鄺筱珊 胡松楠 游淑珠等
摘要 [目的]建立FMV35S基因啟動子環介導等溫擴增的檢測方法。[方法]建立一種檢測食品和飼料中FMV35S轉基因成分的環介導恒溫擴增(LAMP)檢測方法,并利用實時濁度法對該LAMP檢測方法進行靈敏度、特異性和穩定性評價。[結果]該方法的檢測限為0.5%,特異性和穩定性良好。采用LAMP法與熒光PCR方法進行了實際樣品對比檢測,結果一致可靠。[結論]可采用LAMP法對食品和飼料中FMV35S轉基因成分進行檢測。
關鍵詞 食品;飼料;FMV35S基因;環介導恒溫擴增;檢測
中圖分類號 S188 文獻標識碼 A 文章編號 0517-6611(2014)16-04999-03
截止到2012年,轉基因作物的種植面積已經連續增長17年,達到了420 000 000 hm2[1]。新型轉基因生物不斷涌現的同時,有關轉基因作物在食品安全性、環境保護和倫理方面的爭論一直愈演愈烈。為了滿足消費者的知情權和國際貿易的要求,越來越多的國家和地區要求對轉基因食品進行標示。不同的國家和地區也相應的發布了檢測方法和判定標準。我國也于2002年7月開始實施《轉基因食品衛生管理條例》,對轉基因食品產品進行標識管理。
熒光PCR法是經典的轉基因檢測方法,同時也是目前采用較多的一種檢測方法。近年來,越來越多的人將目光投向了非PCR檢測方法的研究,比如基于蛋白質的ELISA、免疫層析試紙條方法;還有基于核酸的熒光交叉相關光譜法[2]、基于生物條形碼的電化學發光法[3]、基因芯片法[4]等。
環介導等溫擴增(LAMP)是一種新的、非PCR的核酸檢測方法[5],最少可利用4條引物,在Bst DNA poLymerase作用下檢測目的基因片段。LAMP反應有以下幾個優點:不需要復雜的儀器裝置,僅靠水浴鍋或等溫孵育裝置即可達到反應要求;擴增產物肉眼可辨,不需要檢測裝置即可快速準確的判斷;、LAMP檢測反應時間短,1 h內可出具檢測結果。基于以上優點,近些年LAMP已經廣泛應用于病毒、食源性微生物、轉基因和肉類鑒定方面[6-10]。
玄參花葉病毒35S啟動子(Figwort Mosaic Virus promoter)FMV35S基因是植物遺傳操作常用標記基因,很多轉基因植物(如MON89034,RT73等)都含有FMV35S基因,是檢測轉基因生物的重要指標。筆者建立一種檢測食品和飼料中FMV35S轉基因成分的LAMP方法,為轉基因的檢測擴增提供理論依據。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 研究對象。豇豆、四季豆、大豆、玉米、花生、白云豆、豌豆、燕麥、蕎麥、馬鈴薯、扁豆、番茄、核桃、大杏仁、綠豆、蠶豆、轉基因油菜RT73、轉基因水稻KMD、轉基因小麥B73.6.1、轉基因大豆DP305423、轉基因大豆A5547.127、轉基因大豆GTS40.3.2、轉基因玉米MON89034、轉基因玉米MIR604、轉基因玉米EVENT98140、轉基因玉米BT176和轉基因玉米MON810,均由實驗室提供。
1.1.2 主要儀器。PICO17高速臺式離心機,購自Thermo Fisher Scientific公司;LA.320CLAMP實時濁度儀,購自日本榮研化學株式會社。
1.1.3 主要試劑。Bst DNA 聚合酶,購自New England Biolabs(NEB)公司;甜菜堿(Betaine)和MgCl2,購自Sigma公司;dNTPs,購自寶生物工程(大連)有限公司;SYBR Green I 熒光染料,購自廈門致善生物科技有限公司;LAMP引物,由生工生物工程(上海)有限公司合成;其他試劑均為國產分析純,市售。
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA 的提取。將樣品置于粉碎機中均質碾磨成粉末狀,植物樣品基因組DNA提取采用CTAB法[11]。DNA提取完畢后,利用Thermo Fisher Nanodorp 測定核酸含量和質量。當OD260/OD280比值在1.7~1.9時,濃度50~100 ng/μl適宜于LAMP檢測。
1.2.2 LAMP檢測體系和反應條件。LAMP反應體系總體積為25 μl,其成分包括:FIP和BIP各1.6 μmol/L,F3和B3各0.2 μmol/L,20 mmol/L Tris.HCl(pH8.8),10 mmol/L KCl,8 mmol/L MgSO4,10 mmol/L (NH4)2SO4,0.1% Tween20,1 mol/L甜菜堿,1.6 mmol/L dNTP,8 U Bst大片斷DNA聚合酶,2 μl DNA(50~100 ng/μl)。參照LAMP濁度儀使用說明,將混合物置于反應孔中,于63 ℃恒溫反應60 min,最后于80 ℃下保溫5 min以結束反應。
1.2.3 LAMP檢測法檢測FMV35S基因引物序列。通過GENEBANK下載FMV35S啟動子序列,使用在線設計軟件Primer Explorer version 4 (http://primerexplorer.jp/e)和LAMP Designer軟件設計特異引物FMV.4。
1.2.4 FMV35S基因LAMP檢測法靈敏度試驗。用均質的100%轉基因玉米MON89034粉與均質非轉基因大豆粉按比例配置成20%、10%、5%、1%、0.5%和0.1%(W/W)的標準樣品,每個稀釋度分別提取基因組DNA進行LAMP試驗,以ddH2O代替DNA模板作為陰性對照,以FMV.4作為LAMP引物,100%轉基因玉米MON89034作為陽性對照,63 ℃運行60 min以確定LAMP反應的靈敏度。
1.2.5 FMV35S基因LAMP檢測法特異性試驗。用轉基因油菜RT73、豇豆、四季豆、大豆、玉米、花生、白云豆、豌豆、燕麥、蕎麥、馬鈴薯、扁豆、番茄、核桃、大杏仁、綠豆、蠶豆、轉基因水稻KMD、轉基因小麥B73-6-1轉基因大豆DP305423、A5547-127、GTS40-3-2、轉基因玉米MON89034、MIR604、EVENT98140、BT176、MON810的DNA作為LAMP反應的模板,用FMV-4作為LAMP引物進行反應,63 ℃反應60 min,驗證LAMP反應的特異性,利用LAMP濁度儀觀察反應結果。
1.2.6 FMV35S基因LAMP檢測法穩定性試驗。利用建立的LAMP檢測法,分別對3個不同濃度(空白樣品0%和添加水平0.5%、1%的MON89034陽性模擬樣品)及MON89034標準品進行檢測,每個樣品重復20次,驗證LAMP反應的穩定性,反應結束后向反應管加入SYBR Green I觀察顏色變化,沒有擴增產物的陰性管呈橙色,有擴增產物的陽性管為綠色。利用LAMP濁度儀和肉眼直接觀察反應結果。
1.2.7 FMV35S基因LAMP檢測法的應用。采用試驗方法對市售的食品和飼料等20份樣進行LAMP 檢測。采用熒光 PCR法驗證檢測結果,熒光 PCR 檢測所用引物探針參考檢驗檢疫行業標準SN/T 1204-2003。
2 結果與分析
2.1 FMV35S基因LAMP檢測法的特異性評價 以27種不同植物DNA作為LAMP反應的模板,用試驗設計的FMV.4引物作為LAMP引物,進行LAMP檢測。圖1表明,FMV.4引物只對含有FMV35S啟動子的模板(MON89034,轉基因油菜RT73)特異性檢出,對其他不含FMV35S啟動子的轉基因品系和非轉基因物種均無擴增,未出現假陰性或假陽性結果,表現出良好的特異性。
2.2 LAMP靈敏度測定 圖2表明,LAMP實時濁度法結果顯示,不同濃度陽性模擬樣品的出峰時間和樣品濃度呈明顯梯度變化,LAMP實時濁度法檢測靈敏度可達0.5%。最低檢出限0.5%出峰時間約41 min,可以將反應時間確定為60 min。
2.3 LAMP穩定性評價 采用以FMV4為引物,對3種不同濃度樣品進行LAMP檢測,每種樣品重復20次。由表2可知,1%、0.5%及陰性樣品穩定性試驗結果與預期一致,顯示該方法重復性和穩定性良好。
2.4 應用LAMP法檢測食品中FMV35S轉基因成分 對市售燕麥片、小麥粉玉米球和菜籽粕20份食品和飼料樣品分別采用LAMP顯色法和實時熒光PCR法進行對比檢測。由表3可知,2種方法檢測結果一致,表明可以采用LAMP法檢測食品和飼料中FMV35S轉基因成分。
3 結論與討論
生物技術的不斷發展使新轉基因植物的種類在不斷增加。圍繞轉基因植物的爭議也是層出不窮。建立簡單、快速,成本低廉的檢測方法能夠更好保證相關貿易的順利進行,也可以更加高效的阻止非法轉基因植物流入我國。 注:1為轉基因玉米MON89034,2為四季豆,3為大豆,4為玉米,5為花生,6為白云豆,7為豌豆,8為燕麥,9為蕎麥,10為馬鈴薯,11為扁豆,12為番茄,13為核桃,14為大杏仁,15為綠豆,16為蠶豆,17為轉基因水稻KMD,18為轉基因大豆DP305423,19為基因大豆DP305423,20為轉基因油菜RT73,21為轉基因大豆GTS-40-3-2,22為豇豆,23為轉基因玉米MIR604,24為轉基因玉米EVENT98140,25為轉基因玉米BT176,26為轉基因玉米MON810,27為轉基因大豆A5547-127,28為H2O。自從PCR于1985年發明以來,有關核酸(DNA)的檢測多采用PCR法。目前檢測轉基因成分的主要方法是熒光PCR法。然而,需要昂貴的熒光PCR儀也是熒光PCR法檢測轉基因成分的缺點[12]。近幾年,盡管有很多非PCR方法檢測目的基因的方法被報道。但是,能夠達到與PCR法相同檢測限的方法很少[3]。該方法檢測限為0.5%,能夠滿足日常檢測的限量要求(歐盟和英國0.9%,巴西4%,澳大利亞和新西蘭1%,俄羅斯、中國香港、日本、中國臺灣5%,韓國和馬來西亞3%)。
已經有報道采用LAMP法檢測不同品系的轉基因植物如轉基因大米BT63,KMD和KF6[13],轉基因大豆GTS 40-3-2[14],轉基因玉米Bt176[15]。但是,對于含有多種原料的食品(餅干、面包、),很難逐一品系進行檢測。這時篩選檢測則是較好的選擇。轉基因篩選檢測常用的目的基因包括:CaMV35S、NOS、NPTII和FMV35S等。FMV35S基因是植物遺傳操作常用標記基因,可以作為一個重要的指標判定食品和飼料中是否含有轉基因成分。
試驗建立了一種檢測食品和飼料中FMV35S轉基因成分的LAMP方法。與經典PCR法相比,LAMP法更加快速、易操作,檢測結果肉眼可見,不需要復雜的檢測儀器。該方法的檢測限為0.5%,特異性和穩定性滿足日常檢測要求,對食品和飼料中日常的快速篩檢轉基因成分有重要的意義。
食品和飼料中轉基因植物FMV35S啟動子環介導等溫擴增檢測方法的建立參考文獻
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責任編輯 李占東 責任校對 況玲玲