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魅力無窮的極地微生物研究

2013-09-07 01:26:20中國極地研究中心
世界科學 2013年7期
關鍵詞:生物研究

羅 瑋(中國極地研究中心)

“雪龍”號極地科考船在南極

●在海洋食物鏈中,微生物本身作為有機物質的初級生產者,成為許多原生動物、浮游動物和底棲動物等的食物,也在海洋生態系統的物質和能量轉化、生物地球化學循環中擔當著特殊而極其重要的角色;包括極區海洋生態系統的結構與功能,以及海洋生物資源及其可持續發展,愈來愈成為人們普遍關注的問題之一。

人類自南、北極分離出微生物后,各國的微生物學家相繼在南、北極地區進行了大量的研究工作,證實了在極地冰、雪、水、土壤及巖石樣品中廣泛存在著各種類型的微生物。哪怕是最嚴酷的極地冰雪生態系統,也有豐富的微生物多樣性。以極地海冰為例,作為地球上最寒冷的環境之一,其環境溫度在0℃到-35℃變動;與淡水冰不同,海冰是個半固體矩陣,冰晶間彌漫著大小不等、充滿鹵水的孔道網絡,在海冰內部形成了溫度、鹽度和營養鹽濃度急劇變化的封閉或半封閉的微生境。在這極端環境中存在著復雜的充滿活力的海冰微生物群落,包括游離病毒、細菌、自養藻、原生動物和后生動物;其中包括大量嗜冷和耐冷微生物。

除掉驚人的生物多樣性,科學研究同時還證明微生物在南、北極自然環境下的物質循環、生物地球化學過程中擔負著重要作用。極區微生物類群不但在極地有機物質的礦化過程中起重要作用,而且在極區其他生境如湖泊、海洋等食物鏈中本身也是許多原生動物、浮游動物和底棲動物的食物來源。極地微生物通過參與極區陸地及海洋的營養循環過程和生物生產過程,在極地生態與環境系統中具有重要的地位和作用。以海冰細菌為例,不僅作為初級生產者為群落中的原生動物、后生動物提供食物,更重要的是作為分解者在海冰有機物礦化中起著主導作用,據估算海冰初級生產量的20%~30%通過細菌進行物質循環。

極地微生物的生物地理分布

傳統的技術,例如分離培養技術和顯微鏡分類鑒定技術已經無法滿足我們在特殊生境中的微生物多樣性、微生物區系分子組成以及微生物系統進化等方面的研究要求。首先,由于缺乏細胞表面的形態學特征,一些微型生物,特別是微微型生物(3微米以下)無法通過顯微鏡技術來鑒定;其次,用來分離培養微生物類群的培養通常具有選擇性,而且自然環境中有85%~99.9%的微生物至今還不可純培養,這就造成了對特殊生境中微生物多樣性的低估。

另外,在傳統的富集、培養、分離和研究過程中可能造成微生物多樣性丟失、種群構成發生變化等弊端。因此,多種不依賴于培養的分子生物學方法促進了我們對微生物生態學的理解。應用分子生物學技術直接從海洋環境中分離微生物的遺傳物質,從而為極地微生物生態學注入了新的活力,甚至改變了人們對極地微生物群落多樣性的認識。

現代分子生物學技術是在基因水平上研究極地微生物群落組成的多樣性及動態性。近年來,中國極地研究中心的科研人員通過不斷地參與我國及與各國合作的南、北極科學考察,對極區海洋、海冰、大型冰川、湖泊(包括冰川覆蓋下的湖泊)、土壤、極地內陸深冰芯、深海等各個極區生境的微生物多樣性進行著調查及研究,尤其是一些需要特殊后勤支持的生態環境樣品現場采集和分析,如深冰芯鉆探、深海樣品采集等,需要多個學科融合的項目支撐開展。通過這些現場采樣觀測、生物活體分離培養及保藏、基因文庫、DGGE、454高通量測序等多種手段對極區微生物的生物地理分布進行研究,不斷的有新的種類被發表在各個國際期刊上,極大地拓展了我們對極地微生物多樣性,及微生物類群與極地生物地球科學中的重要作用等科學領域的認知水平。

氣候變化與極地微生物生態系統

如今,全球氣候變暖和各種全球性氣候異常現象的加劇,使得人們更加重視對地球各個圈層(即大氣圈、水圈、生物圈和巖石圈)內部變化及其相互作用的研究,逐步揭示全球氣候變化及其動因已成為當今地球科學必須面對并解決的重大科學問題。極地是地球冷源之一,是全球氣候變化的啟動器,它在整個地球系統中占有重要的位置,因而有關極區海洋生態環境的效應及其對全球氣候變化的影響和響應、極區海洋生態系統的結構與功能和海洋生物資源及其可持續發展,愈來愈成為人們普遍關注的問題。很多的研究監測表明,正經歷著顯著變化的極地生境,將對極區各個生態系統產生著深遠的影響。

微生物在極區海洋生態系統中占有重要的地位,成為極區海洋生態系統研究的重要組成部分。它們在海洋有機物質的生物地球化學循環中起著重要作用,如分解有機物質并釋放出基本要素,在海洋食物鏈中,它們本身又作為有機物質的初級生產者,成為許多原生動物、浮游動物和底棲動物等的食物,在海洋生態系統的物質和能量轉化以及生物地球化學循環中擔當特殊而極其重要的角色。例如浮游細菌,能夠在遠洋生物量中占據優勢地位,成為從溶解有機碳到顆粒有機碳這一重要通量的聯系紐帶,并且在海洋呼吸系統中占據實質性的部分。

隨著全球氣候的急劇變化,極區微生物及其對溫度的敏感性成為當今各類監測研究、生態模型構建中的一大亮點。由于極區比其他地區更持續快速的升溫,冰蓋的逐漸消失和海水持續增溫,使得海洋浮游生態系統中這些較低等群落已成為微食物環中最脆弱的一環。在南、北極高緯地區,微生物群落組成結構將有何種變化、豐度和時空分布特點在快速變化的海洋生態環境中扮演何種角色,已成為極區深入開展微生物生態學研究的關鍵問題之一,亦是極區生態系統中對全球氣候變化快速響應的先驅類群。

極區微生物抗逆性及其應用前景

極地獨特的地理及氣候特征,形成了一個干燥、酷寒、強輻射的自然環境,生存于其中的微生物具備了相對獨特的分子生物學機制和生理生化特性,如嗜冷和耐冷特性、抗強輻射等。同時,其他一些耐鹽微生物、中溫及嗜熱微生物的發現,也大大豐富了極地微生物資源的多樣性。南、北極是一個潛在的、重要的微生物資源庫,它不僅是微生物新種屬的生存繁衍地,也是具有獨特生態系統微生物的生存繁衍地,更是產生新型生物活性物質和先導化合物(如酶、抗生素、多糖及脂類等)微生物株系的潛在種源地。

自從1985年在南極發現臭氧層空洞以來,大氣平流層臭氧層破壞已經成為人們最為關心的全球問題之一。破毀臭氧層的主要原因是氟氯烴化合物和哈龍等鹵族化合物的大量使用。近年來,這些物質對臭氧層的破壞速度大大加快,在南極和北極上空形成了臭氧層空洞。由于臭氧層的變薄,極地的UV-B水平高于溫帶、熱帶和亞熱帶緯度區。而極地臭氧層變化則更為敏感,對極地的生態系統也將產生不可推測的影響。

由于臭氧層的嚴重破壞,人們非常重視紫外線輻射(UVR,200nm~400nm)對生態系統可能造成的影響,以中間波長280nm~320nm的紫外線UV-B輻射最為引人關注。以極地微藻對UV-B的增強效應研究為例,UV-B輻射增強對微藻細胞內大分子物質、核酸的合成、及藻類多糖含量造成影響。UVB輻射可使某些藻體中的孢子花粉素(sporopollenin)、三苯甲咪唑氨基酸(MAAs)等 UV-B 吸收物質增加。有些藻類在強UV-B環境中,能合成抗UV-B的同功能物質以適應這種環境。

位于上海浦東新區的中國極地研究中心

極地微藻被證明含有DNA損傷的修復機制,還可以合成抗紫外線物質來吸收紫外線,使得一定強度內的UV-B不會對微藻細胞造成傷害。此外,UV-B還可以影響微藻的保護酶系統、影響自由基的產生速率。對極地藻類抗UV-B輻射的物質研究主要集中在類胡蘿卜素、多糖和UV吸收色素。這些極地微生物對不同強度UV-B輻射的反應,將為深入了解極地微型生物對UV-B輻射的敏感程度,以及目前強UV-B輻射下的極區水生態系統構建基礎。

在嚴酷的極地環境中,低溫是一個非常重要的環境因素,極地的低溫環境對生存于其中的微生物產生了深刻而廣泛的影響。低溫通過各種途徑影響生命活動:降低細胞的生化反應速率、影響某些細胞組分的穩定性以及冷凍所造成的破裂作用。盡管低溫有著很強烈的副作用,但是極地的微生物為了生存,需要一系列的耐受低溫的特性,或者說適應性來將極端環境所造成的損傷降低到最低限度。

盡管在溫帶地區也能夠發現這些細胞及其生命活動的機理,然而,極地的特殊理化條件造就了一群非常強壯和有韌性的微生物群落。由于低溫微生物具有抗低溫特性,能在低溫條件下生長、繁殖,由此在酶分子水平、細胞膜以及細胞質等各個方面引發了精細組成和結構方面的變化,因而彌補了低溫對細胞生長的消極影響,這在工業生產,特別是在食品工業中有重要價值。

應用低溫微生物可以提供許多可能性:在可防止微生物污染 (尤其是在連續運轉系統中)的0℃~20℃溫度范圍內 (此時同源的嗜溫型酶不活潑),低溫微生物具有高生長速率、高酶活力及高催化效率,可大大縮短處理過程的時間并省卻昂貴的加熱/冷卻系統,因而在節能方面有相當大的進步:經過溫和的熱處理即可使低溫酶的活力喪失,而且低溫或適溫處理不會影響產品的品質。

在低溫酶類中,脂酶和蛋白酶具有相當大的潛力,許多微生物都產生這兩種酶:其中脂酶可作為食品的風味改變酶、去污劑添加物或立體特異性催化劑等,而蛋白酶也可被大量應用于食品工業(啤酒的處理、面包店中的應用、發酵食品的生產、奶酪生產中的加速成熟作用)、洗衣業、皮革鞣制以及對X光膠片上銀的回收等。低溫微生物亦可作為生產醫療用途產品的潛在的適宜工具:如適冷性類流感病毒被認為是對付這種感染的有效疫苗。

隨著對極地微生物研究的不斷拓展,人們對“漠漠荒原”的極地生態系統,尤其是肉眼不能見的微型生物生態系統有了更深入的了解。就像輕輕推開一扇門,那里蘊藏著一個豐富無垠的、嶄新的生物世界。

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