｅ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ ２ ｔｒａｉｔｓ． Ｔｈｅ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｒａｔｅ ｗａｓ ｆｒｏｍ １５．１％ ｔｏ ３２．８％， ａｎｄ ｔｈｅ ＳＧ５－１６０ ｍａｒｋｅｒ ａｃｃｏｕｎｔｅｄ ｆｏｒ ３２．８％ ｏｆ ｔｈｅ ｐｈｅｎｏｔｙｐｉｃ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｏｆ ｉｎｔｅｒｎｏｄｅ ｌｅｎｇｔｈ． Ｔｈｅ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｒａｔｅ ｏｆ ｆｏｕｒ markers ｏｆ ｐｒｅｍｉｅｒ ＳＧ２５ ｗａｓ ａｃｃｏｕｎｔ ｆｏｒ ９１．6％ ｏｆ ｔｈｅ ｐｈｅｎｏｔｙｐｉｃ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｏｆ ｓｔｅｍ ｄｉａｍｅｔｅｒ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｗａｓ ｕｓｅｆｕｌ ｔｏ ｆｉｎｄ ｅｘｃｅｌｌｅｎｔ Ｈ． ｃｏｍｐｒｅｓｓａ ｇｅｒｍｐｌａｓｍ ｅａｒｌｙ， ｒｅｄｕｃｅ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｒａｎｇｅ， ｄｅｃｒｅａｓｅ ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ ｃｏｓｔ ａｎｄ ｗｏｒｋｌｏａｄ， ａｎｄ ａｃｃｅｌｅｒａｔｅ ｂｒｅｅｄｉｎｇ ｐｒｏｃｅｓｓ．

Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ： Ｈｅｍａｒｔｈｒｉａ ｃｏｍｐｒｅｓｓａ； ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ； ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒ； ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ

扁穗牛鞭草（Ｈｅｍａｒｔｈｒｉａ ｃｏｍｐｒｅｓｓａ）為禾本科牛鞭草屬多年生牧草，在我國(guó)主要分布在長(zhǎng)江以南及河北、山東、陜西等地。扁穗牛鞭草生長(zhǎng)期長(zhǎng)、生長(zhǎng)速度快、抗逆性強(qiáng)、產(chǎn)量高，是熱帶、亞熱帶建植人工草地和南方草山草坡改良的優(yōu)良草種。目前對(duì)扁穗牛鞭草的遺傳多樣性［１－３］、生產(chǎn)性能［４］、繁殖特性［５］等方面進(jìn)行了較為深入的研究，但對(duì)多基因控制的數(shù)量性狀位點(diǎn)（ＱＴＬ）定位及與扁穗牛鞭草表型變異相關(guān)分子標(biāo)記的研究，尚未見報(bào)道。

關(guān)聯(lián)分析是一種把候選基因的遺傳變異與目標(biāo)性狀聯(lián)系起來(lái)的技術(shù)，其理論依據(jù)是遺傳標(biāo)記與性狀的連鎖分析［６］。Ｖｉｒｋ等［７］對(duì)４０份具代表性的東南亞水稻種質(zhì)進(jìn)行ＲＡＰＤ標(biāo)記與農(nóng)藝性狀間的關(guān)聯(lián)分析，檢測(cè)到與水稻的分蘗數(shù)、株高、開花期、穗長(zhǎng)、葉長(zhǎng)和粒寬相關(guān)的ＲＡＰＤ標(biāo)記，其中ＯＰＣ－０８－３４０可以解釋４９．８４％分蘗數(shù)變異。后來(lái)，在燕麥［８］、大麥［９－１１］、小麥［１２］、馬鈴薯［１３］、桑樹［１４－１６］、楊樹［１７，１８］等植物上，也找到一些與重要性狀緊密相關(guān)的標(biāo)記。但是，在牧草作物上，關(guān)聯(lián)分析僅見于紫花苜蓿［１９，２０］和早熟禾［２１］。

扁穗牛鞭草結(jié)實(shí)率相當(dāng)?shù)停饕捎脽o(wú)性繁殖，關(guān)聯(lián)分析無(wú)需構(gòu)建專門的作圖群體，為扁穗牛鞭草的ＱＴＬ定位提供了方向。扁穗牛鞭草主要采用傳統(tǒng)育種方法，對(duì)表型進(jìn)行選擇，需要進(jìn)行多年多點(diǎn)觀測(cè)，耗時(shí)長(zhǎng)效率低。本研究在扁穗牛鞭草表型研究的基礎(chǔ)上，進(jìn)行ＳＳＲ標(biāo)記與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析，篩選與重要農(nóng)藝性狀緊密關(guān)聯(lián)的ＳＳＲ分子標(biāo)記，以期從分子水平解釋扁穗牛鞭草遺傳變異規(guī)律和機(jī)制，為篩選優(yōu)異種質(zhì)、加快育種進(jìn)程奠定基礎(chǔ)。

１材料與方法

１．１材料

１．１．１扁穗牛鞭草材料采自四川、重慶、云南、貴州等地不同生境、野生狀態(tài)下，外部形態(tài)差異明顯的扁穗牛鞭草無(wú)性系４１份，及人工草地種植的國(guó)審品種“廣益”、“重高”、“雅安”（表1），每個(gè)無(wú)性系取具２～３個(gè)節(jié)的莖段種植于直徑為３０ ｃｍ的塑料盆內(nèi)，每盆１株，５個(gè)重復(fù)。

１．１．２試劑近緣植物高粱的ＳＳＲ引物，由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成；植物ＤＮＡ提取試劑盒、Ｔａｑ酶、１００ ｂｐ ＤＮＡ Ｌａｄｄｅｒ、Ｍｇ２＋、ｄＮＴＰｓ購(gòu)自天根生化科技（北京）有限公司；其他化學(xué)試劑購(gòu)自成都博瑞克生物技術(shù)有限公司。

１．２方法

１．２．１ＳＳＲ分子標(biāo)記取幼嫩扁穗牛鞭草葉片，按植物ＤＮＡ提取試劑盒步驟提取ＤＮＡ。用０．８％的瓊脂糖凝膠檢測(cè)ＤＮＡ質(zhì)量。從５０對(duì)ＳＳＲ引物中篩選出條帶清晰、多態(tài)性好的１０對(duì)引物（表２）進(jìn)行ＰＣＲ擴(kuò)增。ＰＣＲ體系及程序按照ＷＡＮＧ的方法［２２］。用６％的變性聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行電泳分離檢測(cè)，照相觀察并記錄結(jié)果。

１．２．２農(nóng)藝性狀測(cè)定測(cè)定單株生物量、莖葉比、分蘗數(shù)、葉長(zhǎng)、葉寬、節(jié)間長(zhǎng)、節(jié)直徑、莖長(zhǎng)，其中單株生物量、莖葉比、分蘗數(shù)為５次重復(fù)結(jié)果，其他為１５次重復(fù)結(jié)果。

１．３數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

對(duì)擴(kuò)增條帶進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，在相同的遷移位置，有帶記為“１”，無(wú)帶記為“０”，僅記錄清晰強(qiáng)帶和重復(fù)性好的弱帶。根據(jù)標(biāo)記帶型的有無(wú)將群體劃分為２個(gè)亞群體：組１和組０，對(duì)農(nóng)藝性狀進(jìn)行單因素方差分析和相關(guān)分析［２３］，分析軟件為ＳＰＳＳ１５．０。用組間方差與總方差的比值求得標(biāo)記產(chǎn)生的性狀變異占性狀總變異的百分率，即標(biāo)記對(duì)該性狀變異的貢獻(xiàn)率［１８］。

２結(jié)果與分析

２．１農(nóng)藝性狀的表型變異

研究結(jié)果表明，所選擇扁穗牛鞭草群體的農(nóng)藝性狀存在較大變異（表3），其中分蘗數(shù)變異最大，變異系數(shù)達(dá)３４．８％，其次是單株生物量、葉長(zhǎng)和莖葉比，變異系數(shù)也達(dá)２０％以上，葉寬、節(jié)間長(zhǎng)、莖直徑、莖長(zhǎng)也存在不同程度的變異，變異系數(shù)分別為14.4%、17.3%、16.3%、16.2%。扁穗牛鞭草葉片最長(zhǎng)為２８．９ ｃｍ，最短為１０．４ ｃｍ；葉片寬度最大值為０．９７６ ｃｍ，最小值為０．４７５ ｃｍ；節(jié)間最長(zhǎng)為１０．１ ｃｍ，最短為５．１ ｃｍ；莖直徑最大為０．５７１ ｃｍ，最小為０．２７８ ｃｍ；莖最長(zhǎng)為１２４．２ cｍ，莖最短為６３．１ cｍ；單株分蘗數(shù)最多達(dá)２２７．３個(gè)，最少達(dá)４５．３個(gè)；單株生物量最高達(dá)９１３．３６ ｇ，最少僅為２８１．３４ ｇ；莖葉比最高為５．１，最低為２．３。

２．２農(nóng)藝性狀表型相關(guān)

對(duì)農(nóng)藝性狀進(jìn)行相關(guān)分析，結(jié)果表明，扁穗牛鞭草的農(nóng)藝性狀間均存在顯著或極顯著相關(guān)。對(duì)牧草育種來(lái)說(shuō)，單株生物量和莖葉比是最重要的兩個(gè)指標(biāo)。從表４可知，扁穗牛鞭草單株生物量與葉寬、莖直徑、莖長(zhǎng)呈極顯著正相關(guān)，莖葉比與節(jié)間長(zhǎng)、莖長(zhǎng)呈極顯著正相關(guān)，與分蘗數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān)。利用單株生物量和莖葉比與形態(tài)指標(biāo)的相關(guān)關(guān)系，可對(duì)扁穗牛鞭草種質(zhì)進(jìn)行初步篩選，選擇符合育種目標(biāo)的種質(zhì)作為進(jìn)一步育種的材料。

２．３ＳＳＲ標(biāo)記與性狀的關(guān)聯(lián)分析

采用１０對(duì)ＳＳＲ引物，共擴(kuò)增出２２０條清晰、重復(fù)性好的條帶，片段大小為５０～４００ ｂｐ，其中多態(tài)性條帶為１８２條，多態(tài)率為８２．７％，如ＳＧ５引物對(duì)的擴(kuò)增結(jié)果，見圖１。標(biāo)記位點(diǎn)與數(shù)量性狀的關(guān)聯(lián)分析采用單向分組資料的方差分析方法，即根據(jù)標(biāo)記帶型的有無(wú)將群體劃分為兩個(gè)亞群體——組１和組０，然后進(jìn)行單因素方差分析，獲得與數(shù)量性狀相關(guān)聯(lián)的標(biāo)記位點(diǎn)。通過(guò)單向分組資料的方差分析（表5），共檢測(cè)到與扁穗牛鞭草農(nóng)藝性狀極顯著相關(guān)的ＳＳＲ標(biāo)記１８?jìng)€(gè)，其中有６個(gè)標(biāo)記分別與２個(gè)以上性狀關(guān)聯(lián)，分別是ＳＧ５－１６０（葉長(zhǎng)、節(jié)間長(zhǎng)、莖長(zhǎng)）、

ＳＧ１５－１２７（葉寬、節(jié)間長(zhǎng)、莖直徑）、ＳＧ２５－１５７（葉長(zhǎng)、葉寬、莖直徑）、ＳＧ７－２２０（分蘗數(shù)、單株生物量）、ＳＧ２５－１３６（葉寬和莖直徑）、ＳＧ２６－１６７（節(jié)間長(zhǎng)、莖長(zhǎng)）。單個(gè)性狀關(guān)聯(lián)的標(biāo)記在１～７個(gè)之間，莖直徑和單株分蘗數(shù)關(guān)聯(lián)的標(biāo)記最多，分別為７個(gè)和６個(gè)；其次，葉寬、節(jié)間長(zhǎng)、莖長(zhǎng)、葉長(zhǎng)關(guān)聯(lián)的標(biāo)記分別是４個(gè)、３個(gè)、３個(gè)和２個(gè)，單株生物量和莖葉比關(guān)聯(lián)的標(biāo)記均為１個(gè)。每個(gè)標(biāo)記對(duì)性狀變異的貢獻(xiàn)率為１５．１％～３２．８％，ＳＧ５－１６０能解釋３２．８％節(jié)間長(zhǎng)表型變異，引物ＳＧ２５的ＳＧ２５－１５７、ＳＧ２５－１３６、ＳＧ２５－１２５和ＳＧ２５－１１８ ４個(gè)標(biāo)記對(duì)莖直徑表型變異的總貢獻(xiàn)率達(dá)９１．６％。

３結(jié)論與討論

目前，對(duì)多基因控制的數(shù)量性狀位點(diǎn)（ＱＴＬ）的研究均是利用兩個(gè)具有多態(tài)性的種源（或家系）構(gòu)建分離群體進(jìn)行研究，但是這種人工創(chuàng)造的作圖群體所含的優(yōu)良目標(biāo)基因有限，構(gòu)建群體耗時(shí)，效率低［６］，而且對(duì)于無(wú)性繁殖的扁穗牛鞭草等植物，幾乎不可能得到這樣的分離群體。本研究采用野生扁穗牛鞭草無(wú)性系進(jìn)行分子標(biāo)記與數(shù)量性狀間的關(guān)聯(lián)分析，不僅避免了單一分離群體不易獲得的局限性，而且由于野生扁穗牛鞭草無(wú)性系來(lái)源廣泛、遺傳背景復(fù)雜，可能聚集較多的性狀基因，從而有望全面而系統(tǒng)地揭示出與扁穗牛鞭草農(nóng)藝性狀相關(guān)的ＱＴＬ。本研究中，某些標(biāo)記同時(shí)與多個(gè)性狀相關(guān)聯(lián)，如ＳＧ５－１６０與葉長(zhǎng)、節(jié)間長(zhǎng)、莖長(zhǎng)關(guān)聯(lián)，ＳＧ１５－１２７與葉寬、節(jié)間長(zhǎng)、莖直徑關(guān)聯(lián)，且各農(nóng)藝性狀間也彼此相關(guān)。性狀的相互關(guān)聯(lián)可能是由于控制該性狀的ＱＴＬ相互連鎖或是某個(gè)ＱＴＬ的一因多效造成的，同一標(biāo)記與多個(gè)相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)可能是數(shù)量性狀間在遺傳上相關(guān)造成的［２４］。

連鎖不平衡（Ｌｉｎｋａｇｅ ｄｉｓｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ，ＬＤ）程度決定關(guān)聯(lián)分析的精度和所需標(biāo)記的數(shù)量、密度。通常異花授粉植物重組率高，ＬＤ衰減較快，需要較多的標(biāo)記；而自花授粉植物，特別是閉花授粉植物，ＤＮＡ多態(tài)性偏低，重組率低，ＬＤ衰減距離大，關(guān)聯(lián)分析所需要的標(biāo)記少［２５］。本研究從２２０個(gè)ＳＳＲ標(biāo)記中找到１８?jìng)€(gè)標(biāo)記與農(nóng)藝性狀極顯著相關(guān)，這與扁穗牛鞭草依靠無(wú)性繁殖、ＬＤ衰減慢、ＬＤ程度較高、所采用的ＳＳＲ標(biāo)記可能覆蓋了大部分基因組有關(guān)。

農(nóng)藝性狀是受多基因控制的數(shù)量性狀，且各性狀間均有一定的關(guān)聯(lián)，通過(guò)常規(guī)育種技術(shù)對(duì)農(nóng)藝性狀進(jìn)行改良往往效果不顯著，且周期長(zhǎng)。在ＤＮＡ水平上利用分子標(biāo)記輔助選擇育種對(duì)農(nóng)藝性狀、抗性等重要性狀進(jìn)行早期選擇是很有前景的領(lǐng)域。本研究采用ＳＳＲ分子標(biāo)記對(duì)扁穗牛鞭草材料進(jìn)行掃描，發(fā)現(xiàn)１８?jìng)€(gè)與扁穗牛鞭草農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)的標(biāo)記，其中ＳＧ５－１６０對(duì)節(jié)間長(zhǎng)變異的貢獻(xiàn)率達(dá)３２．８％，引物ＳＧ２５的４個(gè)標(biāo)記（ＳＧ２５－１５７、ＳＧ２５－１３６、ＳＧ２５－１２５和ＳＧ２５－１１８）對(duì)莖直徑表型變異的總貢獻(xiàn)率達(dá)９１．６％。利用與主要農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)的標(biāo)記可對(duì)大量扁穗牛鞭草種質(zhì)進(jìn)行篩選，可在早期發(fā)現(xiàn)優(yōu)異種質(zhì)，降低成本和工作量，這在扁穗牛鞭草新品種培育中有重要意義。

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