羅 昌,陳東亮,程 曦,黃叢林
(北京市農林科學院 北京農業生物技術研究中心,北京100097)
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甘菊ClHSP70與ClHSP90基因的克隆及表達分析
羅昌,陳東亮,程曦,黃叢林*
(北京市農林科學院 北京農業生物技術研究中心,北京100097)
該研究以甘菊(Chrysanthemumlavandulifolium)為實驗材料,通過RT-PCR方法從甘菊轉錄組數據中分離出熱激蛋白合成相關基因,命名為ClHSP70和ClHSP90。序列分析表明,ClHSP70基因ORF全長為2 559 bp,編碼852個氨基酸,蛋白功能區預測表明含有典型的HSP70蛋白NBD和SBD保守結構域;ClHSP90基因ORF全長為2 094 bp,編碼697個氨基酸,含有HATPase結構域和HSP90保守結構域。生物信息學分析表明,甘菊ClHSP70與大豆(Glycinemax)和煙草(Nicotianatomentosiformis)HSP70蛋白有較高的一致性,ClHSP90基因編碼的氨基酸序列與紫莖澤蘭(Ageratinaadenophora)HSP90高度相似;實時熒光定量表達分析表明,在42 ℃處理不同時間,甘菊葉片中ClHSP70和ClHSP90基因表達均在0.5 h時顯著增加,1 h達到最大值,2 h后緩慢下降;不同組織表達分析表明,甘菊在42 ℃處理1 h后,ClHSP70在成熟葉中的表達量顯著高于嫩葉和根等其他組織;ClHSP90在成熟莖中的表達量最高。研究說明,ClHSP70和ClHSP90基因具有熱激蛋白特征,參與了甘菊熱脅迫應答過程,該研究結果為以后深入研究其基因功能奠定了基礎。
甘菊;ClHSP70;ClHSP90; 熱脅迫
熱激蛋白(heat shock protein, HSPs)是在熱激條件下被誘導且表達增加的一部分特異蛋白質,在植物應對外界環境壓力,如干旱、鹽、低溫及高溫等時起著重要的作用[1]。HSPs的積累與生物耐熱性呈正相關,也就是說,在熱脅迫下HSPs的積累可以提高植株的耐熱性。
HSPs種類存在范圍很廣,根據其分子量大小,可分為5類:HSP110、HSP90、HSP70、HSP60和‘小HSPs’[2]。在植物熱激蛋白家族中,HSP70最為保守和普遍,HSP70在氨基酸序列上高度相似,含有核酸結合區和底物結合區2個功能區,N-末端具有典型的約45 kD的ATPase區域。……