潘強龍 周成林 楊先知 謝國良 崔大偉

[摘要] 目的 探討ABI 7500與TL 988熒光定量PCR儀之間的性能差異。 方法 參照EP9-A2文件中的評價標準,兩臺儀器分別對5種不同濃度的甲型流感病毒陽性質控品進行檢測,每個濃度測量20次,比對兩種儀器的精密度、靈敏度,并評價兩臺儀器結果一致性。 結果 精密度:TL 988的變異系數(CV)從0.68%到1.52%,ABI 7500的CV從1.93%到2.69%。兩臺儀器在檢測高濃度的甲型流感病毒DNA時(107、106、105 copies/mL)差異無統計學意義(P>0.05),檢測低濃度的病毒DNA時(104、103 copies/mL)差異有統計學意義(P<0.05)。靈敏度:兩種儀器檢測濃度103 copies/mL時,TL 988陽性檢出率為100%,ABI 7500檢出率為0。兩種儀器檢測數據相關性良好(r=0.998)。結論 熒光定量TL 988 PCR儀器的性能(精密度和靈敏度)比ABI 7500好。
[關鍵詞] 熒光定量PCR儀;比對;精密度;靈敏度;一致性
[中圖分類號] R446.1 [文獻標識碼] B [文章編號] 1673-9701(2015)02-0155-02
根據ISO 15189要求,實驗室需要定期對使用的儀器進行性能評估,當實驗室使用兩套及以上檢測系統檢測同一項目時,應比對數據表明其檢測結果一致性。現筆者按EP9-A2文件要求[1-5],對美國ABI 7500和國產TL 988的主要性能指標進行評估,以了解結果差異性與一致性,從而尋找國產儀器可替代國外產品的可能性。
1材料與方法
1.1材料
(1)主要儀器:ABI 7500和TL 988熒光定量PCR儀、生物安全柜、低溫高速離心機、超凈工作臺等。
(2)試劑:上海之江生物科技有限公司提供的甲型流感病毒熒光定量PCR檢測試劑盒。檢測標本:陽性定量質控品(含甲型流感病毒DNA的濃度為107 copies/mL),用free H2O準確10倍比稀釋成106、105、104、103 copies/mL,充分混勻,分裝250 μL到1.5 mL的eppendorf管中備用。
1.2 方法
1.2.1 精密度測定 按NCCLS標準,分別在ABI 7500和TL 988熒光定量PCR儀上同時檢測107、106、105、104 copies/mL四種濃度的陽性質控品。各濃度均測定20次,計算其均值、標準差和變異系數。
1.2.2 靈敏度測定 分別取107、106、105、104、103 copies/mL五個濃度標本在兩臺PCR儀上進行檢測,根據陽性檢測率分析其靈敏度。
1.2.3相關性檢測 通過重復性試驗中的數據,分別取107、106、105、104 copies/mL濃度的檢測結果的平均值,分析兩臺儀器的數據相關性。
1.3統計學方法
應用SPSS 17.0統計學軟件對數據分析處理。檢查是否有離群值,對數據進行初步檢查,兩變量間線性關系分析采用直線相關及回歸分析。P<0.05為差異有統計學意義。
2 結果
2.1兩臺儀器精密度結果比較
TL 988 和ABI 7500兩臺熒光PCR儀器的精密度結果比較,見表1。可以看出TL 988測得各濃度數據的變異系數(CV)從0.68%到1.52%,ABI 7500測得各濃度數據的變異系數(CV)是從1.93%到2.69%,變異系數(CV)均在要求范圍內(<10%),數據表明ABI 7500的精密度略低于TL 988(P>0.05)。此外,關于相同濃度的標準品檢測結果的Ct值和標準差分析,顯示兩臺PCR儀的批內重復性均良好。
表1 兩臺儀器精密度結果比較
2.2兩臺儀器靈敏度結果比較
甲型流感病毒DNA的濃度在107、106、105、104 copies/mL時,兩臺儀器的陽性檢出率均為100%,當濃度為103 copies/mL時,TL 988檢出率依然為100%,但ABI 7500的檢出率為0。靈敏度方面,TL988要比ABI 7500能檢測到更低濃度,即靈敏度相對較高(P<0.05)。
2.3 相關性比較
兩臺儀器對各標本的甲型流感病毒DNA的含量進行測定,結果表明,兩臺儀器測定值的回歸直線方程為:y=1.2364x-5.2097(r=0.998),具有良好的直線相關和回歸關系。
3 討論
在2013年全球高科技產業值中,精密儀器醫療設備約為3萬億美金,占13%。而精密醫療設備基本上被國外所壟斷。醫療設備是現代醫療業發展的必備手段,所以需要加快精密儀器的國有化進程,降低成本,推動民族品牌企業不斷發展,降低老百姓就醫費用成本。
熒光定量PCR技術是通過熒光染料或熒光標記的特異性探針對PCR產物進行標記跟蹤,實時監控反應過程。與傳統的PCR技術相比,實時熒光定量技術具有特異性高等優點[6-8],在檢測甲型流感病毒上具有很好的準確性。
另外實驗室中不應使用同一種檢測系統進行臨床檢驗,以避免儀器出現系統性的檢測錯誤[9-12]。對樣本進行檢測時,一般只做一次檢驗便要發出報告,這便要求儀器檢測系統具有良好的可重復性,因此對儀器的精密度具有很高的要求[12-14]。實驗室中,當樣本在低拷貝狀態下也要求有很高的檢出率。
兩臺儀器在試驗前,室內質控品的檢測結果均可靠,具有較好的重復性,此次試驗中,兩臺儀器未出現故障,穩定性良好,操作方便,檢測快速。對 ABI 7500熒光定量PCR儀在重復性、線性、靈敏度上與TL 988進行比較,結果顯示兩臺 PCR儀的批內批間重復性好, CV均在要求范圍內,線性良好。ABI 7500在精密度和靈敏度上明顯略遜于TL 988,可能與本次試驗中所用試劑與國產TL 988更配套,致使TL 988在本次試驗中表現優異。兩臺儀器測定值比較,r=0.998,表明兩臺儀器具有良好的直線相關和回歸關系。說明ABI 7500與TL988測定甲型流感病毒的結果具有可比性,而國產TL 988 PCR儀能較好地服務于臨床。
[參考文獻]
[1] 張秀明,李煒煊,鄭松柏,等. 不同檢測系統17項常規生化結果的比對和偏倚評估[J]. 檢驗醫學,2007,22(2):166-170.
[2] Berger A,Preiser WJ. Viral genome quantification as a tool for improving patient management:The example of HIV,HBV,HCV and CMV[J]. Antimicrob Chemother, 2002,49(5):713-721.
[3] Strader DB,Wright T,Thomas DL,et al. Diagnosis,management,and treatment of hepatitis C[J]. Hepatology,2004, 39(4):1147-1171.
[4] Ho SK,Yam WC,Leung ET,et al. Rapid quantification of hepatitis B virus DNA by real-time PCR using fluorescent hybridization probes[J]. J Med Microbio,2003,52(Pt5):397-402.
[5] The National Committee for Clinical Laboratory Standaeds.EP9-A2:2002 Method comparison and bias estimation using patient samples [S].
[6] 王露楠,鄧 巍,申子瑜,等. 乙型肝炎病毒DNA標準物質的研究[J]. 中華肝臟病雜志,2007,15(2):107-110.
[7] 李金明. 實時熒光PCR技術[M]. 北京:人民軍醫出版社,2007:198.
[8] 王寧. 定量PCR技術研究進展[J]. 國外醫學臨床生物化學與檢驗學分冊,2000,21(6):314-316.
[9] 程剛,何蘊韶,周新宇. 熒光定量聚合酶鏈式反應檢測乙型肝炎病毒[J]. 中華醫學檢驗雜志,1999,22(1):135-138.
[10] 曾爭,劉丹,公維波,等. 三種PCR儀的特異性及靈敏度評價[J]. 醫療衛生裝備,2006,27(10):10.
[11] 楊有業,張秀明. 臨床檢驗方法學評價[M]. 北京:人民衛生出版社,2008:362.
[12] 梁映亮,隋洪,鄭文婷,等. ABI prism 7000熒光定量PCR儀性能評價及應用價值[J]. 醫藥前沿,2012,(2):337-338.
[13] Sertoz RY,Erensoy S,Pas S et al. Evaluation of the agreement of results obtained from ABI7000 and ABI 7700 sequencers in the quantification of hepatitis B virus DNA[J]. Mikrobiyol Bul,2005,39(2):175-181.
[14] Hartman LJ,Coyne SR,Norwood DA. Development of a novel internal positive control for Taqman based assays[J].Mol Cell Probes,2005,19(1):51-59.
(收稿日期:2014-07-17)