利用SSR和SFP標記分析水稻葉色突變體的多態性

劉明浩，肖 楠，方希林，陳茜霖，吳旺嬪，陳光輝,2，王 悅

（1.湖南農業大學農學院，湖南 長沙 410128；2.南方糧油作物協同創新中心，湖南 長沙 410128）

利用SSR和SFP標記分析水稻葉色突變體的多態性

劉明浩1，肖 楠1，方希林1，陳茜霖1，吳旺嬪1，陳光輝1,2，王 悅1

（1.湖南農業大學農學院，湖南 長沙 410128；2.南方糧油作物協同創新中心，湖南 長沙 410128）

利用1 286對SSR標記和66對SFP標記對水稻轉綠型新葉黃化突變體ygr和正常綠葉水稻品種日本晴（NBP）的基因組進行多態性研究。結果表明：1 236對SSR標記和63對SFP標記有擴增產物，擴增效率為96.08%；親本間共篩選到248對SSR多態標記和12對SFP多態標記，平均每條染色體有22對，多態檢出率為19.23%；多態標記覆蓋水稻基因組達1 626.2 cM，相鄰多態標記間平均遺傳距離為6.25 cM。不同類型標記間比較發現，SSR標記的多態檢出率比SFP標記高1.1個百分點，兩者相差不大。

水稻；SSR標記；SFP標記；葉色；多態性

分子標記技術在水稻功能基因定位、分子標記輔助選擇育種以及遺傳多樣性分析等研究中具有重要作用。20世紀90年代以來，分子生物學的迅速發展，水稻品種93-11 和日本晴測序的完成，加速了水稻分子標記的開發和應用。不同類型分子標記的開發對水稻功能基因的定位和克隆具有重要意義。簡單重復序列（simple sequence repeats，SSR）也稱微衛星標記，覆蓋了水稻的整個基因組，具有數量多、高多態性、呈共顯性等優點。Ouyang等[1]研究表明，水稻基因組含有18 828個SSR分子標記。目前，這些SSR分子標記在水稻功能基因圖位克隆和分子標記輔助選擇育種的研究中得到廣泛應用。SFP標記（single feature polymorphism，SFP）是近年來開發出來的一種基于微陣列技術的基因組插入/缺失差異標記。……