999精品在线视频,手机成人午夜在线视频,久久不卡国产精品无码,中日无码在线观看,成人av手机在线观看,日韩精品亚洲一区中文字幕,亚洲av无码人妻,四虎国产在线观看 ?

利用SSR標記對新疆部分向日葵自交系材料進行群體結構劃分及聚類分析

2017-04-13 06:56:49劉勝利段維王鵬柳延濤王沛政
新疆農業科學 2017年2期

劉勝利,段維,王鵬,柳延濤,王沛政

(1. 新疆農墾科學院作物研究所,新疆石河子 832000;2. 新疆康地種業科技股份有限公司,烏魯木齊 830011;3.海南熱帶海洋學院,海南三亞 572022)

利用SSR標記對新疆部分向日葵自交系材料進行群體結構劃分及聚類分析

劉勝利1,段維2,王鵬1,柳延濤1,王沛政3

(1. 新疆農墾科學院作物研究所,新疆石河子 832000;2. 新疆康地種業科技股份有限公司,烏魯木齊 830011;3.海南熱帶海洋學院,海南三亞 572022)

【目的】序列位置標簽(Sequence Tagged Site, STS)為一段短的DNA序列,在其生物染色體上只出現一次,適宜于作為作物基因組的一種地標。【方法】研究隨機選取向日葵500對序列標簽位點SSR引物,利用其中62對具有多態SSR標記對136份新疆食葵和油葵自交系進行PCR多態擴增和篩選。【結果】62對序列標簽位點SSR標記在136份向日葵中擴增表現穩定多態,占所選引物數量的12.4%,擴增產物條帶清晰、穩定和易讀。136份向日葵群體基因型依據△K的變化,可以分為2大類群。其中73份油葵自交系材料中,70%自交系材料被分配到第1大群,油葵資源材料主要歸類在第1大群。30份油葵保持系中只有4份保持系被分配到第2大群,其余保持系均在第1大群。而在43份油葵恢復系中有25份分配到第1大群,其余分配到其它群中,表明油葵恢復系遺傳多樣性較為豐富。在55份食葵自交系中,僅有21%食葵被分到第1大群,食葵資源材料主要屬于第2大群。【結論】食葵的遺傳多樣性較油葵的遺傳多樣性豐富,食葵和油葵資源材料間有部分基因相互交叉滲透,為新疆向日葵核心種質的構建和資源的合理利用提供理論支持。

向日葵;序列標簽位點;群體結構;聚類分析

0 引 言

【研究意義】向日葵(HelianthusannuusL.)因具有耐鹽堿、耐瘠薄、抗旱、適應性強等特點,特別適合于我國西部地區種植[1]。向日葵主要有食用向日葵和油用向日葵兩種。油用向日葵籽實含油率高,油品質量好,其中亞油酸含量達60%以上,現已成為世界第4大油料作物[2]。當前國外公司向日葵雜交種在中國占有很大市場,國內品種與國外品種綜合性狀相比還有一定差距,主要原因是目前我國向日葵種質資源材料的基礎研究還比較薄弱[3]。近幾年,分子標記技術已發展成為提高育種工作效率強有力的武器,對向日葵生物學研究具有重要意義。【前人研究進展】國外文獻報道方面,Yue 等[4]等利用TRAP標記分析了177個向日葵自交系遺傳多樣性。Lawson等[5]用RAPD方法報道了7個自交系、5個澳大利亞地方栽培種等16個向日葵材料,材料之間的平均相似性達到了0.73。 Hongtrakul[6]等采用AFLP技術對24份油用向日葵自交系材料進行了分析。Norma等[7]用 SSR 分子標記報道了12個向日葵基因型,平均多態信息度(PIC)為0.57。Mokrani等[8]利用AFLP標記標記和SSR相結合的方法研究了向日葵的品質特性、含油率和一些重要的農藝性狀。國內也有不少研究向日葵遺傳多樣性的報道[9-13]。向日葵群體遺傳結構研究分析方面,Mandel等[14]利用來自美國和歐洲的433份向日葵栽培種質和24野生向日葵種為材料的群體遺傳結構分析表明,所有向日葵種質可以分為4個結構群體,其中向日葵栽培種主要為兩個群體。Marjan等[15]利用SSR標記對收集到的50份食用向日葵的群體結構分析表明,食用向日葵可以分為三大群。Filippi[16]等利用 137份向日葵自交系、13個開放授粉材料和20個復合品種的群體結構表明,利用SNP標記可以將群體劃分2兩群,而SSR標記可以將群體劃分3群。國內外研究向日葵遺傳多樣性研究報道不少,但對向日葵群體遺傳結構分析的研究報道不多,尚未見研究新疆向日葵群體結構的研究報道。【本研究切入點】向日葵群體的遺傳多樣性分群劃分通常依據個人經驗,不同研究報道其群體的遺傳多樣性劃分也不盡相同,人為因素影響較大。為準確劃分新疆向日葵資源材料的群體結構、明確新疆食葵保持系和恢復系之間、油葵保持系和恢復系之間以及新疆食葵資源材料和油葵資源材料間的遺傳差異。【擬解決的關鍵問題】研究以新疆食葵、油葵自交系以及部分油葵雜交種為材料,利用SSR標記,對其進行群體結構劃分、聚類分析,為新疆向日葵核心種質的構建以及合理利用提供理論支撐。

1 材料與方法

1.1 材 料

供試材料由新疆農墾科學院作物所提供,共136份。其中,油葵保持系30份,恢復系43份,油葵雜交種8份,食葵保持系20份,恢復系35份。表1

1.2 方 法

DNA提取:供試材料種植于海南三亞農墾科學院試驗田。取新鮮葉片,當天取樣后直接提取基因組DNA。 DNA提取采用百泰克新型快速植物基因組DNA提取試劑盒(離心柱型),最后得到的DNA樣品用TE(Tris-EDTA)緩沖液溶解,放在-20℃的冰箱內保存。

TaqDNA聚合酶、dNTPs、Marker ladder、溴酚藍、丙烯酰胺、甲叉雙丙烯酰胺和TEMED等主要生化試劑購自海南相關生物銷售商,為國產分析純。

SSR引物:SSR引物見Tang等[17](2002)報道的向日葵序列標簽位點(sequence tagged site)序列,隨機選取500對SSR引物,由上海生物工程公司合成引物,利用16份(分別為1-4,31-34,74-77,111-114)向日葵自交系材料進行擴增,進行多態篩選。

PCR 擴增、PCR反應程序以及變性聚丙烯酞胺凝膠參照有關文獻[18]。

1.3 數據統計

應用STRUCTRE軟件,對供試群體進行基于數學模型的類群劃分。使用NTSYS-pc210e軟件進行聚類分析,其參數設定見已發表文獻[19]。

2 結果與分析

2.1 SSR引物篩選

利用向日葵500對序列標簽位點SSR引物對16份向日葵自交系進行了PCR擴增篩選多態,篩選到62對序列標簽位點引物,可用于新疆向日葵自交系分子水平的遺傳分析。這些標記擴增產物條帶清晰、穩定和易讀,占所選引物數量的12.4%。列出62對序列標簽位點SSR多態標記信息,其中56對標記引物擴增片段的重復為雙堿基重復,占絕大多數,其余6對為多堿基重復。標記引物的PIC數值絕大部分都在0.5以上,表明其多態信息量豐富。PCR期望擴增長度都介于112~477 bp,沒有大片段,易于擴增,對擴增反應條件不是很苛刻。退火溫度介于52~60℃。

表1,表2

表1 新疆向日葵自交系材料
Table 1 Sunflower Inbred Lines of Xinjiang

編號No名稱Name特性traits編號No名稱Name特性traits編號No名稱Name特性traits12541⊕-1油葵,恢復系473019-2油葵,保持系933386⊕食葵,恢復系22542⊕-1油葵,恢復系483021-1油葵,恢復系943248-6食葵,保持系32544⊕-4油葵,恢復系493027-1油葵,保持系953268-1食葵,保持系42549⊕-1R油葵,恢復系503034-1油葵,保持系963276-1食葵,保持系52564⊕-3油葵,恢復系513045-1油葵,保持系973242-4食葵,保持系62567⊕-4油葵,恢復系523030-1油葵,保持系983268-4食葵,保持系72584⊕-8油葵,恢復系532892-1油葵,保持系993244-1食葵,恢復系82587⊕-1R油葵,恢復系542702-1油葵,恢復系1003215-2食葵,保持系92588⊕-4油葵,恢復系552918-1油葵,保持系1013218-1食葵,保持系102591⊕-6油葵,恢復系562892-2油葵,恢復系1023232-1食葵,恢復系112597⊕-3油葵,恢復系572938-1油葵,保持系1033235-2食葵,恢復系122602⊕-1油葵,恢復系582914-1油葵,恢復系1043229-1食葵,保持系132605⊕-1油葵,恢復系592928-2油葵,保持系1053119-1食葵,恢復系142611⊕-1油葵,恢復系602647-1油葵,恢復系1063160B食葵,恢復系152613⊕-2油葵,恢復系612891-2油葵,保持系1073201-1食葵,保持系162619⊕-1油葵,恢復系622867-1油葵,保持系1083132-1食葵,恢復系172624⊕-1油葵,恢復系632648-1油葵,恢復系1097B-1食葵,保持系182627⊕-1油葵,恢復系642659-1油葵,恢復系1103126-1食葵,恢復系192631⊕-1油葵,恢復系652672-1油葵,恢復系1113324食葵,保持系202635⊕-3油葵,恢復系662655-1油葵,恢復系1123207-5食葵,保持系212638⊕-1油葵,恢復系672751-1油葵,恢復系1133226-1食葵,保持系222639⊕-1油葵,恢復系682707-1油葵,恢復系1143300-3食葵,保持系232695⊕-2R油葵,恢復系692776-1油葵,恢復系1153243-3食葵,保持系242708⊕-2油葵,恢復系702861-1油葵,保持系1163180-1食葵,保持系252719⊕-2R油葵,恢復系712880-1油葵,保持系1173114-1食葵,保持系262735⊕-2R油葵,恢復系722897-2油葵,保持系118184015食葵,恢復系272744⊕-2R油葵,恢復系73D874油葵,保持系1193329⊕-4食葵,恢復系282745⊕-2R油葵,恢復系743079食葵,恢復系1203022×2627油葵雜交種292746⊕-6油葵,恢復系753161⊕混食葵,恢復系1213028×2605油葵雜交種302830⊕-1R油葵,恢復系763302食葵,恢復系1223028×2588油葵雜交種312959-3油葵,保持系773303-2食葵,恢復系1233038×3039油葵雜交種322963-2油葵,保持系783304食葵,恢復系1243041×3040油葵雜交種332973-1油葵,保持系793307食葵,恢復系1253263×3187油葵雜交種342975-2油葵,保持系803308食葵,恢復系1263253×3318油葵雜交種352979-3油葵,保持系813309-1食葵,恢復系1273253×3319油葵雜交種362981-4油葵,保持系823310食葵,恢復系1283121食葵,恢復系372983-3油葵,保持系833311食葵,恢復系1293163食葵,恢復系382986-1油葵,保持系843312-8食葵,恢復系1303301食葵,恢復系392989-2油葵,保持系853313食葵,恢復系1313305-2食葵,恢復系402991-1油葵,保持系863314食葵,恢復系1323306食葵,保持系412997-1油葵,保持系873315食葵,恢復系1333214-1食葵,保持系422961-1油葵,恢復系883316-7食葵,恢復系1343246-1食葵,恢復系433003-1油葵,保持系893317-2食葵,恢復系1353223-1食葵,恢復系443009-2油葵,保持系903318-5食葵,恢復系1363322-1食葵,保持系453013-2油葵,保持系913319食葵,恢復系463015-1油葵,保持系923320食葵,恢復系

表2 SSR多態標記的基本統計信息
Table 2 Basic statistical information of SSR polymorphism marker

名稱Name重復序列RepeatMotifs擴增長度ExpectedLength多態信息量PIC退火溫度Ta名稱Name重復序列RepeatMotifs擴增長度ExpectedLength多態信息量PIC退火溫度TaORS294(AT)8(GT)6G(GT)5375062557ORS571(AG)9262062557ORS309(A)19121050057ORS615(CT)13320062560ORS311(AC)11320030057ORS631(CT)25152050052ORS313(AT)12(GT)11104030057ORS635(CT)12109050052ORS317(AC)11(AT)8(AG)6204037557ORS637(CT)16126062554ORS329(GT)6236037557ORS641(AG)7343037554ORS337(AC)15184050057ORS659(AG)8221037557ORS339(GT)11327020057ORS671(AG)20182037557ORS343(AC)8242037557ORS673(AG)21215062557ORS351(AC)11225062557ORS679(AG)16240062557ORS377(GT)18265012057ORS687(CT)14168075057ORS385(AC)23224062557ORS749(CT)13112075057ORS387(CT)7(AT)8(CT)9323037552ORS765(CT)14387062557ORS401(GT)15165037557ORS770(CT)14246050054ORS403(GT)8322050054ORS777(CT)14293037557ORS405(AC)11268050054ORS781(CT)5374062560ORS413(AC)8418050060ORS785(AG)17161062557ORS439(AC)7391050060ORS798(CT)8141062562ORS451(GT)9176050052ORS799(CT)13143062557ORS453(GTGTT)12305075057ORS802(GA)13395037560ORS455(GT)12167050057ORS803(CT)20165037557ORS475(GT)5302050057ORS830(GT)13213062559ORS493(AC)7350037560ORS844(AC)17307062559ORS496(AC)9178037557ORS845(AC)10360037559ORS521(AC)6477050057ORS852(GT)10(GA)9197037559ORS527(CT)7354050057ORS878(AC)112030559ORS531(AG)9365037557ORS903(AC)14347037559ORS539(CT)12255062554ORS904(GT)10172050059ORS549(AG)8354037560ORS906(GT)11274050059ORS565(AG)13145075054ORS924(AC)16284037559ORS569(AG)24190050052ORS925(AC)16201062559

2.2 參試材料的群體結構劃分

136份向日葵資源材料群體基因型經過structure軟件運行后得到的△K值與k變化關系,研究表明,當k=2時,△K達到最大,為85左右,然后迅速降低,在K為3~9時其△K基本降低到0附近,近似一條直線。因此依據△K的變化,參試的向日葵自交系材料群體可以劃分為2大類群。依據k=2時,利用Simulation Result中的bar plot,可以繪制得到k=2時各品種在群中所占基因型的比例圖。研究表明,2個類群分別用2種顏色來表示,兩種顏色分別描述不同品種被分到這2類群中基因型所占比例,紅色部分較綠色部分比例大一些,表明劃分到紅色類群的品種材料較多一些。圖1,圖2

Y軸為△k、X軸為K向日葵群體結構分群數目

Numbers on y-axis show the △Kand numbers on x-axis showKbelongs to sunflower populations

圖1 利用△K對向日葵群體結構優化曲線
Fig.1 Bilateral charts(△K)to access the optimal construction of populations in studied sunflower

Y軸顯示所在群向日葵個體的相關系數, X軸為所在群的日葵個體

Numbers on y-axis show the membership coefficient to sub-populations and numbers on x-axis show the individual code belongs to sunflower populations

圖2 利用Structure軟件分析向日葵群體分群
Fig.2 The construction of sunflower populations using Structure software

2.3 參試材料的聚類分析

利用62對列標簽位點多態性SSR標記對136份向日葵資源材料進行基因型鑒定,其中數字1為有帶、0為無帶,缺失為999。部分標記的136份材料的擴增效果,研究表明,PCR擴增圖像清晰,條帶易讀。NTSYS-pc2.10軟件對136份基因型數據分析的聚類樹狀圖見圖 3。依據△K=2,在0.65 相似系數水平上136 份向日葵品種資源可聚為2大群。其中第1大群有67份,其材料號分別為:1、2、42、67、5、128、75、7、8、93、15、19、22、20、21、9、110、120、27、69、70、76、100、105、87、128、13、35、36、55、41、48、49、32、18、121、122、45、46、123、47、40、61、71、64、52、58、73、43、44、50、33、34、53、57、116、56、66、37、63、59、60、38、39、80、97、108。

第2大群有50份,其材料號分別為:4、106、109、112、14、29、113、101、104、111、107、16、91、127、92、132、133、96、103、135、136、102、88、90、125、126、94、23、54、24、68、114、25、65、26、30、31、17、77、118、85、99、51、124、62、115、72、130、74、79。另有19份未分配到任何群中,其材料號分別為:10、82、83、11、12、84、129、134、117、78、81、86、89、95、98、119、3、6、131。以上分群顯示參試材料在群體1和群體2中包含的材料數目比較均衡,表明這些群體材料的遺傳多樣性代表性較好。

從聚類分析可以看出,材料77和118基因型相似性為100%,125和126基因型相似性為100%,應該為同一材料。其中基因型相似性系數達90%以上的分別有:77、118和85之間;106和109之間;82和83之間;38和39之間;40和6之間;45、46和47之間。這些相似性高的育種材料在今后向日葵自交系基因型改良育種時要盡量避免互相雜交。

73份油葵自交系材料中,有51份被劃分到第1大群,占比70%,17份被劃分到第2大群,3份不能劃分到任何一群。表明參試油葵自交系資源材料主要歸屬于第1大群。參試的30份油葵保持系中只有4份保持系歸屬到第2大群,其余保持系均在1大群。而在43份油葵恢復系中有25份劃分到第1大群。研究表明參試的油葵恢復系材料分群較保持系分群分散,暗示其遺傳多樣性較保持系豐富。在55份食葵自交系中,有12份被劃分到第1大群,占比21%,有29份劃分到第2大群,研究表明參試食葵資源材料主要歸屬于第2大群。其中 20份食葵保持系中有3份被劃分到第1大群,14分到第2大群。35份恢復系中有9份劃分到第1大群。在第在未劃分到任何群的材料中油葵材料有3份,其余13份材料為食葵。8份油葵雜交種有4份劃分到第1大群,另4份劃分到第二大群。研究表明參試油葵資源材料主要屬于第1大群,其恢復系遺傳多樣性較保持系豐富。而參試食葵材料主要屬于第2大群,食葵的遺傳多樣性較油葵的遺傳多樣性豐富,同時新疆食葵和油葵資源材料間有部分基因相互交叉滲透。圖3~6

(第一大群)(續下頁)

圖3 136份新疆向日葵資源材料樹狀聚類圖


Fig.3 The tree dendrogram of 136 population of Xinjiang sunflower materials

注:從左到右為標準DNA分子量以及標記ORS 671在1-136號向日葵材料擴增結果

Note: The Lanes from left to right were molecular weight bands and the products of PCR replication of ORS671 in 136 sunflower materials

圖4 ORS671標記在136份向日葵材料中的擴增效果
Fig.4 The products of replication of ORS671 in 136 sunflower materials

注:從左到右為標準DNA分子量以及標記ORS 679在1-136號向日葵材料擴增結果

Note: The Lanes from left to right were molecular weight bands and the products of PCR replication of ORS679 in 136 sunflower materials

圖5 ORS679標記在136份向日葵材料中的擴增效果
Fig.5 The products of replication of ORS679 in 136 sunflower materials

注:從左到右為標準DNA分子量以及標記ORS 687在1-136號向日葵材料擴增結果

Note: The Lanes from left to right were molecular weight bands and the products of PCR replication of ORS687 in 136 sunflower materials

圖6 ORS687標記在136份向日葵材料中的擴增效果
Fig.6 The products of replication of ORS687 in 136 sunflower materials

3 討 論

3. 1 向日葵自交系種質類群的劃分

研究向日葵育種材料的遺傳多樣性和親緣關系,對于提高其自交系的利用效率有著重要意義。以往研究表明利用界內認可的標準系可以有效地將不明系譜關系的自交系劃分到相應的種質類群中。這種不同種質類群的劃分,對雜種優勢利用有著重要的參考意義。由于向日葵缺乏相應的標準系,國內對向日葵群體的種質類群的劃分通常依據個人經驗,不同研究報道其群體的遺傳多樣性劃分也不盡相同,人為因素影響較大。研究選用136份向日葵種質群體, 利用structure軟件分析了向日葵群體基因型,依據△K的變化,將新疆向日葵自交系材料群體劃分為2大類群,這為今后選配新雜交組合提供了理論依據。這與李艷花報道[20]在0.69 相似系數水平上分為 5 類,以及胡小利報道[21]在遺傳相似系數為0.62時將參試品種被劃為4種類群不同。

向日葵群體遺傳結構研究方面,Mandel等[14]將向日葵栽培種主要分為兩個群體。Marjan等[15]對收集到的50份食用向日葵的群體結構分析表明,食用向日葵可以分為三大群。Filippi[16]等利用 137份向日葵自交系、13個開放授粉材料和20個復合品種的群體結構表明,SNP標記可以將群體劃分2兩群,而SSR標記可以將群體劃分3群。上述研究向日葵分群與研究向日葵分群數目有相同也有異同。由于不同向日葵栽培地區其育種研究方向的差異,如前蘇聯選育的優良向日葵品種多為高含油量、高產量、高抗病蟲為特點;法國較為重視選育莖稈矮小、分枝多和抗旱性強的向日葵新品種;美國育種家多重視選育抗病、抗倒伏、抗雜草等優良向日葵雜交種。其次不用研究報道所利用的向日葵的資源材料豐富度也有差異。這些都可能對向日葵資源材料分群有一定的影響。

3.2 遺傳聚類結果比較

食葵資源材料的遺傳多樣性大于油葵資源材料間的遺傳多樣性,同時食葵和油葵資源材料間有部分相互交叉滲透。造成油葵資源材料間的遺傳多樣性小食葵的原因可能與新疆油葵育種家長期一味追求油葵高產育種目標相關,長期對油葵自交系材料的高產性狀的選擇會造成其它豐富基因的流失,導致油葵品種對外界環境的壓力的敏感,從而可能造成油葵潛在病蟲害爆發的危險。因此研究結果不僅可以幫助了解新疆向日葵種質的遺傳多樣性及其差異情況,了解向日葵種質的更新進程,為新疆向日葵育種研究提供理論依據。

4 結 論

研究參試的136份向日葵群體基因型依據△K的變化,可以分為2大類群。其中73份油葵自交系材料中,70%自交系材料被分配到第1大群。30份油葵保持系中只有4份保持系被分配到第二大群,其余保持系均在1大群。而在43份油葵恢復系中有25份分配到第1大群,其余分配到其它群中。在55份食葵自交系中,僅有21%食葵被分到第1大群。參試食葵品種的遺傳多樣性較油葵的遺傳多樣性豐富,食葵和油葵資源材料間有部分基因相互交叉滲透。

References)

[1] 崔良基,劉悅,王德興. 我國發展向日葵生產潛力及對策 [J]. 雜糧作物,2008,28(5):336-338.

CUI Liang-ji, LIU Yue, WANG De-xing. (2008).The potential and Countermeasure of development of sunflower production [J].CoarseCerealsCrops, 28(5):336-338. (in Chinese)

[2]羅偉強.氣相色譜法測定葵花籽油的脂肪酸[J].食品工業科技,2003,24(6) : 79-80.

LUO Wei-qiang. (2003).Determination of fatty acids in sunflower seed oil by gas chromatography [J].FoodIndustrialScienceandTechnology, 24 (6): 79-80. (in Chinese)

[3]張明.國內外向日葵育種概況及動向[J].黑龍江農業科學, 2010,(6):149-151.

ZHANG Ming. (2010). General situation and trends of domestic and foreign Sunflower Breeding [J].HeilongjiangAgriculturalSciences, (6): 149-151 (in Chinese)

[4]Yue, B., Cai, X. W., Vick, B. A., & Hu, J. G. (2009). Genetic diversity and relationships among 177 public sunflower inbred lines assessed by trap markers.CropScience, 49(4):1,242-1,249.

[5]Lawson, WR, Henry, RJ, Kochman, JK, & Kong, GA. (1994). Genetic diversity in sunflower (HelianthusannuusL.) as revealed by random amplified polymorphic dna analysis.AustralianJournalofAgriculturalResearch, 45(7):1,319-1,327.

[6]Hongtrakul, V., Huestis, G. M., & Knapp, S. J. (1997). Amplified fragment length polymorphisms as a tool for dna fingerprinting sunflower germplasm: genetic diversity among oilseed inbred lines.TheoreticalandAppliedGenetics, 95(3):400-407.

[7]Norma P, Marianne M, Mercedes E, et al.Microsatellitedevelopmentforsunflower[C]//. Plant and Animal Genome Conference. San Diego: Stanford University Press,1999.

[8]Mokrani, L., Gentzbittel, L., Azanza, F., Fitamant, L., Al-Chaarani, G., & Sarrafi, A. (2002). Mapping and analysis of quantitative trait loci for grain oil content and agronomic traits using aflp and ssr in sunflower (Helianthusannuus, L.).TheoreticalandAppliedGenetics, 106(1):149-156.

[9]范麗娟,王貴,關洪江,等.黑龍江省向日葵地方品種資源研究初報[J].黑龍江農業科學, 1992,(4): 31-33.

FAN Li-juan, WANG Gui, GUAN Hong-jiang, et al. (1992).Research on the local germplasm resources of sunflower in Heilongjiang province [J].HeilongjiangAgriculturalSciences, (4): 31-33. (in Chinese)

[10]劉杰, 莫結勝,劉公社, 等.向日葵種質資源的隨機擴增多態性DNA(RAPD)研究[J].植物學報, 2001, 43(2):151-157.

LIU Jie, MO Jie-sheng, LIU Gong-she, et al. (2001). RAPD Analysis on the Germplsm Resources of Sunflower [J].ActaBotanicaSinica, 43(2): 151-157. (in Chinese)

[11]郭樹春.食用向日葵種質資源基礎類群劃分研究[D].呼和浩特:內蒙古農業大學碩士研究生學位論文, 2008.

GUO Shu-chun. (2008).Studyontheclassificationofthebasicgroupsofediblesunflowergermplasm[D]. Master Dissertation.Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot. (in Chinese)

[12]鐘淮欽, 吳建設,陳詩林,等.觀賞向日葵種質資源遺傳多樣性RAPD分析[J].分子植物育種, 2009,7(1):73-78.

ZHONG Huai-qin, WU Jian-she, CHEN Shi-lin, et al. (2009). Genetic diversity of Ornamental Sunflower germplasm resources RAPD analysis [J].MolecularPlantBreeding, 7(1):73-78. (in Chinese)

[13]張曼,田娟,張雷, 等. 向日葵 DNA 指紋圖譜構建及遺傳多樣性分析[J].寧夏農林科技, 2015,56(7):26-30.

ZHANG Man, TIAN Juan, ZHANG Lei, et al. (2015). Construction of DNA fingerprint and genetic diversity analysis of sunflower [J].NingxiaAgricultureandForestryScienceandTechnology, 56(7):26-30. (in Chinese)

[14]Jannatdoust, M., Darvishzadeh, R., Ziaeifard, R., Ebrahimi, M. A., Maleki, H. H., & Gholinezhad, E., et al. (2016). Analysis of genetic diversity and population structure of confectionery sunflower (Helianthusannuus, L.) native to iran.JournalofCropScienceandBiotechnology, 19(1):37-44.

[15]Filippi, C. V., Aguirre, N., Rivas, J. G., Zubrzycki, J., Puebla, A., & Cordes, D., et al. (2015). Population structure and genetic diversity characterization of a sunflower association mapping population using ssr and snp markers.BMCPlantBiology, 15(1): 268-272.

[16]Tang, S., Yu, J. K., Slabaugh, B., Shintani, K., & Knapp, J. (2002). Simple sequence repeat map of the sunflower genome.TheoreticalandAppliedGenetics, 105(8):1,124-1,136.

[17]Paterson, A. H., Brubaker, C. L., & Wendel, J. F. (1993). A rapid method for extraction of cotton (gossypium spp.) genomic dna suitable for rflp or pcr analysis. plant mol bio rep.PlantMolecularBiologyReporter, 11(2): 122-127.

[18]張俊,王靜毅,陳友,等. 基于模型的香蕉種質資源群體結構聚類分析及其親緣關系分析[J]. 熱帶作物學報, 2014,35(2):232-238.

ZHANG Jun, WANG Jing-yi, CHEN You, et al. (2014). Group Clustering Analysis and Genetic Relationship Analysis of Banana Germplasm Resources Based on the Model [J].ChineseJournalofTropicalCrops, 35(2):232-238. (in Chinese)

[19]李艷花. 向日葵種質資源遺傳多樣性的SSR分析及4個油葵的品比試驗[D].楊凌: 西北農林科技大學碩士學位論文,2015.

LI Ya-hua. (2015).GeneticdiversityofsunflowergermplasmresourcesbySSRanalysisand4OilSunflowerVarietyTest[D]. Master Dissertation. Northwest Agriculture and Forestry University, Yangling.(in Chinese)

[20]胡小利. 102份食用向日葵自交系結實和SSR分子標記研究[D]. 呼和浩特:內蒙古農業大學碩士研究生學位論文, 2015.

HU Xiao-li. (2015).Studyontheseedsettingof102ediblesunflowerinbredlinesandSSRmolecularmarkers[D]. Master Dissertation.Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot. (in Chinese)

Supported by:The Yuanjiang project of Science and technology Corps"Study on breeding techniques with rapid and efficient and Germplasm Resources Innovation of sunflower" (2014AB007); The project of national Industrial technology system of sunflower (CARS-16)

Study on the Population Structure and Cluster Analysis of Some Sunflower Inbred Lines in Xinjiang by SSR Markers

LIU Sheng-li1, DUAN Wei2, WANG Peng1, LIU Yan-Tao1, WANG Pei-zheng3

(1.XinjiangAcademyofAgriculturalReclamationSciences,ShiheziXinjiang832000,China;2.XinjiangKangdiSeedScience&TechnologyCo.Ltd,Urumqi830011,China;3.HainanTropicalOceanUniversity,SanyaHainan572022,China)

【Objective】 Sequence Tagged Site (STS) is a short DNA sequence, which appears only once on its biological chromosome and is suitable for a landmark of crop genome.【Method】500 STS-SSR primers of sunflower were synthesized randomly and were used to screen the samples of Xinjiang edible sunflower and oil sunflower inbred lines for finding the polymorphism.【Result】All of them 62 markers showed stable polymorphism among those 136 sunflowers with clear, stable and easy to read characteristics, which accounted for 12.4% of the number of selected primers. 136 Xinjiang sunflower inbred populations could be divided into 2 groups according to the change of △Kand be clustered into 2 groups at the 0.65 similarity level. In the 73 oil sunflower inbred lines, 70% inbred lines were assigned to first groups which meant the oil sunflower inbred lines were mainly classified in the first group. Among 30 maintainer lines of oil sunflower lines only 4 maintainer lines were assigned to second groups, the rest were in group I. In the 43 restorer line of oil sunflower, 25 restorer lines were allocated to first large groups, and the rest were allocated to other groups, which indicated that the genetic diversity of restorer line was more abundant than maintainer lines. In the 55 edible sunflower inbred lines, only 21% of them were divided into first groups which indicated that edible sunflower inbred lines belonged to the second and the third groups.【Conclusion】This study showed that the genetic diversity of edible sunflower was greater than that of oil sunflower, and some genes between the edible sunflower and oil sunflower materials were crossed and penetrated. The results of this study have provided theoretical support for the construction of the core collection and the rational utilization of resources in the future.

sunflower; sequence tagged site; population structure; cluster analysis

10.6048/j.issn.1001-4330.2017.02.004

2016-10-07

兵團科技支疆項目“向日葵快速高效選育技術及種質資源創新研究”(2014AB007);國家向日葵現代產業技術體系建設項目(CARS-16)

劉勝利(1967-),男,山東寧津人,碩士,研究員,研究方向為向日葵新品種選育與栽培,(E-mail)liushenglilsl@163.com

王沛政(1972-),男,陜西人,副教授,研究方向分子遺傳育種,(E-mail)condywpz@126.com

S565.5

A

1001-4330(2017)02-0223-11

主站蜘蛛池模板: 亚洲一道AV无码午夜福利| 国内黄色精品| 黄色国产在线| 国产第一页屁屁影院| 97久久免费视频| 国产婬乱a一级毛片多女| 欧美一区日韩一区中文字幕页| 亚洲天堂成人在线观看| 亚洲第一国产综合| 毛片免费观看视频| 91久久偷偷做嫩草影院| 亚洲一区二区三区麻豆| 欧美日本激情| 国产精品极品美女自在线| 一本一道波多野结衣av黑人在线| 99久久精彩视频| 丝袜亚洲综合| 国模极品一区二区三区| 伊人久久大线影院首页| 日韩一二三区视频精品| 国产精品无码AV片在线观看播放| 欧美一级黄片一区2区| 5555国产在线观看| 国产精品污污在线观看网站| 波多野结衣一二三| 国产一区二区三区夜色| 老司机aⅴ在线精品导航| 伊人久久久久久久| 日本一区二区不卡视频| 18黑白丝水手服自慰喷水网站| 国产凹凸视频在线观看| 成人午夜福利视频| 国产h视频免费观看| 欧美激情成人网| 久久久久国产精品免费免费不卡| 四虎综合网| 亚洲精品你懂的| 亚洲最大综合网| 国产精品亚洲片在线va| 欧美成人一级| 日韩精品毛片| 毛片免费视频| 亚洲一区第一页| 欧美精品1区| 中文字幕日韩丝袜一区| 久久99国产综合精品女同| 国产无遮挡裸体免费视频| 国产免费自拍视频| 国产成人夜色91| 亚洲精品免费网站| 无码'专区第一页| 亚洲午夜天堂| 天天色综合4| 秋霞一区二区三区| 欧美精品啪啪一区二区三区| 中文字幕 日韩 欧美| 久热精品免费| 午夜高清国产拍精品| 欧美黑人欧美精品刺激| 99视频只有精品| 日韩精品一区二区三区中文无码| 国产精品手机在线播放| 91 九色视频丝袜| 国产h视频免费观看| 99re在线视频观看| 亚洲欧美成人影院| 五月六月伊人狠狠丁香网| 中文字幕人成人乱码亚洲电影| 亚洲中文精品久久久久久不卡| 99免费在线观看视频| 999精品视频在线| 99re经典视频在线| 亚洲av无码牛牛影视在线二区| 美女视频黄又黄又免费高清| 午夜国产精品视频| 在线看片中文字幕| 中国成人在线视频| 刘亦菲一区二区在线观看| 欧美劲爆第一页| 青草娱乐极品免费视频| 伊人精品成人久久综合| 五月婷婷综合网|