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PRDX5基因啟動子的熒光素酶報告質粒的構建

2014-12-31 00:00:00胡樂林
醫學信息 2014年16期

摘要:目的 構建含PRDX5基因啟動子的熒光素酶報告質粒。方法 ①通過生物信息學方法,查詢PRDX5基因啟動子核酸序列;②使用PCR擴增人PRDX5基因啟動子片段,將啟動子插入到pGL3-Basic載體中,構建含PRDX5基因啟動子片段的熒光素酶報告質粒;③雙酶切及測序確定PRDX5基因啟動子的熒光素酶報告質粒擴增正確。結果 PCR擴增的PRDX5啟動子片段插入到載體中,經測序證實正確。結論 成功構建含PRDX5啟動子的熒光素酶報告質粒。

關鍵詞:PRDX5;啟動子;熒光素酶報告基因

Construction of Luciferase Reporter Plasmid PRDX5 Gene Promoter

HU Le-lin

(School of Medicine,The Anhui University of Science and Technology,Huainan 232001,Anhui,China)

Abstract:ObjectiveTo construct a pGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid and to vertifying its luciferase activity. Methods①search the nucleic acid sequence of the promoter PRDX5 by bioinformatics analysis.②Methods of PCR was performed to amplify the promoter PRDX5. the promoter PRDX5 was inserted into pGL3-Basic cloning vector to construct luciferase reporter plasmid with the promoter PRDX5.③pGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid was verified by double-enzyme cleavage and sequencing method.ResultspGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid was identified to be correct by double-enzyme cleavage and sequencing method.Conclusion A pGL3-PRDX5-promoter-Luc plasmid was successfully constructed.

Key words:PRDX5;Promoter;Luciferase reporter plasmid;Reactive oxygen species

PRDX5是Peroxiredoxins(PRDXs)過氧化物酶家族蛋白的一種,研究顯示在它廣泛表達于哺乳動物的各種細胞,定位于細胞質、過氧化物酶體和線粒體中,但在許多細胞中PRDX5主要定位于線粒體,它與組織過氧化物、過氧化亞硝基陰離子有高的親和力[1]。Masaki shiota[2]等人發現在外源過氧化氫處理或組織缺氧情況下人類前列腺癌PC3細胞PRDX5表達增高。研究還顯示人類定位于線粒體的PRDX5能保護線粒體DNA免受過氧化氫的損傷。并且PRDX5能夠抑制p53誘導的活性氧簇的產生和細胞凋亡[3]。

1材料與方法

1.1實驗材料

1.1.1 菌種、質粒和細胞系大腸桿菌tans-5α購自Trans-Gene(全式金)公司;載體質粒pGL3-Basic,由本室保存。

1.1.2 DNA 重組所用工具酶及試劑BglII、MluI 等限制性內切酶,Taq DNA Polymerase,T4 DNA Ligase購自New England Lab和Promega 公司。大提質粒試劑盒購自威格拉斯儀器有限公司。其它常規試劑均為進口分裝或國產分析純。

1.2方法

1.2.1用PCR和酶切的方法得到目的片段利用DNA提取試劑盒在U2OS細胞中提取全基因組細胞作為模板,根據已知PRDX5cDNA序列,由生物信息學方法自UCSC數據庫分析其可能的轉錄起始位點,選擇TSS上游約1200bp下游約200bp范圍作為其可能的啟動子序列進行引物設計。預計擴增片段長度為1400bp。我們使用軟件DNAMAN分析其上可能存在的限制性內切酶位點,結合載體質粒pGL3-Basic上的限制性內切酶位點,選擇分別在上、下游引物末端,添加BglII、MluI限制性內切酶位點序列。見表1。

1.2.2目的片段與相應載體的連接將擴增好的目的片段和PGL3-basic-Luc進行同樣的雙酶切鑒定,回收酶切產物,并進行質粒連接反應。在10μl的反應體系中加入載體、插入片段、T4DNA ligase、T4DNA ligase buffer。載體與插入片段的摩爾數之比控制在1:3,且二者的總量控制在300ng~500ng之間,置于4℃冰箱連接16h。目的片段和PGL3-basic-Luc通過BglII、MluI酶切位點連接重組質粒PGL3-PRDX5-promoter-Luc。

1.2.3篩選陽性質粒并測序將連接產物轉化E.coli DH5ɑ感受態細胞,提取質粒酶切鑒定,酶切正確的質粒送至公司測序確定。

2結果

2.1生物信息學方法預測PRDX5啟動子序列根據已知的PRDX5 cDNA序列,在UCSC Genome Bioinformatics(http://genome.ucsc.edu/)數據庫中,預測其可能的轉錄起始位點。根據預測的轉錄起始位點,將其上游約1200bp下游約200bp范圍作為可能的啟動子序列。

2.2 PCR方法擴增預測序列根據預測啟動子的序列設計引物,利用DNA提取試劑盒在U2OS細胞中提取全基因組細胞作為模板,用PCR試劑盒擴增出約1.4kb的目的條帶。見圖1。

圖1PCR擴增PRDX5promoter結果

2.3構建pGL3-PRDX5-promoter-Luc熒光素酶報告基因質粒將擴增好的目的片段和PGL3-basic-Luc進行同樣的雙酶切鑒定,回收酶切產物,并進行質粒連接反應。再將連接產物轉化到感受態大腸桿菌中,接種在帶氨芐西林的LB固體培養基中,37℃孵育過夜后。挑出陽性克隆,提取質粒并進行酶切鑒定。圖2為0.8%的瓊脂糖凝膠結果,可看出在相應的大小條帶上出現陽性結果。

圖2PRDX5啟動子片段連接入熒光素酶報告質粒pGL3-Basic酶切鑒定。挑選的克隆擴增后所提質粒進行KpnI、NheI限制性內切酶雙酶切。

2.4篩選陽性質粒并測序將連接產物轉化E.coli DH5ɑ感受態細胞,提取質粒酶切鑒定,酶切正確的質粒送至公司測序確定。

3討論

PRDX5是Peroxiredoxins過氧化物酶家族蛋白的一種,但在許多細胞中PRDX5主要定位于線粒體。在氧化應激情況下PRDXs家族蛋白能將H2O2轉化為水,清除ROS,抵抗ROS對細胞的損害[4]。Yuan Zhou等在哺乳動物細胞中首次證實PRDX5能發揮抗氧化劑功能,抑制p53誘導產生的細胞內ROS。PRDX5的晶體結構研究顯示,與PRDXs家族的其它成員相比,PRDX5具有更強的清除ROS的能力。大量研究顯示活性氧簇水平與腫瘤的發生密切相關,因此可以推測PRDX5可能與腫瘤的發生相關。如果PRDX5與腫瘤的發生相關,那么研究PRDX5的轉錄激活將是很有意義的。在本研究中,我們克隆出PRDX5的啟動子熒光素酶報告質粒,并檢測了其活性。

參考文獻:

[1]Banmeyer I, Marchand C, Verhaeghe C, et al. Overexpression of human peroxiredoxin 5 in subcellular compartments of Chinese hamster ovary cells: effects on cytotoxicity and DNA damage caused by peroxides[J]. Free Radic Biol Med,2004,36(1):65-77.

[2]Shiota M, Izumi H, Miyamoto N, et al. Ets regulates peroxiredoxin1 and 5 expressions through their interaction with the high-mobility group protein B1[J]. Cancer Sci,2008,99(10):1950-1959.

[3]Zhou Y, Kok K H, Chun A C, et al. Mouse peroxiredoxin V is a thioredoxin peroxidase that inhibits p53-induced apoptosis[J]. Biochem Biophys Res Commun. 2000, 268(3): 921-927.

[4] Dubuisson M, Vander S D, Clippe A, et al. Human peroxiredoxin 5 is a peroxynitrite reductase[J]. FEBS Lett. 2004, 571(1-3): 161-165.

編輯/哈濤

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