威寧綿羊IGF—1基因外顯子多態性分析

劉標　易鳴　張依裕　王振　程朝友　楊德文　程均華　付正仙　王進

摘要：為了更好地保護和開發利用威寧綿羊這一優良地方品種，本實驗利用威寧綿羊構建DNA池，設計4對引物擴增威寧綿羊IGF-1基因外顯子及部分內含子序列。將PCR產物純化并進行雙向測序，通過DNAStar生物軟件分析確定多態性位點。利用在線生物信息學軟件分析多態位點對IGF-1基因RNA的二級結構、類胰島素生長因子1的二級和三級結構的影響。結果表明，在擴增的IGF-1基因中篩選到3個SNPs：Intron1-A4387C、Exon2-T87C、Exon4-A27T，其中Exon4-A27T為錯義突變，導致編碼的精氨酸（Arg）變為絲氨酸（Ser）；Exon2-T87C多態位點均未改變氨基酸的編碼，為同義突變；Intron1-A4387C在內含子區，不參與氨基酸編碼。

關鍵詞：威寧綿羊；IGF-1基因；SNPs

中圖分類號：Q812

文獻標識碼：A

文章編號：1008-0457（2017）02-00082-04國際DOI編碼：10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2017.02.018

Abstract：In order to protect and utilize the fine local variety， DNA pool of Weining sheep was constructed. 4 primers were designed to amplify exon and intron sequences of IGF-1 gene in Weining sheep . Products of PCR were purified and bidirectional sequenced to determine the SNPs. Influence of polymorphic sites on the RNA secondary and tertiary structure of IGF-1 gene was analyzed by online bioinformatics software. The result showed that 3 SNPs were detected in IGF-1 gene， namely Exon2-T87C， a synonymous mutation； Exon4-A27T， a missense mutation which changed the code of Arg into Ser； and Intron1-A4387C， a noncoding mutation in the intron.

Key words：Weining sheep； IGF-1 gene； SNPs

威寧綿羊的主產區為貴州省威寧縣，有悠久的飼養歷史，屬藏系山谷型粗毛綿羊。威寧綿羊體質結實，個體矮小，生長速度慢，繁殖能力差，生產性能低下。因此，對威寧綿羊的育種工作，特別是分子輔助育種對威寧綿羊的保護和開發利用具有重要意義。

類胰島素生長因子（IGF）與胰島素原相似，是一種單鏈多肽，包括IGF-1和IGF-2。IGF-1能夠促進動物的生長，并且對胎兒的生長也有一定的作用，Breier B H等[1]研究發現，IGF-1基因缺失會使小鼠初生重下降。前人研究發現人類IGF-1基因5′調控區多態性與高度近視、身高肥胖和疾病的發生具有顯著相關性[2-4]。王明輝[5]通過研究IGF1-FoxO通路發現基因間的互作效應會對豬的生長性狀產生影響。張春香[6]通過對山羊IGF-1基因的多態性研究發現該基因的多態性顯著影響山羊的初生重和周歲體重。……