江為 谷慧英 王志敏 宋明 湯青林
(西南大學(xué)園藝園林學(xué)院 南方山地園藝學(xué)教育部重點實驗室 重慶市蔬菜學(xué)重點實驗室,重慶 400715)
擬南芥花分生組織決定基因AGL24對花發(fā)育的影響
江為 谷慧英 王志敏 宋明 湯青林
(西南大學(xué)園藝園林學(xué)院 南方山地園藝學(xué)教育部重點實驗室 重慶市蔬菜學(xué)重點實驗室,重慶 400715)
AGAMOUS-LIKE 24(AGL24)基因編碼MADS蛋白,在植物花發(fā)育的不同時期發(fā)揮著重要的作用。綜述了AGL24如何通過和其他花分生組織決定基因的相互作用來影響擬南芥花的發(fā)育,調(diào)節(jié)開花時間,這將有助于人們對開花基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有更進(jìn)一步的認(rèn)識,能夠在生產(chǎn)上有效的調(diào)控開花時間,從而為植物育種提供借鑒。
擬南芥 AGL24 花發(fā)育
高等植物通過自主途徑、光周期途徑、低溫春化途徑以及赤霉素途徑等響應(yīng)發(fā)育及環(huán)境信號,調(diào)節(jié)植物從營養(yǎng)生長向生殖生長轉(zhuǎn)變。在擬南芥中,自主途徑會響應(yīng)植物不同發(fā)育時期的內(nèi)源性信號;光周期途徑和春化途徑受光照時長和溫度變化等環(huán)境信號調(diào)控[1,2];赤霉素是非誘導(dǎo)性條件下開花所必須的,施加外源赤霉素能夠促進(jìn)開花。目前對擬南芥突變體庫的研究發(fā)現(xiàn),至少有20個基因參與對植株開花發(fā)育的調(diào)控。對突變體的表型與上位性關(guān)系的研究發(fā)現(xiàn),這些開花調(diào)控基因分布在不同的開花途徑中[3-5],調(diào)節(jié)植物開花時間。而植物成花過程是由一個復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的,在這個調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中,MADS-box轉(zhuǎn)錄因子中的SHORT VEGETATIVE PAHSE(SVP)和AGAMOUS-LIKE24(AGL24)在生殖發(fā)育的不同時期發(fā)揮著相當(dāng)重要的作用[6-9]。這兩個基因序列同源性較高,但是在開花轉(zhuǎn)換時期它們的功能卻截然相反。SVP是抑制開花的因子,而AGL24卻能夠促進(jìn)開花轉(zhuǎn)換。目前,有關(guān)SVP的功能和作用機(jī)制已有較多報道,但是花分生組織決定基因AGL24的分子機(jī)制鮮有報道。本文是在前人研究基礎(chǔ)上綜述了擬南芥AGAMOUS-LIKE 24(AGL24)的功能及其與互作基因調(diào)控擬南芥花發(fā)育和影響開花時間的機(jī)制(圖1),這為人們深入了解AGL24在開花調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的重要作用提供借鑒。
在擬南芥中,AGL24編碼典型的MADS域蛋白,
包含N端保守的MADS-box結(jié)構(gòu)域和第88-156殘基間相對保守的K-box結(jié)構(gòu)域。序列比對發(fā)現(xiàn),AGL24與開花負(fù)調(diào)因子SHORT VEGETATIVE PHASE(SVP)高度相似[6]。原位雜交表明:AGL24能在營養(yǎng)生長期的莖端分生組織、新葉原基的整個區(qū)域以及生殖生長期的葉片維管束中表達(dá)。

圖1 調(diào)控擬南芥花發(fā)育的基因模式圖
擬南芥的花發(fā)育可細(xì)分為20個時期,每個發(fā)育時期的的特點各異(圖2,表1)[10]。在花發(fā)育的第1個時期,AGL24在莖尖和新生花分生組織中表達(dá)。在花發(fā)育的第2、3時期以及整個花絮分生組織中,AGL24也都有表達(dá)。在花發(fā)育的第6個時期,AGL24基因的表達(dá)局限于雌蕊和雄蕊的原基中。到了花發(fā)育的第8個時期,AGL24主要在心皮和胚珠內(nèi)中表達(dá)。

圖2 擬南芥花發(fā)育的20個時期

表1 花發(fā)育不同時期的標(biāo)志性事件
研究發(fā)現(xiàn),在AGL24持續(xù)表達(dá)的轉(zhuǎn)基因擬南芥植株中,萼片的腋處會有花芽的產(chǎn)生。然而在SVP持續(xù)表達(dá)的轉(zhuǎn)基因擬南芥植株中也有類似的表型,植株產(chǎn)生了異位花。這說明在花發(fā)育的早期階段(花發(fā)育時期1和2)AGL24和SVP在功能上具有一定的冗余性[11]。在ap1突變體中也有觀察到異位花,通過原位雜交試驗發(fā)現(xiàn)在ap1突變體中AGL24和SVP均異位表達(dá)了,這說明異位花的形成是由于這兩個基因的異位表達(dá)造成的。這一點在ap1 agl24或ap1 svp突變體中也得到了證實[12,13],在這些雙突變體中,異位花的數(shù)量明顯降低。由此可以說明在ap1突變體中AGL24和SVP的異位表達(dá)的確是異位花芽形成的原因;同時也說明了在花發(fā)育第2個時期的后期,AGL24和SVP在花的中心必須被抑制以阻止異位花的形成。Liu等[12]認(rèn)為這種抑制作用是由于AP1蛋白通過直接結(jié)合到AGL24和SVP啟動子上的多個MADS-box蛋白結(jié)合位點(CArG boxes),從而抑制AGL24和SVP異位表達(dá)。在擬南芥中,AGL24的過量表達(dá)可以促進(jìn)開花并能夠使花分生組織轉(zhuǎn)化為花序分生組織。由花分生組織基因APETALA1(AP1)直接抑制AGL24和另外兩個調(diào)控花期基因SOC1和SVP,從而抑制了莖發(fā)育進(jìn)程,促進(jìn)花分生組織特征的形成[12,13]。在高溫條件下,
花分生組織中的AGL24和SVP表達(dá)量對B類和C類花同源基因的調(diào)控至關(guān)重要[14]。因此,AGL24在調(diào)控花的發(fā)育和開花時間上發(fā)揮著非常重要的作用。
最近有研究發(fā)現(xiàn),在大王花(又名“霸王花”,Rafflesia,一種肉質(zhì)寄生草本植物,這種寄生性植物有著植物世界最大的花朵,它一生中只開一朵花且沒有葉片)中含有一個和擬南芥中AGL24高度同源的基因RcMADS1,其同源度高于SVP。RcMADS1和AGL24相似,能夠彌補(bǔ)agl24-1和FRIGIDA的晚花表型,但是對于svp-41的早花表型無影響[15]。
已有報道表明5個MADS-box基因?qū)M南芥的開花起著調(diào)控作用:FLC、FLM/MAF1和SVP作為開花抑制因子,而FUL和SOC1作為開花促進(jìn)因子,AGL24與花的抑制基因SVP有著非常高的相似性,但在調(diào)控開花時間上的功能存在差異。過量表達(dá)SVP的植株表現(xiàn)為異常開花,且花器官發(fā)育出現(xiàn)畸形。這表明SVP在調(diào)控開花時間和花的發(fā)育過程中有多種功能。與此類似的是開花促進(jìn)基因FT和抑制基因TFL也是序列高度相似,但對于開花卻起著截然相反的作用[16,17]。在營養(yǎng)發(fā)育期,SVP蛋白作為開花核心調(diào)節(jié)子直接抑制莖尖和葉中的開花整合子SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CO 1(SOC1)的表達(dá)[18]。另外,SVP也能調(diào)控開花途徑整合子FLOWERING LOCUS T(FT)的表達(dá)[18,19]。SVP蛋白與另一個開花抑制因子FLOWERING LOCUS C(FLC)相互作用,抑制開花[18]。與SVP蛋白的抑制功能相反,AGL24和FT蛋白在開花轉(zhuǎn)變期能夠促進(jìn)SOC1的表達(dá)[8,20-22]。AGL24和SVP蛋白與AP1、LUG和SEU相互作用形成多元復(fù)合物,抑制AG的表達(dá)[9,14]。
雖然AGL24基因序列與SVP高度相似,但是agl24突變體的晚花表現(xiàn)型與soc1非常相似。agl24和soc1均表現(xiàn)出正常的光周期響應(yīng),但在長日照及短日照條件下是晚花。除此之外,兩個突變體的晚花表型不能被春化作用有效抑制。結(jié)合遺傳分析與表達(dá)特性研究發(fā)現(xiàn):AGL24是SOC1的一個正調(diào)控因子,在含有FRI株系或者自主途徑突變體中,SOC1的表達(dá)水平通常很低,這是由于FLC的高度表達(dá)造成的,但是AGL24的超表達(dá)會引起這些背景系和早花表型植株中SOC1的上調(diào)。有趣的是,SOC1的超表達(dá)也可以引起AGL24表達(dá)水平的上調(diào),因此,這兩個含有MADS域的轉(zhuǎn)錄因子可以彼此正調(diào)控。AGL24與SOC1分別超表達(dá)對soc1和agl24突變體的開花時間均有影響[8]。
AGL24和SOC1之間除能相互正調(diào)控,也可獨立促進(jìn)花的發(fā)育。二者功能上具有相似性,都能通過低溫春化作用上調(diào)。但它們之間的作用機(jī)制并不相同,SOC1被FLC負(fù)調(diào)控。在哥倫比亞野生型擬南芥(Col)中,F(xiàn)LC的水平相對較低,SOC1的表達(dá)水平很高,在之前所提到的含有FRI株系或是自主途徑突變體中,F(xiàn)LC抑制了SOC1的表達(dá)。春化作用能抑制FLC的表達(dá),從而促進(jìn)SOC1的高度表達(dá)。所以FRI株系以及自主途徑突變體在經(jīng)歷春化作用后,SCO1上調(diào)而FLC下調(diào)。AGL24卻相反,不受FLC調(diào)控。在FRI具有活性或活性喪失的植株經(jīng)歷春化作用后,AGL24的表達(dá)均上調(diào)。因此,AGL24的表達(dá)被春化作用上調(diào)是獨立于FLC調(diào)控途徑的,不受其調(diào)控。有試驗表明缺失FLC的突變體呈現(xiàn)出春化響應(yīng),這進(jìn)一步說明AGL24的調(diào)控是獨立于FLC的春化途徑中的調(diào)控因子[8]。
AGL24和SOC1能夠調(diào)控彼此的mRNA的水平,它們的表達(dá)模式具有一定的冗余性。在蔬菜作物中克隆得到的AGL24和SOC1同源基因在花序分生組織中大量表達(dá)[8]。然而原位雜交顯示,AGL24在花原基時期到花發(fā)育第2個時期均能大量表達(dá)。SOC1卻相反,在新生花原基中不表達(dá),但是在花發(fā)育第2個時期的花中重新出現(xiàn),并且持續(xù)到花發(fā)育的整個過程,在花蕊和心皮中也可檢測到SOC1的表達(dá)[23]。AGL24和SOC1在表達(dá)模式上的不同表明這兩個基因在調(diào)控擬南芥花的發(fā)育上有一些不同的作用。例如,AGL24的過量表達(dá)會引起花的異常發(fā)育,但是目前還沒有關(guān)于SOC1的超表達(dá)會引起花異常的報道。其次,當(dāng)AGL24在soc1突變體中過量表達(dá)時,花異常現(xiàn)象的發(fā)生頻率會大大降低,說明AGL24與SOC1基因在花發(fā)育中的作用具有一定的冗余性。
在調(diào)控開花時間上AGL24與SOC1能影響彼此間的表達(dá)[7,8],AGL24和SOC1在開花調(diào)控中的差
異:首先,雖然AGL24的表達(dá)被春化所調(diào)控,但它不受開花抑制因子FLC的影響。相反,F(xiàn)LC在分生組織中抑制SOC1的表達(dá)并通過抑制FT延遲SOC1的表達(dá)。FT編碼的蛋白作為一種開花信號,可從葉維管組織中長距離運(yùn)輸?shù)角o尖分生組織[21,24,25];其次,在光周期途徑中,AGL24被CONSTANS(CO)影響卻不受FT調(diào)控[7],但SOC1主要受FT直接調(diào)控。同時,CO通過一個目前未知的DNA結(jié)合因子間接的調(diào)控SOC1[23,25,26]。最后,AGL24活性的改變決定開花時間,部分異于SOC1;反之亦然,說明AGL24與SOC1可在各自獨立的途徑中促進(jìn)開花[7,8]。
擬南芥的花由4種類型的花器官組成,即花萼、花瓣、雄蕊和心皮。花器官排列成向心的圓環(huán)形,稱作輪性(whorl)。擬南芥的花由4個花萼組成最外的第1輪、依次向內(nèi)為4個花瓣組成第2輪,6個雄蕊組成第3輪,兩個融合的心皮組成第4輪。
在花發(fā)育過程中,AP1蛋白參與調(diào)控AGL24和SVP的表達(dá)。AP1結(jié)合到這些基因的上游調(diào)控區(qū)域,并且在ap1突變體的花發(fā)育過程中AGL24和SVP的異位表達(dá)導(dǎo)致了在第1輪器官的葉腋內(nèi)有花芽的形成。在ap1-10突變體中,第1輪中含有苞片狀的器官,在萼片中含有二次花,沒有花瓣并且在第3輪中有少量的雄蕊。將ap1-10突變體與agl24-2 svp-41突變體雜交,后代表現(xiàn)為花分生組織缺失,但能持續(xù)產(chǎn)生花序分生組織,這與ap1-1 cal-1雙突變體的表型非常相似[27,28],表明AP1、SVP和AGL24對花分生組織形成具有一定的冗余性。
另外,自花發(fā)育的第2個時期以后,除了AP1,其他花器官決定基因如SEPALLATA1(SEP1)、SEP2、SEP3和AG也會調(diào)控AGL24和SVP,因為在ap1、ag以及sep1 sep2 sep13突變體中,AGL24和SVP的異位表達(dá)形成異位花。AGL24和SVP對AP1有部分的冗余作用,但其功能并不完全相同,AP1蛋白對其起關(guān)鍵的調(diào)控作用。AP1和CAL或AP1和SVP/AGL24的缺失將會完全抑制花的形成,但CAL和SVP/AGL24的缺失卻因AP1的活性仍可誘導(dǎo)花的產(chǎn)生。agl24-2 svp-41 cal-01突變體與agl24 svp-41突變體的表型差異不大,兩個突變體在分子水平上呈現(xiàn)出相似的特點。其突變體中的LFY、AP1的表達(dá)水平均減少,其變化規(guī)律相似,F(xiàn)MI基因表達(dá)量會減少但并不會消失。在這兩突變體中,AP1可能不與SOC1蛋白互作,而是與其他的蛋白發(fā)生相互作用。在agl24-2 svp-41 cal-01 soc1-2突變體中FMI沒有消失,表明在沒有AGL24和SVP蛋白作用的情況下,SOC1蛋白的存在與否對AP1蛋白無關(guān)鍵性影響。
擬南芥的花序為總狀花序,在新生花分生組織中,AGL24、SVP、SOC1及SEP4通過抑制TFL1的表達(dá)共同調(diào)控其花序的分支,TFL1也可影響LFY和AP1的表達(dá),從圖3可以看到在野生型花序分生組織(IM)的橫向的分生組織中,SEP4、SOC1、AGL24及SVP對于AP1抑制TFL1的表達(dá)不可或缺,若這4個基因缺失會使TFL1抑制AP1的表達(dá),從而使花分生組織(FM)轉(zhuǎn)化為花序分生組織(IM)[29]。在新生的花分生組織中,AP1和CAL需要TFL1被抑制才能表達(dá)[27,28,30,31]。此外,F(xiàn)olter等[32]通過酵母試驗發(fā)現(xiàn),AP1、CAL基因能與AGL24、SOC1、SVP和SEP4蛋白發(fā)生相互作用。雙分子熒光互補(bǔ)(BiFC)檢測顯示,在植物細(xì)胞中AP1或CAL蛋白與AGL24、SOC1、SVP或SEP4蛋白發(fā)生了相互作用。在ap1-1 gAP1-2HA轉(zhuǎn)基因家系中,融合有2HA的AP1能在很大程度上彌補(bǔ)ap1-1的開花突變表型。對ap1-1 g AP1-2HA進(jìn)行免疫共沉淀分析顯示:AP1∶2HA蛋白被抗體特異性沉淀下來,這些抗體分別抵抗AGL24、SOC1、SVP及SEP4蛋白。由此表明,AGL24、SOC1、SVP和SEP4蛋白也許是通過與AP1或CAL蛋白在體內(nèi)相互作用來抑制TFL1基因的表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),35S∷AP1對soc1-2 agl24-3 svp-41 sep4-1突變體的花序分支沒有有效的抑制,這表明AGL24、SOC1、SVP和SEP4對AP1賦予花分生組織特性必不可少[29]。
為了進(jìn)一步確定AGL24、SOC1、SVP和SEP4是否間接的抑制TFL1,Wellmer等[33]用地塞米松誘導(dǎo)的AP1-GR系統(tǒng)對ap1-1 cal-1突變體背景的家系進(jìn)行染色體免疫共沉淀分析(CHIP)。利用這個系統(tǒng)他們發(fā)現(xiàn)在花序頂端對AP1蛋白進(jìn)行1 h的地塞米松誘導(dǎo)處理后,TFL1的表達(dá)量下降
50%。CHIP分析表明在地塞米松處理的花序頂端,AGL24、SOC1和SVP附著到TFL1基因部位上的區(qū)域與AP1附著區(qū)域重疊[34],但其在空白處理的組織中未發(fā)現(xiàn)有結(jié)合,證實這3個蛋白結(jié)合到TFL1部位上依靠的是AP1蛋白。利用CHIP進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)在野生型的花序頂端SVP蛋白主要結(jié)合于TFL1上,而在svp-41中,AGL24和SOC1蛋白主要于TFL1上。這3個蛋白的結(jié)合區(qū)域與在地塞米松處理的ap1-1 cal-1 35S:AP1-GR材料中所發(fā)現(xiàn)的結(jié)合區(qū)域一樣。但在soc1-2 agl24-3 svp-41突變體中,SEP4蛋白的結(jié)合區(qū)域和之前AGL24、SOC1和SVP蛋白結(jié)合到TFL1的部位相同。這與在soc1-2 agl24-3 svp-41突變體中SEP4的異位表達(dá)說明SEP4蛋白只有在AGL24、SOC1和SVP都缺失的情況下才會直接抑制TFL1的表達(dá)[29]。可見,AGL24、SOC1、SVP及SEP4間接的抑制TFL1的表達(dá)來共同調(diào)控擬南芥花序的分枝。
最近Chang等[29]研究發(fā)現(xiàn),在水稻中這些MADS-box基因(SVP,AGL24,SOC1,SPE4)的同源基因通過調(diào)控類似于TFL1基因的表達(dá)來決定穗的分枝。他們的發(fā)現(xiàn)揭示了在開花植物中有一個決定花序結(jié)構(gòu)的保守遺傳途徑,這也為作物生產(chǎn)提供了一個很重要的理論依據(jù)。

圖3 花分生組織中MADS-box基因協(xié)同抑制TFL1的表達(dá)來調(diào)控花序的結(jié)構(gòu)[29]
擬南芥花器官的同源異型突變有3大類型,第一類為第1輪和第2輪器官受影響,產(chǎn)生心皮狀的花萼和雄蕊狀的花瓣;第二類為第2輪和第3輪器官受影響,產(chǎn)生花萼狀的花瓣和心皮狀的雄蕊;第三類為第3輪和第4輪器官受影響,產(chǎn)生花瓣狀的雄蕊和花萼狀的心皮,而且最內(nèi)兩輪器官的數(shù)量和輪數(shù)也發(fā)生了改變。這表明至少有一些基因在決定擬南芥花器官性質(zhì)上具有同源的功能,而具有同源功能的基因在結(jié)構(gòu)上可能也會有保守性,因此將這些基因稱為同源異型基因。
基于擬南芥的3類同源異型突變以及它們之間的遺傳關(guān)系,Coen和Meyerowitz提出了花器官發(fā)育的ABC模型。隨著研究的深入和克隆出的花同源異型基因數(shù)量的增加,人們在擬南芥中又相繼發(fā)現(xiàn)了D類和E類基因,即目前廣泛所接受的擬南芥花發(fā)育的ABCDE模型。在擬南芥中,A類以AP2(apetala2)基因為代表,B類以AP3(APETALA3)基因和PI(PISTILLATA)基因為代表,C類以AG(AGAMOUS)基因為代表。D類基因包括SEEDSTICK(STK)、SHATTERPROOF1(SHP1)和SHATTERPROOF2(SHP2),這些基因共同參與控制了胚珠的發(fā)育。E類基因包括SEPALLATA1(SEP1),SEPALLATA2(SEP2),SEPALLATA3(SEP3)和SEPALLATA4(SEP4)。ABC類基因與SEP基因聯(lián)合表達(dá)可以使葉片轉(zhuǎn)化成為完整的花器官。每一類同源異型基因?qū)︵徑膬蓚€輪起作用,這樣每一輪都對應(yīng)著不同的同源異型基因的組合,即A類同源異型基因獨自作用于第1輪;A和B類同源異型基因共同作用于第2輪;B和C類同源異型基因共同作用于第3輪;C類同源異型基因獨自作用于第4輪。
當(dāng)agl24-2 svp-41突變體和ap1-12弱突變體雜交后會嚴(yán)重影響花的發(fā)育[14]。在這些花中,控制花瓣、雄蕊以及心皮特性的B類和C類基因提早表達(dá)且沒有局限于某一特定輪生器官,這就導(dǎo)致了花器官數(shù)量的減少并使得各輪生器官性質(zhì)具有相似性。由于該表型只在agl24-2 svp-41突變體與 ap1-12弱突變體的雜交后代中出現(xiàn),并考慮到SVP僅僅在花發(fā)育的第1、2個時期表達(dá),因此,這極有可能是花器官決定基因AGL24、AP1的在花發(fā)育早期異位表達(dá)導(dǎo)致花器官基因的異常。把a(bǔ)gl24-2 svp-41突變體
與ap1-10強(qiáng)突變體雜交,這種花發(fā)育表型并未得到改善。而其表型類卻似于ap1-1 cal-1突變體,花的發(fā)育在很大程度上受到抑制,然而花序分生組織大量增加,說明花分生組織特征在agl24-2 svp-41突變體與ap1-10強(qiáng)突變體雜交后代中消失[9]。
關(guān)于花分生組織的形成和生長(花發(fā)育的第1和2個時期),Gregis等[35]均認(rèn)為AP1和SVP或AGL24首先相互作用形成對花分生組織特性和花器官的形成具有重要作用的二聚體,這些二聚體抑制控制花器官形成的基因。隨后,當(dāng)SVP和AGL24在花發(fā)育第2個時期末被抑制,AP1蛋白和SEP蛋白(從第2時期末開始表達(dá))則發(fā)生相互作用,花器官的發(fā)育也就開始了。花分生組織形成在擬南芥花發(fā)育期是至關(guān)重要的一個時期,Gregis等提出了有關(guān)AGL24,SVP和AP1蛋白在花發(fā)育早期對AG,AP3,PI,SEP3的調(diào)控機(jī)制。他們發(fā)現(xiàn)AGL24,AP1和SVP能直接附著于B類和C類花器官基因的調(diào)控區(qū)域,從而說明了這3個蛋白在花分生組織形成時期的基本作用。Gregis等同時也發(fā)現(xiàn)了AP1-SVP或AP1-AGL24二聚體能與SEU-LUG復(fù)合體發(fā)生聚合,抑制靶基因SCO1。并且在agl24-2 svp-41突變體中,他們通過對SOC1的原位表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)在花發(fā)育的第1、2個時期,SOC1異位表達(dá)了。這說明在花發(fā)育的早期,SOC1與AP1蛋白相互作用直接抑制B類和C類基因,以彌補(bǔ)AGL24、SVP的缺失[35]。
AP1與SVP或AGL24蛋白互作對花器官形態(tài)建成相當(dāng)重要。AP1,AGL24和SVP在花發(fā)育的第1、2個時期,花分生組織開始變大但是花器官原基還未分化,這對花的形成至關(guān)重要,它們的缺失會影響花的后期發(fā)育。從花發(fā)育第3個時期開始,AP1結(jié)合到SEP蛋白上,誘導(dǎo)花器官發(fā)育[35]。
AGL24蛋白和SVP蛋白能直接作用于E類基因SEP3,而且B類基因和C類基因的異位表達(dá)因SEP3的異位引起[36]。但SEP3表達(dá)活性也許并非真正的影響因子,因為在花發(fā)育早期時期B類、C類花器官基因的活性應(yīng)該受到抑制。Liu等[36]利用原位雜交分析表明:B類基因(AP3,PI)和C類基因(AG)的表達(dá)在agl24 svp soc1 sep3突變體中沒有完全被抑制。另外,先前的研究已證實AG的調(diào)控機(jī)制是通過激活和抑制建立的[37-41]。由LUG蛋白通過作用于AG的第2個內(nèi)含子達(dá)到抑制作用[37,39],這和Hong等[42]所觀察到的AP1-SVP和AP1-AGL24二聚體附著于AG的第2個內(nèi)含子的CArG-box上并和LUG和SEU相互作用相一致。其次,在這些CAr-Gbox上的突變會引起花發(fā)育的早期時期AG的異位表達(dá)。AP1-SVP和AP1-AGL24二聚體結(jié)合到AG第二內(nèi)含子上的CArG-box并與LUG、SEU相互作用,從而抑制LUG、SEU的活性[37,39]。另外,在這些CArG-box上的突變會引起花發(fā)育早期時期AG的異位表達(dá)[42]。在花分生組織中,SVP似乎是在抑制花器官決定基因上起主要作用,這是由于AGL24沒有結(jié)合到任何B類、C類和E類基因所致。
AGL24、SVP、FLC和SOC1等開花時間控制基因均屬于典型的TypeⅡMADS-box基因MIKCC型,它們在植物體內(nèi)行使的特殊功能與其為MIKC型蛋白有著緊密的聯(lián)系。TypeⅡ型MADS域蛋白中包含的功能區(qū)域:MADS、Intervening(I)、Keratin-like(K)和Carboxyl-terminal(C)4個結(jié)構(gòu)域,即成為MIKC型蛋白。AGL24編碼的是一個典型的MADS-box蛋白,與SVP的序列高度同源,兩者只在C端有些差異[6]。而C域位于K域下游為富含疏水殘基的非保守區(qū)域,與MADS域、I域和K域不同的是C域不參與蛋白相互作用域和靶DNA的結(jié)合區(qū)[43]。但將C域突變會造成植物功能性缺陷。在功能域劃分中發(fā)現(xiàn),C域?qū)P1、AP3、PI和AG相互作用的特異性沒有影響,其可能參與多聚體對靶DNA的轉(zhuǎn)錄激活。AP1蛋白和其同源蛋白的C域具有對靶DNA的轉(zhuǎn)錄激活功能。但目前對于C域在MADS-box蛋白中的功能了解甚少,還需進(jìn)一步研究[44]。
AGL24和SOC1調(diào)控擬南芥花發(fā)育的表達(dá)模式不同,說明其在調(diào)控發(fā)育有不同的作用。如AGL24的過量表達(dá)會引起花的異常發(fā)育,但是目前尚無有關(guān)SOC1超表達(dá)引起花異常的報道。其次,當(dāng)AGL24在soc1突變體背景中過量表達(dá)時,花異常現(xiàn)象的發(fā)生頻率會大大降低,這表明AGL24與SOC1基因在花發(fā)育中的作用具有一定的冗余性。關(guān)于這兩個基因在調(diào)控花發(fā)育上有何不同的作用目前還有待研究。
在擬南芥中,作為TFL1上游的調(diào)控因子,
AGL24、SOC1、SVP以及SEP4在由營養(yǎng)生長到生殖生長的開花轉(zhuǎn)變時期發(fā)揮著不同的作用。AGL24和SOC1是整合不同遺傳途徑中開花信號的開花啟動子,然而SVP作為一個開花抑制因子和另外一個開花抑制因子FLC相互作用來共同抑制兩個開花途徑整合因子FT和SOC1的表達(dá)。SEP4和SEP3高度同源,它能夠介導(dǎo)MADS-box蛋白形成各種高階復(fù)合物[45,46]。另外,SEP4在許多組織中均有表達(dá),但是在SEP4的功能缺陷的突變體,植株并沒有表現(xiàn)出可見的缺陷[47]。因此,在發(fā)育的許多過程中,SEP4與一些相關(guān)MADS-box蛋白在功能上具有冗余性。但是SEP4對調(diào)控發(fā)育各種程序中的高階MADS-box復(fù)合物的形成是否產(chǎn)生影響還需要進(jìn)一步研究。
[1] Koornneef M, Alonso-Blanco C, Peeters AJM, et al. Genetic control of flowering time in Arabidopsis[J]. Ann Rev Plant Physiol, Plant Mol Biol, 1998, 49:345-370.
[2] Simpson GG, Dean C. Arabidopsis, the Rosetta stone of flowering time?[J]. Science, 2002, 296:285-289.
[3] Mouradov A, Cremer F, Coupland G. Control of flowering time:interacting pathways as a basis for diversity[J]. Plant Cell, 2002, 14:S111-S130.
[4] Koornneef M, Alonso-Blanco C, Blankestijn-de Vries H, et al. Genetic interactions among late-flowering mutants of Arabidopsis[J]. Genetics, 1998, 148:885-892.
[5] Levy YY, Dean C. The transition to flowering[J]. Plant Cell, 1998, 10:1973-1989.
[6] Hartmann U, Ho-hmann S, Nettesheim K, et al. Molecular cloning of SVP:a negative regulator of the floral transition in Arabidopsis[J]. Plant J, 2000, 21:351-360.
[7] Yu H, Xu Y, Tan EL, et al. AGAMOUS-LIKE 24, a dosagedependent mediator of the flowering signals[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2002, 99:16336-16341.
[8] Michaels SD, Ditta G, Gustafson-Brown C, et al. AGL24 acts as a promoter of flowering in Arabidopsis and is positively regulated by vernalization[J]. Plant J, 2003, 33:867-874.
[9] Gregis V, Sessa A, Colombo L, et al. AGAMOUS-LIKE24 and SHORT VEGETATIVE PHASE determine floral meristem identity in Arabidopsis[J]. Plant J, 2008, 56:891-902.
[10] Elena RA, Mariana B, Adriana C, et al. Flower development[M]. The Arabidopsis Book, 2010.
[11] Masiero S, Li MA, Will I, et al. INCOMPOSITA:a MADS-box gene controlling prophyll development and floral meristem identity in Antirrhinum[J]. Development, 2004, 131:5981-5990.
[12] Liu C, Zhou J, Bracha-Drori K, et al. Specification of Arabidopsis floral meristem identity by repression of floweringtime genes[J]. Development, 2007, 134:1901-1910.
[13] Yu H, Ito T, Wellmer F, et al. Repression of AGAMOUS-LIKE 24 is a crucial step in promoting flower development[J]. Nat Genet, 2004 36:157-161.
[14] Gregis V, Sessa A, Colombo L, et al. AGL24, SHORT VEGETATIVE PHASE, and APETALA1 redundantly control AGAMOUS during early stages of flower development in Arabidopsis[J]. Plant Cell, 2006, 18:1373-1382.
[15] Ramamoorthy R, Phua EE, Lim S, et al. Identification and characterization of RcMADS1, an AGL24 Ortholog from the Holoparasitic Plant Rafflesia cantleyi Solms-Laubach(Rafflesiaceae)[J]. PLOS ONE, DOI:10.1371/journal.done.0067243.
[16] Kardailsky I, Shukla VK, Ahn JH, et al. Activation tagging of the floral inducer FT[J]. Science, 1999, 286(5446):1962-1965.
[17] Kobayashi Y, Kaya H, Goto K, et al. A pair of related genes with antagonistic roles in mediating flowering signals[J]. Science, 1999, 286(5446):1960-1962.
[18] Li D, Liu C, Shen L, et al. A repressor complex governs the integration of flowering signals in Arabidopsis[J]. Dev Cell, 2008, 15:110-120.
[19] Lee JH, Yoo SJ, Park SH, et al. Role of SVP in the control of flowering time by ambient temperature in Arabidopsis[J].Genes Dev, 2007, 21(4):397-402.
[20] Yoo SK, Chung KS, Kim J, et al. Constans activates suppressor of overexpression of constans 1 through Flowering Locus T to promote flowering in Arabidopsis[J]. Plant Physiol, 2005, 139:770-778.
[21] Searle I, He Y, Turck F, et al. The transcription factor FLC confers a flowering response to vernalization by repressing meristem competence and systemic signaling in Arabidopsis[J]. Genes Dev, 2006, 20:898-912.
[22] Liu C, Chen H, Er HL, et al. Direct interaction of AGL24 and SOC1 integrates flowering signals in Arabidopsis[J]. Development, 2008, 135:1481-1491.
[23] Samach A, Onouchi H, Gold SE, et al. Distinct roles of CONSTANS target genes in reproductive development of Arabidopsis[J]. Science, 2000, 288(5471):1613-1616.
[24] Corbesier L, Vincent C, Jang S, et al. FT protein movement contributes to long-distance signaling in floral induction of Arabidopsis[J]. Science, 2007, 316:1030-1033.
[25] Hepworth SR, Valverde F, Ravenscroft D, et al. Antagonistic regulation of flowering-time gene SOC1 by CONSTANS and FLC via separate promoter motifs[J]. EMBO J, 2002, 21:4327-4337.
[26] Lee H, Suh SS, Park E, et al. The AGAMOUS-LIKE 20 MADS domain protein integrates floral inductive pathways in Arabidopsis[J]. Genes Dev, 2000, 14:2366-2376.
[27] Bowman JL, Alvarez J, Weigel D, et al. Control of flower development in Arabidopsis thaliana by APETALA1 and interacting genes[J]. Development, 1993, 119:721-743.
[28] Kempin SA, Savidge B, Yanofsky MF. Molecular basis of the cauliflower phenotype in Arabidopsis[J]. Science, 1995, 267:522-525.
[29] Chang L, Zhi WNT, Yang B, et al. A conserved genetic pathway determines inflorescence architecture in Arabidopsis and rice[J]. Dev Cell, 2013, 24:612-622.
[30] Mandel MA, Gustafson-Brown C, Savidge B, et al. Molecular characterization of the Arabidopsis floral homeotic gene APETALA1[J]. Nature, 1992, 360:273-277.
[31] Ratcliffe OJ, Bradley DJ, Coen ES. Separation of shoot and floral identity in Arabidopsis[J]. Development, 1999, 126:1109-1120.
[32] Folter S, Immink RG, Kieffer M, et al. Comprehensive interaction map of the Arabidopsis MADS Box transcription factors[J]. Plant Cell, 2005, 17:1424-1433.
[33] Wellmer F, Alves-Ferreira M, Dubois A, et al. Genome-wide analysis of gene expression during early Arabidopsis flower development[J]. PLoS Genet, 2006, 2:e117.
[34] Kaufmann K, Wellmer F, Muino JM, et al. Orchestration of floral initiation by APETALA1[J]. Science, 2010, 328:85-89.
[35] Gregis V, Sessa A, Dorca-Fornell C, et al. The Arabidopsis floral meristem identity genes AP1, AGL2 and SVP directly repress class B and C floral homeotic genes[J]. Plant J, 2009, 60:626-637.
[36] Liu C, Xi W, Shen L, et al. Regulation of floral patterning by flowering time genes[J]. Dev Cell, 2009, 5:711-722.
[37] Sieburth LE, Meyerowitz EM. Molecular dissection of the AGAMOUS control region shows that cis elements for spatial regulation are located intragenically[J]. Plant Cell, 1997, 9:355-365.
[38] Bomblies K, Dagenais N, Weigel D. Redundant enhancers mediate transcriptional repression of AGAMOUS by APETALA2[J]. Dev Biol, 1999, 216:260-264.
[39] Deyholos MK, Sieburth LE. Separable whorl-specific expression and negative regulation by enhancer elements within the AGAMOUS second intron[J]. Plant Cell, 2000, 12:1799-1810.
[40] Lohmann JU, Hong R, Hobe M, et al. A molecular link between stem cell regulation and floral patterning in Arabidopsis[J]. Cell, 2001, 105:793-803.
[41] Bao X, Franks RG, Levin JZ, et al. Repression of AGAMOUS by BELLRINGER in floral and inflorescence meristems[J]. Plant Cell, 2004, 16:1478-1489.
[42] Hong RL, Hamaguchi L, Busch MA, et al. Regulatory elements of the floral homeotic gene AGAMOUS identified by phylogenetic footprinting and shadowing[J]. Plant Cell, 2003, 15:1296-1309.
[43] Riechmann JL, Meyerowitz EM. Determination of floral organ identity by Arabidopsis MADS domain homeotic proteins AP1, AP3, PI, and AG is independent of their DNA-binding specificity[J]. Mol Biol Cell, 1997, 8:1243-1259.
[44] Cho RJ, Fromont-Racine M, Wodicka L, et al. Parallel analysis of genetic selections using whole genome oligonucleotide arrays[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1998, 95:3752-3757.
[45] Immink RG, Tonaco IA, Shchennikova A, et al. SEPALLATA3:the‘glue’ for MADS box transcription factor complex formation[J]. Genome Biol, 2009, 10:R24.
[46] Smaczniak C, Immink RG, Muino JM, et al. Characterization of MADS-domain transcription factor complexes in Arabidopsis flower development[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2012, 109:1560-1565.
[47] Ditta G, Pinyopich A, Robles P, et al. The SEP4 gene of Arabidopsis thaliana functions in floral organ and meristem identity[J]. Curr Biol, 2004, 14:1935-1940.
(責(zé)任編輯 馬鑫)
The Flower Development of Arabidopsis thaliana Affected by Floral Meristem Identity Gene AGL24
Jiang Wei Gu Huiying Wang Zhimin Song Ming Tang Qinglin
(Key Laboratory of Horticulture Science for Southern Mountainous Regions,Ministry of Education,Key Laboratory of Olericulture,College of Horticulture and Landscape Architecture,Southwest University,Chongqing 400715)
AGAMOUS-LIKE24(AGL24)encodes a typical MADS-domain protein that plays a very important role at different stages of flower development. This paper reviews how AGL24 interacts with other floral meristem identity genes to affect flower development of Arabidopsis thaliana, then regulate flowering time, which will help us to have a better understanding of flowering gene regulatory network and to regulate effectively the flowering time in production. It can provide reference for plant breeding.
Arabidopsis thaliana AGL24 Flower development
2013-10-08
國家自然科學(xué)基金項目(31000908),重慶市自然科學(xué)基金重點項目(2011BA1002),中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(XDJK2012B020)
江為,男,碩士研究生,研究方向:蔬菜遺傳育種與生物技術(shù);E-mail:jainveborry@163.com
湯青林,男,副研究員,碩士生導(dǎo)師,研究方向:蔬菜遺傳育種與發(fā)育調(diào)控;E-mail:swutql@163.com宋明,男,教授,研究方向:蔬菜遺傳育種與生物技術(shù);E-mail:swausongm@163.com