謝海坤,焦 健,樊秀彩,張 穎,姜建福,孫海生,劉崇懷
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所,鄭州450009)
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中國野生葡萄葉綠體分離及葉綠體DNA提取的研究
謝海坤,焦健,樊秀彩,張穎,姜建福,孫海生,劉崇懷*
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所,鄭州450009)
以中國野生刺葡萄、山葡萄、桑葉葡萄和東南葡萄的成熟葉片為材料,比較柱式植物葉綠體DNAout試劑盒和改良的高鹽-低pH法分離葉綠體及提取cpDNA效果。結(jié)果顯示:(1)2種方法均分離得到了中國野生葡萄的葉綠體,但與柱式植物葉綠體DNAout試劑盒相比,改良的高鹽-低pH法得到的葉綠體濃度高、雜質(zhì)少,更適合中國野生葡萄葉綠體分離。(2)柱式植物葉綠體DNAout試劑盒提取的cpDNA,其OD260/OD280在1.28~1.36之間,質(zhì)量濃度為4.2~7.8 ng·μL-1,質(zhì)量低,不能滿足后續(xù)測(cè)序要求;而改良的高鹽-低pH法提取的cpDNA,其OD260/OD280值在1.84~1.90之間,質(zhì)量濃度為2 514.4~4 133.7 ng·μL-1,質(zhì)量高,純度好,能滿足后續(xù)測(cè)序要求。研究表明,改良的高鹽-低pH法能簡(jiǎn)便、快速獲得中國野生葡萄完整葉綠體及高質(zhì)量cpDNA,并且提取的cpDNA可滿足后續(xù)測(cè)序要求,為葡萄屬植物葉綠體基因組的深入研究奠定了基礎(chǔ)。
中國野生葡萄;葉綠體分離;cpDNA提取;柱式植物葉綠體DNAout;改良的高鹽-低pH法
葉綠體是植物進(jìn)行光合作用的重要細(xì)胞器,具有相對(duì)獨(dú)立的遺傳物質(zhì)(cpDNA)。cpDNA一般長120 160 kb[1],多數(shù)是共價(jià)閉合雙鏈分子,少數(shù)為線狀分子。葉綠體基因組由4部分組成,大單拷貝區(qū)(LSC)、小單拷貝區(qū)(SSC)和2個(gè)反向重復(fù)序列(IRs)。葉綠體基因組序列高度保守,且屬于母系遺傳,后代遺傳穩(wěn)定,已在遺傳結(jié)構(gòu)分析[2]、分子標(biāo)記[3]、核質(zhì)互作和葉綠體基因工程[4]、起源演化[5]等領(lǐng)域開展了廣泛研究。……