龐倩 張文文 王康 吉挺
(揚州大學動物科學與技術學院,揚州225009)
蜜蜂基因功能驗證技術研究進展
龐倩 張文文 王康 吉挺
(揚州大學動物科學與技術學院,揚州225009)
蜜蜂是研究社會性行為、生態學以及神經生物學的模式動物,開展相關功能基因研究具有重要的意義。然而鑒于蜜蜂的社會性及清潔行為等特征,其有關功能基因驗證的研究進展緩慢。本文對轉基因技術、RNA干擾技術及CRISPR/Cas9介導的基因組定點編輯技術在蜜蜂功能基因驗證方面的研究成果進行綜述,并對蜜蜂功能基因研究的前景進行展望,以期為蜜蜂相關研究提供依據。
蜜蜂;基因功能;驗證技術
蜜蜂作為重要的經濟傳粉昆蟲,對農業生產起著至關重要的作用,具有巨大的生態價值。蜜蜂以群體為單位的社會性行為,嚴格的等級制度以及學習記憶等特性,使其成為社會行為學、生態學以及神經生物學研究的模式動物[1],具有重要的研究意義。蜜蜂作為模式動物,其研究優勢主要有:(1)典型的社會性昆蟲,具有精確而復雜的社會性結構;(2)生長周期短;(3)蜂王繁殖力高,據統計,意大利蜜蜂的蜂王一天最多可產2000粒卵;(4)擁有完整的基因組信息。但是,蜜蜂的社會性使其在模式動物方面的研究受到一定的限制[2],蜜蜂功能基因的研究也相對比較落后。隨著生物技術的進步與發展,基因組的研究已經成為遺傳育種熱點研究之一[3],加強并完善蜜蜂基因功能的研究,進一步闡明其中的分子機理,有助于更好的闡釋蜜蜂的行為特征,從而為蜜蜂的遺傳改良、抗病育種提供有利的基因。
隨著意大利蜜蜂全基因組測序的完成,大量未知功能的基因等待挖掘,而驗證基因組中這些基因的功能、基因的表達調控以及基因間的相互關系等是一項艱巨的任務。生物信息學雖然能夠預測基因的功能,但是具有局限性,而且基因功能的研究最終仍需要實驗來驗證。蜜蜂雖具有悠久的飼養歷史,但有關其功能基因驗證的研究比較少。現在,功能基因研究的技術主要有轉基因技術、RNA干擾技術、基因編輯技術等。本文就功能基因的驗證技術做一綜述,旨在為蜜蜂基因功能的研究提供思路。
轉基因最初應用于基因功能的研究,即把外源基因導入受體基因組內,通過觀察生物體表現出來的性狀,達到揭示基因功能的目的。有關蜜蜂轉基因的研究早在30幾年前就已經開始,但并沒有大的突破[4]。動物轉基因技術主要有顯微注射法、精子介導法、電穿孔法、轉座子載體法、病毒轉染法等。
用精子作為轉移外源DNA的載體最早由Brackett等[5]提出。1991年,Atkinson等[6]首次證實了蜜蜂的精子能夠吸收外源DNA。2000年,Robinson等[7]證實了蜜蜂精子能夠將外源DNA攜帶進入卵子,數月之后,仍能在受體蜜蜂中檢測到外源DNA,并且可以穩定遺傳給下一代,證實了精子介導法在蜜蜂上的可行性。郭冬生等[8]通過精子介導法以及人工授精技術將線性化的pGFP-2質粒導入處女王,成功獲得了帶有綠色熒光的后代,得到克隆轉基因蜜蜂。該研究為利用精子介導法使外源基因在蜜蜂體內表達提供了理論支持,同時,為蜜蜂基因功能的驗證做出了探索。
利用精子能夠吸收外源DNA的能力,將其作為載體,然后結合人工授精技術將外源DNA導入到胚胎中,這一方法具有簡單、易操作、成功率高等優點,但是,外源DNA在蜂王的受精囊內有被降解的風險,所以,為降低外源DNA的降解率,提高成功率,在人工授精之后應盡量縮短蜂王開始產卵的時間。
活體電穿孔法是指通過電場作用,將外源基因導入目標組織或器官。其原理是細胞膜表面在直流電場作用的瞬間會產生疏水或親水的微小通道,這種通道能維持幾毫秒到幾秒,在此期間生物大分子可通過這種微小的通道進入細胞,而后通道自行恢復[9]。
2004年,Kunieda and Kubo[10]建立了蜜蜂電穿孔法轉基因體系,RT-PCR和免疫印跡分析證明導入的外源基因在蜜蜂大腦中獲得表達。郭冬生等[11]通過電穿孔法成功將外源基因EGFP導入中華蜜蜂的卵內,并且檢測到EGFP基因的表達,其陽性表達率達到1.05%。該兩項研究為利用電穿孔法研究基因功能做出了有益探索,并為蜜蜂功能基因的研究提供了技術參考,奠定了理論基礎。
近年來活體電穿孔法用于轉基因研究的報道逐漸增多,在基因治療方面的優勢也日漸明顯,是一種有效的活體基因導入方法[12]。首先,電穿孔法可在多種組織器官上應用,且效率較高[13]。其次,對導入的外源基因片段的大小沒有限制[14]。此外活體電穿孔法操作簡單快速,電穿孔的時間只有幾秒鐘,并且DNA片段不需要特殊的純化操作。但是電穿孔法也存在一些缺點,如:電壓過低,則外源基因無法進入細胞;電壓過高會增加對機體的損傷,甚至造成外源基因的無法表達。另外,在操作過程中還可能對活體造成污染。由于蜜蜂的清潔行為,經過電轉處理的卵或者幼蟲的飼養也是需要解決的問題,所以電穿孔技術還需要進一步的優化。
分析發現,近幾年利用精子介導法或者電穿孔法做蜜蜂轉基因的相關研究較少,究其原因,除了技術本身的缺陷,主要是因為蜜蜂工蜂的清潔行為,哺育蜂清潔巢房時,會清理掉有異味或者受損的等不正常的卵和幼蟲。而對蜜蜂的幼蟲或者卵進行轉基因操作時肯定會對幼蟲或者卵造成損傷或者使幼蟲或者卵攜帶異味,當把處理過的幼蟲或者卵放回蜂群哺育時,這些幼蟲或者卵就會被清理掉,導致實驗的失敗。而蜜蜂是以群體為單位的社會性昆蟲,若由人工孵育幼蟲或者卵,則失去了實驗的說服性和意義。其次是雌性蜜蜂具有級型分化現象,如何使經過轉基因操作的卵或者幼蟲發育為蜂王,并且將遺傳信息高效穩定的遺傳給后代也是阻礙蜜蜂轉基因技術發展的另一主要原因。
近年來,隨著技術的發展和研究的深入,研究人員將對蜜蜂轉基因的研究轉移到轉座子piggyBac的利用上。2014年,Schulte等[15]構建piggyBac轉座子轉基因載體,然后給0~1.5 h的卵注射轉基因載體和轉座酶mRNA,注射后的卵于34℃孵化72 h后移入有王漿的王臺,10天后將王臺移入王籠,羽化后的處女王由哺育蜂哺育,在飛行房中交尾。該實驗表明piggyBac載體能夠有效的將表達組件導入蜂王基因組,并且可以穩定高效的在子代中表達。這一研究結果為蜜蜂基因功能的研究提供了參考,并為piggyBac轉座子轉基因載體在基因功能的相關研究中的應用提供了廣闊的前景。
RNA干擾是指利用外源或內源的雙鏈RNA特異性抑制靶基因轉錄后表達的現象,它通過導入與內源靶基因具有相同序列的雙鏈RNA,進而誘導內源靶基因的mRNA的降解,達到阻止基因表達的目的[16,17]。RNA干擾能特異性地引起基因表達沉默,是生物體抵御病毒和外源基因的入侵而特異性地調節或干擾基因表達的一種“免疫”應答機制。昆蟲上RNA干擾的方法主要有注射、飼喂、浸泡、病毒轉染等。
RNA干擾在昆蟲上的應用最早是應用在黑腹果蠅上[18]。有關蜜蜂RNA干擾報道是在1988年,Milne等[19]對意大利蜜蜂(Apis mellifera L.)的早期胚胎進行了顯微注射的初步探索,他們將產下的卵置于帶有雙面膠膠條的玻片上,在卵的后端注射石蠟油,其中有21%的卵成功孵化。邵瑞宜等[20]利用顯微注射技術同樣注射石蠟油到中華蜜蜂1日齡卵內,其孵化率達到35.13%。Beye等[21]將dsRNA注射到意大利蜜蜂前囊胚期胚胎的前端,結果顯示注射的dsRNA片段成功干擾整個胚胎期目的基因的蛋白表達,并導致表型缺陷,而注射無意義密碼子的dsRNA沒有顯示異常現象,這是蜜蜂上關于靶向干擾基因功能的第一篇報道。Amdam等[22]給蜜蜂0~6 h的卵注射dsRNA,由注射dsRNA的卵孵化而來的蜜蜂,有15%的蜜蜂其卵黃蛋白原的mRNA水平明顯降低。他們又將dsRNA注射到新出房蜜蜂的腹內,其中有96%的蜜蜂的表型發生突變。石元元等[23]給3日齡的意大利蜜蜂的幼蟲注射DNA甲基化轉移酶3(Dnmt3)siRNA,并分別注射Ringer、uth siRNA作為對照,在注射后的24 h,48 h,72 h分別測定Dnmt3酶活性、mRNA的表達量以及相關基因的甲基化水平,并在蜜蜂羽化后測定其形態指標,結果注射Dnmt3 siRNA的蜜蜂幼蟲其初生重、體長以及第3背板長均顯著提高,進而說明了Dnmt3影響蜜蜂幼蟲的發育。Li-Byarlay等[24]通過在1日齡蜜蜂的腹部注射siRNA抑制DNA甲基轉移酶3(dnmt3)的表達,證明了蜜蜂的DNA甲基轉移酶3影響基因的可變剪接。Costa等[25]利用RNA干擾技術抑制骨化激素基因,導致成年蜜蜂表皮完整性的形成以及表皮的黑化和硬化受到影響,從而證明了骨化激素在成年蜜蜂表皮的形成和黑化過程中具有重要作用。
RNA干擾具有簡單方便、實驗周期短、特異性強等特點,得到廣泛應用,成為驗證基因功能強有力的工具。而實現昆蟲高效的RNA干擾,其關鍵是選擇合適的導入dsRNA的方法。如注射法,蜜蜂的卵容易獲得,而且卵較大,卵膜較薄,易于注射針穿過注射,方便操作。但是注射不可避免的會對昆蟲造成損傷,如果將注射過的蜜蜂的卵或者幼蟲放到蜂群中哺育,這些經過注射的卵或者幼蟲會因為損傷而被清理掉,給實驗造成困難。另外,注射效率以及卵的存活率受到操作的熟練程度、注射時間、注射劑量、注射壓力、環境等方面的影響[20,26,27],因此,利用顯微注射技術進行RNA干擾時,為提高干擾效率,需要優化各種相關條件。再如飼喂法,飼喂法具有操作簡單,不會對昆蟲造成傷害等優點,但研究表明,不同的基因其通過口腔傳輸的RNA干擾的敏感性不同[28],是否所有基因都能通過飼喂法達到RNA干擾的目的還有待研究。有研究表明,dsRNA 5’端的基團對干擾也會產生影響[29]。
基因組定點編輯技術又稱基因打靶技術,是對生物體遺傳信息進行定向修飾的一種實驗手段。通過編輯后的遺傳信息在生物體中的遺傳表達,實現對基因功能的研究與分析。CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)/Cas(CRISPR-associated)系統是基于細菌的一種獲得性免疫系統改造而成的一項新興的RNA靶向的基因組定點編輯技術[30]。2013年,CRISPR/Cas9基因編輯技術被英國《自然》雜志子刊評為2013年年度方法,美國科學雜志將該技術評為2013年年度十大突破之一[31],雖然該技術出現較晚,但具有巨大廣闊的應用前景和發展潛力。
CRISPR/Cas9基因打靶技術雖然是一種新工具,但已經成功應用于多種生物體,如大腸桿菌[32]、釀酒酵母[33]、果蠅[34]、斑馬魚[35]、小鼠[36,37]、大鼠[38]、小麥[39]、水稻[39,40]以及人類[41]等。尉偉[42]運用TALEN及CRISPR-Cas9技術在蜂卵上進行了基因打靶實驗,尉偉將TALEN mRNA及Cas9/gRNA分別注射到5~6 h的蜂卵中,人工培養48~60 h后進行酶切檢測,結果兩種技術均檢測到了突變。Kohno等[43]給3 h的蜜蜂的受精卵注射sgRNA和Cas9 mRNA,運用CRISPR/Cas9技術成功獲得了突變體。由此表明,CRISPR/Cas9基因編輯技術在蜜蜂中也可有效發揮基因敲除功能,并且可為后期蜜蜂功能基因的驗證及突變體的獲得提供有利工具。
與其他基因組定點編輯技術相比,CRISPR/Cas9只需要改變一段RNA序列即可識別多個不同位點,省去了重新合成不同蛋白的步驟,具有成本低、效率高,可同時修飾多個堿基,適用范圍廣等優勢。該技術不僅可以直接在細胞內進行多個基因的編輯,而且可以定向修飾生物活體的遺傳信息,同時還克服了蜜蜂胚胎不可逆的問題,主要缺點是有可能會出現脫靶現象[44]。CRISPR/Cas9基因編輯技術作為一項新興技術,從一出現,就受到廣大科研工作者的極大關注,雖處于起步階段,但已得到廣泛應用,并顯示出明顯的優勢,另外,有研究表明,利用CRISPR-Cas技術實現的基因修飾可傳遞到下一代[45]。隨著研究的深入和CRISPR/Cas9基因編輯技術的優化,相信CRISPR/Cas9系統的應用范圍會更加廣泛,也必定會成為基因功能分析的重要工具。
蜜蜂作為一種重要的經濟傳粉昆蟲和行為學等研究的模式動物,其基因的功能等待挖掘與研究。蜜蜂的社會性、清潔行為以及雌性蜜蜂的級型分化現象等都賦予了蜜蜂一定的特殊性,探討基因的功能及其聯系,有助于我們更加全面的了解蜜蜂的生物學特性,并為其他生物的研究提供借鑒。在分子生物學技術不斷深入和發展的同時,再結合蜜蜂的特殊性將其加以優化完善,相信在不斷的研究探索下,蜜蜂功能基因的研究會取得重大進展與突破。其中,RNA干擾的方法較多,在蜜蜂的任一發育階段均可進行,可操作性優于轉基因技術,且應用廣泛,相關研究也比較多,如果再結合成熟的人工孵化技術,RNA干擾更有可能成為未來蜜蜂功能基因研究的主要技術,具有廣闊的應用前景。
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Research advance on the function gene verification technologies of honeybee
Pang Qian,Zhang Wenwen,Wang Kang,Ji Ting
(College of Animal Science and Technology,Yangzhou University,Yangzhou 225009)
Honeybee is important research object and model animal of social behavior and ecology,its functional gene research is of great significance.However,the problem of honeybee functional gene research is enhanced by the sociality phenomenon and the comb cleaning behavior of bees.The honeybee functional gene research is relatively undeveloped.In this review,in order to provide a reference basis for the research of the bee functional genes,we described the research results of transgenic technology,RNAi and CRISPR/Cas9.Meanwhile,we made the prospect of functional gene research in honeybees.
honeybee;gene function;verification technologies
國家自然科學基金(31372382);國家蜂產業技術體系專項經費(CARS-45-SYZ6)
龐倩(1994-),女,碩士研究生,E-mail:18852717155@163.com
吉挺(1974-),E-mail:tji@yzu.edu.cn