溫見翔,陳 娟,楊 虹
(北京大學深圳醫院 檢驗科,廣東 深圳518036)
陰溝腸桿菌是臨床常見的條件致病菌之一,亦是醫院獲得性感染的重要病原菌[1]。近年來,隨著廣譜抗菌藥物的廣泛使用,陰溝腸桿菌在抗生素的選擇性壓力下出現高耐藥性和多重耐藥。陰溝腸桿菌感染已成為醫院感染的重要致病菌之一。我院陰溝腸桿菌感染分布與耐藥狀況亦不容樂觀[2],本研究通過檢測我院臨床分離的141株陰溝腸桿菌AcrAB-TolC外排系統acrA,acrB,tolC和acrR 4種基因,分析4種基因的攜帶分布,研究AcrAB-TolC外排系統基因與陰溝腸桿菌耐藥性之間的關系。
1.1菌株鑒定與藥敏試驗2010年5月至2013年6月從北京大學深圳醫院門急診及住院部患者痰液、尿液、血液、膿液、膽汁等標本分離到的陰溝腸桿菌共計141株。所有菌株經 MicroScanWalkaway40細菌分析儀進行鑒定和藥敏試驗,測其對各種抗生素的最小抑菌濃度(MIC)。同一患者同一部位分離出的陰溝腸桿菌,如藥敏結果相同,僅采用首次分離菌株。以大腸桿菌ATCC 25922、銅綠假單胞菌ATCC27853為質控菌株,藥敏結果依據CLSI2013年執行標準判定。
1.2儀器與試劑美國德靈公司生產的 MicroScanWalkaway40型全自動細菌分析系統及該公司提供的陰性菌復合板;PCR擴增儀為美國Biosytems公司產品;凝膠成像系統為美國BIO-RAD公司產品質;標準分子量DNA、Taq DNA聚合酶、pMD18-T載體、DNA膠回收試劑盒為TAKARA公司產品。
1.3AcrAB-TolC外排系統基因的擴增根據AcrAB-TolC外排系統acrA,acrB,acrR和tolC 4種基因序列,設計PCR引物,并由TAKARA公司合成引物,引物序列及產物長度見表1。采用煮沸法提取各株陰溝腸桿菌基因組的DNA,進行PCR擴增。四種基因的PCR反應總體積均為50μl(DNA聚合酶系統Premix Taq9.5μl,上游引物及下游引物各1μl,DNA模板2μl,去離子水36.5μl)。基因擴增反應條件分別為:acrA基因94℃預變性4min,95℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸1min,共35個循環,72℃終末延伸5min;acrB基因94℃預變性4min,95℃變性30s,48℃退火30s,72℃延伸3min,共40個循環,72℃終末延伸5min;acrR基因94℃預變性4min,95℃變性30s,48℃退火30 s,72℃延伸1min,共35個循環,72℃終末延伸5 min;tolC基因94℃預變性4min,95℃變性30s,43℃退火30s,72℃延伸1min,共35個循環,72℃終末延伸5min。PCR產物在含0.5mg/L溴化乙啶的1%瓊脂糖凝膠中電泳30min,使用BIO-RAD凝膠成像系統觀察結果,分析PCR產物。
1.4擴增產物的純化、克隆與測序PCR擴增產物經凝膠回收試劑盒回收并純化,將其與pMD-18T載體連接,連接產物轉化入感受態大腸桿菌E coli JM109中,用含氨芐西林的LB平板篩選含陽性質粒的菌落,陽性菌經擴增培養后送TAKARA公司進行測序。
1.5統計學分析采用SPSS 17.0統計軟件對結果進行卡方檢驗。

表1 靶基因引物識別序列及目的產物長度
2.1藥敏試驗結果141株陰溝腸桿菌對常見抗菌藥物的藥敏試驗結果見表2。根據耐藥表型不同,將141株陰溝腸桿菌分為4組見表3。

表2 141株陰溝腸桿菌對常見抗菌藥物的藥敏試驗結果

表3 141株陰溝腸桿菌耐藥表型分組
2.2AcrAB-TolC外排系統基因擴增及測序結果acrA,acrB,acrR和tolC 4種基因在141株陰溝腸桿菌中均擴增出陽性株,其PCR擴增電泳結果見圖1、圖2、圖3和圖4。4種基因PCR產物經克隆后測序,測序 結 果 與 (CNBI)Genbank 數 據 庫 (http://www.cnbi.nim.nih.gov BLAST 程序)進行對比,同源性比對后證實,4種基因與陰溝腸桿菌同源性均為96%。

圖1 acrA基因PCR擴增電泳圖

圖2 acrB基因PCR擴增電泳圖

圖3 acrR基因PCR擴增電泳圖

圖4 tolC基因PCR擴增電泳圖
2.3統計學分析結果141株陰溝腸桿菌分別擴增出139株acrA基因陽性株,陽性率為98.58%;72株acrB基因陽性株,陽性率為51.06%;111株acrR基因陽性株,陽性率為78.72%;116株tolC基因陽性株,陽性率為82.27%,4種基因的陽性率差異有統計學意義(P<0.01),見表4。分別比較多重耐藥組、雙重耐藥組、單重耐藥組和敏感組不同基因的陽性率,acrA基因和acrB基因在4組菌株的陽性率差異均具有統計學意義(P<0.01),而AcrR基因和tolC基因的陽性率組間無統計學差異,見表5。

表4 4種基因陽性率的比較

表5 四種基因在不同組中陽性率的比較
主動外排系統是引起細菌多重耐藥的機制之一,作為一種非特異性耐藥機制,可引起細菌固有的耐藥性[3,4],而耐藥結節細胞分化家族 AcrAB-TolC外排系統是導致革蘭陰性菌多重耐藥性的重要因素[5-7]。陰溝腸桿菌染色體上存在acrA,acrB,acrR和tolC基因,可以編碼AcrAB-TolC外排泵,多重耐藥的陰溝腸桿菌存在活躍的AcrAB-To1C外排泵[8],陰溝腸桿菌多重耐藥與主動外排系統有關。
本研究結果顯示,141株陰溝腸桿菌高水平攜帶AcrAB-TolC系統的acrA,acrB,acrR和tolC四種基因,其中acrA基因的陽性檢出率最高,acrB基因的陽性檢出率最低,四種基因的陽性檢出率有顯著的差異(P<0.01)。根據耐藥表型的不同,將141株陰溝腸桿菌分為多重耐藥組、雙重耐藥組、單重耐藥組和敏感組,比較各組陰溝腸桿菌不同基因的陽性檢出率,acrA基因和acrB基因在不同組的陽性率有顯著性差異(P<0.01),各耐藥組高于敏感組,且多重耐藥組陽性率最高;acrR基因和tolC基因在不同組的陽性率無顯著性差異。
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