一種小鼠CT圖像分割方法

邵萌珠　鄒辰

摘要：由于microCT圖像的成像原理和組織特性導(dǎo)致的多樣性和復(fù)雜性，針對(duì)小鼠CT圖像，單一的圖像分割方法難以取得良好的分割結(jié)果。結(jié)合當(dāng)前醫(yī)學(xué)圖像分割方法，提出將閾值分割和基于Amira軟件的交互式分割相結(jié)合的方法。針對(duì)不同的器官組織，根據(jù)對(duì)象灰度特征、形狀、空間分布以及邊緣分布等信息，使用不同的分割方法及工具進(jìn)行逐一分割，最后將不同的器官融合成完整的分割后CT圖像。該半自動(dòng)交互式分割方法結(jié)合了兩者的特點(diǎn)，可實(shí)現(xiàn)小鼠CT圖像的準(zhǔn)確分割。

關(guān)鍵詞：醫(yī)學(xué)圖像分割；閾值分割；Amira軟件；MATLAB應(yīng)用

DOIDOI：10.11907/rjdk.151432

中圖分類號(hào)：TP317.4

文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A 文章編號(hào)文章編號(hào)：16727800（2015）008020703

0 引言

在小鼠microCT圖像數(shù)據(jù)獲取過程中，如使用液體麻醉劑容易使小鼠的呼吸和心跳運(yùn)動(dòng)加快，導(dǎo)致運(yùn)動(dòng)偽影的產(chǎn)生，致使microCT圖像成像分辨率低，進(jìn)而降低圖像分割的準(zhǔn)確性并對(duì)后期重建工作造成誤差；而可以提高圖像分辨率的用于小動(dòng)物的造影劑價(jià)格昂貴，成本較大。基于準(zhǔn)確性、快捷性和成本代價(jià)適當(dāng)?shù)脑瓌t，本文提出使用閾值分割與交互式分割相結(jié)合的分割方法對(duì)小鼠microCT圖像進(jìn)行分割。

1 小鼠microCT圖像分割

基于小鼠microCT圖像特點(diǎn)，分步進(jìn)行分割：①利用閾值分割方法[13]分割出小鼠的骨骼部分；②利用基于Amira軟件的交互式分割方法分割出其它器官；③利用Amira軟件對(duì)分割后的各切片進(jìn)行平滑操作；④利用Matlab將各器官融合[4，5]。操作流程如圖1所示。

1.1 基于閾值的自動(dòng)分割

閾值分割法是一種將灰度圖像變?yōu)槎祱D像以達(dá)到分割目的的方法。……