沉默DNA依賴蛋白激酶亞基對肝癌耐藥細胞Bel-7402/5-Fu DNA損傷修復功能的影響*

李大玉，梁大敏，束波，楊加偉，生欣，李長福，余春波，范芳

（遵義醫學院生化教研室，貴州遵義563099）

沉默DNA依賴蛋白激酶亞基對肝癌耐藥細胞Bel-7402/5-Fu DNA損傷修復功能的影響*

李大玉，梁大敏，束波，楊加偉，生欣，李長福，余春波，范芳

（遵義醫學院生化教研室，貴州遵義563099）

目的探討DNA依賴蛋白激酶亞基（DNA-PKcs）基因沉默后對肝癌耐藥細胞Bel-7402/5-Fu DNA損傷修復功能的影響。方法采用陽離子脂質體法將shDNA-PKcs干擾質粒轉染Bel-7402/5-Fu細胞，根據熒光細胞數計算轉染率，實時熒光定量聚合酶鏈反應（qR T-PCR）及Western blot檢測DNA-PKcs的沉默效率；Western blot檢測TopoⅡ、γ-H2AX蛋白表達；5-乙炔基-2'脫氧尿嘧啶核苷法檢測細胞DNA合成。結果質粒的轉染效率為67%；qR T-PCR及Western blot檢測結果顯示，DNA-PKcs mR NA及蛋白水平的沉默效率分別為82.6%和71.8%；Western blot結果顯示，實驗組TopoⅡ蛋白表達水平比對照組低，差異有統計學意義（P<0.05），γ-H2AX蛋白表達水平比對照組高，差異有統計學意義（P<0.01）。5-乙炔基-2'脫氧尿嘧啶核苷法結果顯示，實驗組DNA合成率比對照組低，差異有統計學意義（P<0.05）。結論shDNA-PKcs干擾質粒能下調Bel-7402/5-Fu細胞中DNA-PKcs、TopoⅡ蛋白的表達，抑制Bel-7402/5-Fu細胞DNA合成。

DNA依賴性蛋白激酶亞基；肝癌耐藥細胞/Bel-7402/5-Fu細胞；DNA損傷修復

DNA雙鏈斷裂（double-stranded breaks，DSBs），是細胞最嚴重的一種損傷，可導致細胞失去分裂增殖而死亡，是多數抗癌藥物殺死腫瘤細胞的重要機制。DNA依賴蛋白激酶亞基（DNA-dependent ki nase catalytic subunit，DNA-PKcs）是非同源重組修復（nonhomologous end-joining，NHEJ）途徑的核心成分，在許多DNA損傷修復途徑中扮演著重要角色，如NHEJ、VDJ重組。同時可以磷酸化許多修復基因和轉錄因子[1-2]。腫瘤耐藥與DNA損傷修復能力增強有關[3]，本文將沉默DNA-PKcs的表達，將干擾質粒shDNA-PKcs轉染Bel-7402/5-Fu肝癌耐藥細胞，檢測DNA-PKcs沉默后，對細胞DNA損傷修復功能的影響，以探討DNA-PKcs在肝癌耐藥的發生發展中的作用機制。

1 材料與方法

1.1材料

Bel-7402/5-Fu細胞株購于南京凱基生物科技發展有限公司，PRNAi-U6.1-Neo shRNA質粒購于百奧邁科生物科技有限公司，LipofectamineTM2000 Reagent購于美國Invitrogen公司，DNA-PKcs抗體購于美國Assay biotech公司，TopoⅡ抗體購于英國Abcam公司，γ-H2AX抗體購于美國ABGENT公司，其他試劑為國產分析純。

1.2方法

1.2.1細胞培養將Bel-7402/5-Fu細胞放在含有10%的胎牛血清的1640培養液中，置于37℃、5%的二氧化碳培養箱中培養，每天觀察細胞生長狀態，取對數期細胞用于實驗。

1.2.2分組與轉染分為空白對照組、脂質體組、質粒對照組、shDNA-PKcs實驗組。細胞接種于6孔板，每孔種5×105個細胞，融合度達到60%～80%時進行轉染。配制質粒-脂質體復合物，并加入對應孔中，每孔200μl，4～6h后換液。48h后熒光顯微鏡下計數，計算轉染率（每個視野下的熒光細胞個數/相同視野下的總細胞個數×100%）。

1.2.3實時熒光定量聚合酶鏈反應檢測DNA-PKcs mR NA的表達水平總RNA的提取按TIANGEN公司總RNA提取試劑盒（離心柱型）說明書進行，實時熒光定量聚合酶鏈反應（real-time quantitative polymerase chain reaction，qRT-PCR）引物：DNA-PKcs正向引物5'-GTGACAAGGCAACTGTATGAGC-3'，反向引物3'-TTCTCTAAAAACACCAGCCACA-5'，擴增片段長度163 bp；β-actin正向引物5'-TGACGTGG ACATCCGCAAAG-3'，反向引物3'-GGAGCGACAGG TGGAAGGTC-5'，擴增片段長度206 bp，每個樣品DNA-PKcs mRNA表達量經qRT-PCR檢測，PCR產物作熔解曲線分析，根據公式2-△△CT相對定量分析計算DNA-PKcs mRNA相對表達量。

1.2.4Western blot檢測DNA-PKcs、TopoII、γ-H2AX蛋白表達提取各組細胞總蛋白，聚氰基丙烯酸正丁酯法定量樣品蛋白含量。Western blot法檢測DNA-PKcs、TopoII、γ-H2AX蛋白在各組中的表達。

1.2.5EdU法檢測細胞DNA合成率細胞處理48 h后，按照廣州銳博5-乙炔基-2'脫氧尿嘧啶核苷（5-Ethynyl-2'-deoxyuridine，EdU）檢測試劑盒操作說明書進行操作，熒光顯微鏡下觀察細胞，拍照。由綠光激發藍色熒光，由紫光激發紅色熒光。每組取5個視野，計數相同視野下EdU標記細胞及總細胞數，計算DNA合成率。

1.3統計學方法

采用SPSS 18.0統計軟件對數據進行分析，計量數據以均數±標準差（±s）表示，用單因素方差分析和LSD-t檢驗，P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1shDNA-PKcs質粒的轉染效率

shDNA-PKcs質粒轉染效率約為67%。見圖1。

圖1　shDNA-PKcs質粒轉染效率

2.2DNA-PKcs mRNA的表達水平

各組DNA-PKcs mRNA水平比較，經單因素方差分析，差異有統計學意義（F=74.404，P=0.000）。各組DNA-PKcs相對倍數變化比較，經單因素方差分析，差異有統計學意義（F=160.518，P=0.000）。shDNAPKcs實驗組與空白對照組DNA-PKcs mRNA水平比較，經LSD-t檢驗，差異有統計學意義（t=2.919，P= 0.004），shDNA-PKcs實驗組mRNA水平高于空白對照組；shDNA-PKcs實驗組與空白對照組DNA-PKcs相對倍數變化比較，經LSD-t檢驗，差異有統計學意義（t= 17.237，P=0.001），即shDNA-PKcs實驗組DNA-PKcs mRNA相對表達量低于空白對照組。DNA-PKcs mRNA水平的沉默效率為82.6%。見附表和圖2。

附表各組DNA-PKcs mRNA相對表達量比較（n=3±s）

注：?與對照組比較，P<0.01

DNA-PKcs相對倍數空白對照組23.133±0.16417.207±0.3371.000±0.000脂質體組22.493±0.13516.630±0.4781.045±0.101質粒對照組22.680±0.27417.047±0.6901.226±0.052 shDNA-PKcs實驗組26.013±0.562?17.537±0.4680.174±0.083?F值74.404160.518 P值0.0000.000組別DNA-PKcs mRNA β-actin mRNA

2.3DNA-PKcs、TopoII、γ-H2AX的蛋白表達水平

各組DNA-PKcs、TopoⅡ、γ-H2AX蛋白相對表達量比較，經單因素方差分析，差異有統計學意義（DNA-PKcs：F=23.478，P=0.000；TopoⅡ：P=15.564，P=0.001；γ-H2AX：F=157.096，P=0.000）。shDNAPKcs實驗組DNA-PKcs、TopoⅡ、γ-H2AX蛋白相對表達量與對照組比較，經LSD-t檢驗，差異有統計學意義（DNA-PKcs：t=8.407，P=0.006；TopoⅡ：t= 5.225，P=0.017；t=12.348，P=0.003），表明shDNAPKcs實驗組DNA-PKcs、TopoⅡ蛋白相對表達量低于空白對照組，γ-H2AX蛋白相對表達量高于空白對照組。DNA-PKcs蛋白水平的沉默效率為71.8%。見圖3。

2.4DNA合成率

各組DNA合成率，經單因素方差分析，差異有統計學意義（F=49.296，P=0.000），而shDNA-PKcs實驗組DNA合成率與空白對照組比較，經LSD-t檢驗，差異具有統計學意義（t=12.290，P=0.003），即shDNA-PKcs實驗組DNA合成率低于空白對照組。可見DNA-PKcs的沉默可降低肝癌耐藥細胞Bel-7402/5-Fu DNA的合成。見圖4。

圖4　各組DNA合成率比較

3 討論

肝癌是臨床常見的惡性腫瘤，目前臨床常用手術結合放療和化療。但長期放療和化療后，容易出現耐藥，這可能與DNA損傷信號紊亂和DNA損傷修復有關[4-5]。很多因素均會引起DNA損傷。其中，由電離輻射、抗癌藥物（如阿霉素）等引起的DNA雙鏈斷裂是最嚴重的損傷。在哺乳動物細胞中，以DNA依賴蛋白酶（DNA-dependent protein kinase，DNA-PK）為核心組件的NHEJ途徑，在DNA雙鏈斷裂的修復中有著非常重要的作用[6-7]。

DNA-PKcs是DNA-PK的催化亞單位，位于染色體8ql1，由4 128個氨基酸組成的大分子量蛋白質，相對分子量為470 kD，主要包括DNA斷裂結合區、催化功能區、Ku結合區3個功能區，屬于胞內磷脂酰肌醇激酶（phosphatidylinositol 3-kinases，PI3K）家族。DNA雙鏈斷裂后，DNA-PKcs結合到DNA斷裂末端，通過自身磷酸化，以及磷酸化下游蛋白，如Artemis、DNA ligase4、XRCC4和Cernunnos等完成DNA損傷修復[8-9]。DNA-PKcs能維持基因組的穩定性，具有腫瘤抑制功能[10]。目前有研究[11]表明，下調DNA-PKcs表達能增加腫瘤細胞對藥物的敏感性。有研究顯示，在耐藥的神經膠質瘤、口腔癌的放療患者中，發現DNA-PKcs表達量增加[12]，表明放療和化療后，機體產生了耐藥性。另外，在一些耐藥細胞中發現DNA-PKcs表達和活性增加[13-14]。本實驗已通過沉默DNA-PKcs發現耐藥蛋白P-gp表達降低，因此推測耐藥細胞Bel-7402/5-Fu耐藥性降低可能與DNA-PKcs沉默所致的P-gp下調有關。可能原因是DNA-PKcs介入到耐藥細胞Bel-7402/5-Fu DNA損傷修復系統所致。DNA-PKcs在某些耐藥細胞中表達增加和活性增強，提高了耐藥細胞DNA損傷修復的能力，從而對抗化療藥物所致的DNA損傷而引起耐藥。本實驗采用RNAi技術沉默DNA-PKcs，檢測肝癌耐藥細胞中γ-H2AX的表達情況。結果發現，沉默后肝癌耐藥細胞中γ-H2AX明顯增加，說明DNA-PKcs沉默后能夠增加DNA的損傷。為了進一步說明沉默DNA-PKcs后能增加DNA的損傷情況，本實驗還檢測沉默后DNA的合成情況和TopoⅡ蛋白的表達情況，結果發現沉默后DNA合成降低，TopoⅡ表達也降低。以此可以推測沉默DNAPKcs后能增加DNA損傷，降低DNA損傷修復功能。可能是DNA-PK為核心的NHEJ途徑在肝癌耐藥細胞DNA損傷修復中有著重要的作用，DNA-PKcs是否還通過其他機制調節肝癌耐藥細胞Bel-7402/5-Fu DNA損傷修復功能，還有待進一步實驗研究。

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（申海菊編輯）

Effects of DNA-PKcs gene silence on repair of damaged DNA in multidrug-resistant hepatocellular carcinoma cell line Bel7402/5-Fu*

Da-yu Li，Da-min Liang，Bo Shu，Jia-wei Yang，Xin Sheng，Chang-fu Li，Chun-bo Yu，Fang Fan

（Department of Biochemistry，Zunyi Medical College，Zunyi，Guizhou 563099，China）

Objective To investigate the effect of shDNA-PKcs on DNA damage repair function of the multidrug-resistant hepatocellular carcinoma cell line Bel7402/5-Fu.Methods shDNA-PKcs plasmids were transiently transfected into Bel7402/5-Fu cells via cathodolyte liposome transfection method.Transfection efficiency was evaluated by calculating the fluorescent cells and silence efficiency was determined using qRTPCR and Western blot.qRT-PCR and Western blot were used to detect mRNA and protein expressions of TopoⅡand γ-H2AX.The cellular DNA synthesis was detected by 5-ethynyl-2'-deoxyuridine（EdU）.Results Transfection efficiency was 67%.qRT-PCR and Western blot results showed the efficiency of RNA and protein interference for DNA-PKcs was 82.6%and 71.8%.Western blot analysis showed that the protein expression of TopoⅡin the shDNA-PKcs group was significantly lower than that in the control group（P＜0.05），while γ-H2AX expression was higher than that of the control group（P＜0.01）.EdU detection results showed the DNA synthesis of the shDNA-PKcs group decreased compared with that of the control group（P＜0.05）. Conclusions shDNA PKcs interference plasmid can down-regulate the expressions of DNA-PKcs and TopoⅡand inhibit the DNA synthesis of Bel7402/5-Fu cells.

DNA-PKcs；Bel7402/5-Fu cell；DNA damage repair

R 735.7

A

10.3969/j.issn.1005-8982.2016.17.004

1005-8982（2016）17-0019-04

2015-10-30

貴州省社發攻關項目（No：[2009]3066）；貴州省社發攻關項目[黔科合SY（2013）3008]

范芳，E-mail：fanf1970@126.com