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無細(xì)胞生物科技加速創(chuàng)新

2017-06-12 21:27:15李雨蒙
中國民商 2017年6期
關(guān)鍵詞:系統(tǒng)

李雨蒙

人類的生命物質(zhì)包裹在一個稱謂“細(xì)胞”的微小口袋中。細(xì)胞內(nèi)部是DNA分子,攜帶了如何運轉(zhuǎn)人類細(xì)胞的指令,發(fā)展、被激發(fā),最終分裂為兩個細(xì)胞。RNA(核糖核酸)——存在細(xì)微差別的分子信息,攜帶指令進(jìn)入稱謂“核糖體”的分子細(xì)胞中。一個核糖體的工作是讀取RNA信息,并且將它們轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)。接下來,這些蛋白質(zhì)會監(jiān)督、執(zhí)行運轉(zhuǎn)、成長以及分裂的過程。

這是自地球上出現(xiàn)生命體的40億年以來,一直完整運轉(zhuǎn)的一套體系。可是,對于有些生物技術(shù)學(xué)家而言,細(xì)胞或許只是一頂老舊的帽子。他們認(rèn)同DNA、RNA、核糖體和蛋白質(zhì)的配置,它們可以被設(shè)計成為有其他用途的化學(xué)成分,從醫(yī)藥到建筑塑料模塊。但是科學(xué)家們一直試圖,逃脫包裹這些物質(zhì)的袋子,進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部僅僅留下原漿質(zhì)“粘液”用于他們的指令。

所以,相比傳統(tǒng)的基因工程帶點來的可能性(甚至像CRISPR-Cas9這樣先進(jìn)的基因修正技術(shù)),無細(xì)胞生物技術(shù)能夠更加準(zhǔn)確的控制。在這里,基因信息是由核糖體(Ribosomes)轉(zhuǎn)譯,最終產(chǎn)品可以進(jìn)行大規(guī)模產(chǎn)生。

同樣重要的是,無細(xì)胞生物技術(shù)意味著沒有任何生物化學(xué)過程浪費在運轉(zhuǎn)、發(fā)展和分裂任何實質(zhì)細(xì)胞上。事實上,科學(xué)家們最初的目的就是為制造特定產(chǎn)品尋找最佳基因的一種快速方法。最終,所有努力形成的這樣的成果——無細(xì)胞生產(chǎn)將意味著大規(guī)模制造。

無細(xì)胞原漿質(zhì)粘液的制作過程如下:取4公升培養(yǎng)皿的大腸桿菌(大腸細(xì)菌深受基因工程學(xué)家的偏愛)。壓力作用下,通過微型閥門打開細(xì)菌細(xì)胞,撕裂細(xì)胞膜和DNA,最后釋放核糖體。在37攝氏度下培養(yǎng)得到的混合物一小時,然后激活能吞噬DNA碎片的一種稱為核酸外切的酶。運用離心機(jī),將細(xì)胞膜和其他碎屑廢棄物從包含核糖體的粘液中分離出去,分離去除多余的離子。然后,拌入氨基酸(蛋白質(zhì))、糖和攜帶能量的三磷酸腺苷(ATP)分子。最后,加入少量進(jìn)行嘗試,并對產(chǎn)生的蛋白質(zhì)粘液發(fā)出指令。

這一研究過程,采用的是加州伯克利大學(xué)的Synvitrobio公司的研究方法,這是一家加州理工學(xué)院的Zachary Sun和Richard Murray,以及哈佛大學(xué)喬治George Church共同創(chuàng)立的一家公司。運用不同生物體的其他無細(xì)胞技術(shù)也正在展開實驗,比如,酵母和鏈霉菌就成功進(jìn)行了實驗。煙草的細(xì)胞或是中國倉鼠的卵巢也是進(jìn)行這個實驗的不錯選擇。在自由懸浮暫停,所有這些公式在隔絕細(xì)胞的蛋白制造機(jī)制的狀態(tài)之下,將成為變種。

Synvitrobio公司的工程師建立了一種機(jī)器人系統(tǒng),融入他們實驗的最后一個階段。這個機(jī)器人將精制的原漿細(xì)胞打包注入一批384個微型試管中。每一支試管裝有幾百萬升之一的細(xì)胞液。然后,將一些DNA分子投入每一個試管,在這些分子信息轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)的過程中,分離出的粘液開始發(fā)揮作用。目前,這個系統(tǒng)能夠為每個試管處理8個DNA序列,這意味著能夠同時處理3072個蛋白質(zhì)。這樣能夠達(dá)到1萬個基因“字母”的長度——這足以編碼任何你能夠注意到的蛋白質(zhì)分子。

現(xiàn)在,Synvitrobio公司正在使用這一系統(tǒng)測試DNA序列,測試它能否值得作為抗生素考察。通過黏合到生物學(xué)上重要的分子,并且以傷害部分生物體的方式改變分子特性,才能讓藥物開始發(fā)揮效用。為了尋找這樣的黏合,每一個迷你試管同時裝備了一些特定的分子,每一個附上“報道者”標(biāo)簽的分子,當(dāng)黏合發(fā)生就會發(fā)出光亮。那些閃爍的試管標(biāo)志著,其中一組或多組的DNA序列值得研究者注意。所以,Synvitrobio公司的技術(shù)能夠以新DNA序列特定的速度,掃描出潛在的藥物。

按需人工合成新的基因序列是現(xiàn)在國際通行的技術(shù),這意味著全球的基因庫可以如候選人一樣被爭奪。基因被殘忍扭曲篩選,直到最好的基因出現(xiàn)。而此刻重點在于,如果當(dāng)Synvitrobio公司將新發(fā)現(xiàn)的分子,以傳統(tǒng)科技黏合進(jìn)合適的細(xì)胞內(nèi),在發(fā)酵罐中培養(yǎng)這些細(xì)胞,就如同釀造啤酒的過程一樣,這相比簡單將它們投入粘液中要消耗更多的時間。

靠近美國舊金山的SutroBiopharma生物制藥公司,已經(jīng)使用了無細(xì)胞系統(tǒng)生產(chǎn)抗癌的抗體。今年月,Sutro公司宣布運用這套系統(tǒng)生產(chǎn)阻止腫瘤擴(kuò)散的STRO-001抗體,并計劃在2018年開始臨床試驗STRO-001抗體。用于試驗的無細(xì)胞抗體即將開始生產(chǎn)。抗體是特殊的蛋白質(zhì),所以一旦Sutro公司的系統(tǒng)鑒定出最佳的“候選人”,所有需要的工作就是編碼“候選人”的DNA粘液。

Genomatica是一家位于圣地亞哥的生物科技公司,現(xiàn)在正在試驗利用無細(xì)胞系統(tǒng),從單糖中獲取1,4-丁二醇。1,4-丁二醇是一種用于制造聚合物(比如萊卡)的小分子。一般來說,相比生物科技,從化學(xué)過程中提煉這種尺寸分子的成本更低,而1,4-丁二醇恰恰是一個例外。

Genomatica公司的系統(tǒng)在合成過程中大量生產(chǎn)出關(guān)聯(lián)的酶,產(chǎn)生一個完整的無細(xì)胞代謝途徑——就是所有糖可以專注用于特定的化學(xué)物質(zhì),而不是為了謀取最大利益,運轉(zhuǎn)一個細(xì)胞的其他生化過程。目前,這家公司還沒有將系統(tǒng)用于商業(yè)使用,而對于它賦予更高的期望。

美國馬塞諸塞州的GreenLight生物科技公司,同樣計劃根據(jù)大腸桿菌,運用無細(xì)胞系統(tǒng)生產(chǎn)不易消化的核糖類似物——一種自然形成的糖,可應(yīng)用于零卡路里的飲料中。而借助于基因修改過的大腸桿菌已經(jīng)應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)。這家公司表示,他們對這套系統(tǒng)的熟練操作已經(jīng)達(dá)到一定高度,能夠每次生產(chǎn)數(shù)千公升的糖溶液。

與此同時,Greenlight公司用無細(xì)胞系統(tǒng),生產(chǎn)工業(yè)定制量產(chǎn)的RNA分子,阻止昆蟲幼蟲發(fā)展,可以用做殺蟲劑。現(xiàn)在,RNA生產(chǎn)的成本是每克5000美元。GreenLight公司認(rèn)為,擴(kuò)大生產(chǎn)過程,成本能夠降低50-100美元。

無論無細(xì)胞生物科技,能否通過制造化學(xué)物質(zhì)的基因修正技術(shù),來取代發(fā)酵技術(shù),這還有待時間檢驗。自從12000年前啤酒杯發(fā)明以來,發(fā)酵就成為一種經(jīng)過人類考驗值得信任的技術(shù)。

然而,剝離生物分子,直至剩下最后裸露的本質(zhì),同時也是最具效率的部分,至少對于一些應(yīng)用而言,生物細(xì)胞的功效能夠被充分發(fā)揮。

編譯自《經(jīng)濟(jì)學(xué)人》

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