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ABI 7500與TL 988實時熒光PCR儀的性能評價

2015-04-09 00:17:42潘強龍周成林楊先知謝國良崔大偉
中國現代醫生 2015年2期
關鍵詞:一致性

潘強龍 周成林 楊先知 謝國良 崔大偉

[摘要] 目的 探討ABI 7500與TL 988熒光定量PCR儀之間的性能差異。 方法 參照EP9-A2文件中的評價標準,兩臺儀器分別對5種不同濃度的甲型流感病毒陽性質控品進行檢測,每個濃度測量20次,比對兩種儀器的精密度、靈敏度,并評價兩臺儀器結果一致性。 結果 精密度:TL 988的變異系數(CV)從0.68%到1.52%,ABI 7500的CV從1.93%到2.69%。兩臺儀器在檢測高濃度的甲型流感病毒DNA時(107、106、105 copies/mL)差異無統計學意義(P>0.05),檢測低濃度的病毒DNA時(104、103 copies/mL)差異有統計學意義(P<0.05)。靈敏度:兩種儀器檢測濃度103 copies/mL時,TL 988陽性檢出率為100%,ABI 7500檢出率為0。兩種儀器檢測數據相關性良好(r=0.998)。結論 熒光定量TL 988 PCR儀器的性能(精密度和靈敏度)比ABI 7500好。

[關鍵詞] 熒光定量PCR儀;比對;精密度;靈敏度;一致性

[中圖分類號] R446.1 [文獻標識碼] B [文章編號] 1673-9701(2015)02-0155-02

根據ISO 15189要求,實驗室需要定期對使用的儀器進行性能評估,當實驗室使用兩套及以上檢測系統檢測同一項目時,應比對數據表明其檢測結果一致性。現筆者按EP9-A2文件要求[1-5],對美國ABI 7500和國產TL 988的主要性能指標進行評估,以了解結果差異性與一致性,從而尋找國產儀器可替代國外產品的可能性。

1材料與方法

1.1材料

(1)主要儀器:ABI 7500和TL 988熒光定量PCR儀、生物安全柜、低溫高速離心機、超凈工作臺等。

(2)試劑:上海之江生物科技有限公司提供的甲型流感病毒熒光定量PCR檢測試劑盒。檢測標本:陽性定量質控品(含甲型流感病毒DNA的濃度為107 copies/mL),用free H2O準確10倍比稀釋成106、105、104、103 copies/mL,充分混勻,分裝250 μL到1.5 mL的eppendorf管中備用。

1.2 方法

1.2.1 精密度測定 按NCCLS標準,分別在ABI 7500和TL 988熒光定量PCR儀上同時檢測107、106、105、104 copies/mL四種濃度的陽性質控品。各濃度均測定20次,計算其均值、標準差和變異系數。

1.2.2 靈敏度測定 分別取107、106、105、104、103 copies/mL五個濃度標本在兩臺PCR儀上進行檢測,根據陽性檢測率分析其靈敏度。

1.2.3相關性檢測 通過重復性試驗中的數據,分別取107、106、105、104 copies/mL濃度的檢測結果的平均值,分析兩臺儀器的數據相關性。

1.3統計學方法

應用SPSS 17.0統計學軟件對數據分析處理。檢查是否有離群值,對數據進行初步檢查,兩變量間線性關系分析采用直線相關及回歸分析。P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1兩臺儀器精密度結果比較

TL 988 和ABI 7500兩臺熒光PCR儀器的精密度結果比較,見表1。可以看出TL 988測得各濃度數據的變異系數(CV)從0.68%到1.52%,ABI 7500測得各濃度數據的變異系數(CV)是從1.93%到2.69%,變異系數(CV)均在要求范圍內(<10%),數據表明ABI 7500的精密度略低于TL 988(P>0.05)。此外,關于相同濃度的標準品檢測結果的Ct值和標準差分析,顯示兩臺PCR儀的批內重復性均良好。

表1 兩臺儀器精密度結果比較

2.2兩臺儀器靈敏度結果比較

甲型流感病毒DNA的濃度在107、106、105、104 copies/mL時,兩臺儀器的陽性檢出率均為100%,當濃度為103 copies/mL時,TL 988檢出率依然為100%,但ABI 7500的檢出率為0。靈敏度方面,TL988要比ABI 7500能檢測到更低濃度,即靈敏度相對較高(P<0.05)。

2.3 相關性比較

兩臺儀器對各標本的甲型流感病毒DNA的含量進行測定,結果表明,兩臺儀器測定值的回歸直線方程為:y=1.2364x-5.2097(r=0.998),具有良好的直線相關和回歸關系。

3 討論

在2013年全球高科技產業值中,精密儀器醫療設備約為3萬億美金,占13%。而精密醫療設備基本上被國外所壟斷。醫療設備是現代醫療業發展的必備手段,所以需要加快精密儀器的國有化進程,降低成本,推動民族品牌企業不斷發展,降低老百姓就醫費用成本。

熒光定量PCR技術是通過熒光染料或熒光標記的特異性探針對PCR產物進行標記跟蹤,實時監控反應過程。與傳統的PCR技術相比,實時熒光定量技術具有特異性高等優點[6-8],在檢測甲型流感病毒上具有很好的準確性。

另外實驗室中不應使用同一種檢測系統進行臨床檢驗,以避免儀器出現系統性的檢測錯誤[9-12]。對樣本進行檢測時,一般只做一次檢驗便要發出報告,這便要求儀器檢測系統具有良好的可重復性,因此對儀器的精密度具有很高的要求[12-14]。實驗室中,當樣本在低拷貝狀態下也要求有很高的檢出率。

兩臺儀器在試驗前,室內質控品的檢測結果均可靠,具有較好的重復性,此次試驗中,兩臺儀器未出現故障,穩定性良好,操作方便,檢測快速。對 ABI 7500熒光定量PCR儀在重復性、線性、靈敏度上與TL 988進行比較,結果顯示兩臺 PCR儀的批內批間重復性好, CV均在要求范圍內,線性良好。ABI 7500在精密度和靈敏度上明顯略遜于TL 988,可能與本次試驗中所用試劑與國產TL 988更配套,致使TL 988在本次試驗中表現優異。兩臺儀器測定值比較,r=0.998,表明兩臺儀器具有良好的直線相關和回歸關系。說明ABI 7500與TL988測定甲型流感病毒的結果具有可比性,而國產TL 988 PCR儀能較好地服務于臨床。

[參考文獻]

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(收稿日期:2014-07-17)

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