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湖南地區(qū)漢族人群20個(gè)非CODIS STR基因座多態(tài)性

2015-12-13 12:26:36周健吳曉雪
法醫(yī)學(xué)雜志 2015年6期

周健,吳曉雪

(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)

·研究簡報(bào)·

湖南地區(qū)漢族人群20個(gè)非CODIS STR基因座多態(tài)性

周健,吳曉雪

(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)

法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;短串聯(lián)重復(fù)序列;湖南;漢族

本研究采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒,對湖南湘西自治州300名漢族無關(guān)個(gè)體的20個(gè)非CODIS STR基因座進(jìn)行群體遺傳學(xué)調(diào)查,以獲取20個(gè)STR基因座在該地區(qū)的相關(guān)群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù),為該地區(qū)的法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),現(xiàn)報(bào)道如下。

1 材料與方法

湖南漢族人群血樣在知情同意原則下采自健康志愿者,包括男性180名,女性120名。采用Chelex-100法[1]提取DNA。Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒購自基點(diǎn)認(rèn)知(北京)公司。PCR反應(yīng)體系為10 μL,循環(huán)條件:95℃11 min;94℃30 s,60℃60s,70℃60s,30個(gè)循環(huán);60℃30min。PCR產(chǎn)物變性后在3130XL型遺傳分析儀(美國AB公司)上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,用GeneMapper ID v3.2.1軟件對STR基因座進(jìn)行分型。對基因型頻率進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)。采用PowerStats軟件分別計(jì)算20個(gè)基因座的雜合度(H)、個(gè)人識別率(DP)、非父排除率(PE)、多態(tài)信息含量(PIC)等群體遺傳學(xué)參數(shù)。

2 結(jié)果與討論

目前市場上的商業(yè)化試劑盒中大多數(shù)基因座是CODIS基因座結(jié)合個(gè)別非CODIS基因座,由于STR基因座的突變率較高,在親權(quán)鑒定中對于非CODIS基因座的需求比較大。本研究采用的Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒則涵蓋了20個(gè)非CODIS基因座,這20個(gè)STR基因座的群體遺傳學(xué)參數(shù)見表1。

經(jīng)對每個(gè)基因座的基因型分布進(jìn)行χ2檢驗(yàn),符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。20個(gè)STR基因座的DP值均大于0.85,在群體中的累積個(gè)體識別率為1-3.2264×10-26。該20個(gè)STR基因座在二聯(lián)體和三聯(lián)體中的累積非父排除率均大于0.99999。以上表明,這20個(gè)STR基因座在湖南漢族人群中具有良好的多態(tài)性,能夠用于日常法醫(yī)學(xué)實(shí)踐。

表1 20個(gè)STR基因座在湖南漢族人群中的群體遺傳學(xué)參數(shù)(n=300)

[1]Walsh PS,Metzger DA,Higushi R.Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material.BioTechniques 10(4):506-513(April 1991)[J].Biotechniques,2013,54(3):134-139.

DF795.2

B

10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.017

1004-5619(2015)06-0478-01

2015-08-24)

(本文編輯:李成濤)

周?。?982—),男,法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學(xué)鑒定;E-mail:45159121@qq.com

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