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鴨流感病毒HA基因遺傳變異分析

2012-11-20 05:48:40馬德明解觀增楊志隆河北省故城縣畜牧水產局河北衡水253800莊燕飛常維山山東農業大學動科院山東泰安
山東畜牧獸醫 2012年8期
關鍵詞:分析

馬德明 解觀增 楊志隆 (河北省故城縣畜牧水產局 河北 衡水 253800) 莊燕飛 常維山 (山東農業大學動科院 山東 泰安)

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鴨流感病毒HA基因遺傳變異分析

馬德明 解觀增 楊志隆 (河北省故城縣畜牧水產局 河北 衡水 253800) 莊燕飛 常維山*(山東農業大學動科院 山東 泰安)

本文根據近年來中國醫學機構發表的分離自我國鴨群的流感病毒HA基因,與我國正在使用的流感疫苗等毒株的HA基因進行了遺傳進化分析。結果顯示,目前我國流行的鴨流感病毒與H5N1 Re-5最接近,但是也有一定程度的變異。

鴨流感病毒 血凝素基因 遺傳變異

引起鴨發病并造成損失的流感病毒以H5亞型毒株最為常見,一般小鴨比老鴨易感。健康鴨接觸病鴨或被病毒污染的飼料、設備、運載工具、蛋筐、衣物、鞋帽等就會感染發病,并迅速傳播開來。該病一年四季均可發生,但以每年冬季至次年初夏多發,特別是氣候驟變、寒流過后或陰雨連綿的天氣最易暴發。該病傳播極快,在數天內即可蔓延到鄰近鴨場。單純鴨流感死亡率很低或無死亡,多因繼發感染而導致死亡,但是近年來單純鴨流感病毒感染也可造成嚴重的損失。本文分析了兩株我國醫學機構發表的分離自我國鴨糞便和圈養鴨群的流感病毒HA基因與我國正在使用的禽流感疫苗等毒株的HA基因的進行了遺傳變異分析。

1 材料與方法

1.1 基因來源 見表1。

表1 基因來源

注:CY098790由中國疾病預防與控制中心分離[1],JN646713由杭州某醫院分離[2], GU596984由揚州大學分離[3]。

1.2 同源性比較與進化樹分析 將表1中病毒序列從GENBANK上下載,利用DNAStar軟件比較同源性、制作進化樹。

2 結果

2.1 鴨流感病毒HA基因同源性比較 近年我國來分離的鴨流感病毒與其他流感病毒HA基因同源性比較,見表2。

表2 近年來分離的鴨流感病毒與其他流感病毒HA基因同源性比較

由表2可以看出2009年分離的CY098790與Re-5的HA基因的同源性為97.3%;2011年分離的JN646713與Re-5的同源性為94%。

2.2 鴨流感病毒HA基因遺傳進化樹 近年我國來分離的鴨流感病毒與其他鴨流感病毒HA進化關系,見圖1。

圖1 鴨流感病毒HA基因遺傳進化樹

由圖1可以看出,2009年分離的CY098790與Re-5和2008年分離的GU596984可聚為同一支,2011年分離的JN935004與CY098751為另一支,Re-1和Re-4與上述毒株相距更遠。

3 討論

近年來,國內獸醫領域鮮有鴨高致病性禽流感病毒的研究報告。我國目前使用的H5N1 Re-4、H5N1 Re-5疫苗原始毒株都是2006年分離的[4],距今已6年,本文證明在此期間我國流行的H5N1已發生了一定程度的變異。

根據遺傳進化樹圖可知,2009年以前分離的鴨流感病毒可與Re-5分為一支,2011年分離的鴨流感病毒與目前使用的三株疫苗毒株H5N1 Re-1,Re-4,Re-5親緣關系都有一定距離,雖然與Re-5親緣關系相對較近,但是已不屬于同一家族。有鑒于此,我國疫苗研發部門應盡快推出新的鴨用流感(H5N1)疫苗。

[1] Xiu-Feng Wan,Libo Dong,Yu Lan,et al.Indications that Live Poultry Markets Are a Major Source of Human H5N1 Influenza Virus Infection in China. J Virol. 2011,85(24): 13432–13438

[2] Hai-Bo,W., Chao-Tan,G., Ru-Feng,L.,et al.Characterization of a highly pathogenic H5N1 avian influenza virus isolated from ducks in Eastern China in 2011. Arch. Virol. 2012,157(6): 1131-1136

[3] 顧敏, 劉文博, 曹軍平等. 1株含H9N2內部基因的H5N1亞型基因重配禽流感病毒的全基因測序及遺傳進化分析[J]. 病毒學報, 2010, 26(4): 298-304.

[4] 田國彬, 曾顯營, 鐘功勛等. H5N1亞型禽流感變異株滅活疫苗種毒Re-4株的生物學特性及免疫原性研究[J]. 中國預防獸醫學報, 2009, 31(9): 717-720.

(2012–07–29)

S834.2

A

1007-1733(2012)08-0014-02

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