靳聰1,林嵐1,張柏雯1,趙一平2,吳水才1
DTI腦網絡中樞節點識別方法的比較
靳聰1,林嵐1,張柏雯1,趙一平2,吳水才1

Hub已成為腦網絡分析中一個熱點。通過圖論分析,可以獲取腦網絡的拓撲結構特征,并依據這些特征進行hub識別。在對Hub的識別中,識別方法(即網絡拓撲特征)的選取是其中的關鍵的一步。由于全局網絡參數不能反映個體節點對于整體網絡的貢獻,因此局部特征參數被廣泛應用于hub識別。當前,有多種hub識別方法在腦網絡分析中被應用,但這些方法彼此間的關系還沒有確定性的結論。Sporns等人在對動物的研究[8]中采用了模塊團、節點度、中心介數、中心度等網絡參數。結果顯示,獼猴腦網絡的hub主要位于V4,FEF,46,7a,TF,5和7b等區域,而貓腦網絡的hub主要位于CGp,35,AES,Ia,20a和EPp等區域。他們同時發現,模塊團、節點度、中心介數、中心度等識別方法之間存在一定的相關關系。雖然前人對動物hub識別方法的相互關系進行了前期探索,但對于人腦這方面研究還比較少。基于上述研究背景,本研究從hub識別參數的選擇入手,探究多種hub識別參數間的關系。
1.1實驗對象與MRI數據采集
75例健康的右利手老年人被用于本研究,他們在實驗前均簽署知情同意書。受試者年齡范圍在50歲至70歲之間,39名女性,36名男性。受試者納入標準:無精神異常史及其他影響中樞神經系統的疾病,簡易精神狀態量表(Minimum Mental State Examination,MMSE)檢查評分均≥25分,漢密爾頓抑郁評定量表(Hamilton Depression Scale,HAMD)≤10分,實驗對象具體特征如表1所示。

表1 實驗對象特征表
所有的磁共振成像數據都是采用3T 高場強GE Signa Excite scanner (General Electric,Milwaukee,WI)掃描獲得。數據采集于美國亞利桑那大學附屬醫院。基于三維擾相梯度回波序列(3D-SPGR)采集204張連續冠狀面T1加權像,掃描參數如下:TR 5.3 ms,TE 2.0 ms,TI 500ms,翻轉角15°,矩陣:256 x 256,FOV = 256 x 256 mm2,層厚 1mm。DTI掃描采用單次激發自旋回波平面成像(echo-planar imaging, EPI)序列,掃描參數為:8個方向無擴散敏感梯度b值為0 s/mm2,51個方向施加擴散敏感梯度b值為1000 s/mm2,TR 12500ms,TE 71 ms,矩陣:128 x 128,FOV = 250 x 250 mm2,層厚2.6mm。
1.2腦網絡構建
在本研究中,我們采用AAL(Anatomical Automatic Labeling,AAL)模板,共劃分90個功能區域,每個區域為一個網絡節點。DTI影像的預處理及大腦結構網絡構建過程通過PANDA軟件(a Pipeline for Analysing braiN Diffusion images,http://www.nitrc.org/projects/panda/)實現[9]。首先通過正向和反向配準將AAL模板配準到個體腦空間,完成個體腦網絡節點的定義。隨后,選用確定性纖維追蹤[10]進行纖維束追蹤。當FA值>0.2時,纖維束追蹤開始計算,當角度閾值(angle threshold)<45°或FA值<0.2時追蹤停止[11]。個體空間下模板分割后的AAL影像與白質纖維束進行纖維網絡構建,得到二值化的纖維數量連接矩陣[12,13]。大腦白質纖維網絡構建基本處理流程如圖1所示。
1.3Hub識別
1.3.1Hub識別參數選擇
節點度直接反映了和該節點相關聯的節點的連接情況。腦網絡中的絕大多數節點只有少數連接,而少數節點卻可以擁有比較多的連接。節點度較高的節點在很大概率上會是腦網絡中的重要的‘交通樞紐’,承擔大量的信息傳遞和轉換工作,因而是應用頻率較高的hub識別參數。中心介數計算經過某個節點的最短路徑的個數,揭示該腦區節點在整個網絡的信息傳遞過程中的重要性,可以從側面反映出大腦的運行效率,因而是測量節點重要性的另一常見指標。網絡脆弱性通過對腦區節點的潛在攻擊來衡量節點的重要性。它計算節點去除前后腦網絡的全局效率,評估去除該節點對于整個網絡影響。除上述單參數識別方法外,多參數識別方法因其全面綜合性,也正逐漸被更多的研究者采用。復合參數的構成主要考慮以下因素:(1)復合參數中包含的每一個單參數均具有較高的敏感性;(2)組合應具備綜合識別能力,可從不同方面捕捉節點對于網絡的貢獻;(3)包含的單參數自身具備較高的應用頻率。經過甄選,復合參數由節點度,中心介數,聚類系數三個參數組成。
1.3.2Hub識別參數計算
表2和圖2展示了識別參數具體的計算公式和注解。

圖1 DTI影像預處理及大腦結構網絡構建流程圖

表2 hub識別參數的計算公式及注解
復合參數中包含度、中心介數和聚類系數三個參數,其中聚類系數揭示節點的鄰接節點間的連接情況,因此聚類系數值越低的節點越可能是hub節點。復合參數值的計算中,需要對三個參數值進行加減運算,為降低由于運算引入的誤差,這里采用標準化方法對參數值進行處理。
節點排序完成后,將前5%、25%和50%節點挑選出,識別為hub節點。

圖2 參數解釋
圖3為大腦網絡中的hub分布圖。從左到右分別為節點度、中心介數、網絡脆弱性和復合參數識別出的hub腦區。紅色節點代表5%閾值下識別出的hub腦區,黃色節點代表5%~25%閾值下識別出的hub腦區,藍色節點代表25~50%閾值下識別出的hub腦區。結果顯示,4種識別方法識別出的hub腦區較為一致。4種識別方法可以將一些關鍵的hub腦區一致性的識別出來,這說明識別方法的差異并不會對hub識別結果造成嚴重影響。

圖3 Hub分布的腦皮層圖
我們進一步對不同識別方法識別出的腦區進行排序,圖4為不同識別方法識別出的節點的排列順序。圖(a)~圖(d)分別對應于節點度、中心介數、網絡脆弱性和復合參數計算下的排列情況。
圖4 不同識別方法的節點排列
排列結果顯示,4種不同的Hub識別方法的結果存在高度的相似性。圖5為識別結果的一致性。其中D&B表示節點度與中心介數;D&C表示節點度與復合參數;D&V表示節點度與網絡脆弱性;B&C表示中心介數與復合參數;B&V表示中心介數與網絡脆弱性;V&C表示網絡脆弱性與復合參數。

圖5 識別結果的一致性
我們選取的4個識別方法各有其代表性。節點度為最常用的hub識別方法,中心介數能夠衡量節點在腦網絡信息傳遞中的重要作用,網絡脆弱性的應用頻率低于節點度和中心介數,但能夠從網絡效率的角度評估個體節點對于整個網絡功能的貢獻。此外,我們引入的復合參數,集節點度、中心介數和聚類系數于一體,能夠從多特征的角度進行綜合性節點重要性的評估。前人的動物實驗中,發現了腦連接組hub不同識別方法識別結果的相關性。本章的實驗在驗證前人研究結果的同時,發現人腦網絡特征參數具有更高相關性。在4個識別參數之中,中心介數和復合參數在不同閾值下整體相關性較高,節點度和中心介數在不同閾值下整體相關性較低。我們認為,盡管這些識別參數從數學上并不存在直接關系,但腦網絡的腦區劃分是依據大腦的解剖結構而實現的。為了實現腦網絡的高效性能,Hub節點可能同時具有我們Hub識別的多個特性。Hub節點的重要性并不會由于識別方法的改變而出現大的改變。研究中,不同識別方法識別出的Hub腦區在一定程度上存在可比性。本文研究結果為后人在腦網絡Hub方面的進一步研究提供重要的參考依據。

圖4 不同識別方法的節點排列
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