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不同豬種肉質相關基因FTO多態性研究

2016-04-29 00:00:00楊攀許棟馬海明
國外畜牧學·豬與禽 2016年2期

摘 要:為了研究肉質候選基因FTO(fat mass and obesity associated)在中外不同豬種群體中的遺傳變異,本試驗以杜洛克豬、大白豬、寧鄉豬、大圍子豬4個豬種為研究對象,運用PCR-RFLP的方法檢測了FTO基因g.276Ggt;T(AM931150)位點的基因頻率和基因型頻率。結果表明,寧鄉豬、大圍子豬的優勢基因型均為GG,G是杜洛克豬、寧鄉豬和大圍子豬的優勢等位基因,而大白豬的優勢等位基因是T。本研究發現FTO基因的基因型分布在國外2個豬種群和地方豬種群之間存在較明顯的差異,且這種差異極有可能是影響不同豬種肉質性狀的原因之一,為以后更深入的研究打下了基礎。

關鍵詞:豬;肉質性狀;FTO基因

中圖分類號:S813.1 文獻標識碼:A 文章編號:1001-0769(2016)02-0045-02

FTO(fat mass and obesity associated)是脂肪肥胖相關基因,表達于人體各組織,且在下丘腦中高表達。FTO基因多態性與體重和肥胖癥密切相關。FTO基因能夠影響能量攝入及能量消耗,并通過多種途徑誘導人群中肥胖癥及2型糖尿病等相關疾病的發生。該基因位于豬的6號染色體上,包括9個外顯子。本文研究了FTO基因的多態性,旨在尋找與豬肉質性狀相關的遺傳標記,為深入研究中外豬種的肉質形成機制奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 樣品采集

杜洛克豬24頭,大白豬28頭,寧鄉豬67頭,大圍子豬43頭。剪少量耳組織,-20 ℃保存。

1.2 DNA的提取與PCR擴增

常規酚/氯仿抽提法提取基因組DNA。根據L. Fontanesi等(2008)設計引物擴增FTO基因第4內含子長度為397 bp的g.276Ggt;T(AM931150)位點,該位點的左右引物為:5′-ACAGGCCCTGAAGAGGAAAG-3′;5′-AGTAACCTGGAGTTCCTGTGG-3′

PCR產物經Tai I限制性內切酶酶切后確定基因型。PCR反應體系為Green PCR Master Mix (2X) 12.5 μL,正反引物各0.8 μL,加ddH2O至25 μL, PCR反應程序為95 ℃預變性5 min,95 ℃變性 30 s,60 ℃復性30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環,72 ℃延伸5 min。酶切反應體系均為20 μL,其中PCR擴增產物10 μL,限制性內切酶2U,65 ℃消化4 h,酶切產物用2 %瓊脂糖凝膠電泳后確定基因型。

2 結果與分析

2.1 FTO基因g.276Ggt;T位點與PCR-RFLP

FTO基因g.276Ggt;T(AM931150)位點T等位基因為397 bp,G等位基因為275 bp+122 bp,組成3種基因型,TT為397 bp,TG為397 bp+275 bp+ 122 bp,GG為275 bp+122 bp。

2.2 基因型頻率與基因頻率

杜洛克豬G等位基因頻率為0.521,大白豬等位基因G的基因頻率為0.881,大圍子豬種G等位基因頻率為0.942,而大白豬中等位基因T的頻率為0.768。經Hardy-Weinberg平衡適合性檢測表明,除寧鄉豬此位點處于不平衡狀態(Plt;0.01),其余均處于平衡狀態(Pgt;0.05,表1)。

3 討論和結論

在豬肉質性狀的研究中,有大量的報道表明FTO基因的g.276Ggt;T(AM931150)位點與豬的肌內脂肪的沉積有很大的關系,而肌內脂肪含量是評價肉質的重要方面。經檢測的杜洛克和大白豬都呈現出多態,本地豬種寧鄉豬和大圍子豬則幾乎表現為單態,均為GG型,有少量的TG基因型出現,說明本地豬種在此位點上已開始存在少量變異。本研究發現FTO基因的基因型分布在國外2個豬種群和地方豬種群之間存在較明顯的差異,且這種差異極有可能是影響不同豬種肉質性狀的原因之一,這為以后更深入的研究提供了科學依據。□□

參考文獻:(略)

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