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一種低成本血液HIV病毒核酸篩查系統的開發和應用

2015-12-19 12:18:33鐘展華鄒曉東萬小春嚴鳳好
實驗與檢驗醫學 2015年6期
關鍵詞:檢測方法

鐘展華,鄒曉東,萬小春,丁 渭,嚴鳳好

(1、惠州市中心血站,廣東惠州516000;2、中山大學達安基因股份有限公司,廣東廣州510665)

一種低成本血液HIV病毒核酸篩查系統的開發和應用

鐘展華1,鄒曉東1,萬小春1,丁 渭2,嚴鳳好1

(1、惠州市中心血站,廣東惠州516000;2、中山大學達安基因股份有限公司,廣東廣州510665)

目的開發一種低成本,有效和方便快捷的血源篩查核酸檢測系統。方法利用臨床上使用的HIV-1核酸定量檢測試劑,用酶免實驗用的加樣器對血液標本進行混樣和核酸提取。結果使用常規方法和加樣器改進方法的檢測有效性沒有差異,經過加樣器改進的方法檢測速度快,比常規手工方法勞動強度大大降低。結論低成本血液HIV病毒核酸篩查系統,成本低,效率高,可以有效提高血液的安全性。

低成本核酸檢測;血液安全;PCR;HIV

核酸擴增技術(NAT)直接檢測病毒核酸,因其可縮短病毒檢測的窗口期而被應用于獻血者篩查。西方發達國家1999年開始已經將NAT檢測納入獻血者的常規篩查項目,輸血感染傳染病的危險性因而大大降低。我國近兩年大力推進核酸檢測,但核酸檢測的成本很高,很多中小血站無法承受昂貴的檢測費用。筆者所在血站與達安基因公司合作,將應用于臨床的HIV PCR核酸定量試劑用于血液篩查,并利用現有的加樣器對檢測方法進行改進,提高了檢測效率,降低了檢測成本。現將有關內容報告如下。

1 材料與方法

1.1 檢測標本2013年12月至2015年7月我站無償獻血的留樣常規標本,使用5ml帶分離膠EDTAK2真空采血管留樣,1500r/min離心5min后2~8℃冰箱保存。

1.2 儀器7500熒光定量PCR儀(美國ABI公司);瑞士哈米爾頓STAR自動加樣儀及其配套一次性加樣針(瑞士HAMILTON公司);單通道連續移液器(法國Gilson公司);恒溫金屬浴(江蘇金壇)。

1.3 試劑和耗材HIV核酸定量試劑盒(PCR-熒光探針法)(廣州達安基因)、核酸提取試劑盒(離心柱法)、HIV-1 RNA標準物質(北京康徹斯坦生物,濃度為2000IU/ml,批號:201312001)、無水乙醇、經高壓滅菌的一次性離心管和吸頭、滅菌1.6ml深孔板等采購市售產品。

1.4 標準的核酸提取方法吸取每人份20μl血漿進行11人份混樣,將混樣的標本分配到已加入50μl蛋白酶K的1.5ml離心管內,按照試劑說明書進行核酸提取:加病毒裂解液→震蕩→離心→溫育→加無水乙醇→震蕩→離心→轉移到離心柱→離心→加入抑制物去除劑→離心→換收集管→加入去離子液→離心→換收集管→加入去離子液→離心→換收集管→離心→換離心管→烘干→加洗脫液→靜置→離心→分配反應液→加樣→蓋八連管蓋子→離心→上機。

1.5 改進的核酸提取方法

1.5.1 標本匯集和留樣使用全自動加樣器進行標本匯集,每人份吸取20μl血漿進行11人份混樣,加入1.6ml深孔板里,混樣前先在一個1.6ml深孔板每個標本留樣400μl,用于一旦檢測結果出現陽性后進行單個樣品拆分檢測。

1.5.2 病毒裂解使用全自動加樣器每個孔分配50μl預先配置好的蛋白酶K和Carry RNA混合液后吹打8次進行混勻,加入200μl病毒裂解液,將深孔板蓋上封板膜后,放入72℃水浴箱溫浴10min。

1.5.3 過柱和洗柱將離心柱從收集管取出,套到普通10ml的纖維試管上,將已經加入無水乙醇的反應混合液分配到離心柱上。用普通的臺式離心機將套有離心柱的纖維試管進行3000r/min 2min離心。分別進行過柱和洗柱,洗柱時,利用10ml連續加樣槍分配抑制物去除液和去離子液。第二次將去離心水離心后,將離心柱裝至新的收集管,將收集管-離心柱于室溫下14000r/min離心3min以去除殘余的乙醇。剩下的步驟按照試劑說明書操作,最后取得病毒核酸溶液。

1.5.4 加樣利用STAR加樣器和300μl帶濾芯的加樣尖,將反應液和待測核酸分配至8連管,8連管利用1.6ml深孔板進行位置固定。

1.6 檢測的靈敏度及重復性測試以陰性血漿稀釋HIV-1 RNA(2000IU/ml)標準品,配制成核酸拷貝數分別為1000、500、250、100、50、25IU/ml的HIV應用標準品溶液。于不同時間配制不同拷貝數的應用標準品溶液,進行重復核酸擴增檢測,以觀察擴增體系的穩定性,每個梯度共檢測20份。

1.7 檢測質量保證方法將內標溶液用洗脫液(DEPC水)稀釋20倍,如內標結果是陰性,進行重復檢測。如HIV結果為陽性,將原混合標本和單個標本均進行重復檢測。

2 結果

2.1 不同檢測體系的靈敏度及重復性比較標準的提取方法和改進后的提取方法以對不同拷貝數的標準品的檢測情況見表1和表2,兩者對≥100IU/ ml拷貝數HIV標準品的檢出率均為95%,無顯著差異。

2.2 獻血標本檢測情況獻血者標本108194份,11人份混合后共檢測出混合陽性49例,經過混合標本重復檢測及拆分檢測,最終CDC確認陽性48例。其中有一例第一次確認結果為不確定,10d后再次抽取的血樣確認為陽性。

2.3 檢測系統的有效性驗證結果在檢測過程中,不定時將濃度為2000IU/ml的的HIV RNA標準物質作為盲樣隨機插入已檢測的陰性標本中,總共測試42例,均能成功檢出。

表1 標準核酸提取方法的HIVRNA標準品檢測靈敏度和重復性

表2 改進核酸提取方法的HIVRNA標準品檢測靈敏度和重復性

3 討論

國外有研究顯示,處于HIV酶免窗口期的窗口期的血液具有高濃度病毒血癥,HIV傳播效率最高,56%~92%新的HIV感染是由處在這個時期的HIV感染者傳播的[1]。近期發生在四川的因輸血而感染HIV的事件證實了這一點,事后經過當地CDC的調查,確認為酶免窗口期感染,經過對留樣的標本重新檢測,第三代和第四代的酶免HIV診斷試劑依然均為陰性,但核酸檢測顯示是其病毒濃度高達37000IU/ml[2]。從前期已經開展核酸檢測的血站,不斷有報道檢測出HIV窗口期的標本,如常州[3]、武漢[4]、遼寧[5]和濟南[6]等,雖然2012版的《血站技術操作規程》和《全血和成分血質量要求》沒有規定必須強制核酸檢測,但國家衛生和計劃生育委員會已將核酸檢測作為血站2015年前必須完成的目標進行了規定[7]。因為我國的HIV感染率有上升的趨勢,血液安全的形式不容樂觀[8-15]。

但目前國內市場上獲得我國食品和藥品監督部門使用許可的核酸血液篩檢試劑均含全套設備包括混樣、核酸提取和熒光定量PCR儀均是進口的,成本較高。對于中小血站,如果沒有獲得政府財政的額外撥款,檢測費用是個巨大的負擔。國內很多生物技術企業,已經利用熒光PCR方法開發出成熟的NAT定量檢測產品,主要用于傳染病的診斷、病毒載量測定及抗病毒治療效果評估,但這些產品只獲得食品和藥品監督部門臨床診斷使用許可,而且操作繁瑣和復雜。血站與醫院的核酸檢測相比,具有不同的特點,一是時間緊迫、當碰到急救用血的時候,檢測結果不能拖延太長時間。二是血站的樣本量一般都比較大。所以如果完全按照臨床的方法進行檢測,無論是時間還是成本均無法滿足血站的實際工作要求。

本研究我們采取了幾個措施來降低核酸檢測的成本,一是只檢測HIV、HBV和HCV暫時不檢測,同時,HIV檢測保留2遍ELISA方法。二是將標本進行混樣后再檢測,為了跟酶免檢測銜接和拆分方便,混樣的數量我們確定為11個,因為一個酶標檢測微板,有96孔,12豎排,在混樣前,先用1.6ml深孔板留樣,第一豎排作為一旦出現陽性時的備查標本,其他11橫排的留樣標本作為出現陽性后,進行單個標本拆分檢測。三是將標本混樣的工作交由進行ELISA實驗的加樣器來完成。四是核酸提取的方法磁珠法改為離心柱法,將核酸提取由核酸提取儀改為手工提取,同時,為了提高檢測效率,利用加樣器對實驗方法進行改進。經過以上措施,可以將核酸檢測的成本降低為血篩試劑的10%左右,相當于加做一遍HIV的酶免實驗的費用。

雖然用以上方法將核酸檢測的成本大大降低,但從以上數據表明,我們的檢測方法是有效和適合在血站應用的。首先是內對照的稀釋和成功檢出,有研究證明,濃度過高的內對照,會影響弱陽性的檢出[16],我們對內對照的稀釋提高了檢測的靈敏度。其次是第二是使用濃度為2000IU/ml的的HIV RNA標準物質作為盲樣檢測,均能成功檢出,檢出靈敏度符合美國FDA和歐洲對血篩核酸檢測的靈敏度要求,即混合檢測時單份獻血者血液的檢出靈敏度至少為5000IU/ml(95%檢出率)[17]。國外已有研究證明,50~100人份的血漿混合物不會減弱核酸檢測系統的敏感度。HIV急性感染的陽性結果一般在10000IU/ml以上[18],所以考慮到即使RNA部分降解,11倍稀釋以后的標本病毒濃度也在檢測系統的靈敏度內。其次是我們和酶免檢測是同步進行的,從2013年10月至2014年7月,共有21份確診HIV陽性標本,我們的檢測系統能夠全部檢出來,跟HIV確診實驗符合率100%,且無1例假陽性。最后是利用現有加樣器對PCR實驗方法的改進,既減輕工作人員的勞動強度,從混樣到上機檢測,354例標本共耗時約4h,手工操作的步驟,只剩下試劑的配置,離心柱的離心洗滌等,僅需時1.5h左右。又因為跟酶免檢測同步進行,不影響血液的發放時間。

對于核酸檢測,有2個關鍵點,一是要順利將核酸提取出來,在血液標本采集和提取過程中要盡量減少核酸的降解,防止假陰性。二要防止擴增產物污染環境而引起以后的假陽性。為了開展核酸檢測,我們參照臨床基因擴增(PCR)檢驗實驗室規范的要求裝修了實驗室,核酸檢測實驗室分為三個區,分別為試劑配制室、標本處理室和擴增檢測室,3個室之間用緩沖間隔離。因為標本混樣和核酸提取過程用到的加樣器是和酶免實驗共用的,為了減少環境中的RNA酶對RNA的降解,我們每天做完酶免實驗后,對酶免酶免實驗室進行徹底消毒,第二天早上先做核酸的混樣和提取,核酸提取工作完成后,再做酶免實驗。為了防止擴增后產物對環境的污染,在擴增反應前,反復檢查擴增反應的8連管,確保蓋子蓋緊,反應完畢后,用多層密封袋將8連管密封后再帶出擴增反應室,擴增反應室內的大功率風機24h開著,確保擴增反應室的負壓。

核酸檢測是有史以來成本最高的血液篩查項目,在我國這樣一個發展中國家,地區發展差異大,全國有不少中小血站,如果未取得當地財政的額外撥款,是沒有足夠的經費來開展全自動的核酸檢測系統的。而像我們這種半自動的核酸檢測系統,充分利用了實驗室現有的條件,費用低廉,雖然靈敏度和操作方便性跟全自動的商品化的核酸檢測系統還有差距,但其檢測的靈敏度已經高于歐盟和FDA對血液篩查HIV靈敏度的要求。實際上,根據國際輸血協會輸血傳播傳染性疾病工作組的調查,即使在發達國家的血液中心(如德國和奧地利等)除了有商品化的核酸檢測系統,也有自建的核酸檢測系統[19]。如何繼續提高檢測的靈敏度,將是我們未來研究的方向。

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Development and application of a low-cost nucleic acid screening system for the detection of blood transmitted HIV

ZHONG Zhanhua,ZOU Xiaodong,WAN Xiaochun,et al.Huizhou Blood Center,Huizhou Guangdong 516000,China.

Objective To develop a low-cost nucleic acid detection system for efficient and rapid detection of blood transmitted HIV.Methods The pipettes of ELISA experiments were used to mix blood samples and do with the nucleic acid.Accordingly,the nucleic acid was tested using HIV-1 nucleic acid quantitative detection reagents.Results There was no difference in the effectiveness of conventional methods and pipette improved methods,while the latter showed the more efficient and quicker features.Conclusion The Low-costnucleic acid screening system was able to detect blood transmitted HIV economically and efficiently,which could effectively improve the security use of blood.

Low-cost nucleic acid testing;Blood safety;PCR;HIV

R512.91

A

1674-1129(2015)06-0724-03

10.3969/j.issn.1674-1129.2015.06.010

2015-09-17;

2015-11-01)

鐘展華,男,1976年8月生,碩士,副主任技師,專業:醫學檢驗,研究方向:血液安全與采供血信息化建設。

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