XPD基因多態性與非霍奇金淋巴瘤的相關性

李素霞，朱宏麗，郭 搏，楊 洋，王紅艷，孫敬芬，曹永彬

1解放軍總醫院 老年血液科，北京 100853；2解放軍總醫院 血液科，北京 100853；3解放軍總醫院第一附屬醫院 血液科，北京 100048

XPD基因多態性與非霍奇金淋巴瘤的相關性

李素霞1，朱宏麗1，郭 搏1，楊 洋1，王紅艷2，孫敬芬2，曹永彬3

1解放軍總醫院 老年血液科，北京 100853；2解放軍總醫院 血液科，北京 100853；3解放軍總醫院第一附屬醫院 血液科，北京 100048

目的探討核苷酸剪切修復基因-著色性干皮病基因D(Xeroderma pigmenting group D，XPD)單核苷酸多態性與非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma，NHL)及其亞型發病風險的關系。方法選取解放軍總醫院、解放軍總醫院第一附屬醫院2011年3月- 2013年9月282例NHL患者和231例正常對照者為研究對象，采用SNaPshot方法檢測XPD的2個基因rs1799793、rs13181的基因多態性，分析其在NHL組和正常對照組中基因型和等位基因頻率分布的差異。采用Logistic回歸分析計算各個SNP的等位基因的比值比(odd ratio，OR)和95%置信區間(confidence interval，CI)。結果XPD rs1799793、rs13181在NHL組和正常對照組中基因型和等位基因頻率分布無統計學差異。XPD rs1799793、rs13181組合基因型在對照組和NHL組中無統計學差異。對NHL亞型分析顯示，與對照相比較，彌漫大B細胞性淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、T細胞性淋巴瘤、其他B細胞性淋巴瘤發病風險無差異。結論本組人群XPD rs1799793、rs13181基因多態性與NHL組及其亞型的發病無明顯相關性。

著色性干皮病基因D；非霍奇金淋巴瘤；單核苷酸多態性

非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma，NHL)是一種常見的血液系統惡性腫瘤，其發病危險因素除了病毒感染、大劑量輻射、接觸氯酚、苯、農藥、服用某些免疫抑制劑導致免疫功能障礙等，遺傳易感性作用也日益突出。DNA損傷后個體修復能力的差異是決定遺傳易感性的主要因素。著色性干皮病基因D(xeroderma pigmenting group D，XPD)又被稱作切除修復交叉互補基因2(excision repair cross-complementing group 2，ERCC2)，作為一種重要的DNA修復基因，在腫瘤研究中發現其基因多態性與多種腫瘤的易感性有關[1-6]。我們以病例對照方法，探討中國北方漢族人群XPD基因多態性與NHL患病風險的關系。

對象和方法

1 研究對象 非霍奇金淋巴瘤組患者為解放軍總醫院、解放軍總醫院第一附屬醫院血液科患者。鑒于種族因素影響，本研究對象選自2011年3月-2013年9月經病理明確診斷的中國北方(長江以北地區)漢族NHL患者282例，其中男性203例，女性79例，平均年齡48.87歲。按照2008年淋巴組織腫瘤WHO新分類法，彌漫大B細胞淋巴瘤159例，T細胞性淋巴瘤52例，濾泡性淋巴瘤25例，其他B細胞性淋巴瘤46例。對照組為同期解放軍總醫院健康查體合格無腫瘤的中國北方漢族人群。

2 樣本采集 兩組均取外周靜脈血2 ml，EDTA抗凝，應用Omega公司血標本DNA提取試劑盒按照操作步驟提取DNA，于-20℃保存。

3 主要試劑及儀器 SNaPshot試劑盒(ABI PRISM?SNaPshotTMMulitiplex Kit，ABI公司)，PCR純化試劑盒(ABI公司)，Taq酶(TAKARA Taq Polymeras，TAKARA公司)，凝膠成像儀(BioSens SC 810B，上海山富科學儀器有限公司)，9700 PCR儀(ABI公司)，3730XL測序儀(ABI公司)。

4 XPD基因rs1799793、rs13181基因型檢測：1)引物設計合成：根據SNP位點序列信息，使用Primer5軟件設計擴增引物和延伸引物并合成(表1)。2)預擴增及純化：PCR預擴增反應體系為10 μl(包括10×緩沖液1.0 μl，dNTP混合物(2.5 mmol/L) 0.8 μl，HotstarR Taq DNA聚合酶(5 U/μl) 0.1 μl，PCR引物(32 mol/L)各0.2 μl和DNA模板(50 ng/μl)1 μl，擴增程序為：95℃ 5 min、95℃ 30 s、53℃ 30 s、72℃ 30 s共35個循環；72℃ 10 min。PCR擴增后取反應產物2 μl行瓊脂糖凝膠電泳進行PCR產物質檢。之后取PCR產物15 μl加入1 U CPI，37℃反應1 h，75℃變性15 min進行產物純化。3)延伸反應及純化：取純化好的PCR產物、SNaPshot引物混合物、SNaPshot熒光混合物(含AmpliTaqDNA多聚酶和不同熒光標記的ddNTP)組成一個PCR反應體系。SNaPshot反應程序為96℃變性10 s，然后96℃變性10 s，53℃退火5 s，60℃延伸30 s，25個循環。之后60℃延伸30 s，4℃保存。延伸反應產物10 μl加2.5 μl EDTA，18 μl無水乙醇，13 000 r/min，30 min，墊上吸水紙倒甩5 s，加入70%的冰乙醇，13 000 r/min，15 min，墊上吸水紙倒甩5 s，烘干10 min進行純化。4)3730XL測序儀檢測：將SNaPshot產物稀釋20倍.每份樣品中加入高純甲酰胺8.6 μl，分子內標0.9 μl，SNaPshot純化產物0.5 μl，總體積10 μl，95℃變性5 min，迅速冷凍4 min。在ABI3730XL型DNA序列檢測儀上進行毛細管電泳，運行Gene-Mapper4.0軟件分析實驗結果。

5 統計學分析 采用擬合優度χ2檢驗，計算基因型頻數分布是否符合Hardy-Weinberg平衡，檢驗樣本的群體代表性；采用χ2檢驗統計兩組間等位基因的頻率分布的差異，采用Logistic回歸分析計算各個SNP的等位基因以及各個突變組合基因型的比值比(odd ratio，OR)和95%置信區間(confidence interval，CI)，統計分析用R統計軟件進行。

表1 XPD基因SNP擴增及延伸引物序列Tab. 1 XPD gene SNP amp lif cation p rimer and extension primer

結 果

1 兩組人口學特點 本研究病例組和對照組均選自中國北方漢族人群，231例對照組中男性138例(59.71%)，女性93例(40.26%)，年齡分布為13 ～87歲，平均年齡45.59歲。282例非霍奇金淋巴瘤組中男性203例(71.99%)，女性79例(28.01%)，年齡分布為12 ～ 89歲，平均年齡48.87歲，病例組和對照組年齡差異無統計學意義，性別差異有統計學意義。所有研究對象均知情同意并自愿參加。

2 XPD基因型及等位基因頻率分布 rs1799793、rs13181基因型分布在NHL組和正常對照組中均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)，其基因型和等位基因頻率分布在兩組間差異無統計學意義(P＞0.05)。見表2。

3 XPD基因型分布與NHL亞型發病風險的相關性 將281例NHL患者分為彌漫大B細胞淋巴瘤、T細胞性淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤和其他B細胞淋巴瘤4種亞型，結果表明，rs1799793、rs13181基因型分布在正常對照組與4種NHL亞型中無統計學差異。見表3。

4 XPD組合基因型與NHL及其亞型的相關性 將野生純合型基因型編碼為WT，突變純合型和雜合型基因型編碼為VT。XPD基因rs1799793、rs13181的4種組合基因型為WT-WT、WT-VT、VT-WT、VT-VT，以WT-WT為參考組合基因型，Logistic回歸計算其他3種組合基因的OR值和P值。結果顯示XPD的3種突變組合基因型在對照組和非霍奇金淋巴瘤組及其亞型組均無差異。見表4、表5。

表2 XPD rs1799793，rs13181 位點基因型和等位基因頻率分布Tab. 2 Genotype distributions and allele frequencies of exam ined polymorphism between cases and controls, as well as their prediction for NHL risk

表3 XPD 基因多態性與NHL及其亞型發病相關性Tab. 3 Genotype distributions of XPD exam ined polymorphism between cases and controls, as well as their prediction for NHL subtype risk

表4 XPD組合基因型與NHL發病相關性Tab. 4 Correlation between the combined XPD genotypes and risk of NHL (n,%)

討 論

隨著人類對疾病發生發展過程認識的不斷加深，目前研究認為，DNA修復基因多態性是決定機體腫瘤易感性的一個重要因素。著色性干皮病基因D位于19號染色體長臂q13.3，由23個外顯子組成，編碼760個氨基酸。XPD蛋白是Ⅱ型轉錄因子H復合體的重要組成部分，涉及核苷酸切除修復(nucleotide excision repair，NER)和基因轉錄。作為一種重要的DNA修復基因，XPD基因突變減少其復合物的活性并引起修復和轉錄缺陷。研究顯示，XPD基因多態性與肺癌、食管癌、乳腺癌、胃癌等多種腫瘤的發生存在相關性[1-10]。

影響DNA修復基因單核苷酸多態性與腫瘤易感性關系的因素紛繁復雜，如不同DNA修復基因的多態性之間或同一DNA修復基因的不同多態性位點之間的交互作用、DNA修復基因的多態性與其他腫瘤相關基因的多態性之間的交互作用、接觸致癌物的類型、劑量、接觸方式和時間等、種族因素以及性別、年齡、生活習慣、內分泌功能、營養狀況等。本研究以中國北方漢族人群病例對照研究為基礎，采用SNapShot聯合毛細管電泳的方法檢測了XPD rs1799793、rs13181基因多態性，比較不同基因型與NHL及其亞型發病風險的關系，同時對XPD rs1799793、rs13181這兩個不同多態性位點的組合基因型進行了分析。結果顯示，rs1799793、rs13181基因多態性與NHL及其亞型的發病無明顯相關性，在進一步的XPD rs1799793、rs13181突變組合基因型研究分析顯示，兩個不同多態性位點的突變組合基因型同樣與NHL及其亞型的發病無相關性。這與國外一些關于XPD與NHL的相關性研究結果一致[11-15]。與國內宋寶等[16]對山東地區NHL患者研究XPD rs1799793、rs13181均與NHL或NHL亞型的發病無相關性的結果也一致。英國學者Worrillow等[17]研究了XPD rs13181、rs1799793、rs238406多態性與非霍奇金淋巴瘤的相關性，結果顯示上述基因多態性與非霍奇金淋巴瘤發病無相關性，但XPD rs13181 (Lys751Gln)Gln等位基因可以使彌漫大B細胞淋巴瘤的發病風險降低2倍(OR：0.56，95% CI：0.34 ～0.92，P=0.02)。

表5 XPD 組合基因型與NHL亞型發病相關性Tab. 5 Correlation between the combined XPD genotypes and risk of NHL subtypes

目前對于XPD的基因多態性與惡性血液系統腫瘤的發病風險、個體化治療、治療并發癥以及預后判斷的相關性也有研究[18-24]。如Monroy等[18]對200例霍奇金淋巴瘤(Hodgkin lymphoma，HL)患者的研究顯示XPD rs13181與HL的發病無相關性。而Storm等[19]對170例中危AML患者預后相關性的研究結果顯示XPD rs13181對中危急性髓系白血病(acute myeloid leukemia，AML)患者的總生存期有影響，rs13181帶有突變基因(AC/CC)組的AML患者生存期明顯短于野生型(AA)組患者(中位生存期22個月vs 40個月，P=0.03)。瑞金醫院Shi等[20]對15個基因的42個多態性位點與AML發病及預后的相關性研究，結果顯示XPD rs13181帶有突變的雜合子基因型增加AML的風險(OR：1.637；95% CI：1.118 ～ 2.395)。西班牙學者Cibeira等[21]研究了包括XPD rs13181在內的15個不同基因的19個多態性位點與沙利度胺治療復發或難治多發性骨髓瘤患者的反應率和生存期的相關性，結果顯示XPD rs13181與對藥物的反應率和生存期無關。土耳其學者Ozdemir等[22]研究了XPD基因多態性與兒童白血病、淋巴瘤患者發生發熱性中性粒細胞減少癥、黏膜炎的相關性研究。該研究包括29例Brukitt淋巴瘤和61例急性淋巴細胞白血病兒童患者，結果顯示XPD rs13181、rs1799793基因多態性與上述疾病無關。此外還有少量的XPD基因多態性與繼發性AML預后、原發性血小板增多癥、真性紅細胞增多癥、骨髓纖維化出現白血病轉化的相關性研究[23-24]。

由于多種因素的影響，XPD基因多態性與多種血液系統疾病的相關性研究結果不同。本研究初期結果雖然顯示XPD rs13181、rs1799793與NHL的發病無明顯相關性，但由于樣本例數較少，今后的研究中將繼續擴大研究范圍和研究對象，充分考慮這些影響因素，并進行詳細分層研究，盡可能明確XPD基因單核苷酸多態性與NHL及其他血液系統惡性疾病易感性、疾病預后、治療并發癥之間的關聯。

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Correlation between XPD genetic polymorphism and non-Hodgkin's lymphoma

LI Su-xia1, ZHU Hong-li1, GUO Bo1, YANG Yang1, WANG Hong-yan2, SUN Jing-fen2, CAO Yong-bin3

1Department of Geriatric Hematology, Chinese PLA General Hospital, Beijing 100853, China;2Department of Hematology, Chinese PLA General Hospital, Beijing 100853, China;3Department of Hematology, The First Aff liated Hospital of Chinese PLA General Hospital, Beijing 100048, China
Corresponding author: ZHU Hong-li． Email: bjzhl202@sina．com

ObjectiveTo explore the correlation between Xeroderma pigmenting group D (XPD)gene polymorphisms and non-Hodgkin lymphoma (NHL) risk．MethodsA case-control study with 282 non-Hodgkin lymphoma patients and 231 control subjects were conducted to investigate the role of two XPD gene polymorphisms (rs1799793, rs13181) on susceptibility to non-Hodgkin lymphoma by SNaPshot． A ll statistical analysis were done with R software． Genotype and allele frequencies of XPD were compared between patients and control group by chi-square test． Crude and adjusted odds ratios and 95% conf dence intervals were calculated by logistic regression based on genetic different models．ResultsThere was no signif cant difference between the control group and NHL or NHL subtype cases in genotype and variant genotype frequency． Analysis of XPD rs1799793, rs13181 showed that no combined genotype was associated with risk of NHL overall or four kinds of subtypes of NHL．ConclusionThere is no close relationship between XPD polymorphism (rs1799793, rs13181) and the risk of NHL or each histologic subtype of NHL．

xeroderma pigmenting group D; non-Hodgkin lymphoma; single nucleotide polymorphism

R 733.1

A

2095-5227(2014)08-0853-05

10.3969/j.issn.2095-5227.2014.08.022

2014-04-02 17:30

http://www.cnki.net/kcms/detail/11.3275.R.20140402.1730.001.html

2013-12-04

“重大新藥創制”科技重大專項(2008ZXJ09001-019)；解放軍總醫院南樓青年創新基金(NQ201107)

Supported by “Major Country to Create a Special New Drugs”S&T Major Project(2008ZXJ09001-019)

李素霞，女，博士，副主任醫師。研究方向：血液病診斷及治療。Email: lisuxia301@163.com

朱宏麗，女，主任醫師，碩士生導師。Email: bjzhl202@ sina.com