韓 慧,黃福達,張秀明,吳炳義
(1.中山大學附屬中山醫院/中山市人民醫院檢驗醫學中心,廣東中山 528403;2.南方醫科大學附屬南方醫院臨床醫學實驗研究中心,廣州 510515)
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·論著·
TaqMan熒光定量PCR檢測新型隱球菌方法的建立
韓慧1,黃福達1,張秀明1,吳炳義2△
(1.中山大學附屬中山醫院/中山市人民醫院檢驗醫學中心,廣東中山 528403;2.南方醫科大學附屬南方醫院臨床醫學實驗研究中心,廣州 510515)
目的建立TaqMan熒光定量PCR方法定量檢測新型隱球菌基因組DNA,為檢測隱球菌性腦膜炎提供重要方法。方法在國家生物技術信息中心(NCBI)查找新型隱球菌各亞型的ITS-rDNA序列,序列比對后設計特異性引物和探針,擴增片段為114 bp,構建質粒標準品,調整質粒濃度為1.42×108copy/μL ~ 1.42×10 copy/μL共8個濃度梯度,分別取2 μL作為模板,優化反應條件,建立標準曲線,進行敏感性、特異性、重復性評價,并檢測臨床確診的15例隱球菌腦膜炎感染菌株。結果建立的熒光定量PCR可以檢測2.84×102拷貝的質粒DNA,對臨床分離的各10例其他真菌、細菌、乙型肝炎病毒DNA和人類基因組DNA均無擴增曲線,重復性良好,3個濃度的批間變異系數分別為2.86%、1.48%、1.36%,可準確檢測15例新型隱球菌。結論成功建立檢測新型隱球菌的熒光定量PCR方法,敏感性和特異性較高,結果穩定可靠,可早期、快速診斷隱球菌性腦膜炎。
熒光定量PCR;新型隱球菌;基因組DNA
新型隱球菌是一種條件致病菌,主要通過呼吸道進入肺部,引起炎性或隱性感染。機體免疫功能降低,侵襲中樞神經系統,導致隱球菌性腦膜炎。由于該病早期無明顯癥狀和體征,腦脊液變化不典型,很難與其他疾病相鑒別,易被誤診而延誤治療。……