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基于顏色矩陣映射的細胞圖像核、漿提取方法研究

2012-10-15 02:09:54王萌張留龍趙運立東營市人民醫院
中國醫療設備 2012年10期
關鍵詞:方法

王萌,張留龍,趙運立東營市人民醫院

a.信息中心;b.放射科;c.設備科,山東 東營 257091

0 前言

在細胞圖像處理過程中,主要是對粘連細胞進行分割,形成獨立的個體,以便計算各單個細胞的相關參數,如面積、直徑、質心等。因此,細胞分割的準確性直接影響到后期圖像處理效果。目前已有多種分割算法,這些算法在進行圖像分割時各有優劣,但單一算法通常很難得到好的效果,綜合多種算法進行處理可得到較理想的分割效果[1-3]。

在分割過程中,通常的做法都是直接將彩色細胞圖像灰度化,但這樣無疑會損失彩色圖像的某些信息,特別是在推片不均產生色斑時,不能很好地將細胞從背景中分割出來,同時也不能較好地保留細胞形態。本研究嘗試充分利用圖像的彩色信息對細胞圖像進行預處理,分別對細胞核、細胞漿進行提取,為后期圖像處理提供更豐富、準確的信息。

1 RGB圖與灰度圖之間的關系

灰度圖又稱灰階圖,把黑色與白色之間按對數關系分為若干等級,成為灰度。灰度分為256階,用灰度表示的圖像成為灰度圖。任何顏色都由紅(R)、綠(G)、藍(B)三原色組成,假如原來某點的顏色為RGB(R,G,B),那么,我們可以通過下面幾種方法,將其轉換為灰度(Gray):

(1)公式計算法:

Gray=R*0.3+G*0.59+B*0.11;

Gray=(R*30+G*59+B*11)/100;

Gray =(R*28+G*151+B*77)>>8 ;

Gray=(R+G+B)/3。

(2)僅取單色:

Gray=R(紅色通道);

Gray=G(綠色通道);

Gray=B(藍色通道)。

通過上述任一種方法求得Gray后,將原來的RGB中的R、G、B統一用Gray替換,形成新的顏色RGB(Gray,Gray,Gray),用它替換原來的RGB(R,G,B)就是灰度圖了.轉換后,灰度值的變化范圍是0~255,它綜合了彩色圖像中3種基色的灰度級變化。

(3)RGB圖的顏色矩陣映射。一幅RGB圖像存儲為數據矩陣,數組中的元素定義了圖像中每一個像素的R、G、B顏色值,像素的顏色由保存在像素位置上的R、G、B的灰度值組合來確定,根據目標區域的偏向色限定R、G、B顏色的取值,從而使目標圖像更明確。

2 圖像預處理方法比較

在matlab運行環境下對彩色細胞圖像進行預處理,目的是使處理后的圖像更易于分割,以達到細胞提取的目的。上述(1)、(2)兩種方法,將彩色圖像轉換成灰度圖分別運用了公式法和單色法處理,而方法(3)利用了原圖像的色彩信息進行顏色矩陣映射。下面將分別介紹此3種方法的實現過程:

方法(1),用函數rgb2gray直接將原RGB圖像灰度化,其中函數rgb2gray使用公式計算法對彩色圖像進行轉換(圖 1~2)。

圖1 RGB圖像

圖2 灰度圖

方法(2),選取單通道顯示[4]。一副完整的圖像,是由R、G、B 3個通道組成的,選擇彩色圖像中一個合適的通道進行分割,在matlab運行環境下顯微病理涂片在R、G、B通道下的顯示,見圖3~5。

圖3 R通道圖像

圖4 G通道圖像

圖5 B通道圖像

從彩色圖像上可見背景偏紅,在R通道上前景和背景對比度較好,便于分割操作。所以選擇圖(3)進行下一步操作。

方法(3),顏色矩陣映射[5]。用交互式(impixel)獲取像素值,取多個細胞核的點,以確定細胞核像素的取值范圍,然后使用imadjust函數來映射彩色圖像的顏色矩陣,取得細胞核、細胞漿(圖6~7)。

圖6 顏色矩陣映射提取細胞核

圖7 顏色矩陣映射提取細胞漿

圖像處理中關鍵技術的應用,無論對邊緣檢測[6]還是形態學操作,都希望圖像的前景、背景對比度越明顯越好。經比較:圖2對比度不強,細胞漿難以與背景區分;圖3提取細胞核可行,但一些外沿的細胞漿與背景色斑較難區分;圖6可直接識別細胞核,背景干擾較少;圖7利于提取細胞漿,細胞漿與背景區分較明顯,為下一步圖像處理能提供更準確的信息。本研究采用顏色矩陣映射法實現,具體實驗步驟如下。

3 顏色矩陣映射法實驗步驟[7-8]

用交互式(impixel)方法在圖1中獲取像素值,取多個細胞核(顏色深度不同)的點,按先后順序依次顯示像素值,每1行為1個點的像素值。將細胞核像素值的大體取值范圍0~255轉換為與之對應的0~1值(表1)。該取值用于確定一個范圍參考,不必每次都做此步驟。

表1 細胞核的大體取值范圍及其對應的數值轉換關系

使用imadjust函數來映射彩色圖像的顏色矩陣,取得有意義的部分:

此式表示,將原圖像中的亮度值映射到新圖像中的新參數值,low_in為最低輸入值,high_in為最高輸出值,low_out為最低輸出值,high_out為最高輸入值,參數gamma默認為1 線性映射。即將low_in~hige_in之間的值映射到low_out~high_out,low_in以下與high_in以上的值被剪切掉了。也就是說,low_in以下的值映射到low_out,high_in以上的值映射到high_out。

對RGB圖像的R、G、G調色板分別進行調整。即隨著顏色矩陣的調整,每一個調色板都有唯一的映射值。由表1可知:R(0.38~0.8)、G(0.29~0.61),B 通道顏色較少,此處可不取。即原細胞圖像中紅色調色板中像素值<0.38的像素都將被置為0,>0.8的都將被置為1,原圖像中綠色調色板中像素值<0.29的像素都將被置為0,>0.61的都將被置為1。

細胞核表達式為 : imadjust(I,[0.38 0.29 0; 0.8 0.61 .01],[]);執行此式得到了圖6。

我們用選取細胞核的方法選取細胞漿。像素的取值范圍及對應轉換關系,見表2。

表2 選取細胞漿像素的取值范圍及對應轉換關系

由表2可知,對應的數值轉換后,R(0.74~0.93)、G(0.54~0.77),因原圖像B通道顏色較少此處可不取。即原細胞圖像中紅色調色板中像素值<0.748的像素都將被置為0,>0.93的都將被置為1;原圖像中綠色調色板中像素值<0.54的像素都將被置為0,>0.77的都將被置為1。

細胞漿表達式為: imadjust(I,[0.74 0.54 0; 0.93 0.77 .01],[])

執行此式得到了圖7。

4 結束語

本研究提出了一種目標性更強的背景分割方法。采用顏色矩陣映射方法能夠更充分地利用彩色圖像的色彩信息,為圖像的后期處理提供了更可靠的數據。經過色彩矩陣映射法預處理的圖像再進行灰度化,其前景、背景對比度更強,對后期的圖像分割等處理更有實際應用意義。

[1] 丁宏,王澤,施月玲.粘連細胞分割算法的研究與實現[J].計算機應用與軟件,2008,25(4):202-203.

[2] 王兆仲,趙宇,周付根,等.血細胞圖像的自適應分割[J].中國體視學與圖像分析,2002,7(1):49-52.

[3] 李宗林,羅曉暉,蔣愛德.顯微細胞的圖像分析技術[J].機械工程與自動化,2006,(2):146-148.

[4] 劉國慶,傅蓉.基于優勢背景色的細胞圖像綜合分割方法[J].計算機工程與設計,2011,32(6):2080-2082.

[5] 曹茂永,徐小平,郁道銀.具有光照強度不變性的顯微細胞圖像處理算法[J].光學技術,2003,29(5):575-577.

[6] 胡麗琴,宋麗梅.基于灰度形態學的紅細胞圖像邊緣檢測[J].傳感器與微系統,2009,28(3):98-100.

[7] 張毓晉.圖像工程(上冊)圖像處理[M].北京:清華大學出版社,2006.

[8] 張強,王正林.精通MATLAB圖像處理[M].北京:電子工業出版社,2009.

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