陽春砂基于轉錄組的萜類合酶基因挖掘及一個單萜合酶基因的克隆

鄧可，楊錦芬，王騰，王虹，王煥，蘇金鋒，詹若挺

（1.廣州中醫藥大學中藥資源科學與工程研究中心，嶺南中藥資源教育部重點實驗室，國家中成藥工程技術研究中心南藥研發實驗室，廣東廣州　510006；2.廣州中醫藥大學中藥學院，廣東廣州　510006）

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陽春砂基于轉錄組的萜類合酶基因挖掘及一個單萜合酶基因的克隆

鄧可1，楊錦芬1，王騰1，王虹1，王煥1，蘇金鋒2，詹若挺1

（1.廣州中醫藥大學中藥資源科學與工程研究中心，嶺南中藥資源教育部重點實驗室，國家中成藥工程技術研究中心南藥研發實驗室，廣東廣州510006；2.廣州中醫藥大學中藥學院，廣東廣州510006）

摘要：【目的】深入挖掘陽春砂轉錄組中揮發性萜類合酶相關基因，為全面認識陽春砂揮發性萜類代謝途徑和分子調控模式奠定基礎?！痉椒ā空砬捌诠ぷ鳙@得的陽春砂2個轉錄組的數據，篩選已注釋的及利用本地blast方法再注釋的萜類合成途徑的unigene；并通過對部分候選unigene的表達量與揮發性萜類化合物含量的相關性分析及生物信息學分析，進一步篩選出相關基因；采用PCR及重組載體構建的方法克隆其中一個單萜合酶基因，并對其編碼蛋白序列進行分析。【結果】篩選得到10個揮發性萜類合成上游途徑相關unigene及11個下游萜類合酶基因；相關性分析證明候選基因與陽春砂主要揮發性萜類有較強相關性；并成功克隆得到AvTPS1基因，其序列包含1 803 bp的開放閱讀框，編碼600個氨基酸；其編碼蛋白含有單萜合酶蛋白特有的DDXXD、RRX8W和NSE/DTE等保守基序，N端含有一段葉綠體轉運肽；……