白芨SSR引物篩選及群體遺傳多樣性研究

黎　君，楊　恒，周天華,2*

(1 陜西理工大學 生物科學與工程學院，陜西漢中 723001; 2 陜南秦巴山區資源生物綜合開發協同創新中心，陜西漢中 723001)

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白芨SSR引物篩選及群體遺傳多樣性研究

黎君1，楊恒1，周天華1,2*

(1 陜西理工大學 生物科學與工程學院，陜西漢中 723001; 2 陜南秦巴山區資源生物綜合開發協同創新中心，陜西漢中 723001)

白芨(BletillastriataRchb.)為中國珍稀瀕危植物，重要的藥用植物。該研究基于Illumina測序技術構建白芨基因組文庫和微衛星文庫，設計白芨微衛星引物，用白芨4個野生種群80個個體對引物進行多態性檢測，應用4個白芨近緣種中進行引物的通用性檢測，并在此基礎上分析了白芨的遺傳多樣性和遺傳分化，以探討白芨的遺傳結構和進化潛能。結果表明：(1)白芨基因組中微衛星片斷豐富，共檢測出17 841條微衛星片斷。基于白芨微衛星庫對100個位點設計了引物對，經PCR擴增和檢測篩選出能夠穩定擴增的多態性位點20個，每個位點的復等位基因數(Na)在2～6之間，平均為3.85；20對引物的大部分能夠在4個白芨近緣種中成功擴增。(2)白芨在物種水平均有較高的遺傳多樣性(Na=3.85，I=1.07，H=0.614 7)，白芨種群遺傳分化強烈(Gst=0.43)，居群間的基因流較弱(Nm= 0.867 6)，居群聚類分析結果均表明地理距離較近的居群具有較近的遺傳關系。

白芨；微衛星；遺傳多樣性；居群；引物篩選

白芨(BletillastriataRchb. f.)是蘭科多年生草本植物，生長在海拔100～3 200 m的常綠闊葉林下，櫟樹林、路邊草或巖石縫中。主要分布于四川、云南、陜西、湖北、甘肅等省份，全國各地有少量栽培。花紫紅色或粉紅色，可供觀賞。……