黃龍全,張劍韻
維生素B6(VB6)是一組可相互轉換的吡啶衍生物的總稱,包括吡哆醇(pyridoxine,PN)、吡哆胺(pyridoxamine,PM)、吡哆醛(pyridoxal,PL)、磷酸吡哆醇(pyridoxine 5′-phosphate,PNP)、磷酸吡哆胺(pyridoxamine 5′-phosphate,PMP)和磷酸吡哆醛(pyridoxal 5′-phosphate,PLP)。其 中,PLP 是140多種細胞酶的輔酶,在生物體內發揮廣泛、重要的作用。植物和微生物是自然界VB6的制造者,動物從食物中獲得VB6。在植物體內,PLP作為胱硫醚合成酶[1]、氨基環丙烷羧化物合成酶[2]、絲氨酸棕櫚酰轉移酶[3]、蘇氨酸合成酶[4]、胱硫醚裂合酶[5]等的輔酶有詳細研究;PLP 也是乙烯、葉綠素和生長素 合 成 所 必 需 的[6-7];PLP 還 涉 及 亞 油 酸 和 淀 粉 的合成[8]。近年來發現VB6也是抗氧化劑,可有效淬滅單線態氧和超氧陰離子自由基[9-10];它作為細胞信號傳導的調節分子,對細胞膜上的離子通道具有調節作用[11];它發揮抗逆作用,保護植物免受低溫、紫外線、氧化、滲透壓等環境脅迫的影響[12-13]。無論是闡明VB6參與調控植物生長發育和環境反應的機理,通過遺傳改良提高食源性植物的VB6含量,還是利用VB6的特殊生理功能提高植物的逆境適應能力,都依賴于對VB6代謝的研究。植物VB6代謝包括VB6的從頭合成和合成后的代謝轉換。本文綜述了植物VB6從頭合成與代謝轉換的研究進展。
至今發現兩種VB6從頭合成途徑(de novo synthetic pathway),兩者的底物、產物和作用酶均不相同。首先發現的DXP依賴途徑(DXP dependent pathway)在大腸桿菌有詳細研究,利用1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸(DXP)和4-磷酸羥基-蘇氨酸首先合成PNP,再經PNP氧化酶的作用,轉變為PLP后用于細胞代謝過程[14]。
另外一條途徑DXP 非依賴途徑(DXP independent pathway)于1999年發現。該途徑以谷氨酰胺、3-磷酸甘油醛(或磷酸二羥丙酮)和5-磷酸核糖(或5-磷酸核酮糖)為底物直接合成PLP[15-17](圖1)。Ehrenshaft等[15]在研究尾孢菌(C.nicotianae)對自身毒素的抗性中發現了涉及VB6代謝的新基因,最初指定為單線態氧抗性基因SOR1,后來鑒定為PDX1。2001年又從尾孢菌鑒定出涉及VB6合成的第2 個基因PDX2[16]。目前已經明確PDX1和PDX2構成PLP合酶復合體(PLP synthase complex),PDX2發揮谷氨酰胺酶的作用,催化從谷氨酰胺產生氨;PDX1發揮閉環蛋白的作用,催化5-磷酸核糖、3-磷酸甘油醛和氨的縮合,完成PLP 的合成[17]。DXP非依賴途徑的產物直接用于細胞代謝,生物效率高于DXP依賴途徑,是自然界VB6的主要合成途徑。DXP 非依賴途徑通過谷氨酰胺將VB6和氨基酸代謝聯系起來,通過丙糖和戊糖磷酸代謝池又將VB6與細胞能量途徑聯系起來。
VB6合成途徑作用酶及其編碼基因的鑒定是極為重要的一歩。學術界很長時間認為植物通過DXP依賴途徑合成VB6,但始終沒有找到實驗依據。作為植物逆境應答中VB6作用研究的一部分,2005年Denslow 等[18]從煙草鑒定出PDX1 和PDX2同源序列。使用兼并引物的基因擴增獲得2個PDX1序列,彼此相差15個堿基,編碼相同氨基酸序列,可能是2 個等位基因或者2 個拷貝。PDX2為單拷貝基因,表達也遠低于PDX1。多個研究小組從擬南芥也鑒定出PDX1和PDX2同源序列,并開展了更為深入的研究[13,19-23]。目前已經明確植物通過DXP非依賴途徑從頭合成VB6。

圖1 DXP非依賴性維生素B6 合成途徑Fig.1 DXP independent vitamin B6synthetic pathway
擬南芥PDX2也是單拷貝基因,位于5號染色體上(At5g60540),基因長度為2 180bp,含有7個外顯子,轉錄長度為768bp,編碼255個氨基酸、理論分子量為27 303Da的蛋白。存在3個PDX1同系物,分別命名為AtPDX1.1、AtPDX1.2和AtPDX1.3。PDX1.1(At2g38230)、PDX1.2(At3g16050)和PDX1.3(At5g01410)分別位于2號、3號和5號染色體上。PDX1.1和PDX1.3具有89%的相似性,而與PDX1.2的相似性為60%。擬南芥還存在一個小的不完全拷貝(PDX1.4),其與PDX1.1基因上游序列33%相同,在細胞代謝中可能沒有作用。PDX1同系物都沒有基因內含子,提示其原核起源。PDX1.1、PDX1.2和PDX1.3的轉錄長度分別為1 053、1 380和1 297bp。PDX2對擬南芥的生長發育至關重要,突變體胚胎致死[19,23]。因為難以獲得PDX2的純合突變體,所以大量的研究集中 在PDX1同系物上[13,19-22]。其 中PDX1.3 的 轉錄豐度最高,突變體表型和VB6水平的變化最大,研究也最為詳細。
PDX1.1基因沉默植物出現萎黃和根系生長不良,而PDX1.1和PDX1.3基因都沉默植物葉片萎黃畸形,多數死亡,幸存植物的花朵小、未能結籽,提 示PDX1.1 和PDX1.3可能存在功能重疊[21]。Titiz等[20]對PDX1.1 和PDX1.3 基因進行了TDNA 插入突變。pdx1.3突變體的表型與Wagner等的結果非常相似,但pdx1.1突變體的VB6水平沒有下降,也不呈現萎黃表型。Titiz等也進行了PDX1.1和PDX1.3雙突變,惡化的表型和致命的雙突變也預示兩基因至少部分功能重疊。但是,2個基因的時空表達存在差異[13,20-21],提示兩者也可能具有相對獨立的功能,在擬南芥基因組中都有存在的意義。擬南芥PDX1.2的作用還不清楚,基因插入突變體的表型與野生型沒有差異[21]。但擬南芥遭遇紫外線和氧化脅迫時PDX1.2轉錄上調[22],提示PDX1.2可能在脅迫條件下發揮作用。
煙草感染假單胞桿菌后PDX1和PDX2的基因表達下調,而水楊酸和茉莉酮酸甲酯處理可致基因短暫上調[18]。Chen等[13]在分離干旱和鹽脅迫響應蛋白互作伴侶的酵母雙雜交實驗中,首先分離出PDX1.3。植物的根、莖、葉、花和長角果都能檢測出PDX1.3的轉錄,基因的最強表達出現在脈管組織和保衛細胞。pdx1.3突變體的葉綠體和根的生長異常,幼苗的根對鹽和甘露醇敏感,提示PDX1.3蛋白涉及對滲透和離子脅迫的生物應答。pdx1.3突變體根部缺乏色氨酸依賴性生長素的合成,這可能是出現短根表型的原因[24]。2006年,Wagner等[21]獲得了PDX1.3基因EMS 突變體rsr4-1,突變體的蔗糖響應下降,呈現根生長退化、矮小和退綠葉。突變體的表型可以采用向生長媒體中添加PL 的方法加以恢復,添加PN、PM 或者PLP可部分恢復。
Denslow 等[22]報道了非生物脅迫下擬南芥PLP合酶基因的應答調節。正常狀態下,擬南芥PDX1.1和PDX1.3高水平表達,PDX1.2不表達或低水平表達,PDX2中間水平表達。在植物遭遇強光、低溫、干旱、紫外線、百草枯和臭氧時,PDX1和PDX2基因都上調。作者進一步分析多種脅迫因子對煙草VB6存在形態的影響,發現PLP 水平不同程度地應答上升,并引起PL 和PN 的相應變化,隨后回歸對照水平[25]。
2007年Herrero 等[26]在煙草中表達尾孢菌PLP合成酶基因,嘗試提高煙草的VB6含量。結果僅有一個株系VB6水平的增加達到顯著水平,比野生型和轉化對照系高出約17%。然而,轉化系煙草內源PDX1和PDX2 基因的表達下降,提示植物VB6的從頭合成受到嚴格調控。2011年,Raschke等[27]在擬南芥過量表達PDX 蛋白,獲得了VB6含量顯著增加的植株。他們還發現僅能提高PDX1的蛋白表達量,高VB6含量植株的生長期延長,細胞體積增大,對氧化脅迫的抵抗性也增強。
PDX1和PDX2 復合體的細胞定位還存在爭議。Tambasco-Studart等報道所有PDX1和PDX2蛋白都定位于細胞溶質[19]。然而,Chen 等[13]把PDX1.3定位于細胞器和膜系統。Denslow 等[21]也報道能夠從質膜和細胞核觀察到PDX2 蛋白。從SUBA 擬南芥亞細胞定位數據庫匯總的亞細胞定位信息看,PDX1和PDX2定位于細胞溶質和細胞器。基于預測程序,PDX1.1、PDX1.3 和PDX2定位于細胞溶質、線粒體和質體,PDX1.2定位于細胞溶質和線粒體。
除了VB6的從頭合成,細菌和真核生物細胞中還普遍存在一條相似的PLP補救途徑,補救途徑涉及一系列酶的作用,通過VB6各型的代謝轉換使得細胞能夠直接利用外源PN、PM 或PL來合成細胞代謝所需要的PLP。補救途徑在微生物和哺乳動物有詳細研究。雖然PLP是占優勢的輔酶型,其他形式的VB6在細胞中通過補救途徑也保持動態平衡。
PL激酶(PL kinase,EC 2.7.1.35)在金屬陽離子的存在下,利用ATP催化PL、PN 和PM 的5′位醇基磷酸化,生成相應的磷酸酯型。從大腸桿菌發現兩種PL 激酶,pdxk 基因編碼普通PL 激酶,而pdxy 基因編碼的特殊PL 激酶僅以PL 為底物,且活性很低[28-29]。目前,真核生物中僅發現pdxk 基因,而多數原核生物同時具有pdxk和pdxy。
2002、2004和2008年,分別從擬南芥[30]、小麥[31]和油菜[32]克隆出PL 激酶基因。從擬南芥鑒定出的At5g37850與大腸桿菌pdxk 同源,與哺乳動物PL 激酶氨基酸序列的相似性大于40%。At5g37850也稱SOS4,其突變體對鹽高度敏感。擬南芥SOS4基因在葉、莖、根和花均等表達,根尖高度表達,種子吸水60h后可檢測出PL 激酶基因的表達。小麥基因組至少有2個PL 激酶拷貝,在根、芽、穗和花藥均有轉錄。油菜也有2 個PL 激酶拷貝,基因的轉錄受發育和環境的調節。目前還缺乏采用實驗的方法對PL 激酶進行細胞定位,預測結果表示存在于質體和線粒體。
擬南芥SOS4基因突變的研究證明PL 激酶是一個新的鹽耐受性決定因子,其突變體sos4 萎黃,與野生型相比植株重量減輕,根部對蔗糖和鹽高度敏感,存在NaCl時根的生長嚴重受損;突變體出乎預料地出現了VB6積累,其中PLP 的增加量最為顯著,其次是PN 和PM[33]。PLP 的增加可能是因為從頭合成途徑基因的上調,因為sos4 突變體PDX 基因的轉錄量比野生型的高。除了對鹽和蔗糖敏感,sos4突變體耐旱而不耐寒。最近發現葉綠體依靠PL激酶維持磷酸酯型VB6水平[34]。
補救途徑的另一個重要酶是FMN 依賴性PNP氧化酶(PNP oxidase,EC 1.4.3.5),氧化底物PNP和PMP上的4′位醇基或氨基為醛基,生成PLP。2007年克隆出擬南芥At5g49970基因,編碼蛋白由3個部分構成,N 端為葉綠體轉運肽,中部為未知功能的Yjef_N 區域,C 端為PNP氧化酶(PDX3)[35]。Sang等[35]在大腸桿菌中表達該基因,通過酶活性分析證明了其功能。擬南芥PNP氧化酶在不同組織中的表達存在差異,受光、熱、ABA 和乙烯處理的上調,受干旱和NaCl的下調。生物信息學預測PNP 氧化酶定位于葉綠體,也獲得了GFT-AtPPOX 融合實驗的支持。Gonzalez等[33]采用對大腸桿菌pdxh 突變體的互補實驗,也驗證了擬南芥At5g49970的PNP氧化酶功能。他們還對該基因進行了插入突變,2個獨立插入突變系氧化酶的活力均下降。pdx3 突變體的VB6總水平下降,而VB6各型與野生型相比較沒有顯著差異。生長在標準室內環境中的pdx3 突變體比野生型對照矮小。高光照條件下,pdx3 突變體對增強的光照反應遲鈍,植株重量無變化,而野生型在強光照條件下生長量增加。突變體對低溫、鹽與蔗糖引起的滲透壓響應與野生型無區別。pdx3 突變體的SOS4以及從頭合成途徑基因,特別是PDX1.1基因的表達增強。雖然從頭合成途徑基因的表達增加,但pdx3突變體與野生型或者sos4突變體相比較,PDX1的酶活力下降。2011年Sang等[36]又報道PNP 氧化酶在細胞溶質和葉綠體中將PNP 和PMP 氧化為PLP。
PL還原酶(PL reductase,EC 1.1.1.65)也稱為PN 脫氫酶,利用NADPH 將PL 還原成PN,反應在體外是可逆的,但在體內逆反應幾乎不可能發生。2004年,Morita等[37]發現裂殖酵母PL 還原酶基因突變體能夠在缺乏VB6的合成培養基上生長,認為該酶對酵母生存而言是非必要的,僅涉及PL轉變為PN 后的細胞排出。
2011年,采用序列同源比對的方法從擬南芥鑒定出PL 還原酶(PLR1),在酵母PL 還原酶缺失突變體中表達AtPLR1 編碼區域,驗證了該酶催化NADPH 依賴性PL 的 還 原 反 應[38]。采 用T-DNA插入突變的研究發現,plr1突變體VB6從頭合成途徑基因的表達水平變化不大,而補救途徑作用酶PDX3和SOS4 基因的表達發生顯著變化。并且,pdx3和sos4突變體AtPLR1 基因的表達也上調。高效液相色譜的分析結果顯示,2 個plr1 突變體VB6總水平下降,其中PL、PLP、PM 和PMP 水平顯著下降,而PN 和PNP 沒有顯著變化。突變體PL水平下降和PN 水平沒有變化是很意外的,提示AtPLR1基因的表達產物可能不是唯一的PL 還原反應的作用酶。突變體的根系生長正常,但植株明顯小于野生型;對低溫和高光照的抵抗性與野生型沒有差異,但明顯受NaCl和甘露醇的抑制,提示PL還原酶也可能涉及植物對滲透脅迫的抵抗性。
植物的葉際是一個復雜的生態系統,具有豐富的微生物多樣性。這些微生物改變植物體表微環境和參與物質循環。VB6是水溶性維生素,其跨膜轉移已有廣泛的研究,很早就明確只有非磷酸酯型VB6能夠穿越細胞膜。植物即可以從環境中吸收VB6,過量VB6也向環境釋放[39]。我們發現葉際微生物在煙草葉面可以將來源于葉組織的PL 還原為PN,提示植物PL 的還原可能還存在葉際微生物的作用[40]。
作為重要經濟作物和模式植物,煙草VB6從頭合成途徑最早被闡明。我們以組培煙草為材料構建無菌實驗模型,解析了植物體內VB6的代謝轉換,獲得了代謝轉換的重要調控信息。采用底物(PL、PM 和PN)飼喂和應答分析的研究發現,煙草葉片組織中PLP保持穩定、PL 水平受到控制,PL 還原為PN 以及PM 與PL的相互轉化是VB6代謝轉換的重要內容[39]。在建立以HPLC 檢測為基礎的VB6代謝酶活性檢測方法的基礎上,從煙草葉片組織鑒定出PL激酶、PNP氧化酶、PL還原酶,以及酶促PM-PL轉換和PLP 水解脫磷酸反應,在體外最適反應條件下,葉片組織粗提液中這些酶的催化活力分別為0.15、0.10、0.08、0.64和23.08nmol·min-1·mg-1,在代謝酶活力水平上探討了植物體內VB6的代謝轉換[41]。我們的研究結果提示PLP→PL→PN 是植物(煙草)體內VB6從頭合成后代謝轉換的主體流向,PL 激酶和PNP氧化酶構成的PLP補救合成以及酶促PM 和PL 的相互轉換是VB6主體代謝的補充(圖2)。
PLP的水解在動物和微生物有詳細研究,受特異和非特異性磷酸酶的作用。堿性磷酸酶涉及維持細胞外PLP濃度的穩定,而酸性磷酸酶涉及細胞內PLP濃度的穩定。1992年從人紅細胞純化出特異性PLP磷酸酶[42],2003年從人腦克隆出PLP 磷酸酶基因[43],從老鼠組織cDNA中也克隆出PLP 磷酸酶基因。我們以PLP為底物,從煙草純化出水解PLP、PMP和PNP的磷酸酶。該酶為二聚體結構、分子量約為50kD,是一個新的非特異性酸性磷酸酶[44]。植物體內是否存在特異性PLP 磷酸酶還有待進一步的研究。
很早就發現某些生物體內存在PL 和PM 的相互轉換。從大腸桿菌和兔肝純化出PM-草酰乙酸轉氨酶,該酶可逆性地催化PM 和草酰乙酸、PL 和天冬氨酸之間的轉氨反應,但是最終被認為是一個未知轉氨酶的脫輔基形式[45]。因為該文作者發現從豬心純化出的谷氨酸-草酰乙酸轉氨酶在脫去輔酶PLP或者PMP后,也能夠催化PM 和酮酸之間的轉氨反應。PM-丙酮酸轉氨酶(PM-pyruvate aminotransferase,EC 2.6.1.30)和PMP-α-酮戊二酸轉氨酶(PMP-α-ketoglutarateaminotranferase,EC2.6.1.54)是目前已經明確和僅有的PLP非依賴性轉氨酶,特異性地以VB6為底物而非輔酶,參與VB6代謝轉換[46-47]。我們在發現煙草體內存在PM 和PL相互轉換的基礎上,進一步純化出其作用酶。結果表示煙草體內存在PM-丙酮酸轉氨酶,對PM 和PL的相互轉換發揮主導作用,同時也明確煙草的谷氨酸-草酰乙酸轉氨酶在脫去輔酶后,能夠催化PM 和草酰乙酸或者α-酮戊二酸之間的轉氨反應[48]。

圖2 煙草體內維生素B6 代謝轉換示意圖[39]Fig.2 Postulated interconversions of different vitamin B6forms in tobacco plants[39]Thick arrow shows the predominant VB6 metabolic flux
植物合成的VB6對植物自身的生長發育和逆境適應,以及人和動物營養具有重要意義。植物VB6從頭合成途徑已經明確,研究積累也較豐富,而代謝轉換尚未明了,還有許多不明之處。PN 葡糖苷(PN glucoside)是植物體內特有的VB6衍生物[49],可能受UDP-葡萄糖依賴性葡糖基轉移酶(UDP-glucose-dependentglucosyltransferase)的 作用由PN 生成。植物體內水解PLP、PMP 和PNP的磷酸酶、PM-丙酮酸轉氨酶以及催化生成PN 葡糖苷的葡糖基轉移酶,都還需要在基因水平上加以明確。雖然從擬南芥鑒定出PL 還原酶基因,但T-DNA插入突變的研究結果顯示該基因的表達產物不是唯一的作用酶[37]。植物體內PL 的還原和PN 的形成還需要更加深入的研究。
同時,從植物檢出4-吡哆酸(4-pyridoxic acid)[50],盡管其起源和去向還是未解之謎,但提出了VB6的異化問題。因為4-吡哆酸在哺乳動物是排泄型VB6,在微生物是VB6降解途徑的一個中間產物。至今從細菌發現兩種VB6降解途徑,PM-丙酮酸轉氨酶是降解途徑Ⅰ的重要作用酶[51]。從煙草分離出PM-丙酮酸轉氨酶,暗示植物體內可能存在VB6降解途徑Ⅰ。對植物VB6降解的研究具有重要意義,是VB6代謝平衡機制的重要內容,還將為今后通過基因工程技術提高食源性植物的VB6含量提供靶標基因。
另外,植物的質體、線粒體和過氧化物酶體等都存在重要的PLP依賴酶,這些酶的活力受制于細胞器內PLP 的平衡供給。PLP 不能通過質膜,并且PLP的4′位醛基非常活潑,極易與伯胺和仲胺形成醛亞胺結構。PLP與非VB6蛋白的非特異性結合將導致生理功能的紊亂。因此,植物VB6從頭合成與代謝轉換的調控機制也是亟待研究的重要科學問題。
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