吳 麗 王 彤 呂志杰 季聰華
時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線法在生存模型預(yù)后評價(jià)中的應(yīng)用*
吳 麗1,2王 彤1△呂志杰3季聰華2
目的 探討時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線法在生存模型的預(yù)后評價(jià)中的應(yīng)用。方法 介紹時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線法的基本原理,以Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型為例,闡述如何采用Cox模型輸出結(jié)果獲取時(shí)點(diǎn)靈敏度與動態(tài)特異度及時(shí)依ROC曲線,通過對各時(shí)點(diǎn)曲線下的面積進(jìn)行加權(quán)平均得到整個(gè)隨訪期模型的總體預(yù)測準(zhǔn)確度。結(jié)果 時(shí)點(diǎn)/動態(tài)的ROC曲線法是以時(shí)刻風(fēng)險(xiǎn)集中的病例與對照的分類為基礎(chǔ),該定義與風(fēng)險(xiǎn)模型的意義相吻合。同時(shí),可以擴(kuò)展到協(xié)變量不滿足比例風(fēng)險(xiǎn)的生存模型預(yù)測準(zhǔn)確度的評價(jià)。結(jié)論 時(shí)點(diǎn)/動態(tài)的ROC曲線法可以通過不同時(shí)點(diǎn)下風(fēng)險(xiǎn)集的變化情況動態(tài)地觀察模型預(yù)測準(zhǔn)確度的瞬時(shí)變化情況,可作為生存分析中決定系數(shù)這一指標(biāo)更好的替代方法。
ROC曲線 曲線下面積 Cox 預(yù)測準(zhǔn)確度
Heagerty[1]于2005年提出時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線評價(jià)生存模型的預(yù)測準(zhǔn)確度,綜合了模型預(yù)測的靈敏度和特異度,同時(shí)可以反映模型的預(yù)測能力隨時(shí)間的變化趨勢。本研究擬采用時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線法評價(jià)生存模型的預(yù)測準(zhǔn)確度。
本研究擬采用Cox回歸模型的預(yù)后指數(shù)估計(jì)時(shí)依靈敏度和特異度,得出相應(yīng)的ROC曲線、曲線下面積及一致性統(tǒng)計(jì)量C。通過采用不同時(shí)刻曲線下面積變化趨勢來評價(jià)不同時(shí)刻模型所包含的信息量,一致性統(tǒng)計(jì)量C評價(jià)擬合模型隨時(shí)間變化的總體預(yù)測準(zhǔn)確度。
1.時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線
每一時(shí)刻對應(yīng)的時(shí)點(diǎn)靈敏度(incident sensitivity,sensitivityI)和動態(tài)特異度(dynamic specificity,specificityD)具體表示如下:
(1)
(2)
式中:
cp:產(chǎn)生假陽性率p的截點(diǎn)值;
p:動態(tài)的假陽性率,p=P(Mi>cp|Ti>t)=1-specificityI(cp,t),p∈[0,1];
t時(shí)刻ROC曲線下面積(AUC(t)):
(3)
整個(gè)隨訪期內(nèi)(0,τ),對各時(shí)間點(diǎn)的曲線下面積進(jìn)行加權(quán)平均得到模型總的預(yù)測準(zhǔn)確度即個(gè)體的預(yù)測結(jié)局與實(shí)際結(jié)果相一致的概率為:
(4)
2.參數(shù)估計(jì)
采用時(shí)點(diǎn)/動態(tài)的ROC曲線方法來描述生存模型的預(yù)測準(zhǔn)確度,該法獨(dú)到之處在于:時(shí)點(diǎn)靈敏度和動態(tài)特異度的定義是以t時(shí)刻風(fēng)險(xiǎn)集中的病例與對照的分類為基礎(chǔ),該定義與風(fēng)險(xiǎn)模型的意義相吻合。同時(shí),它可進(jìn)一步擴(kuò)展為時(shí)依協(xié)變量的模型評分Mi(t),來定義時(shí)點(diǎn)靈敏度P[Mi(t)>c|Ti=t]和動態(tài)特異度P[Mi(t)≤c|Ti>t],解決了模型中協(xié)變量不滿足比例風(fēng)險(xiǎn)的問題。由此可見,時(shí)點(diǎn)/動態(tài)的ROC曲線方法可以通過不同時(shí)點(diǎn)下風(fēng)險(xiǎn)集的變化情況動態(tài)地觀察準(zhǔn)確度的瞬時(shí)變化情況,因此,時(shí)依ROC曲線法可作為生存分析中R2這一指標(biāo)更好的替代方法。
對NHL患者預(yù)后評價(jià)中,本研究假定刪失時(shí)間與生存時(shí)間是獨(dú)立的,應(yīng)用的時(shí)依ROC曲線法主要關(guān)注于前瞻性研究中不同時(shí)間點(diǎn)的正確分類率來描述指標(biāo)或模型預(yù)后潛力,并沒有將其擴(kuò)展到帶有協(xié)變量的ROC分析中,同時(shí),該法可擴(kuò)展到病例-對照研究中描述罕見病標(biāo)記值的預(yù)測準(zhǔn)確度。
綜上所述,時(shí)點(diǎn)/動態(tài)ROC曲線法應(yīng)用到帶有時(shí)協(xié)變量的標(biāo)記值Mi(t)計(jì)算模型預(yù)測準(zhǔn)確度的研究,對醫(yī)學(xué)研究將會更為適用。同時(shí),帶有協(xié)變量的時(shí)依ROC曲線法預(yù)測準(zhǔn)確度尚待進(jìn)一步探討。
[1]Heagerty PJ,Zheng Y.Survival model predictive accuracy and ROC curves.Biometrics,2005,61(1):92-105.
[2]Xu R,O’Quigley J.Proportional hazards estimate of the conditional survival function.Journal of the Royal Statistical Society:Series B(Statistical Methodological),2000,62(4):667-680.
[3]Efron B.Bootstrap methods:another look at the jackknife.The annals of Statistics,1979,7(1):1-26.
(責(zé)任編輯:劉 壯)
國家自然科學(xué)基金(81473073);浙江省衛(wèi)生廳資助課題(2011ZQ011)
1.山西醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)教研室(030001)
2.浙江省中醫(yī)院信息部
3.浙江大學(xué)附屬邵逸夫醫(yī)院下沙院區(qū)
△通信作者:王彤,E-mail:wtstat@21cn.com